214 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PICST_71247 on replicon NC_009043
Organism: Scheffersomyces stipitis CBS 6054



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009043  PICST_71247  predicted protein  100 
 
 
274 aa  563  1.0000000000000001e-159  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.0950178  normal  0.769643 
 
 
-
 
BN001302  ANIA_10437  NGG1 interacting factor Nif3, putative (AFU_orthologue; AFUA_6G12480)  37.2 
 
 
370 aa  216  2e-55  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.0684928  normal 
 
 
-
 
NC_006693  CNH02550  conserved hypothetical protein  41.13 
 
 
293 aa  206  3e-52  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.156372  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2941  protein of unknown function DUF34  35.66 
 
 
259 aa  146  3e-34  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.00948562  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1972  hypothetical protein  33.08 
 
 
262 aa  128  1.0000000000000001e-28  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0200095  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2261  NIF3 family protein  32.69 
 
 
262 aa  127  2.0000000000000002e-28  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.586771  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1111  protein of unknown function DUF34  30.43 
 
 
255 aa  127  2.0000000000000002e-28  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2313  hypothetical protein  30.15 
 
 
286 aa  123  4e-27  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.919298  normal  0.328132 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0497  hypothetical protein  31.11 
 
 
262 aa  122  6e-27  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.000000247624  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0544  protein of unknown function DUF34  29.88 
 
 
264 aa  117  1.9999999999999998e-25  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.220535  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2905  protein of unknown function DUF34  28.46 
 
 
287 aa  112  5e-24  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.0994154 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0747  hypothetical protein  30.14 
 
 
274 aa  112  6e-24  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2193  protein of unknown function DUF34  28.62 
 
 
307 aa  109  5e-23  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000022092 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_16660  hypothetical protein  27.05 
 
 
294 aa  108  1e-22  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.101676  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_06980  conserved hypothetical protein TIGR00486  27.27 
 
 
269 aa  106  4e-22  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.625612  normal  0.0282972 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2444  hypothetical protein  28 
 
 
310 aa  106  5e-22  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.111119  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1955  hypothetical protein  29 
 
 
278 aa  105  1e-21  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1133  protein of unknown function DUF34  27.04 
 
 
256 aa  105  1e-21  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.000108925  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5891  protein of unknown function DUF34  26.3 
 
 
279 aa  103  3e-21  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.258196 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1001  conserved hypothetical protein (NIF3 domain protein)  30.24 
 
 
241 aa  102  5e-21  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.561476  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2085  protein of unknown function DUF34  25.95 
 
 
290 aa  102  7e-21  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.046547  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1675  protein of unknown function DUF34  28.85 
 
 
268 aa  102  8e-21  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0332721  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6817  protein of unknown function DUF34  28.29 
 
 
278 aa  101  1e-20  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.304888  normal  0.0490159 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0892  hypothetical protein  43.75 
 
 
368 aa  101  2e-20  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0194369  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1301  hypothetical protein  29.26 
 
 
241 aa  98.2  1e-19  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3276  protein of unknown function DUF34  26.91 
 
 
286 aa  97.4  2e-19  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000173418  hitchhiker  0.000776053 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1438  hypothetical protein  29.32 
 
 
240 aa  96.3  5e-19  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.127976  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0285  hypothetical protein  30.13 
 
 
240 aa  96.3  5e-19  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  unclonable  0.000000517518  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3463  protein of unknown function DUF34  27.9 
 
 
273 aa  95.5  9e-19  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.807621  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0805  hypothetical protein  28.82 
 
 
241 aa  95.1  1e-18  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.708368  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0728  hypothetical protein  28.82 
 
 
241 aa  94.4  2e-18  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.0727321  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0618  dinuclear metal center protein, YbgI family  24.37 
 
 
294 aa  94.4  2e-18  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3357  hypothetical protein  27.57 
 
