247 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bamb_0358 on replicon NC_008390
Organism: Burkholderia ambifaria AMMD



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010551  BamMC406_0367  hypothetical protein  100 
 
 
248 aa  509  1e-143  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.465671 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0358  hypothetical protein  100 
 
 
248 aa  509  1e-143  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.388987  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0419  hypothetical protein  96.77 
 
 
248 aa  496  1e-139  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000201589 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2667  hypothetical protein  96.77 
 
 
248 aa  496  1e-139  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0440  hypothetical protein  96.77 
 
 
248 aa  496  1e-139  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3538  hypothetical protein  95.97 
 
 
248 aa  491  9.999999999999999e-139  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.416608 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0343  hypothetical protein  93.15 
 
 
248 aa  479  1e-134  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.799255  normal 
 
 
-
 
NC_006348  BMA2699  hypothetical protein  87.9 
 
 
248 aa  455  1e-127  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.736559  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3677  hypothetical protein  87.9 
 
 
255 aa  455  1e-127  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.392263  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2978  hypothetical protein  87.9 
 
 
255 aa  456  1e-127  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.493869  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3255  NIF3 family protein  87.9 
 
 
255 aa  455  1e-127  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1804  NIF3 family protein  87.9 
 
 
248 aa  455  1e-127  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3651  NIF3 family protein  87.9 
 
 
248 aa  455  1e-127  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.48548  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3708  NIF3 family protein  87.9 
 
 
248 aa  455  1e-127  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2749  NIF3 family protein  87.9 
 
 
248 aa  455  1e-127  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2744  hypothetical protein  83.47 
 
 
248 aa  419  1e-116  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.265192  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0413  hypothetical protein  81.45 
 
 
248 aa  410  1e-114  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3545  protein of unknown function DUF34  82.26 
 
 
248 aa  413  1e-114  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.630294  normal  0.0213286 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3232  hypothetical protein  62.1 
 
 
248 aa  330  2e-89  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3208  protein of unknown function DUF34  62.1 
 
 
248 aa  321  7e-87  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2931  hypothetical protein  62.1 
 
 
248 aa  319  3e-86  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2861  protein of unknown function DUF34  60.89 
 
 
248 aa  311  6.999999999999999e-84  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.227664 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0806  hypothetical protein  61.63 
 
 
249 aa  306  3e-82  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.554338  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3095  hypothetical protein  59.27 
 
 
248 aa  303  2.0000000000000002e-81  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.486394  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3370  hypothetical protein  56.15 
 
 
248 aa  290  2e-77  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0262  hypothetical protein  55.24 
 
 
248 aa  281  9e-75  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.0000334154  hitchhiker  0.00500973 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1728  hypothetical protein  53.2 
 
 
250 aa  278  5e-74  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.00000970699  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1653  hypothetical protein  53.2 
 
 
250 aa  276  1e-73  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.00000959566  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2222  hypothetical protein  52.8 
 
 
250 aa  276  2e-73  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.00000808269  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_12960  hypothetical protein  55.46 
 
 
252 aa  276  2e-73  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2580  hypothetical protein  52.8 
 
 
250 aa  276  3e-73  Shewanella baltica OS195  Bacteria  unclonable  0.000000058003  normal  0.0950239 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1758  hypothetical protein  52.8 
 
 
250 aa  275  4e-73  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.0000958056  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2460  hypothetical protein  53.2 
 
 
250 aa  275  5e-73  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.000000153632  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2621  hypothetical protein  52.4 
 
 
250 aa  274  1.0000000000000001e-72  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1884  protein of unknown function DUF34  52.4 
 
 
250 aa  274  1.0000000000000001e-72  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.00000303025  hitchhiker  0.00204179 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4547  hypothetical protein  53.85 
 
 
252 aa  273  1.0000000000000001e-72  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5016  hypothetical protein  56.54 
 
 
252 aa  273  2.0000000000000002e-72  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2467  hypothetical protein  52.8 
 
 
250 aa  273  2.0000000000000002e-72  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.0000000255427  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1892  hypothetical protein  52.4 
 
 
250 aa  271  8.000000000000001e-72  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.339977  hitchhiker  0.0000115783 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0909  hypothetical protein  53.04 
 
 
252 aa  271  9e-72  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.384195  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_57740  hypothetical protein  55.7 
 
 
252 aa  270  1e-71  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2050  hypothetical protein  52.99 
 
 
249 aa  270  1e-71  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.0000274471  normal  0.24261 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2403  hypothetical protein  50.79 
 
 
253 aa  266  2e-70  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal  0.103164 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0889  hypothetical protein  52.28 
 
 
252 aa  266  2e-70  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1302  hypothetical protein  52.23 
 
 
252 aa  266  2.9999999999999995e-70  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4423  hypothetical protein  53.36 
 
 
252 aa  266  2.9999999999999995e-70  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.348854 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2693  hypothetical protein  50.4 
 
 
250 aa  265  4e-70  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.000000722609  normal  0.114925 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1572  hypothetical protein  50.6 
 
 
250 aa  263  1e-69  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.000308577  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1914  hypothetical protein  50.4 
 
 
250 aa  261  4.999999999999999e-69  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.523763  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2073  hypothetical protein  50.8 
 
