271 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Memar_1515 on replicon NC_009051
Organism: Methanoculleus marisnigri JR1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009051  Memar_1515  hypothetical protein  100 
 
 
236 aa  471  1e-132  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1289  protein of unknown function DUF34  61.02 
 
 
238 aa  306  2.0000000000000002e-82  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.146392  normal  0.550542 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1271  hypothetical protein  58.47 
 
 
235 aa  272  3e-72  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.610569  normal  0.152537 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0037  hypothetical protein  53.74 
 
 
245 aa  253  2.0000000000000002e-66  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.860871 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0272  hypothetical protein  51.25 
 
 
240 aa  243  9.999999999999999e-64  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.492369  normal  0.547542 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0258  hypothetical protein  39.43 
 
 
246 aa  178  5.999999999999999e-44  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.94449  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0014  hypothetical protein  40.79 
 
 
249 aa  171  9e-42  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.0039713  normal  0.167021 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3357  hypothetical protein  34.68 
 
 
290 aa  96.3  3e-19  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6817  protein of unknown function DUF34  37.08 
 
 
278 aa  96.3  4e-19  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.304888  normal  0.0490159 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1498  protein of unknown function DUF34  34.62 
 
 
296 aa  94.4  1e-18  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.855921  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3597  hypothetical protein  31.98 
 
 
290 aa  92.4  5e-18  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000159335 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2460  protein of unknown function DUF34  29.67 
 
 
258 aa  88.6  9e-17  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.625795 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2444  hypothetical protein  32.92 
 
 
310 aa  88.6  9e-17  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.111119  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1675  protein of unknown function DUF34  35.37 
 
 
268 aa  87.8  1e-16  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0332721  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1955  hypothetical protein  32.4 
 
 
278 aa  87.4  2e-16  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0750  hypothetical protein  31.8 
 
 
280 aa  86.3  4e-16  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    hitchhiker  0.000399677 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2693  hypothetical protein  29.17 
 
 
250 aa  85.5  7e-16  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.000000722609  normal  0.114925 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2261  NIF3 family protein  27.97 
 
 
262 aa  84.7  0.000000000000001  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.586771  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0497  hypothetical protein  34.44 
 
 
262 aa  83.2  0.000000000000004  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.000000247624  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1972  hypothetical protein  28.7 
 
 
262 aa  83.2  0.000000000000004  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0200095  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5891  protein of unknown function DUF34  32.8 
 
 
279 aa  81.3  0.00000000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.258196 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2905  protein of unknown function DUF34  32.24 
 
 
287 aa  80.9  0.00000000000001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.0994154 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0917  protein of unknown function DUF34  33.65 
 
 
249 aa  80.5  0.00000000000002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2193  protein of unknown function DUF34  31.56 
 
 
307 aa  80.9  0.00000000000002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000022092 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1133  protein of unknown function DUF34  27.5 
 
 
256 aa  80.9  0.00000000000002  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.000108925  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2571  hypothetical protein  29.02 
 
 
253 aa  80.5  0.00000000000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_14940  conserved hypothetical protein TIGR00486  35.38 
 
 
318 aa  80.1  0.00000000000003  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.234394 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2502  hypothetical protein  30.21 
 
 
250 aa  79  0.00000000000006  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1624  hypothetical protein  27.27 
 
 
246 aa  77.8  0.0000000000001  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2109  hypothetical protein  34.47 
 
 
252 aa  78.2  0.0000000000001  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.194665  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_09470  conserved hypothetical protein TIGR00486  36.41 
 
 
309 aa  77.4  0.0000000000002  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0834  putative hydrolase-oxidase  34.43 
 
 
247 aa  77.4  0.0000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.529886  hitchhiker  0.00118024 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0819  putative hydrolase-oxidase  34.43 
 
 
247 aa  77.4  0.0000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1213  putative hydrolase-oxidase  33.04 
 
 
258 aa  77.4  0.0000000000002  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.522033  normal  0.0315512 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1317  hypothetical protein  35.96 
 
 
371 aa  77.4  0.0000000000002  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00297001  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3463  protein of unknown function DUF34  37.9 
 
 
273 aa  77.4  0.0000000000002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.807621  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0868  putative hydrolase-oxidase  34.43 
 
 
247 aa  77.4  0.0000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.492247 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0771  putative hydrolase-oxidase  34.43 
 
 
247 aa  77  0.0000000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal  0.751383 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2712  protein of unknown function DUF34  43.97 
 
 
373 aa  76.6  0.0000000000003  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.163591  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1572  hypothetical protein  30.83 
 
 
250 aa  76.6  0.0000000000003  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.000308577  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4141  hypothetical protein  29.02 
 
 
373 aa  76.3  0.0000000000004  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  unclonable  0.000000770541  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0758  putative hydrolase-oxidase  33.96 
 
 
247 aa  75.9  0.0000000000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2926  protein of unknown function DUF34  33.65 
 
 
247 aa  75.5  0.0000000000006  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.73965  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0758  putative hydrolase-oxidase  33.65 
 
 
247 aa  75.5  0.0000000000006  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0800  putative hydrolase-oxidase  33.65 
 
 
247 aa  75.5  0.0000000000006  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0575847  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1254  putative hydrolase-oxidase  33.06 
 
 
247 aa  75.5  0.0000000000006  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.190885  normal  0.799705 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0725  putative hydrolase-oxidase  33.65 
 
 
247 aa  75.5  0.0000000000006  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.80137  normal  0.44707 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2945  putative hydrolase-oxidase  33.65 
 
 
247 aa  75.5  0.0000000000006  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0627  putative hydrolase-oxidase  33.65 
 
 
247 aa  75.5  0.0000000000006  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0830  hypothetical protein TIGR00486  34.68 
 
