240 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Svir_06980 on replicon NC_013159
Organism: Saccharomonospora viridis DSM 43017



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013159  Svir_06980  conserved hypothetical protein TIGR00486  100 
 
 
269 aa  530  1e-150  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.625612  normal  0.0282972 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2905  protein of unknown function DUF34  57.19 
 
 
287 aa  278  6e-74  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.0994154 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5891  protein of unknown function DUF34  59.55 
 
 
279 aa  276  2e-73  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.258196 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1675  protein of unknown function DUF34  59.39 
 
 
268 aa  274  1.0000000000000001e-72  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0332721  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3357  hypothetical protein  57.99 
 
 
290 aa  270  2e-71  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1955  hypothetical protein  54.41 
 
 
278 aa  270  2.9999999999999997e-71  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3463  protein of unknown function DUF34  56.62 
 
 
273 aa  260  2e-68  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.807621  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3597  hypothetical protein  54.65 
 
 
290 aa  257  2e-67  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000159335 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6817  protein of unknown function DUF34  54.1 
 
 
278 aa  256  3e-67  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.304888  normal  0.0490159 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4817  hypothetical protein  58.56 
 
 
275 aa  253  2.0000000000000002e-66  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.203194  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2313  hypothetical protein  57.61 
 
 
286 aa  253  2.0000000000000002e-66  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.919298  normal  0.328132 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3276  protein of unknown function DUF34  50.9 
 
 
286 aa  252  4.0000000000000004e-66  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000173418  hitchhiker  0.000776053 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2085  protein of unknown function DUF34  50.18 
 
 
290 aa  250  2e-65  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.046547  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_14940  conserved hypothetical protein TIGR00486  50.88 
 
 
318 aa  239  5e-62  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.234394 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2444  hypothetical protein  45.56 
 
 
310 aa  229  5e-59  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.111119  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2193  protein of unknown function DUF34  46.69 
 
 
307 aa  228  1e-58  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000022092 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1498  protein of unknown function DUF34  46.43 
 
 
296 aa  225  7e-58  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.855921  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_16660  hypothetical protein  47.12 
 
 
294 aa  220  1.9999999999999999e-56  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.101676  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3336  protein of unknown function DUF34  50.53 
 
 
299 aa  213  3.9999999999999995e-54  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.139302  normal  0.206128 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_09470  conserved hypothetical protein TIGR00486  47.87 
 
 
309 aa  197  2.0000000000000003e-49  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5076  hypothetical protein  47.2 
 
 
318 aa  189  5e-47  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.839992  normal  0.0147635 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_12090  conserved hypothetical protein TIGR00486  42.39 
 
 
287 aa  184  1.0000000000000001e-45  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.397733  normal  0.178862 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0879  protein of unknown function DUF34  69.12 
 
 
380 aa  176  3e-43  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0618  dinuclear metal center protein, YbgI family  36.59 
 
 
294 aa  169  3e-41  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0737  hypothetical protein  33 
 
 
306 aa  157  1e-37  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.698842  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0497  hypothetical protein  42.24 
 
 
262 aa  152  8e-36  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.000000247624  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2143  protein of unknown function DUF34  60.63 
 
 
395 aa  149  4e-35  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.454619  normal 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2261  NIF3 family protein  32.13 
 
 
262 aa  145  7.0000000000000006e-34  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.586771  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1972  hypothetical protein  31.73 
 
 
262 aa  145  8.000000000000001e-34  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0200095  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2941  protein of unknown function DUF34  33.19 
 
 
259 aa  144  1e-33  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.00948562  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12259  hypothetical protein  58.02 
 
 
379 aa  144  1e-33  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3344  hypothetical protein  56.83 
 
 
379 aa  144  1e-33  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.547099  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3406  hypothetical protein  56.83 
 
 
379 aa  144  1e-33  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.172214 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3355  hypothetical protein  56.83 
 
 
379 aa  144  1e-33  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.900045  normal  0.361114 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0900  hypothetical protein  56.35 
 
 
393 aa  142  6e-33  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  decreased coverage  0.00277153  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0544  protein of unknown function DUF34  30.57 
 
 
264 aa  140  1.9999999999999998e-32  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.220535  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0771  hypothetical protein  30.89 
 
 
261 aa  139  4.999999999999999e-32  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.149762  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2712  protein of unknown function DUF34  61.16 
 
 
373 aa  137  2e-31  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.163591  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3096  protein of unknown function DUF34  60.32 
 
 
379 aa  135  5e-31  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0247011  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2890  hypothetical protein  56.39 
 
 
373 aa  133  3e-30  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.111198  normal 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0747  hypothetical protein  31.01 
 
 
274 aa  131  9e-30  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3620  hypothetical protein  52.63 
 
 
374 aa  131  1.0000000000000001e-29  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.381663  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1210  hypothetical protein  32.96 
 
 
279 aa  128  1.0000000000000001e-28  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.571993 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1828  protein of unknown function DUF34  50.97 
 
 
384 aa  128  1.0000000000000001e-28  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  hitchhiker  0.00918722  normal  0.0357547 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2013  hypothetical protein  51.82 
 
 
377 aa  127  2.0000000000000002e-28  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.124677  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1111  protein of unknown function DUF34  26.8 
 
 
255 aa  127  2.0000000000000002e-28  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1133  protein of unknown function DUF34  29.75 
 
 
256 aa  126  4.0000000000000003e-28  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.000108925  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1436  hypothetical protein  53.54 
 
 
346 aa  125  1e-27  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.14453  normal  0.0780457 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0258  hypothetical protein  33.72 
 
