208 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ccur_06950 on replicon NC_013170
Organism: Cryptobacterium curtum DSM 15641



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013170  Ccur_06950  hypothetical protein  100 
 
 		 277 aa  557  1e-158  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.112366  normal  0.651716 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1349  protein of unknown function DUF34  58.52 
 
 		 301 aa  308  5e-83  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.0116361  normal  0.661968 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_09950  hypothetical protein  52.4 
 
 		 291 aa  250  2e-65  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  hitchhiker  0.000349861  hitchhiker  0.00000215477 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0497  hypothetical protein  33.87 
 
 		 262 aa  105  7e-22  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.000000247624  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0805  hypothetical protein  26.42 
 
 		 241 aa  93.2  4e-18  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.708368  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2261  NIF3 family protein  26.34 
 
 		 262 aa  92.4  7e-18  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.586771  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1972  hypothetical protein  25.89 
 
 		 262 aa  92.4  7e-18  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0200095  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0728  hypothetical protein  26.42 
 
 		 241 aa  92.4  7e-18  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.0727321  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1046  hypothetical protein  25.7 
 
 		 240 aa  89.4  6e-17  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2085  protein of unknown function DUF34  32.07 
 
 		 290 aa  89.4  7e-17  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.046547  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2444  hypothetical protein  31.05 
 
 		 310 aa  88.6  1e-16  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.111119  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1301  hypothetical protein  25.99 
 
 		 241 aa  87  3e-16  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0774  protein of unknown function DUF34  31.78 
 
 		 255 aa  85.9  7e-16  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.245788  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1133  protein of unknown function DUF34  23.92 
 
 		 256 aa  85.9  7e-16  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.000108925  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1001  conserved hypothetical protein (NIF3 domain protein)  24.49 
 
 		 241 aa  84.7  0.000000000000001  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.561476  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1675  protein of unknown function DUF34  30.9 
 
 		 268 aa  85.1  0.000000000000001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0332721  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1955  hypothetical protein  27.82 
 
 		 278 aa  83.6  0.000000000000004  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1250  protein of unknown function DUF34  29.44 
 
 		 264 aa  83.2  0.000000000000004  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2193  protein of unknown function DUF34  31.15 
 
 		 307 aa  82.8  0.000000000000005  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000022092 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0285  hypothetical protein  22.73 
 
 		 240 aa  82.4  0.000000000000007  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  unclonable  0.000000517518  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0618  dinuclear metal center protein, YbgI family  30.09 
 
 		 294 aa  80.5  0.00000000000003  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1654  protein of unknown function DUF34  25.7 
 
 		 239 aa  80.1  0.00000000000004  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  hitchhiker  0.0000685519  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1438  hypothetical protein  22.67 
 
 		 240 aa  79.3  0.00000000000007  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.127976  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1210  hypothetical protein  29.96 
 
 		 279 aa  79.3  0.00000000000007  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.571993 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3276  protein of unknown function DUF34  29.41 
 
 		 286 aa  78.6  0.00000000000009  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000173418  hitchhiker  0.000776053 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0544  protein of unknown function DUF34  26.36 
 
 		 264 aa  78.6  0.0000000000001  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.220535  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1174  hypothetical protein  29.34 
 
 		 257 aa  78.2  0.0000000000001  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.171309  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3597  hypothetical protein  27.64 
 
 		 290 aa  78.2  0.0000000000001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000159335 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0747  hypothetical protein  28.36 
 
 		 274 aa  77  0.0000000000003  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2677  hypothetical protein  36.61 
 
 		 374 aa  76.3  0.0000000000005  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0444  hypothetical protein  22 
 
 		 240 aa  75.5  0.0000000000008  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.427722  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4817  hypothetical protein  28.88 
 
 		 275 aa  73.6  0.000000000003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.203194  normal  1 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0707  hypothetical protein  23.83 
 
 		 242 aa  73.6  0.000000000003  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3357  hypothetical protein  26.91 
 