 
373 aa  75.1  0.0000000000008  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000000172023  hitchhiker  1.68837e-16 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2220  protein of unknown function DUF34  32.39 
 
 
249 aa  75.1  0.0000000000009  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.010099  normal  0.392171 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00670  conserved metal-binding protein  33.65 
 
 
247 aa  74.7  0.000000000001  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1805  hypothetical protein  33.86 
 
 
367 aa  74.3  0.000000000001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0668481  normal  0.832459 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0663  hypothetical protein  29.11 
 
 
251 aa  74.7  0.000000000001  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1728  hypothetical protein  33.95 
 
 
250 aa  74.7  0.000000000001  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.00000970699  normal 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0747  hypothetical protein  27.76 
 
 
274 aa  75.1  0.000000000001  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00659  hypothetical protein  33.65 
 
 
247 aa  74.7  0.000000000001  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1050  hypothetical protein  25.85 
 
 
246 aa  74.7  0.000000000001  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.277421  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4423  conserved hypothetical protein TIGR00486  27.98 
 
 
373 aa  74.3  0.000000000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000000184902  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4369  hypothetical protein  27.98 
 
 
373 aa  74.3  0.000000000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00198592  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5147  protein of unknown function DUF34  26.69 
 
 
366 aa  73.9  0.000000000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.660499  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2621  hypothetical protein  31.78 
 
 
250 aa  73.6  0.000000000002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2467  hypothetical protein  31.16 
 
 
250 aa  73.6  0.000000000002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.0000000255427  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4029  NIF3-like protein  27.98 
 
 
373 aa  73.6  0.000000000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00007027  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4039  NIF3-like protein  27.98 
 
 
373 aa  73.6  0.000000000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0149626  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0896  hypothetical protein  24.26 
 
 
246 aa  73.6  0.000000000002  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2460  hypothetical protein  31.16 
 
 
250 aa  73.9  0.000000000002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.000000153632  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0735  putative hydrolase-oxidase  33.18 
 
 
247 aa  74.3  0.000000000002  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1653  hypothetical protein  33.95 
 
 
250 aa  73.9  0.000000000002  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.00000959566  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2580  hypothetical protein  30.7 
 
 
250 aa  73.6  0.000000000002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  unclonable  0.000000058003  normal  0.0950239 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1679  hypothetical protein  29.92 
 
 
256 aa  74.3  0.000000000002  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00563581  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1225  putative hydrolase-oxidase  32.11 
 
 
247 aa  73.9  0.000000000002  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4191  hypothetical protein  27.98 
 
 
373 aa  73.2  0.000000000003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.000743156  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4311  conserved hypothetical protein TIGR00486  27.98 
 
 
373 aa  73.2  0.000000000003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.3364399999999999e-45 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4512  hypothetical protein  27.98 
 
 
373 aa  73.2  0.000000000003  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.000424182  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1974  protein of unknown function DUF34  40.35 
 
 
369 aa  73.2  0.000000000003  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.13936  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1174  hypothetical protein  29.38 
 
 
257 aa  73.6  0.000000000003  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.171309  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2699  hypothetical protein  30.3 
 
 
284 aa  73.2  0.000000000003  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0742132  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4406  conserved hypothetical protein TIGR00486  33.87 
 
 
373 aa  72.8  0.000000000004  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00277064  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2410  protein of unknown function DUF34  36.36 
 
 
373 aa  73.2  0.000000000004  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0245658  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1884  protein of unknown function DUF34  30.7 
 
 
250 aa  72.8  0.000000000004  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.00000303025  hitchhiker  0.00204179 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2210  hypothetical protein  32.75 
 
 
251 aa  72.4  0.000000000005  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.266058  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3276  protein of unknown function DUF34  31.08 
 
 
286 aa  72.4  0.000000000006  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000173418  hitchhiker  0.000776053 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2222  hypothetical protein  31.63 
 
 
250 aa  72.4  0.000000000007  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.00000808269  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1758  hypothetical protein  33.02 
 
 
250 aa  72  0.000000000008  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.0000958056  normal 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3588  putative hydrolase-oxidase  31.25 
 
 
248 aa  71.6  0.000000000009  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1114  putative hydrolase-oxidase  31.25 
 
 
248 aa  71.6  0.000000000009  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.0000203365  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1165  putative hydrolase-oxidase  31.25 
 
 
248 aa  71.6  0.000000000009  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.0336563  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0840  hypothetical protein  28.27 
 
 
251 aa  71.6  0.000000000009  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0753  hypothetical protein  25.22 
 
 
254 aa  71.2  0.00000000001  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.0434961  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4434  hypothetical protein  32.17 
 
 
252 aa  70.9  0.00000000001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  hitchhiker  0.00125483  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3370  hypothetical protein  31.54 
 
 
248 aa  71.2  0.00000000001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4876  hypothetical protein  30.08 
 
 
263 aa  71.2  0.00000000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.276153  hitchhiker  0.00000161362 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1982  hypothetical protein  28.95 
 
 
266 aa  71.2  0.00000000001  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.963759  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2667  hypothetical protein  29.91 
 
 
248 aa  71.2  0.00000000001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1068  hypothetical protein  24.45 
 
 
246 aa  71.2  0.00000000001  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0419  hypothetical protein  29.91 
 
 
248 aa  71.2  0.00000000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000201589 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0440  hypothetical protein  29.91 
 
 
248 aa  71.2  0.00000000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_12090  conserved hypothetical protein TIGR00486  34.83 
 
 
287 aa  71.2  0.00000000001  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.397733  normal  0.178862 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3111  putative hydrolase-oxidase  31.01 
 
 
247 aa  70.5  0.00000000002  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.758679  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>