 
290 aa  94.4  2e-18  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1174  hypothetical protein  27.24 
 
 
257 aa  93.6  3e-18  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.171309  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0771  hypothetical protein  26.59 
 
 
261 aa  94  3e-18  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.149762  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5270  protein of unknown function DUF34  38.94 
 
 
386 aa  93.6  3e-18  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1210  hypothetical protein  26.25 
 
 
279 aa  93.6  3e-18  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.571993 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1498  protein of unknown function DUF34  24.41 
 
 
296 aa  93.6  3e-18  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.855921  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3597  hypothetical protein  29.04 
 
 
290 aa  92.8  5e-18  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000159335 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5147  protein of unknown function DUF34  39.62 
 
 
366 aa  91.7  1e-17  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.660499  normal 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1110  hypothetical protein  26.88 
 
 
265 aa  91.7  1e-17  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  0.562425  normal 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_07841  hypothetical protein  35 
 
 
364 aa  90.5  2e-17  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.438332  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3123  protein of unknown function DUF34  39.62 
 
 
366 aa  90.1  3e-17  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1654  protein of unknown function DUF34  28.07 
 
 
239 aa  89.7  5e-17  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  hitchhiker  0.0000685519  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_09470  conserved hypothetical protein TIGR00486  25.67 
 
 
309 aa  88.6  1e-16  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0444  hypothetical protein  26.51 
 
 
240 aa  88.2  1e-16  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.427722  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1619  protein of unknown function DUF34  35.25 
 
 
366 aa  87.8  2e-16  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.15807  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0707  hypothetical protein  28.83 
 
 
242 aa  87.8  2e-16  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1542  protein of unknown function DUF34  32.12 
 
 
365 aa  87.4  2e-16  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.0986735  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1202  hypothetical protein  26.59 
 
 
262 aa  87  3e-16  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2459  hypothetical protein  36.61 
 
 
371 aa  86.3  5e-16  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_12090  conserved hypothetical protein TIGR00486  24.72 
 
 
287 aa  84.7  0.000000000000001  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.397733  normal  0.178862 
 
 
-
 
NC_008532  STER_1227  hypothetical protein  26.01 
 
 
262 aa  85.1  0.000000000000001  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2674  protein of unknown function DUF34  43.43 
 
 
369 aa  84.7  0.000000000000002  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0774  protein of unknown function DUF34  27.98 
 
 
255 aa  84.7  0.000000000000002  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.245788  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1317  hypothetical protein  37.84 
 
 
371 aa  82.4  0.000000000000007  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00297001  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_14940  conserved hypothetical protein TIGR00486  26.53 
 
 
318 aa  81.6  0.00000000000001  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.234394 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6896  protein of unknown function DUF34  36.36 
 
 
364 aa  80.9  0.00000000000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0175851  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1805  hypothetical protein  34.48 
 
 
367 aa  80.9  0.00000000000002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0668481  normal  0.832459 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0830  hypothetical protein TIGR00486  35.71 
 
 
373 aa  80.5  0.00000000000003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000000172023  hitchhiker  1.68837e-16 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4141  hypothetical protein  36.51 
 
 
373 aa  80.5  0.00000000000003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  unclonable  0.000000770541  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1046  hypothetical protein  24.32 
 
 
240 aa  80.5  0.00000000000003  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0233  hypothetical protein  36.7 
 
 
364 aa  80.5  0.00000000000003  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.737243  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4406  conserved hypothetical protein TIGR00486  34.92 
 
 
373 aa  79.7  0.00000000000005  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00277064  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4191  hypothetical protein  34.92 
 
 
373 aa  79.3  0.00000000000006  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.000743156  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4029  NIF3-like protein  34.92 
 
 
373 aa  79.3  0.00000000000006  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00007027  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4512  hypothetical protein  34.92 
 
 
373 aa  79.3  0.00000000000006  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.000424182  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4311  conserved hypothetical protein TIGR00486  34.92 
 