 
246 aa  124  2e-27  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.94449  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3818  hypothetical protein  30.83 
 
 
263 aa  119  3.9999999999999996e-26  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.863222  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4876  hypothetical protein  30.47 
 
 
263 aa  116  5e-25  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.276153  hitchhiker  0.00000161362 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1110  hypothetical protein  27.74 
 
 
265 aa  116  5e-25  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  0.562425  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2459  hypothetical protein  41.73 
 
 
371 aa  113  3e-24  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4311  conserved hypothetical protein TIGR00486  38.21 
 
 
373 aa  109  6e-23  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.3364399999999999e-45 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4191  hypothetical protein  38.21 
 
 
373 aa  109  6e-23  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.000743156  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4029  NIF3-like protein  38.21 
 
 
373 aa  108  6e-23  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00007027  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4512  hypothetical protein  38.21 
 
 
373 aa  109  6e-23  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.000424182  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4423  conserved hypothetical protein TIGR00486  38.21 
 
 
373 aa  108  6e-23  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000000184902  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4039  NIF3-like protein  38.21 
 
 
373 aa  108  7.000000000000001e-23  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0149626  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4369  hypothetical protein  38.21 
 
 
373 aa  108  1e-22  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00198592  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4406  conserved hypothetical protein TIGR00486  38.21 
 
 
373 aa  107  2e-22  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00277064  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0830  hypothetical protein TIGR00486  39.02 
 
 
373 aa  107  2e-22  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000000172023  hitchhiker  1.68837e-16 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0892  hypothetical protein  37.7 
 
 
368 aa  107  2e-22  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0194369  n/a   
 
 
-
 
NC_009043  PICST_71247  predicted protein  27.27 
 
 
274 aa  106  4e-22  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.0950178  normal  0.769643 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4141  hypothetical protein  38.21 
 
 
373 aa  106  5e-22  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  unclonable  0.000000770541  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1174  hypothetical protein  28.63 
 
 
257 aa  105  6e-22  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.171309  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2677  hypothetical protein  40.48 
 
 
374 aa  105  7e-22  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3016  hypothetical protein  37.4 
 
 
373 aa  102  6e-21  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.097716  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG2043  hypothetical protein  37.5 
 
 
364 aa  102  8e-21  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000126917 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0014  hypothetical protein  29.44 
 
 
249 aa  101  2e-20  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.0039713  normal  0.167021 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1974  protein of unknown function DUF34  37.87 
 
 
369 aa  100  3e-20  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.13936  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0626  hypothetical protein  42.64 
 
 
370 aa  99.4  5e-20  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.743702  normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1619  protein of unknown function DUF34  33.61 
 
 
366 aa  99  8e-20  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.15807  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0683  protein of unknown function DUF34  37.4 
 
 
388 aa  99  8e-20  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0774  protein of unknown function DUF34  32.52 
 
 
255 aa  98.6  1e-19  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.245788  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1202  hypothetical protein  27.06 
 
 
262 aa  96.7  3e-19  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3123  protein of unknown function DUF34  34.55 
 
 
366 aa  95.9  6e-19  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3302  hypothetical protein  36.59 
 
 
377 aa  95.9  6e-19  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.53977  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0478  protein of unknown function DUF34  39.84 
 
 
372 aa  95.5  8e-19  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.763164  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1250  protein of unknown function DUF34  27.78 
 
 
264 aa  95.5  8e-19  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1654  protein of unknown function DUF34  28.45 
 
 
239 aa  95.1  9e-19  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  hitchhiker  0.0000685519  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0399  hypothetical protein  37.4 
 
 
372 aa  94.4  2e-18  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.399804  normal 
 
 
-
 
NC_008532  STER_1227  hypothetical protein  27.73 
 
 
262 aa  94  2e-18  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1841  protein of unknown function DUF34  39.16 
 
 
381 aa  93.6  3e-18  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0025  protein of unknown function DUF34  33.86 
 
 
365 aa  92.4  6e-18  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.459063  normal  0.55748 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0707  hypothetical protein  24.89 
 
 
242 aa  92.8  6e-18  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1805  hypothetical protein  29.7 
 
 
367 aa  92.4  8e-18  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0668481  normal  0.832459 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2410  protein of unknown function DUF34  37.4 
 
 
373 aa  92.4  8e-18  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0245658  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1317  hypothetical protein  36.52 
 
 
371 aa  92  9e-18  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00297001  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3988  hypothetical protein  37.4 
 
 
372 aa  91.7  1e-17  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2674  protein of unknown function DUF34  37.1 
 
 
369 aa  90.9  2e-17  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0495  protein of unknown function DUF34  38.21 
 
 
372 aa  91.3  2e-17  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.0420348 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4214  protein of unknown function DUF34  41.12 
 
 
388 aa  90.9  2e-17  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000000117062  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1542  protein of unknown function DUF34  35.71 
 
 
365 aa  90.5  3e-17  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.0986735  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0646  hypothetical protein  31.54 
 
 
371 aa  90.1  4e-17  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  decreased coverage  0.0000133352  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1046  hypothetical protein  26.15 
 
 
240 aa  89.7  4e-17  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0444  hypothetical protein  23.55 
 
 
240 aa  89  8e-17  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.427722  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3085  hypothetical protein  35.94 
 
 
375 aa  88.6  1e-16  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_12390  conserved hypothetical protein TIGR00486  36.29 
 
 
372 aa  88.2  1e-16  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.0226405  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3034  protein of unknown function DUF34  38.02 
 
 
373 aa  87.8  2e-16  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.849304  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>