255 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pcal_0750 on replicon NC_009073
Organism: Pyrobaculum calidifontis JCM 11548



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009073  Pcal_0750  hypothetical protein  100 
 
 		 280 aa  552  1e-156  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    hitchhiker  0.000399677 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0014  hypothetical protein  34.8 
 
 		 249 aa  99  7e-20  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.0039713  normal  0.167021 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6817  protein of unknown function DUF34  33.21 
 
 		 278 aa  98.2  1e-19  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.304888  normal  0.0490159 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5016  hypothetical protein  36.41 
 
 		 252 aa  93.6  3e-18  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1972  hypothetical protein  27.13 
 
 		 262 aa  93.6  4e-18  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0200095  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_57740  hypothetical protein  35.92 
 
 		 252 aa  92.8  5e-18  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0258  hypothetical protein  29.25 
 
 		 246 aa  92.4  6e-18  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.94449  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2261  NIF3 family protein  27.13 
 
 		 262 aa  92.4  7e-18  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.586771  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5891  protein of unknown function DUF34  32.96 
 
 		 279 aa  90.5  3e-17  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.258196 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0771  putative hydrolase-oxidase  32.86 
 
 		 247 aa  89  8e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.751383 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0758  putative hydrolase-oxidase  33.18 
 
 		 247 aa  88.2  1e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0735  putative hydrolase-oxidase  33.18 
 
 		 247 aa  88.2  1e-16  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2926  protein of unknown function DUF34  33.18 
 
 		 247 aa  88.2  2e-16  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.73965  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3111  putative hydrolase-oxidase  30.73 
 
 		 247 aa  87.4  2e-16  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.758679  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0868  putative hydrolase-oxidase  33.18 
 
 		 247 aa  87.8  2e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.492247 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0819  putative hydrolase-oxidase  33.18 
 
 		 247 aa  87.8  2e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0834  putative hydrolase-oxidase  33.18 
 
 		 247 aa  87.8  2e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.529886  hitchhiker  0.00118024 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0758  putative hydrolase-oxidase  33.18 
 
 		 247 aa  88.2  2e-16  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0725  putative hydrolase-oxidase  33.18 
 
 		 247 aa  88.2  2e-16  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.80137  normal  0.44707 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0627  putative hydrolase-oxidase  33.18 
 
 		 247 aa  88.2  2e-16  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2945  putative hydrolase-oxidase  33.18 
 
 		 247 aa  88.2  2e-16  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0800  putative hydrolase-oxidase  33.18 
 
 		 247 aa  88.2  2e-16  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0575847  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1515  hypothetical protein  31.84 
 
 		 236 aa  87.8  2e-16  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00670  conserved metal-binding protein  32.72 
 
 		 247 aa  86.7  4e-16  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00659  hypothetical protein  32.72 
 
 		 247 aa  86.7  4e-16  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1225  putative hydrolase-oxidase  30.54 
 
 		 247 aa  86.3  6e-16  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1675  protein of unknown function DUF34  31.89 
 
 		 268 aa  85.5  8e-16  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0332721  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1213  putative hydrolase-oxidase  32.84 
 
 		 258 aa  85.5  8e-16  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.522033  normal  0.0315512 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1254  putative hydrolase-oxidase  33.33 
 
 		 247 aa  84.7  0.000000000000002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.190885  normal  0.799705 
 
 
-
 
NC_006369  lpl0879  hypothetical protein  30.58 
 
 		 252 aa  84.3  0.000000000000002  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_14940  conserved hypothetical protein TIGR00486  34.89 
 
 		 318 aa  84  0.000000000000003  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.234394 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0910  hypothetical protein  30.1 
 
 		 252 aa  84  0.000000000000003  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4547  hypothetical protein  36.23 
 
 		 252 aa  83.6  0.000000000000003  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0037  hypothetical protein  28.33 
 
 		 245 aa  82.8  0.000000000000005  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.860871 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3597  hypothetical protein  32.25 
 
 		 290 aa  82.4  0.000000000000008  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000159335 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0909  hypothetical protein  35.27 
 
 		 252 aa  82  0.000000000000009  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.384195  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0889  hypothetical protein  34.95 
 
 		 252 aa  81.3  0.00000000000001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3357  hypothetical protein  30.28 
 
 		 290 aa  82  0.00000000000001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4423  hypothetical protein  36.23 
 
 		 252 aa  82  0.00000000000001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.348854 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2109  hypothetical protein  34.51 
 
 		 252 aa  81.6  0.00000000000001  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.194665  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2313  hypothetical protein  31.52 
 
 		 286 aa  80.5  0.00000000000002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.919298  normal  0.328132 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0876  hypothetical protein  35.27 
 
 		 252 aa  80.9  0.00000000000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0358  hypothetical protein  31.34 
 
 		 248 aa  80.9  0.00000000000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.388987  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0367  hypothetical protein  31.34 
 
 		 248 aa  80.9  0.00000000000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.465671 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0753  hypothetical protein  25.69 
 
 		 254 aa  80.5  0.00000000000003  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.0434961  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1289  protein of unknown function DUF34  31.25 
 
 		 238 aa  80.5  0.00000000000003  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.146392  normal  0.550542 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1982  hypothetical protein  32.41 
 
 		 266 aa  80.5  0.00000000000003  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.963759  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0748  protein of unknown function DUF34  34.93 
 
 		 250 aa  80.5  0.00000000000003  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.0214931  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4434  hypothetical protein  34.47 
 
 		 252 aa  79.7  0.00000000000005  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  hitchhiker  0.00125483  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0419  hypothetical protein  31.34 
 
