203 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dret_0541 on replicon NC_013223
Organism: Desulfohalobium retbaense DSM 5692



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013223  Dret_0541  protein of unknown function DUF34  100 
 
 		 324 aa  662    Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1948  protein of unknown function DUF34  43.17 
 
 		 319 aa  251  2e-65  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1623  hypothetical protein  39.38 
 
 		 336 aa  228  8e-59  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.820814  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0259  protein of unknown function DUF34  40.3 
 
 		 344 aa  208  1e-52  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00852119 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1729  hypothetical protein  35.87 
 
 		 330 aa  187  3e-46  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1250  protein of unknown function DUF34  35.74 
 
 		 264 aa  177  3e-43  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0646  hypothetical protein  27.98 
 
 		 371 aa  117  3e-25  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  decreased coverage  0.0000133352  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1317  hypothetical protein  28 
 
 		 371 aa  116  3.9999999999999997e-25  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00297001  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3302  hypothetical protein  28.94 
 
 		 377 aa  114  2.0000000000000002e-24  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.53977  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0478  protein of unknown function DUF34  29.8 
 
 		 372 aa  113  4.0000000000000004e-24  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.763164  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0161  protein of unknown function DUF34  28.2 
 
 		 373 aa  112  1.0000000000000001e-23  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4141  hypothetical protein  28.31 
 
 		 373 aa  111  1.0000000000000001e-23  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  unclonable  0.000000770541  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2459  hypothetical protein  27.32 
 
 		 371 aa  111  1.0000000000000001e-23  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3085  hypothetical protein  29.11 
 
 		 375 aa  111  2.0000000000000002e-23  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0683  protein of unknown function DUF34  27.63 
 
 		 388 aa  111  2.0000000000000002e-23  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0830  hypothetical protein TIGR00486  27.04 
 
 		 373 aa  110  3e-23  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000000172023  hitchhiker  1.68837e-16 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4191  hypothetical protein  26.88 
 
 		 373 aa  110  4.0000000000000004e-23  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.000743156  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4512  hypothetical protein  26.88 
 
 		 373 aa  110  4.0000000000000004e-23  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.000424182  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4311  conserved hypothetical protein TIGR00486  26.88 
 
 		 373 aa  110  5e-23  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.3364399999999999e-45 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4039  NIF3-like protein  26.88 
 
 		 373 aa  109  6e-23  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0149626  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4369  hypothetical protein  26.67 
 
 		 373 aa  108  9.000000000000001e-23  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00198592  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4406  conserved hypothetical protein TIGR00486  27.04 
 
 		 373 aa  108  9.000000000000001e-23  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00277064  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1125  hypothetical protein  24.71 
 
 		 366 aa  108  1e-22  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  hitchhiker  0.00107465  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4423  conserved hypothetical protein TIGR00486  26.67 
 
 		 373 aa  108  1e-22  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000000184902  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0495  protein of unknown function DUF34  28.65 
 
 		 372 aa  108  1e-22  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.0420348 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4029  NIF3-like protein  26.01 
 
 		 373 aa  107  2e-22  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00007027  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2150  hypothetical protein  28.37 
 
 		 373 aa  107  3e-22  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3016  hypothetical protein  27.2 
 
 		 373 aa  105  9e-22  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.097716  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2677  hypothetical protein  29.97 
 
 		 374 aa  105  1e-21  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2410  protein of unknown function DUF34  28.05 
 
 		 373 aa  105  1e-21  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0245658  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1542  protein of unknown function DUF34  25.14 
 
 		 365 aa  103  3e-21  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.0986735  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1841  protein of unknown function DUF34  27.95 
 
 		 381 aa  103  4e-21  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3988  hypothetical protein  27.79 
 
 		 372 aa  103  4e-21  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0399  hypothetical protein  27.37 
 
 		 372 aa  102  6e-21  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.399804  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0892  hypothetical protein  25.21 
 
 		 368 aa  98.6  1e-19  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0194369  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6896  protein of unknown function DUF34  24.57 
 
 		 364 aa  97.1  4e-19  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0175851  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1210  hypothetical protein  24.29 
 
 		 279 aa  94.4  2e-18  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.571993 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1805  hypothetical protein  23.63 
 
 		 367 aa  94  3e-18  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0668481  normal  0.832459 
 
 
-
 
NC_002950  PG2043  hypothetical protein  26.81 
 
 		 364 aa  93.6  4e-18  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000126917 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1617  hypothetical protein  24.05 
 
 		 366 aa  93.6  4e-18  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.00640299  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1651  hypothetical protein  24.05 
 
 		 366 aa  93.6  4e-18  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.0212562  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0747  hypothetical protein  27.04 
 
 		 274 aa  92.8  7e-18  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0025  protein of unknown function DUF34  22.47 
 
 		 365 aa  92.8  8e-18  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.459063  normal  0.55748 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0900  hypothetical protein  27.07 
 
 		 393 aa  89.4  9e-17  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  decreased coverage  0.00277153  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1974  protein of unknown function DUF34  27.09 
 
 		 369 aa  87.8  2e-16  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.13936  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_07841  hypothetical protein  23.74 
 
 		 364 aa  88.2  2e-16  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.438332  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3034  protein of unknown function DUF34  28.28 
 
 		 373 aa  87.4  3e-16  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.849304  normal  1 
 
 
-
 
NC_004116  SAG1202  hypothetical protein  25.26 
 
 		 262 aa  86.7  5e-16  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0879  protein of unknown function DUF34  25.53 
 
 		 380 aa  86.7  5e-16  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2261  NIF3 family protein  23.88 
 
 		 262 aa  84  0.000000000000004  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.586771  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1972  hypothetical protein  23.88 
 
