263 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mpal_1289 on replicon NC_011832
Organism: Methanosphaerula palustris E1-9c



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011832  Mpal_1289  protein of unknown function DUF34  100 
 
 
238 aa  483  1e-135  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.146392  normal  0.550542 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1515  hypothetical protein  61.95 
 
 
236 aa  297  8e-80  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1271  hypothetical protein  58.9 
 
 
235 aa  276  1e-73  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.610569  normal  0.152537 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0037  hypothetical protein  51.52 
 
 
245 aa  258  7e-68  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.860871 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0272  hypothetical protein  47.5 
 
 
240 aa  226  2e-58  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.492369  normal  0.547542 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0014  hypothetical protein  38.77 
 
 
249 aa  155  5.0000000000000005e-37  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.0039713  normal  0.167021 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0258  hypothetical protein  35.53 
 
 
246 aa  152  5.9999999999999996e-36  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.94449  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1498  protein of unknown function DUF34  32.82 
 
 
296 aa  103  3e-21  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.855921  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2460  protein of unknown function DUF34  29.07 
 
 
258 aa  94.4  1e-18  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.625795 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2502  hypothetical protein  31.39 
 
 
250 aa  92.8  4e-18  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0497  hypothetical protein  34.22 
 
 
262 aa  92  7e-18  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.000000247624  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2313  hypothetical protein  31.4 
 
 
286 aa  89.4  4e-17  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.919298  normal  0.328132 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1675  protein of unknown function DUF34  33.06 
 
 
268 aa  87.8  1e-16  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0332721  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1955  hypothetical protein  28.92 
 
 
278 aa  87.4  2e-16  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6817  protein of unknown function DUF34  31.56 
 
 
278 aa  87.4  2e-16  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.304888  normal  0.0490159 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1982  hypothetical protein  32.07 
 
 
266 aa  86.3  3e-16  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.963759  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2571  hypothetical protein  27.88 
 
 
253 aa  83.6  0.000000000000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0747  hypothetical protein  28.91 
 
 
274 aa  83.2  0.000000000000004  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2444  hypothetical protein  30.92 
 
 
310 aa  82  0.000000000000007  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.111119  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1317  hypothetical protein  34.17 
 
 
371 aa  82  0.000000000000008  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00297001  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0840  hypothetical protein  27.96 
 
 
251 aa  81.6  0.000000000000009  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_14940  conserved hypothetical protein TIGR00486  34.78 
 
 
318 aa  81.6  0.000000000000009  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.234394 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0753  hypothetical protein  27.73 
 
 
254 aa  81.3  0.00000000000001  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.0434961  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3357  hypothetical protein  27.87 
 
 
290 aa  81.6  0.00000000000001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1068  hypothetical protein  25.21 
 
 
246 aa  80.5  0.00000000000002  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2905  protein of unknown function DUF34  28.21 
 
 
287 aa  80.5  0.00000000000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.0994154 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1624  hypothetical protein  26.89 
 
 
246 aa  80.9  0.00000000000002  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5891  protein of unknown function DUF34  29.44 
 
 
279 aa  80.1  0.00000000000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.258196 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2210  hypothetical protein  31.62 
 
 
251 aa  80.1  0.00000000000003  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.266058  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3597  hypothetical protein  28.63 
 
 
290 aa  80.1  0.00000000000003  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000159335 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2109  hypothetical protein  31.09 
 
 
252 aa  80.1  0.00000000000003  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.194665  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2926  protein of unknown function DUF34  30 
 
 
247 aa  79.3  0.00000000000004  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.73965  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2945  putative hydrolase-oxidase  30 
 
 
247 aa  79.3  0.00000000000004  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0627  putative hydrolase-oxidase  30 
 
 
247 aa  79.3  0.00000000000004  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0800  putative hydrolase-oxidase  30 
 
 
247 aa  79.3  0.00000000000004  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0575847  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0758  putative hydrolase-oxidase  30 
 
 
247 aa  79.3  0.00000000000004  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0725  putative hydrolase-oxidase  30 
 
 
247 aa  79.3  0.00000000000004  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.80137  normal  0.44707 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0735  putative hydrolase-oxidase  30 
 
 
247 aa  79.7  0.00000000000004  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0892  hypothetical protein  35.77 
 
 
368 aa  79.7  0.00000000000004  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0194369  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3106  protein of unknown function DUF34  32.06 
 
 
255 aa  79.3  0.00000000000005  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1213  putative hydrolase-oxidase  29.82 
 
 
258 aa  79.3  0.00000000000005  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.522033  normal  0.0315512 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1972  hypothetical protein  28.02 
 
 
262 aa  79.3  0.00000000000005  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0200095  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4547  hypothetical protein  30.99 
 
 
252 aa  79  0.00000000000007  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1203  protein of unknown function DUF34  28.16 
 
 
259 aa  78.6  0.00000000000007  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00670  conserved metal-binding protein  30 
 
 
247 aa  78.2  0.00000000000009  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1302  hypothetical protein  30.52 
 
 
252 aa  78.2  0.00000000000009  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00659  hypothetical protein  30 
 
 
247 aa  78.2  0.00000000000009  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2261  NIF3 family protein  28.02 
 
 
262 aa  78.6  0.00000000000009  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.586771  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3276  protein of unknown function DUF34  30.92 
 
 
286 aa  78.2  0.0000000000001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000173418  hitchhiker  0.000776053 
 