 		 248 aa  79.7  0.00000000000005  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000201589 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2667  hypothetical protein  31.34 
 
 		 248 aa  79.7  0.00000000000005  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0440  hypothetical protein  31.34 
 
 		 248 aa  79.7  0.00000000000005  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2905  protein of unknown function DUF34  30.19 
 
 		 287 aa  79.3  0.00000000000006  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.0994154 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1624  hypothetical protein  28.46 
 
 		 246 aa  79  0.00000000000007  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2699  hypothetical protein  32.08 
 
 		 284 aa  79  0.00000000000007  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0742132  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1068  hypothetical protein  28.05 
 
 		 246 aa  78.6  0.0000000000001  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1137  protein of unknown function DUF34  31.16 
 
 		 249 aa  78.6  0.0000000000001  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.43804  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1498  protein of unknown function DUF34  28.92 
 
 		 296 aa  78.6  0.0000000000001  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.855921  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3106  protein of unknown function DUF34  32.26 
 
 		 255 aa  78.6  0.0000000000001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1271  hypothetical protein  30.12 
 
 		 235 aa  78.2  0.0000000000001  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.610569  normal  0.152537 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0272  hypothetical protein  29.88 
 
 		 240 aa  78.6  0.0000000000001  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.492369  normal  0.547542 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1302  hypothetical protein  35.27 
 
 		 252 aa  77.4  0.0000000000002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1050  hypothetical protein  26.67 
 
 		 246 aa  77.8  0.0000000000002  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.277421  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2978  hypothetical protein  32.09 
 
 		 255 aa  77.4  0.0000000000002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.493869  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0663  hypothetical protein  29.26 
 
 		 251 aa  77.4  0.0000000000003  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4129  hypothetical protein  33.33 
 
 		 252 aa  76.6  0.0000000000004  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1955  hypothetical protein  30.8 
 
 		 278 aa  76.6  0.0000000000004  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1114  putative hydrolase-oxidase  29.13 
 
 		 248 aa  76.6  0.0000000000004  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.0000203365  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1165  putative hydrolase-oxidase  29.13 
 
 		 248 aa  76.6  0.0000000000004  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.0336563  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0900  hypothetical protein  42.54 
 
 		 393 aa  77  0.0000000000004  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  decreased coverage  0.00277153  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3588  putative hydrolase-oxidase  29.13 
 
 		 248 aa  76.6  0.0000000000004  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_06980  conserved hypothetical protein TIGR00486  29.55 
 
 		 269 aa  76.6  0.0000000000004  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.625612  normal  0.0282972 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0413  hypothetical protein  30.73 
 
 		 248 aa  76.3  0.0000000000005  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3545  protein of unknown function DUF34  29.82 
 
 		 248 aa  76.3  0.0000000000006  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.630294  normal  0.0213286 
 
 
-
 
NC_006348  BMA2699  hypothetical protein  32.09 
 
 		 248 aa  75.5  0.0000000000009  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.736559  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3708  NIF3 family protein  32.09 
 
 		 248 aa  75.5  0.0000000000009  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2749  NIF3 family protein  32.09 
 
 		 248 aa  75.5  0.0000000000009  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1804  NIF3 family protein  32.09 
 
 		 248 aa  75.5  0.0000000000009  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3651  NIF3 family protein  32.09 
 
 		 248 aa  75.5  0.0000000000009  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.48548  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3677  hypothetical protein  32.09 
 
 		 255 aa  75.5  0.000000000001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.392263  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3255  NIF3 family protein  32.09 
 
 		 255 aa  75.5  0.000000000001  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2403  hypothetical protein  29.82 
 
 		 253 aa  74.3  0.000000000002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.103164 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3538  hypothetical protein  31.34 
 
 		 248 aa  73.9  0.000000000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.416608 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004118  hypothetical protein  30.96 
 
 		 252 aa  74.7  0.000000000002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1203  protein of unknown function DUF34  30.4 
 
 		 259 aa  74.3  0.000000000002  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2576  protein of unknown function DUF34  31 
 
 		 255 aa  72.8  0.000000000005  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.011272  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0343  hypothetical protein  31.19 
 
 		 248 aa  72.8  0.000000000006  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.799255  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2230  hypothetical protein  30.56 
 
 		 251 aa  72.8  0.000000000006  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.0822184  normal  0.601423 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2502  hypothetical protein  31.02 
 
 		 250 aa  72.4  0.000000000007  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0497  hypothetical protein  30.8 
 
 		 262 aa  72.4  0.000000000008  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.000000247624  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1210  hypothetical protein  27.88 
 
 		 279 aa  72  0.000000000009  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.571993 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2220  protein of unknown function DUF34  31.58 
 
 		 249 aa  71.6  0.00000000001  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.010099  normal  0.392171 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3095  hypothetical protein  33.04 
 
 		 248 aa  72  0.00000000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.486394  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3370  hypothetical protein  30.17 
 
 		 248 aa  71.2  0.00000000002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3276  protein of unknown function DUF34  30.84 
 
 		 286 aa  70.9  0.00000000002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000173418  hitchhiker  0.000776053 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2193  protein of unknown function DUF34  29.08 
 
 		 307 aa  71.2  0.00000000002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000022092 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0896  hypothetical protein  26.97 
 
 		 246 aa  70.9  0.00000000002  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0544  protein of unknown function DUF34  26.46 
 
 		 264 aa  70.9  0.00000000002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.220535  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1135  protein of unknown function DUF34  29.13 
 
 		 247 aa  71.2  0.00000000002  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.573001  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2212  hypothetical protein  35.64 
 
 		 263 aa  71.2  0.00000000002  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.228589  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>