222 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene TC0384 on replicon NC_002620
Organism: Chlamydia muridarum Nigg



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_002620  TC0384  hypothetical protein  100 
 
 
251 aa  518  1e-146  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2220  protein of unknown function DUF34  39.84 
 
 
249 aa  177  2e-43  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.010099  normal  0.392171 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2001  hypothetical protein  39.68 
 
 
252 aa  167  2e-40  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0840  hypothetical protein  40.24 
 
 
251 aa  166  2.9999999999999998e-40  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01348  hypothetical protein  37.7 
 
 
252 aa  165  5e-40  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1581  hypothetical protein  39.37 
 
 
268 aa  165  8e-40  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal  0.0168425 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2403  hypothetical protein  38.62 
 
 
253 aa  159  5e-38  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal  0.103164 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1604  hypothetical protein  39.68 
 
 
255 aa  158  8e-38  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00178511 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1679  hypothetical protein  38.08 
 
 
256 aa  157  1e-37  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00563581  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1225  putative hydrolase-oxidase  36 
 
 
247 aa  157  1e-37  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004118  hypothetical protein  37.7 
 
 
252 aa  157  1e-37  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0663  hypothetical protein  37.84 
 
 
251 aa  156  2e-37  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1572  hypothetical protein  39.84 
 
 
250 aa  157  2e-37  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.000308577  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2699  hypothetical protein  37.45 
 
 
284 aa  156  3e-37  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0742132  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0990  hypothetical protein  38.1 
 
 
246 aa  155  8e-37  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3370  hypothetical protein  36.9 
 
 
248 aa  154  1e-36  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0818  hypothetical protein  39.76 
 
 
253 aa  154  1e-36  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.402341  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3111  putative hydrolase-oxidase  36 
 
 
247 aa  153  2.9999999999999998e-36  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.758679  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0786  hypothetical protein  38.78 
 
 
254 aa  153  2.9999999999999998e-36  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.132143 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1254  putative hydrolase-oxidase  38.89 
 
 
247 aa  152  4e-36  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.190885  normal  0.799705 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0749  protein of unknown function DUF34  38.78 
 
 
254 aa  152  4e-36  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5506  hypothetical protein  40.08 
 
 
253 aa  152  5.9999999999999996e-36  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.310808 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1137  protein of unknown function DUF34  36.88 
 
 
249 aa  152  5.9999999999999996e-36  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.43804  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2178  hypothetical protein  38.89 
 
 
253 aa  150  1e-35  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.335063  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1114  putative hydrolase-oxidase  35.91 
 
 
248 aa  150  2e-35  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.0000203365  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3588  putative hydrolase-oxidase  35.91 
 
 
248 aa  150  2e-35  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1165  putative hydrolase-oxidase  35.91 
 
 
248 aa  150  2e-35  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.0336563  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0748  protein of unknown function DUF34  36.96 
 
 
250 aa  149  3e-35  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.0214931  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0889  hypothetical protein  38.27 
 
 
252 aa  150  3e-35  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5016  hypothetical protein  39.5 
 
 
252 aa  149  4e-35  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2699  hypothetical protein  36.51 
 
 
248 aa  149  5e-35  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.736559  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1804  NIF3 family protein  36.51 
 
 
248 aa  149  5e-35  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3651  NIF3 family protein  36.51 
 
 
248 aa  149  5e-35  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.48548  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3708  NIF3 family protein  36.51 
 
 
248 aa  149  5e-35  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2749  NIF3 family protein  36.51 
 
 
248 aa  149  5e-35  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3677  hypothetical protein  36.51 
 
 
255 aa  149  6e-35  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.392263  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01899  NIF3  38.58 
 
 
253 aa  149  6e-35  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.134254  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3255  NIF3 family protein  36.51 
 
 
255 aa  149  6e-35  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_57740  hypothetical protein  38.72 
 
 
252 aa  148  8e-35  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1271  hypothetical protein  35.29 
 
 
278 aa  148  9e-35  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  hitchhiker  0.000360111  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2923  protein of unknown function DUF34  36.8 
 
 
247 aa  147  1.0000000000000001e-34  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0771  putative hydrolase-oxidase  35.83 
 
 
247 aa  147  1.0000000000000001e-34  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal  0.751383 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1185  protein of unknown function DUF34  38.82 
 
 
257 aa  147  1.0000000000000001e-34  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2693  hypothetical protein  36.51 
 
 
250 aa  147  1.0000000000000001e-34  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.000000722609  normal  0.114925 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2978  hypothetical protein  36.76 
 
 
255 aa  147  1.0000000000000001e-34  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.493869  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0758  putative hydrolase-oxidase  35.83 
 
 
247 aa  147  1.0000000000000001e-34  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0917  protein of unknown function DUF34  34.88 
 
 
249 aa  147  2.0000000000000003e-34  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0834  putative hydrolase-oxidase  35.83 
 
 
247 aa  147  2.0000000000000003e-34  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.529886  hitchhiker  0.00118024 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0868  putative hydrolase-oxidase  35.83 
 
 
247 aa  147  2.0000000000000003e-34  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.492247 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0819  putative hydrolase-oxidase  35.83 
 
 
247 aa  147  2.0000000000000003e-34  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2230  hypothetical protein  40.94 
 