 		 290 aa  73.2  0.000000000004  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1498  protein of unknown function DUF34  28.67 
 
 		 296 aa  72.8  0.000000000005  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.855921  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2905  protein of unknown function DUF34  28.69 
 
 		 287 aa  73.2  0.000000000005  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.0994154 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5076  hypothetical protein  32.05 
 
 		 318 aa  69.7  0.00000000005  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.839992  normal  0.0147635 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2941  protein of unknown function DUF34  23.91 
 
 		 259 aa  69.7  0.00000000005  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.00948562  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0478  protein of unknown function DUF34  37.5 
 
 		 372 aa  69.7  0.00000000005  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.763164  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1125  hypothetical protein  30 
 
 		 366 aa  69.3  0.00000000006  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  hitchhiker  0.00107465  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5891  protein of unknown function DUF34  29.22 
 
 		 279 aa  69.3  0.00000000006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.258196 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3463  protein of unknown function DUF34  30.71 
 
 		 273 aa  69.3  0.00000000007  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.807621  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_06980  conserved hypothetical protein TIGR00486  27.51 
 
 		 269 aa  68.2  0.0000000001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.625612  normal  0.0282972 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_14940  conserved hypothetical protein TIGR00486  31.36 
 
 		 318 aa  68.2  0.0000000001  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.234394 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3336  protein of unknown function DUF34  30.56 
 
 		 299 aa  68.2  0.0000000001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.139302  normal  0.206128 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3085  hypothetical protein  41.76 
 
 		 375 aa  67.4  0.0000000002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2313  hypothetical protein  28.79 
 
 		 286 aa  67.4  0.0000000002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.919298  normal  0.328132 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1436  hypothetical protein  41.86 
 
 		 346 aa  66.2  0.0000000005  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.14453  normal  0.0780457 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1617  hypothetical protein  34.19 
 
 		 366 aa  66.2  0.0000000006  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.00640299  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1651  hypothetical protein  34.19 
 
 		 366 aa  66.2  0.0000000006  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.0212562  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0900  hypothetical protein  31.88 
 
 		 393 aa  65.5  0.0000000008  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  decreased coverage  0.00277153  normal  1 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1111  protein of unknown function DUF34  22.52 
 
 		 255 aa  65.5  0.0000000009  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1202  hypothetical protein  26.64 
 
 		 262 aa  65.1  0.000000001  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011374  UUR10_0358  NIF3 family protein  22.85 
 
 		 262 aa  64.7  0.000000001  Ureaplasma urealyticum serovar 10 str. ATCC 33699  Bacteria  normal  0.0554308  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4214  protein of unknown function DUF34  34.21 
 
 		 388 aa  65.1  0.000000001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000000117062  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1841  protein of unknown function DUF34  33.55 
 
 		 381 aa  65.1  0.000000001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1110  hypothetical protein  24.26 
 
 		 265 aa  65.5  0.000000001  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  0.562425  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_16660  hypothetical protein  28.91 
 
 		 294 aa  65.1  0.000000001  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.101676  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3302  hypothetical protein  33.33 
 
 		 377 aa  65.5  0.000000001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.53977  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0495  protein of unknown function DUF34  34.82 
 
 		 372 aa  63.9  0.000000003  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.0420348 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0771  hypothetical protein  25 
 
 		 261 aa  63.2  0.000000004  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.149762  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6817  protein of unknown function DUF34  27.16 
 
 		 278 aa  63.2  0.000000005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.304888  normal  0.0490159 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1317  hypothetical protein  31.85 
 
 		 371 aa  62.8  0.000000006  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00297001  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2143  protein of unknown function DUF34  36.8 
 
 		 395 aa  61.2  0.00000002  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.454619  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0879  protein of unknown function DUF34  33.58 
 
 		 380 aa  58.9  0.00000009  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0025  protein of unknown function DUF34  33.33 
 
