219 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bpro_0818 on replicon NC_007948
Organism: Polaromonas sp. JS666



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007948  Bpro_0818  hypothetical protein  100 
 
 
253 aa  513  1e-144  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.402341  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0710  hypothetical protein  84.52 
 
 
254 aa  371  1e-102  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.51664 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1185  protein of unknown function DUF34  76.65 
 
 
257 aa  367  1e-101  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5506  hypothetical protein  72.37 
 
 
253 aa  344  7e-94  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.310808 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2961  hypothetical protein  77.69 
 
 
252 aa  342  2.9999999999999997e-93  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.134812  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1785  hypothetical protein  74.61 
 
 
252 aa  330  1e-89  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.108016  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1059  hypothetical protein  71.48 
 
 
271 aa  322  3e-87  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0749  protein of unknown function DUF34  70.59 
 
 
254 aa  321  9.000000000000001e-87  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0786  hypothetical protein  70.59 
 
 
254 aa  319  3e-86  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.132143 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1604  hypothetical protein  65.49 
 
 
255 aa  312  2.9999999999999996e-84  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00178511 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0845  hypothetical protein  64.82 
 
 
249 aa  286  2e-76  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3370  hypothetical protein  55.47 
 
 
248 aa  278  4e-74  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0917  protein of unknown function DUF34  56.02 
 
 
249 aa  272  3e-72  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3208  protein of unknown function DUF34  54.03 
 
 
248 aa  270  2e-71  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2931  hypothetical protein  55.78 
 
 
248 aa  266  2e-70  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0419  hypothetical protein  53.63 
 
 
248 aa  261  4.999999999999999e-69  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000201589 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2667  hypothetical protein  53.63 
 
 
248 aa  261  4.999999999999999e-69  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0440  hypothetical protein  53.63 
 
 
248 aa  261  4.999999999999999e-69  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3232  hypothetical protein  52.38 
 
 
248 aa  261  1e-68  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2220  protein of unknown function DUF34  54.62 
 
 
249 aa  260  1e-68  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.010099  normal  0.392171 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2861  protein of unknown function DUF34  53.63 
 
 
248 aa  257  1e-67  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.227664 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3538  hypothetical protein  53.41 
 
 
248 aa  257  1e-67  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.416608 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2178  hypothetical protein  52.55 
 
 
253 aa  256  3e-67  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.335063  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2744  hypothetical protein  53.85 
 
 
248 aa  254  7e-67  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.265192  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0358  hypothetical protein  52.82 
 
 
248 aa  254  7e-67  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.388987  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0367  hypothetical protein  52.82 
 
 
248 aa  254  7e-67  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.465671 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0343  hypothetical protein  52.78 
 
 
248 aa  253  2.0000000000000002e-66  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.799255  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0806  hypothetical protein  53.66 
 
 
249 aa  250  1e-65  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.554338  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2403  hypothetical protein  49.41 
 
 
253 aa  249  4e-65  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal  0.103164 
 
 
-
 
NC_006348  BMA2699  hypothetical protein  51.19 
 
 
248 aa  248  5e-65  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.736559  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3677  hypothetical protein  51.19 
 
 
255 aa  248  5e-65  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.392263  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3255  NIF3 family protein  51.19 
 
 
255 aa  248  5e-65  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1804  NIF3 family protein  51.19 
 
 
248 aa  248  5e-65  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3651  NIF3 family protein  51.19 
 
 
248 aa  248  5e-65  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.48548  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3708  NIF3 family protein  51.19 
 
 
248 aa  248  5e-65  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2749  NIF3 family protein  51.19 
 
 
248 aa  248  5e-65  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0748  protein of unknown function DUF34  53.94 
 
 
250 aa  246  3e-64  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.0214931  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2978  hypothetical protein  50.79 
 
 
255 aa  246  3e-64  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.493869  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0262  hypothetical protein  51.43 
 
 
248 aa  245  4.9999999999999997e-64  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.0000334154  hitchhiker  0.00500973 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1892  hypothetical protein  49.8 
 
 
250 aa  245  6e-64  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.339977  hitchhiker  0.0000115783 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0889  hypothetical protein  50.39 
 
 
252 aa  245  6e-64  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0413  hypothetical protein  51.05 
 
 
248 aa  243  1.9999999999999999e-63  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3545  protein of unknown function DUF34  51.05 
 
 
248 aa  243  3e-63  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.630294  normal  0.0213286 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2693  hypothetical protein  48.8 
 
 
250 aa  241  1e-62  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.000000722609  normal  0.114925 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3095  hypothetical protein  51.59 
 
 
248 aa  240  1e-62  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.486394  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5016  hypothetical protein  47.67 
 
 
252 aa  239  4e-62  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2699  hypothetical protein  47.39 
 
 
284 aa  239  4e-62  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0742132  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0909  hypothetical protein  47.04 
 
 
252 aa  236  2e-61  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.384195  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_57740  hypothetical protein  47.29 
 
 
252 aa  235  6e-61  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01899  NIF3  46.72 
 
 
253 aa  234  8e-61  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.134254  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2210  hypothetical protein  49.42 
 
