260 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mlab_0272 on replicon NC_008942
Organism: Methanocorpusculum labreanum Z



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008942  Mlab_0272  hypothetical protein  100 
 
 
240 aa  492  9.999999999999999e-139  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.492369  normal  0.547542 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0037  hypothetical protein  48.5 
 
 
245 aa  240  1e-62  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.860871 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1515  hypothetical protein  52.38 
 
 
236 aa  239  2e-62  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1289  protein of unknown function DUF34  47.5 
 
 
238 aa  226  2e-58  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.146392  normal  0.550542 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1271  hypothetical protein  47.48 
 
 
235 aa  224  7e-58  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.610569  normal  0.152537 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0014  hypothetical protein  42.73 
 
 
249 aa  175  7e-43  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.0039713  normal  0.167021 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0258  hypothetical protein  34 
 
 
246 aa  150  2e-35  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.94449  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2460  protein of unknown function DUF34  33.33 
 
 
258 aa  97.1  2e-19  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.625795 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1624  hypothetical protein  31.28 
 
 
246 aa  95.1  9e-19  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0896  hypothetical protein  28.26 
 
 
246 aa  92.4  5e-18  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0753  hypothetical protein  29 
 
 
254 aa  87.8  1e-16  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.0434961  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0747  hypothetical protein  27.31 
 
 
274 aa  87  2e-16  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1068  hypothetical protein  29.02 
 
 
246 aa  87.4  2e-16  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1050  hypothetical protein  25.65 
 
 
246 aa  85.5  6e-16  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.277421  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1317  hypothetical protein  36.59 
 
 
371 aa  85.9  6e-16  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00297001  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1498  protein of unknown function DUF34  31.13 
 
 
296 aa  85.1  9e-16  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.855921  normal 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1972  hypothetical protein  30.3 
 
 
262 aa  84.7  0.000000000000001  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0200095  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3357  hypothetical protein  27.04 
 
 
290 aa  83.6  0.000000000000003  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2261  NIF3 family protein  29 
 
 
262 aa  82.4  0.000000000000006  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.586771  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0917  protein of unknown function DUF34  33.98 
 
 
249 aa  80.1  0.00000000000003  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3708  NIF3 family protein  31.25 
 
 
248 aa  79.7  0.00000000000004  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2699  hypothetical protein  31.25 
 
 
248 aa  79.7  0.00000000000004  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.736559  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3677  hypothetical protein  31.25 
 
 
255 aa  79.3  0.00000000000004  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.392263  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3651  NIF3 family protein  31.25 
 
 
248 aa  79.7  0.00000000000004  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.48548  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2749  NIF3 family protein  31.25 
 
 
248 aa  79.7  0.00000000000004  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3255  NIF3 family protein  31.25 
 
 
255 aa  79.3  0.00000000000004  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1804  NIF3 family protein  31.25 
 
 
248 aa  79.7  0.00000000000004  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0367  hypothetical protein  30.56 
 
 
248 aa  79  0.00000000000007  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.465671 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0358  hypothetical protein  30.56 
 
 
248 aa  79  0.00000000000007  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.388987  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0840  hypothetical protein  32.21 
 
 
251 aa  78.6  0.00000000000007  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1572  hypothetical protein  31.31 
 
 
250 aa  78.6  0.00000000000009  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.000308577  normal 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0750  hypothetical protein  29.88 
 
 
280 aa  78.6  0.00000000000009  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    hitchhiker  0.000399677 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3370  hypothetical protein  30.47 
 
 
248 aa  77.4  0.0000000000002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2978  hypothetical protein  32.06 
 
 
255 aa  77.8  0.0000000000002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.493869  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1675  protein of unknown function DUF34  29.63 
 
 
268 aa  76.6  0.0000000000003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0332721  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3538  hypothetical protein  31.1 
 
 
248 aa  76.3  0.0000000000004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.416608 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0663  hypothetical protein  27.85 
 
 
251 aa  76.3  0.0000000000004  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1679  hypothetical protein  27.23 
 
 
256 aa  75.5  0.0000000000008  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00563581  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0910  hypothetical protein  31.28 
 
 
252 aa  75.1  0.0000000000009  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0879  hypothetical protein  31.43 
 
 
252 aa  74.7  0.000000000001  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0343  hypothetical protein  31.25 
 
 
248 aa  74.7  0.000000000001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.799255  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2502  hypothetical protein  31.75 
 
 
250 aa  74.7  0.000000000001  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2085  protein of unknown function DUF34  28.1 
 
 
290 aa  74.3  0.000000000001  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.046547  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2667  hypothetical protein  30.09 
 
 
248 aa  74.7  0.000000000001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0749  protein of unknown function DUF34  31.2 
 
 
254 aa  74.7  0.000000000001  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0440  hypothetical protein  30.09 
 
 
248 aa  74.7  0.000000000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0419  hypothetical protein  30.09 
 
 
248 aa  74.7  0.000000000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000201589 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2744  hypothetical protein  32.85 
 
 
248 aa  74.7  0.000000000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.265192  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0786  hypothetical protein  31.2 
 
 
254 aa  74.7  0.000000000001  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.132143 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2444  hypothetical protein  29.63 
 
 
310 aa  74.3  0.000000000002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.111119  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2313  hypothetical protein  28.03 
 
 
286 aa  73.9  0.000000000002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.919298  normal  0.328132 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01899  NIF3  34.91 
 