 
373 aa  79.3  0.00000000000006  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.3364399999999999e-45 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4423  conserved hypothetical protein TIGR00486  34.92 
 
 
373 aa  79.3  0.00000000000006  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000000184902  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3085  hypothetical protein  33.88 
 
 
375 aa  79  0.00000000000008  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4039  NIF3-like protein  34.92 
 
 
373 aa  79  0.00000000000008  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0149626  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4369  hypothetical protein  34.13 
 
 
373 aa  78.2  0.0000000000001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00198592  n/a   
 
 
-
 
NC_006055  Mfl272  hypothetical protein  26.69 
 
 
258 aa  78.2  0.0000000000001  Mesoplasma florum L1  Bacteria  hitchhiker  0.000472671  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0737  hypothetical protein  25.79 
 
 
306 aa  78.6  0.0000000000001  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.698842  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3016  hypothetical protein  34.06 
 
 
373 aa  77.8  0.0000000000002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.097716  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2712  protein of unknown function DUF34  29.77 
 
 
373 aa  76.6  0.0000000000004  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.163591  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3818  hypothetical protein  24.5 
 
 
263 aa  76.6  0.0000000000004  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.863222  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0399  hypothetical protein  35.59 
 
 
372 aa  76.3  0.0000000000005  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.399804  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0025  protein of unknown function DUF34  30.51 
 
 
365 aa  75.9  0.0000000000006  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.459063  normal  0.55748 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1436  hypothetical protein  28.29 
 
 
346 aa  75.9  0.0000000000007  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.14453  normal  0.0780457 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0753  hypothetical protein  28.14 
 
 
254 aa  75.5  0.0000000000008  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.0434961  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3034  protein of unknown function DUF34  38.84 
 
 
373 aa  75.5  0.0000000000008  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.849304  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0478  protein of unknown function DUF34  38.32 
 
 
372 aa  75.1  0.000000000001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.763164  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1125  hypothetical protein  37.7 
 
 
366 aa  74.7  0.000000000002  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  hitchhiker  0.00107465  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0495  protein of unknown function DUF34  38.32 
 
 
372 aa  74.3  0.000000000002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.0420348 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0427  hypothetical protein  26.47 
 
 
369 aa  73.9  0.000000000002  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.964044 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2677  hypothetical protein  32.11 
 
 
374 aa  73.9  0.000000000003  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0626  hypothetical protein  39.58 
 
 
370 aa  73.6  0.000000000003  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.743702  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3302  hypothetical protein  32.23 
 
 
377 aa  73.9  0.000000000003  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.53977  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2410  protein of unknown function DUF34  31.9 
 
 
373 aa  73.9  0.000000000003  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0245658  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4817  hypothetical protein  25.47 
 
 
275 aa  73.2  0.000000000004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.203194  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0879  protein of unknown function DUF34  30.17 
 
 
380 aa  73.2  0.000000000004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2143  protein of unknown function DUF34  30.17 
 
 
395 aa  72.4  0.000000000008  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.454619  normal 
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0501  hypothetical protein  25.82 
 
 
258 aa  71.6  0.00000000001  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  hitchhiker  0.00505671  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0900  hypothetical protein  33.04 
 
 
393 aa  71.6  0.00000000001  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  decreased coverage  0.00277153  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_12390  conserved hypothetical protein TIGR00486  39.83 
 
 
372 aa  71.6  0.00000000001  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.0226405  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1974  protein of unknown function DUF34  30 
 
 
369 aa  71.2  0.00000000002  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.13936  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0258  hypothetical protein  28.21 
 
 
246 aa  71.2  0.00000000002  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.94449  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4214  protein of unknown function DUF34  33.64 
 
 
388 aa  71.2  0.00000000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000000117062  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3096  protein of unknown function DUF34  35 
 
 
379 aa  70.5  0.00000000003  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0247011  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>