 
-
 
NC_006369  lpl0879  hypothetical protein  27.75 
 
 
252 aa  78.2  0.0000000000001  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4876  hypothetical protein  28.96 
 
 
263 aa  78.2  0.0000000000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.276153  hitchhiker  0.00000161362 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0750  hypothetical protein  31.2 
 
 
280 aa  78.2  0.0000000000001  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    hitchhiker  0.000399677 
 
 
-
 
NC_006348  BMA2699  hypothetical protein  29.05 
 
 
248 aa  77  0.0000000000002  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.736559  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4129  hypothetical protein  31.46 
 
 
252 aa  77  0.0000000000002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3677  hypothetical protein  29.05 
 
 
255 aa  77.4  0.0000000000002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.392263  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2749  NIF3 family protein  29.05 
 
 
248 aa  77  0.0000000000002  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2978  hypothetical protein  26.96 
 
 
255 aa  77.4  0.0000000000002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.493869  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0868  putative hydrolase-oxidase  29.38 
 
 
247 aa  77.4  0.0000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.492247 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1250  protein of unknown function DUF34  28.69 
 
 
264 aa  77  0.0000000000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0834  putative hydrolase-oxidase  29.38 
 
 
247 aa  77.4  0.0000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.529886  hitchhiker  0.00118024 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0771  putative hydrolase-oxidase  29.38 
 
 
247 aa  77  0.0000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal  0.751383 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0758  putative hydrolase-oxidase  29.38 
 
 
247 aa  77.4  0.0000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0819  putative hydrolase-oxidase  29.38 
 
 
247 aa  77.4  0.0000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3255  NIF3 family protein  29.05 
 
 
255 aa  77.4  0.0000000000002  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1804  NIF3 family protein  29.05 
 
 
248 aa  77  0.0000000000002  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3651  NIF3 family protein  29.05 
 
 
248 aa  77  0.0000000000002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.48548  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3708  NIF3 family protein  29.05 
 
 
248 aa  77  0.0000000000002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0544  protein of unknown function DUF34  27.34 
 
 
264 aa  76.6  0.0000000000003  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.220535  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2085  protein of unknown function DUF34  27.5 
 
 
290 aa  77  0.0000000000003  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.046547  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4817  hypothetical protein  31.03 
 
 
275 aa  76.3  0.0000000000004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.203194  normal 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0910  hypothetical protein  27.75 
 
 
252 aa  76.3  0.0000000000004  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3463  protein of unknown function DUF34  33.75 
 
 
273 aa  76.3  0.0000000000004  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.807621  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0896  hypothetical protein  25 
 
 
246 aa  75.5  0.0000000000008  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4434  hypothetical protein  30.99 
 
 
252 aa  75.1  0.0000000000009  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  hitchhiker  0.00125483  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0990  hypothetical protein  28.64 
 
 
246 aa  75.1  0.0000000000009  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2699  hypothetical protein  26.2 
 
 
284 aa  75.1  0.0000000000009  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0742132  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_12090  conserved hypothetical protein TIGR00486  29.03 
 
 
287 aa  75.1  0.000000000001  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.397733  normal  0.178862 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4423  hypothetical protein  30.52 
 
 
252 aa  75.1  0.000000000001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.348854 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2693  hypothetical protein  28.57 
 
 
250 aa  74.3  0.000000000001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.000000722609  normal  0.114925 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0367  hypothetical protein  28.77 
 
 
248 aa  73.9  0.000000000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.465671 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2193  protein of unknown function DUF34  30 
 
 
307 aa  74.3  0.000000000002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000022092 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1050  hypothetical protein  23.73 
 
 
246 aa  73.9  0.000000000002  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.277421  normal 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01348  hypothetical protein  28.17 
 
 
252 aa  74.3  0.000000000002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0358  hypothetical protein  28.77 
 
 
248 aa  73.9  0.000000000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.388987  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1165  putative hydrolase-oxidase  27.53 
 
 
248 aa  73.6  0.000000000003  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.0336563  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1202  hypothetical protein  27.53 
 
 
262 aa  73.2  0.000000000003  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0876  hypothetical protein  30.05 
 
 
252 aa  73.6  0.000000000003  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3818  hypothetical protein  27.95 
 
 
263 aa  73.2  0.000000000003  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.863222  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1114  putative hydrolase-oxidase  27.53 
 
 
248 aa  73.6  0.000000000003  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.0000203365  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3588  putative hydrolase-oxidase  27.53 
 
 
248 aa  73.6  0.000000000003  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1679  hypothetical protein  30 
 
 
256 aa  73.2  0.000000000003  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00563581  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0909  hypothetical protein  30.05 
 
 
252 aa  73.2  0.000000000004  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.384195  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2178  hypothetical protein  24.69 
 
 
253 aa  72.8  0.000000000005  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.335063  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0419  hypothetical protein  28.3 
 
 
248 aa  72  0.000000000007  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000201589 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2667  hypothetical protein  28.3 
 
 
248 aa  72  0.000000000007  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0440  hypothetical protein  28.3 
 
 
248 aa  72  0.000000000007  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2467  hypothetical protein  29.05 
 
 
250 aa  72  0.000000000009  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.0000000255427  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2403  hypothetical protein  27.62 
 
 
253 aa  71.2  0.00000000001  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal  0.103164 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1225  putative hydrolase-oxidase  28.78 
 
 
247 aa  71.6  0.00000000001  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3111  putative hydrolase-oxidase  28.78 
 
 
247 aa  71.2  0.00000000001  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.758679  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>