 
253 aa  73.2  0.000000000003  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.134254  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3106  protein of unknown function DUF34  30.77 
 
 
255 aa  73.6  0.000000000003  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0774  protein of unknown function DUF34  30.05 
 
 
255 aa  73.2  0.000000000004  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.245788  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6817  protein of unknown function DUF34  28.45 
 
 
278 aa  72.8  0.000000000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.304888  normal  0.0490159 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004118  hypothetical protein  28.38 
 
 
252 aa  72  0.000000000007  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2459  hypothetical protein  33.61 
 
 
371 aa  72  0.000000000007  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5891  protein of unknown function DUF34  28.45 
 
 
279 aa  72  0.000000000009  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.258196 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0892  hypothetical protein  30.58 
 
 
368 aa  71.6  0.000000000009  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0194369  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01348  hypothetical protein  27.54 
 
 
252 aa  71.6  0.00000000001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2403  hypothetical protein  30.38 
 
 
253 aa  71.2  0.00000000001  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal  0.103164 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2109  hypothetical protein  31.67 
 
 
252 aa  71.6  0.00000000001  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.194665  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0544  protein of unknown function DUF34  26.92 
 
 
264 aa  70.9  0.00000000002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.220535  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1982  hypothetical protein  29.6 
 
 
266 aa  70.9  0.00000000002  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.963759  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2050  hypothetical protein  30.29 
 
 
249 aa  70.9  0.00000000002  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.0000274471  normal  0.24261 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0889  hypothetical protein  30.37 
 
 
252 aa  70.9  0.00000000002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0161  protein of unknown function DUF34  33.61 
 
 
373 aa  70.1  0.00000000003  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0007  protein of unknown function DUF34  26.72 
 
 
259 aa  69.7  0.00000000004  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4547  hypothetical protein  30.05 
 
 
252 aa  69.7  0.00000000004  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1250  protein of unknown function DUF34  28.57 
 
 
264 aa  69.7  0.00000000004  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2178  hypothetical protein  27.16 
 
 
253 aa  69.3  0.00000000004  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.335063  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1302  hypothetical protein  29.11 
 
 
252 aa  69.3  0.00000000005  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4369  hypothetical protein  32.77 
 
 
373 aa  69.3  0.00000000005  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00198592  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4029  NIF3-like protein  32.77 
 
 
373 aa  69.3  0.00000000005  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00007027  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3545  protein of unknown function DUF34  26.92 
 
 
248 aa  69.3  0.00000000005  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.630294  normal  0.0213286 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3597  hypothetical protein  26.01 
 
 
290 aa  69.3  0.00000000005  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000159335 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0830  hypothetical protein TIGR00486  32.77 
 
 
373 aa  69.3  0.00000000005  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000000172023  hitchhiker  1.68837e-16 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2410  protein of unknown function DUF34  35.34 
 
 
373 aa  69.3  0.00000000005  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0245658  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4423  conserved hypothetical protein TIGR00486  32.77 
 
 
373 aa  68.9  0.00000000006  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000000184902  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4311  conserved hypothetical protein TIGR00486  32.77 
 
 
373 aa  68.9  0.00000000006  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.3364399999999999e-45 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4191  hypothetical protein  32.77 
 
 
373 aa  69.3  0.00000000006  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.000743156  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4039  NIF3-like protein  32.77 
 
 
373 aa  68.9  0.00000000006  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0149626  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0990  hypothetical protein  30.43 
 
 
246 aa  68.9  0.00000000006  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4512  hypothetical protein  32.77 
 
 
373 aa  69.3  0.00000000006  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.000424182  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2693  hypothetical protein  28.5 
 
 
250 aa  68.9  0.00000000007  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.000000722609  normal  0.114925 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4423  hypothetical protein  29.58 
 
 
252 aa  68.9  0.00000000007  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.348854 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2580  hypothetical protein  28.5 
 
 
250 aa  68.9  0.00000000007  Shewanella baltica OS195  Bacteria  unclonable  0.000000058003  normal  0.0950239 
 
 
-
 
NC_002967  TDE2208  hypothetical protein  27.23 
 
 
259 aa  68.6  0.00000000008  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.0171842  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_14940  conserved hypothetical protein TIGR00486  29.58 
 
 
318 aa  68.2  0.0000000001  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.234394 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2222  hypothetical protein  28.5 
 
 
250 aa  67.8  0.0000000001  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.00000808269  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0909  hypothetical protein  28.64 
 
 
252 aa  67.8  0.0000000001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.384195  normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2220  protein of unknown function DUF34  30.8 
 
 
249 aa  68.2  0.0000000001  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.010099  normal  0.392171 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2460  hypothetical protein  28.97 
 
 
250 aa  67.8  0.0000000001  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.000000153632  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4817  hypothetical protein  29.74 
 
 
275 aa  67.8  0.0000000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.203194  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4406  conserved hypothetical protein TIGR00486  32.77 
 
 
373 aa  68.2  0.0000000001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00277064  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1884  protein of unknown function DUF34  28.5 
 
 
250 aa  68.2  0.0000000001  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.00000303025  hitchhiker  0.00204179 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2571  hypothetical protein  27.7 
 
 
253 aa  67.4  0.0000000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2001  hypothetical protein  26.8 
 
 
252 aa  67  0.0000000002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0413  hypothetical protein  26.92 
 
 
248 aa  67.4  0.0000000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2073  hypothetical protein  27.68 
 
 
256 aa  67  0.0000000002  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>