 		 365 aa  58.9  0.00000009  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.459063  normal  0.55748 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2621  hypothetical protein  25.21 
 
 		 250 aa  58.5  0.0000001  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2248  hypothetical protein  25.41 
 
 		 260 aa  58.5  0.0000001  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.0000952152  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0683  protein of unknown function DUF34  33.33 
 
 		 388 aa  58.5  0.0000001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0399  hypothetical protein  33.67 
 
 		 372 aa  57.8  0.0000002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.399804  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0646  hypothetical protein  31.01 
 
 		 371 aa  57.8  0.0000002  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  decreased coverage  0.0000133352  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1914  hypothetical protein  23.43 
 
 		 250 aa  57.8  0.0000002  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.523763  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1758  hypothetical protein  23.43 
 
 		 250 aa  57  0.0000003  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.0000958056  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0892  hypothetical protein  28 
 
 		 368 aa  57.4  0.0000003  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0194369  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3123  protein of unknown function DUF34  38.95 
 
 		 366 aa  57  0.0000003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0737  hypothetical protein  25.45 
 
 		 306 aa  57  0.0000003  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.698842  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1805  hypothetical protein  29.13 
 
 		 367 aa  56.6  0.0000004  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0668481  normal  0.832459 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0272  hypothetical protein  28.23 
 
 		 240 aa  56.6  0.0000004  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.492369  normal  0.547542 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0014  hypothetical protein  26.32 
 
 		 249 aa  56.6  0.0000005  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.0039713  normal  0.167021 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2150  hypothetical protein  33.02 
 
 		 373 aa  56.2  0.0000006  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1892  hypothetical protein  22.59 
 
 		 250 aa  55.8  0.0000007  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.339977  hitchhiker  0.0000115783 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4369  hypothetical protein  27.56 
 
 		 373 aa  55.8  0.0000008  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00198592  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1653  hypothetical protein  23.85 
 
 		 250 aa  55.8  0.0000008  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.00000959566  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3988  hypothetical protein  31.48 
 
 		 372 aa  55.8  0.0000008  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0830  hypothetical protein TIGR00486  27.56 
 
 		 373 aa  55.5  0.0000009  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000000172023  hitchhiker  1.68837e-16 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4423  conserved hypothetical protein TIGR00486  27.56 
 
 		 373 aa  55.5  0.0000009  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000000184902  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4311  conserved hypothetical protein TIGR00486  27.56 
 
 		 373 aa  55.5  0.000001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.3364399999999999e-45 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4191  hypothetical protein  27.56 
 
 		 373 aa  55.5  0.000001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.000743156  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4029  NIF3-like protein  27.56 
 
 		 373 aa  55.5  0.000001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00007027  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4039  NIF3-like protein  26.77 
 
 		 373 aa  55.1  0.000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0149626  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4512  hypothetical protein  27.56 
 
 		 373 aa  55.5  0.000001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.000424182  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_12090  conserved hypothetical protein TIGR00486  26.41 
 
 		 287 aa  55.1  0.000001  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.397733  normal  0.178862 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1728  hypothetical protein  23.85 
 
 		 250 aa  55.1  0.000001  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.00000970699  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0541  protein of unknown function DUF34  34.23 
 
 		 324 aa  54.7  0.000001  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4406  conserved hypothetical protein TIGR00486  27.56 
 
 		 373 aa  55.1  0.000001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00277064  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2712  protein of unknown function DUF34  31.3 
 
 		 373 aa  54.3  0.000002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.163591  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1217  protein of unknown function DUF34  29.89 
 
 		 373 aa  54.7  0.000002  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.00000145347  hitchhiker  0.00320087 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0427  hypothetical protein  25.23 
 
 		 369 aa  54.7  0.000002  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.964044 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3538  hypothetical protein  25.64 
 
 		 248 aa  53.5  0.000003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.416608 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3016  hypothetical protein  29.81 
 
 		 373 aa  53.9  0.000003  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.097716  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>