 
251 aa  233  2.0000000000000002e-60  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.266058  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1302  hypothetical protein  45.31 
 
 
252 aa  232  5e-60  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1758  hypothetical protein  47.6 
 
 
250 aa  231  9e-60  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.0000958056  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1165  putative hydrolase-oxidase  50.2 
 
 
248 aa  230  1e-59  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.0336563  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2050  hypothetical protein  48.41 
 
 
249 aa  231  1e-59  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.0000274471  normal  0.24261 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1114  putative hydrolase-oxidase  50.2 
 
 
248 aa  230  1e-59  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.0000203365  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3588  putative hydrolase-oxidase  50.2 
 
 
248 aa  230  1e-59  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2621  hypothetical protein  47.6 
 
 
250 aa  229  2e-59  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1728  hypothetical protein  47.41 
 
 
250 aa  230  2e-59  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.00000970699  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4423  hypothetical protein  45.06 
 
 
252 aa  229  3e-59  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.348854 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1653  hypothetical protein  47.6 
 
 
250 aa  229  3e-59  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.00000959566  normal 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2109  hypothetical protein  49.2 
 
 
252 aa  228  5e-59  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.194665  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4434  hypothetical protein  45.45 
 
 
252 aa  228  6e-59  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  hitchhiker  0.00125483  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0876  hypothetical protein  45.06 
 
 
252 aa  228  6e-59  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4547  hypothetical protein  45.06 
 
 
252 aa  228  7e-59  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_12960  hypothetical protein  47.08 
 
 
252 aa  228  1e-58  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4129  hypothetical protein  45.06 
 
 
252 aa  225  5.0000000000000005e-58  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2001  hypothetical protein  47.74 
 
 
252 aa  225  6e-58  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3111  putative hydrolase-oxidase  49 
 
 
247 aa  224  1e-57  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.758679  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0840  hypothetical protein  46.9 
 
 
251 aa  223  2e-57  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1572  hypothetical protein  46.22 
 
 
250 aa  223  2e-57  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.000308577  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1225  putative hydrolase-oxidase  48.61 
 
 
247 aa  223  3e-57  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1254  putative hydrolase-oxidase  48.21 
 
 
247 aa  223  3e-57  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.190885  normal  0.799705 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0990  hypothetical protein  46.99 
 
 
246 aa  222  4.9999999999999996e-57  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2460  hypothetical protein  45.82 
 
 
250 aa  221  9e-57  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.000000153632  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0663  hypothetical protein  46.18 
 
 
251 aa  220  9.999999999999999e-57  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1914  hypothetical protein  45.02 
 
 
250 aa  219  1.9999999999999999e-56  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.523763  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2580  hypothetical protein  45.42 
 
 
250 aa  220  1.9999999999999999e-56  Shewanella baltica OS195  Bacteria  unclonable  0.000000058003  normal  0.0950239 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2222  hypothetical protein  46.4 
 
 
250 aa  219  3e-56  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.00000808269  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1884  protein of unknown function DUF34  45.02 
 
 
250 aa  218  6e-56  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.00000303025  hitchhiker  0.00204179 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2467  hypothetical protein  45.02 
 
 
250 aa  218  8.999999999999998e-56  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.0000000255427  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1137  protein of unknown function DUF34  45.78 
 
 
249 aa  216  2.9999999999999998e-55  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.43804  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2248  hypothetical protein  45.67 
 
 
260 aa  215  5.9999999999999996e-55  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.0000952152  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1213  putative hydrolase-oxidase  46.77 
 
 
258 aa  214  9.999999999999999e-55  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.522033  normal  0.0315512 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1135  protein of unknown function DUF34  47.04 
 
 
247 aa  213  2.9999999999999995e-54  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.573001  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004118  hypothetical protein  44.57 
 
 
252 aa  212  4.9999999999999996e-54  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1679  hypothetical protein  45.28 
 
 
256 aa  211  1e-53  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00563581  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01348  hypothetical protein  44.58 
 
 
252 aa  209  3e-53  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2212  hypothetical protein  45.34 
 
 
263 aa  206  2e-52  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.228589  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2073  hypothetical protein  43.25 
 
 
256 aa  206  3e-52  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0819  putative hydrolase-oxidase  44.09 
 
 
247 aa  205  5e-52  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0834  putative hydrolase-oxidase  44.09 
 
 
247 aa  205  5e-52  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.529886  hitchhiker  0.00118024 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0868  putative hydrolase-oxidase  44.09 
 
 
247 aa  205  5e-52  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.492247 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0771  putative hydrolase-oxidase  44.09 
 
 
247 aa  205  7e-52  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal  0.751383 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0910  hypothetical protein  41.67 
 
 
252 aa  204  1e-51  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0758  putative hydrolase-oxidase  43.7 
 
 
247 aa  204  1e-51  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2230  hypothetical protein  46.06 
 
 
251 aa  204  1e-51  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.0822184  normal  0.601423 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2923  protein of unknown function DUF34  47.83 
 
 
247 aa  203  2e-51  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0096  hypothetical protein  43.15 
 
 
248 aa  203  2e-51  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  0.387334  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0023  hypothetical protein  46.25 
 
 
252 aa  203  2e-51  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.102702  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>