257 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mboo_1271 on replicon NC_009712
Organism: Candidatus Methanoregula boonei 6A8



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009712  Mboo_1271  hypothetical protein  100 
 
 		 235 aa  478  1e-134  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.610569  normal  0.152537 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1289  protein of unknown function DUF34  58.9 
 
 		 238 aa  290  2e-77  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.146392  normal  0.550542 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1515  hypothetical protein  58.85 
 
 		 236 aa  273  1.0000000000000001e-72  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0037  hypothetical protein  57.14 
 
 		 245 aa  259  4e-68  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.860871 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0272  hypothetical protein  47.48 
 
 		 240 aa  236  2e-61  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.492369  normal  0.547542 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0258  hypothetical protein  36.05 
 
 		 246 aa  148  8e-35  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.94449  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0014  hypothetical protein  35.54 
 
 		 249 aa  147  2.0000000000000003e-34  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.0039713  normal  0.167021 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1498  protein of unknown function DUF34  34.65 
 
 		 296 aa  95.1  8e-19  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.855921  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3276  protein of unknown function DUF34  34.54 
 
 		 286 aa  89  6e-17  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000173418  hitchhiker  0.000776053 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3597  hypothetical protein  32.64 
 
 		 290 aa  88.2  1e-16  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000159335 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3357  hypothetical protein  30.58 
 
 		 290 aa  87  2e-16  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_14940  conserved hypothetical protein TIGR00486  34.13 
 
 		 318 aa  86.3  4e-16  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.234394 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6817  protein of unknown function DUF34  34.02 
 
 		 278 aa  85.9  5e-16  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.304888  normal  0.0490159 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1972  hypothetical protein  29.57 
 
 		 262 aa  83.6  0.000000000000002  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0200095  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2261  NIF3 family protein  29.57 
 
 		 262 aa  83.2  0.000000000000004  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.586771  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2444  hypothetical protein  33.33 
 
 		 310 aa  82.4  0.000000000000006  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.111119  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1317  hypothetical protein  33.33 
 
 		 371 aa  81.3  0.00000000000001  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00297001  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0892  hypothetical protein  36 
 
 		 368 aa  80.1  0.00000000000003  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0194369  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1955  hypothetical protein  31.12 
 
 		 278 aa  79.3  0.00000000000004  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0750  hypothetical protein  30.04 
 
 		 280 aa  79.7  0.00000000000004  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    hitchhiker  0.000399677 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2313  hypothetical protein  32.03 
 
 		 286 aa  78.6  0.00000000000007  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.919298  normal  0.328132 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0495  protein of unknown function DUF34  41.18 
 
 		 372 aa  78.6  0.00000000000008  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.0420348 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2571  hypothetical protein  28.57 
 
 		 253 aa  77  0.0000000000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2460  protein of unknown function DUF34  26.32 
 
 		 258 aa  77.4  0.0000000000002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.625795 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0900  hypothetical protein  39.84 
 
 		 393 aa  77  0.0000000000002  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  decreased coverage  0.00277153  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3085  hypothetical protein  36.31 
 
 		 375 aa  76.6  0.0000000000003  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0497  hypothetical protein  31.96 
 
 		 262 aa  76.6  0.0000000000003  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.000000247624  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1250  protein of unknown function DUF34  30.17 
 
 		 264 aa  76.6  0.0000000000003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0753  hypothetical protein  26.67 
 
 		 254 aa  76.3  0.0000000000004  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.0434961  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2193  protein of unknown function DUF34  32.03 
 
 		 307 aa  75.9  0.0000000000005  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000022092 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4817  hypothetical protein  31.6 
 
 		 275 aa  75.1  0.0000000000008  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.203194  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5891  protein of unknown function DUF34  31.71 
 
 		 279 aa  75.1  0.0000000000008  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.258196 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0896  hypothetical protein  23.66 
 
 		 246 aa  75.1  0.0000000000009  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0478  protein of unknown function DUF34  39.5 
 
 		 372 aa  75.1  0.0000000000009  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.763164  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1133  protein of unknown function DUF34  26.25 
 
 		 256 aa  74.7  0.000000000001  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.000108925  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0025  protein of unknown function DUF34  32.56 
 
 		 365 aa  73.6  0.000000000003  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.459063  normal  0.55748 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0399  hypothetical protein  38.84 
 
 		 372 aa  72.8  0.000000000004  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.399804  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4191  hypothetical protein  35.83 
 
 		 373 aa  72.4  0.000000000005  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.000743156  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4512  hypothetical protein  35.83 
 
 		 373 aa  72.4  0.000000000005  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.000424182  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4311  conserved hypothetical protein TIGR00486  35.83 
 
 		 373 aa  72.4  0.000000000005  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.3364399999999999e-45 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4423  conserved hypothetical protein TIGR00486  35.83 
 
 		 373 aa  72.4  0.000000000006  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000000184902  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4029  NIF3-like protein  35.83 
 
 		 373 aa  72.4  0.000000000006  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00007027  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4039  NIF3-like protein  35.83 
 
 		 373 aa  72.4  0.000000000006  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0149626  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1974  protein of unknown function DUF34  39.13 
 
 		 369 aa  72  0.000000000007  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.13936  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0830  hypothetical protein TIGR00486  35.29 
 
 		 373 aa  72  0.000000000008  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000000172023  hitchhiker  1.68837e-16 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0683  protein of unknown function DUF34  36.52 
 
 		 388 aa  72  0.000000000008  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4876  hypothetical protein  28.94 
 
 		 263 aa  72  0.000000000008  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.276153  hitchhiker  0.00000161362 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4369  hypothetical protein  35 
 
 		 373 aa  71.2  0.00000000001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00198592  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1436  hypothetical protein  38.66 
 