 
256 aa  261  6.999999999999999e-69  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0748  protein of unknown function DUF34  51.2 
 
 
250 aa  259  2e-68  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.0214931  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0917  protein of unknown function DUF34  50.6 
 
 
249 aa  259  3e-68  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4129  hypothetical protein  50.2 
 
 
252 aa  259  4e-68  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2248  hypothetical protein  50.8 
 
 
260 aa  259  4e-68  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.0000952152  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0876  hypothetical protein  51.68 
 
 
252 aa  258  5.0000000000000005e-68  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1137  protein of unknown function DUF34  49.6 
 
 
249 aa  258  5.0000000000000005e-68  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.43804  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4434  hypothetical protein  49.8 
 
 
252 aa  258  6e-68  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  hitchhiker  0.00125483  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2699  hypothetical protein  49.39 
 
 
284 aa  257  1e-67  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0742132  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0990  hypothetical protein  50 
 
 
246 aa  255  4e-67  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2926  protein of unknown function DUF34  53.2 
 
 
247 aa  253  2.0000000000000002e-66  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.73965  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0800  putative hydrolase-oxidase  53.2 
 
 
247 aa  253  2.0000000000000002e-66  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0575847  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0758  putative hydrolase-oxidase  53.2 
 
 
247 aa  253  2.0000000000000002e-66  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0627  putative hydrolase-oxidase  53.2 
 
 
247 aa  253  2.0000000000000002e-66  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0725  putative hydrolase-oxidase  53.2 
 
 
247 aa  253  2.0000000000000002e-66  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.80137  normal  0.44707 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2945  putative hydrolase-oxidase  53.2 
 
 
247 aa  253  2.0000000000000002e-66  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0735  putative hydrolase-oxidase  53.2 
 
 
247 aa  253  2.0000000000000002e-66  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1213  putative hydrolase-oxidase  54 
 
 
258 aa  252  3e-66  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.522033  normal  0.0315512 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1225  putative hydrolase-oxidase  52.96 
 
 
247 aa  252  4.0000000000000004e-66  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5506  hypothetical protein  55.42 
 
 
253 aa  251  7e-66  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.310808 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2109  hypothetical protein  50.4 
 
 
252 aa  251  7e-66  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.194665  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00670  conserved metal-binding protein  52.8 
 
 
247 aa  251  8.000000000000001e-66  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00659  hypothetical protein  52.8 
 
 
247 aa  251  8.000000000000001e-66  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3588  putative hydrolase-oxidase  53.01 
 
 
248 aa  251  1e-65  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1165  putative hydrolase-oxidase  53.01 
 
 
248 aa  251  1e-65  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.0336563  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3111  putative hydrolase-oxidase  52.96 
 
 
247 aa  251  1e-65  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.758679  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1679  hypothetical protein  49.22 
 
 
256 aa  250  1e-65  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00563581  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1114  putative hydrolase-oxidase  53.01 
 
 
248 aa  251  1e-65  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.0000203365  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0819  putative hydrolase-oxidase  52.42 
 
 
247 aa  249  4e-65  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0758  putative hydrolase-oxidase  52.42 
 
 
247 aa  249  4e-65  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0868  putative hydrolase-oxidase  52.42 
 
 
247 aa  249  4e-65  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.492247 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0845  hypothetical protein  57.72 
 
 
249 aa  249  4e-65  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0834  putative hydrolase-oxidase  52.42 
 
 
247 aa  249  4e-65  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.529886  hitchhiker  0.00118024 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0663  hypothetical protein  50 
 
 
251 aa  248  5e-65  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0771  putative hydrolase-oxidase  52.02 
 
 
247 aa  248  8e-65  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal  0.751383 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0786  hypothetical protein  54.66 
 
 
254 aa  247  1e-64  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.132143 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0749  protein of unknown function DUF34  54.44 
 
 
254 aa  247  2e-64  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1254  putative hydrolase-oxidase  51.2 
 
 
247 aa  246  3e-64  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.190885  normal  0.799705 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2220  protein of unknown function DUF34  49.8 
 
 
249 aa  246  3e-64  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.010099  normal  0.392171 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1604  hypothetical protein  53.04 
 
 
255 aa  243  9.999999999999999e-64  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00178511 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0910  hypothetical protein  46.83 
 
 
252 aa  241  7.999999999999999e-63  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2001  hypothetical protein  48.02 
 
 
252 aa  240  2e-62  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2210  hypothetical protein  50.41 
 
 
251 aa  240  2e-62  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.266058  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1059  hypothetical protein  55.34 
 
 
271 aa  239  2.9999999999999997e-62  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0840  hypothetical protein  45.82 
 
 
251 aa  238  4e-62  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0879  hypothetical protein  45.82 
 
 
252 aa  238  4e-62  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1135  protein of unknown function DUF34  51.81 
 
 
247 aa  237  2e-61  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.573001  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2230  hypothetical protein  48.61 
 
 
251 aa  234  9e-61  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.0822184  normal  0.601423 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0818  hypothetical protein  52.82 
 
 
253 aa  234  1.0000000000000001e-60  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.402341  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2923  protein of unknown function DUF34  53.78 
 
 
247 aa  231  7.000000000000001e-60  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0096  hypothetical protein  46.69 
 
 
248 aa  231  8.000000000000001e-60  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  0.387334  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>