 
251 aa  147  2.0000000000000003e-34  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.0822184  normal  0.601423 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2109  hypothetical protein  38.11 
 
 
252 aa  147  2.0000000000000003e-34  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.194665  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2050  hypothetical protein  36.19 
 
 
249 aa  146  4.0000000000000006e-34  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.0000274471  normal  0.24261 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2621  hypothetical protein  36.82 
 
 
250 aa  145  5e-34  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1892  hypothetical protein  36.11 
 
 
250 aa  145  5e-34  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.339977  hitchhiker  0.0000115783 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1213  putative hydrolase-oxidase  35.66 
 
 
258 aa  145  5e-34  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.522033  normal  0.0315512 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3232  hypothetical protein  35.86 
 
 
248 aa  145  6e-34  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2580  hypothetical protein  36.05 
 
 
250 aa  145  6e-34  Shewanella baltica OS195  Bacteria  unclonable  0.000000058003  normal  0.0950239 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2931  hypothetical protein  35.66 
 
 
248 aa  145  7.0000000000000006e-34  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0735  putative hydrolase-oxidase  36.22 
 
 
247 aa  145  7.0000000000000006e-34  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2926  protein of unknown function DUF34  36.22 
 
 
247 aa  145  8.000000000000001e-34  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.73965  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0627  putative hydrolase-oxidase  36.22 
 
 
247 aa  145  8.000000000000001e-34  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0800  putative hydrolase-oxidase  36.22 
 
 
247 aa  145  8.000000000000001e-34  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0575847  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0758  putative hydrolase-oxidase  36.22 
 
 
247 aa  145  8.000000000000001e-34  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2945  putative hydrolase-oxidase  36.22 
 
 
247 aa  145  8.000000000000001e-34  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0725  putative hydrolase-oxidase  36.22 
 
 
247 aa  145  8.000000000000001e-34  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.80137  normal  0.44707 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2073  hypothetical protein  38.87 
 
 
256 aa  144  1e-33  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1114  hypothetical protein  37.01 
 
 
272 aa  144  1e-33  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  decreased coverage  0.00602952  normal  0.0178129 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00670  conserved metal-binding protein  36.22 
 
 
247 aa  144  2e-33  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1653  hypothetical protein  36.43 
 
 
250 aa  143  2e-33  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.00000959566  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1884  protein of unknown function DUF34  35.66 
 
 
250 aa  143  2e-33  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.00000303025  hitchhiker  0.00204179 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1059  hypothetical protein  40.44 
 
 
271 aa  143  2e-33  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00659  hypothetical protein  36.22 
 
 
247 aa  144  2e-33  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1302  hypothetical protein  35.98 
 
 
252 aa  143  3e-33  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1728  hypothetical protein  36.65 
 
 
250 aa  142  4e-33  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.00000970699  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0023  hypothetical protein  34.11 
 
 
252 aa  142  5e-33  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.102702  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4547  hypothetical protein  36.02 
 
 
252 aa  142  5e-33  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2460  hypothetical protein  36.05 
 
 
250 aa  142  6e-33  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.000000153632  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0909  hypothetical protein  35.59 
 
 
252 aa  142  7e-33  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.384195  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4129  hypothetical protein  35.59 
 
 
252 aa  141  8e-33  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3538  hypothetical protein  35.71 
 
 
248 aa  141  9e-33  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.416608 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1758  hypothetical protein  35.66 
 
 
250 aa  141  9.999999999999999e-33  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.0000958056  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1135  protein of unknown function DUF34  36 
 
 
247 aa  140  1.9999999999999998e-32  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.573001  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4423  hypothetical protein  35.98 
 
 
252 aa  140  1.9999999999999998e-32  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.348854 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2248  hypothetical protein  36.78 
 
 
260 aa  140  1.9999999999999998e-32  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.0000952152  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0358  hypothetical protein  35.57 
 
 
248 aa  140  1.9999999999999998e-32  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.388987  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2467  hypothetical protein  36.05 
 
 
250 aa  140  1.9999999999999998e-32  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.0000000255427  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0367  hypothetical protein  35.57 
 
 
248 aa  140  1.9999999999999998e-32  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.465671 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4434  hypothetical protein  35.56 
 
 
252 aa  139  3e-32  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  hitchhiker  0.00125483  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0419  hypothetical protein  35.57 
 
 
248 aa  140  3e-32  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000201589 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2667  hypothetical protein  35.57 
 
 
248 aa  140  3e-32  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0440  hypothetical protein  35.57 
 
 
248 aa  140  3e-32  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3208  protein of unknown function DUF34  34.66 
 
 
248 aa  139  3.9999999999999997e-32  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1785  hypothetical protein  38.21 
 
 
252 aa  139  3.9999999999999997e-32  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.108016  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_12960  hypothetical protein  36.44 
 
 
252 aa  139  4.999999999999999e-32  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0806  hypothetical protein  36.9 
 
 
249 aa  139  4.999999999999999e-32  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.554338  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2961  hypothetical protein  38.62 
 
 
252 aa  139  6e-32  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.134812  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2210  hypothetical protein  34.27 
 
 
251 aa  138  7e-32  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.266058  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2222  hypothetical protein  35.97 
 
 
250 aa  138  7.999999999999999e-32  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.00000808269  n/a   
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0096  hypothetical protein  35.43 
 
 
248 aa  137  1e-31  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  0.387334  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>