 		 346 aa  71.2  0.00000000001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.14453  normal  0.0780457 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0618  dinuclear metal center protein, YbgI family  26.54 
 
 		 294 aa  71.6  0.00000000001  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3302  hypothetical protein  35.54 
 
 		 377 aa  71.2  0.00000000001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.53977  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1068  hypothetical protein  22.97 
 
 		 246 aa  70.9  0.00000000001  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2712  protein of unknown function DUF34  38.28 
 
 		 373 aa  71.6  0.00000000001  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.163591  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_12090  conserved hypothetical protein TIGR00486  33.5 
 
 		 287 aa  71.2  0.00000000001  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.397733  normal  0.178862 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1624  hypothetical protein  24 
 
 		 246 aa  71.2  0.00000000001  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4141  hypothetical protein  36.67 
 
 		 373 aa  70.5  0.00000000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  unclonable  0.000000770541  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0663  hypothetical protein  28.74 
 
 		 251 aa  70.9  0.00000000002  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1542  protein of unknown function DUF34  34.71 
 
 		 365 aa  70.9  0.00000000002  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.0986735  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3123  protein of unknown function DUF34  33.86 
 
 		 366 aa  70.9  0.00000000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4406  conserved hypothetical protein TIGR00486  35 
 
 		 373 aa  70.1  0.00000000003  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00277064  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3463  protein of unknown function DUF34  42.28 
 
 		 273 aa  69.7  0.00000000003  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.807621  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0771  hypothetical protein  27.2 
 
 		 261 aa  69.7  0.00000000003  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.149762  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1050  hypothetical protein  23.77 
 
 		 246 aa  70.1  0.00000000003  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.277421  normal  1 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0737  hypothetical protein  27.65 
 
 		 306 aa  69.3  0.00000000005  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.698842  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2905  protein of unknown function DUF34  27.82 
 
 		 287 aa  68.9  0.00000000006  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.0994154 
 
 
-
 
NC_004116  SAG1202  hypothetical protein  26.69 
 
 		 262 aa  67  0.0000000002  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1675  protein of unknown function DUF34  31.3 
 
 		 268 aa  67.4  0.0000000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0332721  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0161  protein of unknown function DUF34  35.07 
 
 		 373 aa  67.4  0.0000000002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2220  protein of unknown function DUF34  29.52 
 
 		 249 aa  67.4  0.0000000002  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.010099  normal  0.392171 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1174  hypothetical protein  27.75 
 
 		 257 aa  67.4  0.0000000002  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.171309  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1227  hypothetical protein  23.53 
 
 		 262 aa  67.4  0.0000000002  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3106  protein of unknown function DUF34  29.85 
 
 		 255 aa  67  0.0000000003  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2502  hypothetical protein  28 
 
 		 250 aa  66.2  0.0000000004  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3016  hypothetical protein  34.45 
 
 		 373 aa  66.2  0.0000000004  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.097716  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_06980  conserved hypothetical protein TIGR00486  28.88 
 
 		 269 aa  66.2  0.0000000004  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.625612  normal  0.0282972 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2410  protein of unknown function DUF34  33.58 
 
 		 373 aa  66.2  0.0000000004  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0245658  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0747  hypothetical protein  26.09 
 
 		 274 aa  66.6  0.0000000004  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3818  hypothetical protein  28.09 
 
 		 263 aa  65.5  0.0000000007  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.863222  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0840  hypothetical protein  28.33 
 
 		 251 aa  65.5  0.0000000007  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1841  protein of unknown function DUF34  34.65 
 
 		 381 aa  65.5  0.0000000007  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1651  hypothetical protein  33.33 
 
 		 366 aa  65.1  0.0000000008  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.0212562  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1617  hypothetical protein  33.33 
 
 		 366 aa  65.1  0.0000000008  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.00640299  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3232  hypothetical protein  27.39 
 
 		 248 aa  65.1  0.0000000009  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2085  protein of unknown function DUF34  30.05 
 
 		 290 aa  64.7  0.000000001  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.046547  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2699  hypothetical protein  28.57 
 
 		 248 aa  64.7  0.000000001  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.736559  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3677  hypothetical protein  28.57 
 
 		 255 aa  64.7  0.000000001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.392263  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004118  hypothetical protein  27.48 
 
 		 252 aa  65.1  0.000000001  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1679  hypothetical protein  27.5 
 
 		 256 aa  64.7  0.000000001  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00563581  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2699  hypothetical protein  30.58 
 
 		 284 aa  65.1  0.000000001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0742132  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3255  NIF3 family protein  28.57 
 
 		 255 aa  64.7  0.000000001  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1804  NIF3 family protein  28.57 
 
 		 248 aa  64.7  0.000000001  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3651  NIF3 family protein  28.57 
 
 		 248 aa  64.7  0.000000001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.48548  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3708  NIF3 family protein  28.57 
 
 		 248 aa  64.7  0.000000001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2749  NIF3 family protein  28.57 
 
 		 248 aa  64.7  0.000000001  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG2043  hypothetical protein  30.16 
 
 		 364 aa  63.9  0.000000002  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000126917 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0427  hypothetical protein  28.12 
 
 		 369 aa  64.3  0.000000002  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.964044 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1805  hypothetical protein  31.09 
 
 		 367 aa  63.9  0.000000002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0668481  normal  0.832459 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0646  hypothetical protein  30.7 
 
 		 371 aa  63.9  0.000000002  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  decreased coverage  0.0000133352  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3988  hypothetical protein  31.52 
 
 		 372 aa  63.9  0.000000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2178  hypothetical protein  29.51 
 
 		 253 aa  63.2  0.000000003  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.335063  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>