201 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mpe_A0845 on replicon NC_008825
Organism: Methylibium petroleiphilum PM1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008825  Mpe_A0845  hypothetical protein  100 
 
 		 249 aa  503  9.999999999999999e-143  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1604  hypothetical protein  68.4 
 
 		 255 aa  333  1e-90  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00178511 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0749  protein of unknown function DUF34  67.87 
 
 		 254 aa  300  1e-80  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0786  hypothetical protein  67.87 
 
 		 254 aa  299  3e-80  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.132143 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5506  hypothetical protein  66.27 
 
 		 253 aa  298  4e-80  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.310808 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3232  hypothetical protein  58.61 
 
 		 248 aa  291  8e-78  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1185  protein of unknown function DUF34  65.1 
 
 		 257 aa  291  9e-78  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1059  hypothetical protein  67.19 
 
 		 271 aa  290  1e-77  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3677  hypothetical protein  58.7 
 
 		 255 aa  289  3e-77  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.392263  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3255  NIF3 family protein  58.7 
 
 		 255 aa  289  3e-77  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2699  hypothetical protein  58.7 
 
 		 248 aa  288  4e-77  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.736559  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1804  NIF3 family protein  58.7 
 
 		 248 aa  288  4e-77  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3651  NIF3 family protein  58.7 
 
 		 248 aa  288  4e-77  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.48548  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3708  NIF3 family protein  58.7 
 
 		 248 aa  288  4e-77  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2749  NIF3 family protein  58.7 
 
 		 248 aa  288  4e-77  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3538  hypothetical protein  58.3 
 
 		 248 aa  288  7e-77  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.416608 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0818  hypothetical protein  64.82 
 
 		 253 aa  288  7e-77  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.402341  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0343  hypothetical protein  58.3 
 
 		 248 aa  288  8e-77  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.799255  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2978  hypothetical protein  58.3 
 
 		 255 aa  287  1e-76  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.493869  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2744  hypothetical protein  61.3 
 
 		 248 aa  287  1e-76  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.265192  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0419  hypothetical protein  58.54 
 
 		 248 aa  286  2.9999999999999996e-76  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000201589 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2667  hypothetical protein  58.54 
 
 		 248 aa  286  2.9999999999999996e-76  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0440  hypothetical protein  58.54 
 
 		 248 aa  286  2.9999999999999996e-76  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1785  hypothetical protein  66 
 
 		 252 aa  284  9e-76  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.108016  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0367  hypothetical protein  57.72 
 
 		 248 aa  283  1.0000000000000001e-75  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.465671 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0358  hypothetical protein  57.72 
 
 		 248 aa  283  1.0000000000000001e-75  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.388987  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3370  hypothetical protein  57.38 
 
 		 248 aa  282  4.0000000000000003e-75  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2931  hypothetical protein  56.91 
 
 		 248 aa  280  1e-74  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3208  protein of unknown function DUF34  57.49 
 
 		 248 aa  280  2e-74  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3545  protein of unknown function DUF34  58.7 
 
 		 248 aa  276  3e-73  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.630294  normal  0.0213286 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3095  hypothetical protein  59.02 
 
 		 248 aa  275  4e-73  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.486394  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2220  protein of unknown function DUF34  57.03 
 
 		 249 aa  275  5e-73  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.010099  normal  0.392171 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0748  protein of unknown function DUF34  56.22 
 
 		 250 aa  275  6e-73  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.0214931  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0413  hypothetical protein  58.7 
 
 		 248 aa  275  6e-73  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2861  protein of unknown function DUF34  58.13 
 
 		 248 aa  274  8e-73  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.227664 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2961  hypothetical protein  63.49 
 
 		 252 aa  273  2.0000000000000002e-72  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.134812  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0917  protein of unknown function DUF34  54.69 
 
 		 249 aa  270  1e-71  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0262  hypothetical protein  55.79 
 
 		 248 aa  266  2.9999999999999995e-70  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.0000334154  hitchhiker  0.00500973 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0806  hypothetical protein  55.51 
 
 		 249 aa  265  5.999999999999999e-70  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.554338  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0710  hypothetical protein  62.95 
 
 		 254 aa  263  2e-69  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.51664 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_57740  hypothetical protein  52.19 
 
 		 252 aa  253  2.0000000000000002e-66  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4547  hypothetical protein  52.8 
 
 		 252 aa  253  2.0000000000000002e-66  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0889  hypothetical protein  55.23 
 
 		 252 aa  253  2.0000000000000002e-66  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5016  hypothetical protein  52.19 
 
 		 252 aa  252  4.0000000000000004e-66  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2403  hypothetical protein  49.4 
 
 		 253 aa  249  4e-65  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.103164 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4423  hypothetical protein  52 
 
 		 252 aa  248  9e-65  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.348854 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1302  hypothetical protein  51.2 
 
 		 252 aa  247  1e-64  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0909  hypothetical protein  51.2 
 
 		 252 aa  245  4e-64  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.384195  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_12960  hypothetical protein  50.41 
 
 		 252 aa  244  9.999999999999999e-64  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1914  hypothetical protein  49.2 
 
 		 250 aa  243  1.9999999999999999e-63  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.523763  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2621  hypothetical protein  49.19 
 
 		 250 aa  242  3.9999999999999997e-63  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1728  hypothetical protein  49.4 
 