 		 262 aa  83.6  0.000000000000004  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0200095  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3276  protein of unknown function DUF34  31.31 
 
 		 286 aa  82.8  0.000000000000008  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000173418  hitchhiker  0.000776053 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1217  protein of unknown function DUF34  35.29 
 
 		 373 aa  81.6  0.00000000000002  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.00000145347  hitchhiker  0.00320087 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2905  protein of unknown function DUF34  27.51 
 
 		 287 aa  80.9  0.00000000000003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.0994154 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3123  protein of unknown function DUF34  24.72 
 
 		 366 aa  80.9  0.00000000000003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2674  protein of unknown function DUF34  25.07 
 
 		 369 aa  80.5  0.00000000000004  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0427  hypothetical protein  23.86 
 
 		 369 aa  80.5  0.00000000000004  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.964044 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1498  protein of unknown function DUF34  27.1 
 
 		 296 aa  79.3  0.00000000000008  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.855921  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0233  hypothetical protein  21.55 
 
 		 364 aa  77.8  0.0000000000003  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.737243  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5147  protein of unknown function DUF34  22.8 
 
 		 366 aa  77  0.0000000000004  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.660499  normal  1 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1110  hypothetical protein  23.84 
 
 		 265 aa  77  0.0000000000004  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  0.562425  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2085  protein of unknown function DUF34  26.37 
 
 		 290 aa  77  0.0000000000004  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.046547  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1174  hypothetical protein  28.48 
 
 		 257 aa  75.1  0.000000000002  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.171309  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0626  hypothetical protein  35.34 
 
 		 370 aa  74.3  0.000000000003  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.743702  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4214  protein of unknown function DUF34  25.14 
 
 		 388 aa  73.6  0.000000000004  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000000117062  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1619  protein of unknown function DUF34  29.27 
 
 		 366 aa  73.6  0.000000000005  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.15807  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3096  protein of unknown function DUF34  26.35 
 
 		 379 aa  73.6  0.000000000005  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0247011  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0497  hypothetical protein  36.3 
 
 		 262 aa  72.4  0.00000000001  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.000000247624  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_12390  conserved hypothetical protein TIGR00486  32.2 
 
 		 372 aa  69.7  0.00000000007  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.0226405  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_14940  conserved hypothetical protein TIGR00486  33.9 
 
 		 318 aa  67.8  0.0000000002  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.234394 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_06980  conserved hypothetical protein TIGR00486  30.88 
 
 		 269 aa  68.6  0.0000000002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.625612  normal  0.0282972 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2403  hypothetical protein  24.84 
 
 		 253 aa  68.6  0.0000000002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.103164 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0771  hypothetical protein  28.19 
 
 		 261 aa  67.4  0.0000000003  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.149762  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1955  hypothetical protein  35 
 
 		 278 aa  67  0.0000000004  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2193  protein of unknown function DUF34  35.9 
 
 		 307 aa  67  0.0000000004  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000022092 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1675  protein of unknown function DUF34  30.48 
 
 		 268 aa  66.6  0.0000000006  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0332721  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2712  protein of unknown function DUF34  23.33 
 
 		 373 aa  66.2  0.0000000007  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.163591  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3463  protein of unknown function DUF34  27.21 
 
 		 273 aa  65.5  0.000000001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.807621  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2143  protein of unknown function DUF34  34.45 
 
 		 395 aa  64.3  0.000000003  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.454619  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_16660  hypothetical protein  23.19 
 
 		 294 aa  63.9  0.000000003  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.101676  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2593  hypothetical protein  37.8 
 
 		 361 aa  63.5  0.000000004  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.328565  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0774  protein of unknown function DUF34  29.37 
 
 		 255 aa  63.5  0.000000005  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.245788  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1624  hypothetical protein  29.75 
 
 		 246 aa  63.5  0.000000005  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6817  protein of unknown function DUF34  31.62 
 
 		 278 aa  63.2  0.000000006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.304888  normal  0.0490159 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2313  hypothetical protein  31.62 
 
 		 286 aa  62  0.00000001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.919298  normal  0.328132 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0037  hypothetical protein  35.2 
 
 		 245 aa  62  0.00000001  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.860871 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3597  hypothetical protein  31.82 
 
 		 290 aa  61.2  0.00000002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000159335 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1050  hypothetical protein  28.1 
 
 		 246 aa  60.5  0.00000003  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.277421  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1349  protein of unknown function DUF34  25.54 
 
 		 301 aa  60.5  0.00000004  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.0116361  normal  0.661968 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2444  hypothetical protein  29.03 
 
 		 310 aa  60.5  0.00000004  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.111119  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1828  protein of unknown function DUF34  35.43 
 
 		 384 aa  60.5  0.00000004  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  hitchhiker  0.00918722  normal  0.0357547 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0753  hypothetical protein  25.6 
 
 		 254 aa  60.5  0.00000004  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.0434961  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2941  protein of unknown function DUF34  25.4 
 
 		 259 aa  60.1  0.00000005  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.00948562  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1227  hypothetical protein  25.2 
 
 		 262 aa  60.1  0.00000005  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0014  hypothetical protein  30.58 
 
 		 249 aa  60.1  0.00000006  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.0039713  normal  0.167021 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2001  hypothetical protein  21.18 
 
 		 252 aa  59.7  0.00000007  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2208  hypothetical protein  28.46 
 
 		 259 aa  59.3  0.00000008  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.0171842  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5891  protein of unknown function DUF34  29.6 
 
 		 279 aa  59.3  0.00000008  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.258196 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2460  protein of unknown function DUF34  35.79 
 
 		 258 aa  59.3  0.00000009  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.625795 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3357  hypothetical protein  33.33 
 
 		 290 aa  59.3  0.00000009  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>