 		 250 aa  241  6e-63  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.00000970699  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2248  hypothetical protein  48.79 
 
 		 260 aa  241  6e-63  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.0000952152  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2699  hypothetical protein  49.4 
 
 		 284 aa  241  6e-63  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0742132  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1653  hypothetical protein  49.4 
 
 		 250 aa  240  1e-62  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.00000959566  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1758  hypothetical protein  49 
 
 		 250 aa  240  1e-62  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.0000958056  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1892  hypothetical protein  48.8 
 
 		 250 aa  239  2e-62  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.339977  hitchhiker  0.0000115783 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2580  hypothetical protein  49.6 
 
 		 250 aa  239  2e-62  Shewanella baltica OS195  Bacteria  unclonable  0.000000058003  normal  0.0950239 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4434  hypothetical protein  48.8 
 
 		 252 aa  239  2.9999999999999997e-62  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  hitchhiker  0.00125483  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2109  hypothetical protein  50.4 
 
 		 252 aa  239  2.9999999999999997e-62  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.194665  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2210  hypothetical protein  48.61 
 
 		 251 aa  239  4e-62  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.266058  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2050  hypothetical protein  48.39 
 
 		 249 aa  239  4e-62  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.0000274471  normal  0.24261 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0876  hypothetical protein  50 
 
 		 252 aa  238  5e-62  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1884  protein of unknown function DUF34  49.2 
 
 		 250 aa  238  6.999999999999999e-62  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.00000303025  hitchhiker  0.00204179 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2460  hypothetical protein  49.6 
 
 		 250 aa  237  1e-61  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.000000153632  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4129  hypothetical protein  48.8 
 
 		 252 aa  237  2e-61  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2222  hypothetical protein  48.79 
 
 		 250 aa  235  5.0000000000000005e-61  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.00000808269  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2467  hypothetical protein  49.2 
 
 		 250 aa  235  6e-61  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.0000000255427  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0910  hypothetical protein  45.02 
 
 		 252 aa  234  7e-61  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2178  hypothetical protein  51.22 
 
 		 253 aa  234  1.0000000000000001e-60  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.335063  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1137  protein of unknown function DUF34  46.99 
 
 		 249 aa  233  2.0000000000000002e-60  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.43804  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2693  hypothetical protein  47.18 
 
 		 250 aa  232  5e-60  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.000000722609  normal  0.114925 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1225  putative hydrolase-oxidase  51.82 
 
 		 247 aa  231  8.000000000000001e-60  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1114  putative hydrolase-oxidase  49.4 
 
 		 248 aa  231  9e-60  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.0000203365  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1165  putative hydrolase-oxidase  49.4 
 
 		 248 aa  231  9e-60  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.0336563  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3588  putative hydrolase-oxidase  49.4 
 
 		 248 aa  231  9e-60  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006369  lpl0879  hypothetical protein  44.44 
 
 		 252 aa  231  1e-59  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0990  hypothetical protein  50 
 
 		 246 aa  230  1e-59  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3111  putative hydrolase-oxidase  51.22 
 
 		 247 aa  230  2e-59  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.758679  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2230  hypothetical protein  49.4 
 
 		 251 aa  229  3e-59  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.0822184  normal  0.601423 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1572  hypothetical protein  46.18 
 
 		 250 aa  228  6e-59  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.000308577  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2001  hypothetical protein  47.18 
 
 		 252 aa  228  7e-59  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01899  NIF3  49.39 
 
 		 253 aa  227  1e-58  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.134254  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1213  putative hydrolase-oxidase  48.21 
 
 		 258 aa  225  7e-58  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.522033  normal  0.0315512 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2073  hypothetical protein  46.18 
 
 		 256 aa  224  1e-57  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1254  putative hydrolase-oxidase  50 
 
 		 247 aa  223  2e-57  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.190885  normal  0.799705 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004118  hypothetical protein  45.97 
 
 		 252 aa  223  2e-57  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2926  protein of unknown function DUF34  49.19 
 
 		 247 aa  222  4.9999999999999996e-57  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.73965  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0800  putative hydrolase-oxidase  49.19 
 
 		 247 aa  222  4.9999999999999996e-57  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0575847  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0758  putative hydrolase-oxidase  49.19 
 
 		 247 aa  222  4.9999999999999996e-57  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0627  putative hydrolase-oxidase  49.19 
 
 		 247 aa  222  4.9999999999999996e-57  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2945  putative hydrolase-oxidase  49.19 
 
 		 247 aa  222  4.9999999999999996e-57  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0725  putative hydrolase-oxidase  49.19 
 
 		 247 aa  222  4.9999999999999996e-57  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.80137  normal  0.44707 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0735  putative hydrolase-oxidase  48.78 
 
 		 247 aa  221  9e-57  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00670  conserved metal-binding protein  48.78 
 
 		 247 aa  220  1.9999999999999999e-56  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00659  hypothetical protein  48.78 
 
 		 247 aa  220  1.9999999999999999e-56  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0840  hypothetical protein  46.56 
 
 		 251 aa  219  1.9999999999999999e-56  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01348  hypothetical protein  46.77 
 
 		 252 aa  219  5e-56  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0819  putative hydrolase-oxidase  48.37 
 
 		 247 aa  218  7.999999999999999e-56  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0771  putative hydrolase-oxidase  48.37 
 
 		 247 aa  218  7.999999999999999e-56  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.751383 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>