100 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ping_0681 on replicon NC_008709
Organism: Psychromonas ingrahamii 37



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008709  Ping_0681  structural toxin protein RtxA  100 
 
 		 118 aa  248  2e-65  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.280515  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1197  hypothetical protein  55 
 
 		 105 aa  136  1e-31  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_2172  hypothetical protein  54.46 
 
 		 105 aa  129  1.0000000000000001e-29  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0009  hypothetical protein  54.46 
 
 		 105 aa  129  1.0000000000000001e-29  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.149188  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0761  hypothetical protein  53.06 
 
 		 107 aa  126  9.000000000000001e-29  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1000  hypothetical protein  54.72 
 
 		 103 aa  125  2.0000000000000002e-28  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.354415 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1038  hypothetical protein  55 
 
 		 103 aa  124  5e-28  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.718701  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2483  hypothetical protein  52 
 
 		 103 aa  123  1e-27  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  unclonable  0.000000152567  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2437  hypothetical protein  53.92 
 
 		 104 aa  122  1e-27  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2583  hypothetical protein  51.96 
 
 		 104 aa  122  2e-27  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1270  hypothetical protein  54 
 
 		 103 aa  120  5e-27  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1460  hypothetical protein  52.43 
 
 		 103 aa  120  6e-27  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1356  hypothetical protein  53 
 
 		 105 aa  120  8e-27  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.39818  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_15770  hypothetical protein  53 
 
 		 105 aa  120  9e-27  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000170868 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3412  hypothetical protein  50.96 
 
 		 105 aa  118  3e-26  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.823966 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_39650  hypothetical protein  51 
 
 		 105 aa  118  3e-26  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006365  plpp0085  hypothetical protein  48.54 
 
 		 103 aa  112  1.0000000000000001e-24  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  normal  0.0205991  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2994  hypothetical protein  42 
 
 		 108 aa  112  2.0000000000000002e-24  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.00193289  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0163  hypothetical protein  52 
 
 		 103 aa  110  6e-24  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.278235  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0153  hypothetical protein  51 
 
 		 103 aa  109  2.0000000000000002e-23  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  hitchhiker  0.000296834  hitchhiker  0.0000244541 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2127  hypothetical protein  46.08 
 
 		 103 aa  108  2.0000000000000002e-23  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00294823 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1079  hypothetical protein  54 
 
 		 103 aa  105  1e-22  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.313952  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2640  hypothetical protein  46.6 
 
 		 103 aa  105  2e-22  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4188  hypothetical protein  53 
 
 		 103 aa  104  4e-22  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1035  hypothetical protein  52 
 
 		 103 aa  104  5e-22  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3775  hypothetical protein  48.51 
 
 		 109 aa  100  1e-20  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.33032  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0892  hypothetical protein  40.78 
 
 		 368 aa  93.6  9e-19  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0194369  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6059  hypothetical protein  39.22 
 
 		 106 aa  92  2e-18  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
BN001307  ANIA_11154  conserved hypothetical protein  42.31 
 
 		 112 aa  92  3e-18  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.221049 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2459  hypothetical protein  39.78 
 
 		 371 aa  88.2  4e-17  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3034  protein of unknown function DUF34  38.95 
 
 		 373 aa  87.8  5e-17  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.849304  normal  1 
 
 
-
 
NC_002950  PG2043  hypothetical protein  36 
 
 		 364 aa  85.1  3e-16  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000126917 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2677  hypothetical protein  36 
 
 		 374 aa  84.3  5e-16  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3620  hypothetical protein  37.76 
 
 		 374 aa  83.2  0.000000000000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.381663  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3355  hypothetical protein  34.34 
 
 		 379 aa  82.4  0.000000000000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.900045  normal  0.361114 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_07841  hypothetical protein  41.75 
 
 		 364 aa  82.4  0.000000000000002  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.438332  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3406  hypothetical protein  34.34 
 
 		 379 aa  82.4  0.000000000000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.172214 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3344  hypothetical protein  34.34 
 
 		 379 aa  82.4  0.000000000000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.547099  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4406  conserved hypothetical protein TIGR00486  35.05 
 
 		 373 aa  82  0.000000000000003  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00277064  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3096  protein of unknown function DUF34  42.22 
 
 		 379 aa  80.9  0.000000000000005  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0247011  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0646  hypothetical protein  32.67 
 
 		 371 aa  80.9  0.000000000000006  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  decreased coverage  0.0000133352  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1841  protein of unknown function DUF34  38 
 
 		 381 aa  80.9  0.000000000000006  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0626  hypothetical protein  36.46 
 
 		 370 aa  80.5  0.000000000000008  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.743702  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0830  hypothetical protein TIGR00486  32.99 
 
 		 373 aa  79.7  0.00000000000001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000000172023  hitchhiker  1.68837e-16 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4423  conserved hypothetical protein TIGR00486  34.02 
 
 		 373 aa  79.3  0.00000000000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000000184902  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4191  hypothetical protein  34.02 
 
 		 373 aa  79  0.00000000000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.000743156  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1317  hypothetical protein  40 
 
 		 371 aa  79.3  0.00000000000002  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00297001  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4029  NIF3-like protein  34.02 
 
 		 373 aa  79.3  0.00000000000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00007027  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4369  hypothetical protein  34.02 
 
 		 373 aa  79.3  0.00000000000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00198592  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4512  hypothetical protein  34.02 
 
 		 373 aa  79  0.00000000000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.000424182  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1805  hypothetical protein  31.68 
 
 		 367 aa  79.3  0.00000000000002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0668481  normal  0.832459 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2890  hypothetical protein  36.46 
 
 		 373 aa  79  0.00000000000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.111198  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0161  protein of unknown function DUF34  36.08 
 
 		 373 aa  79  0.00000000000002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12259  hypothetical protein  36.46 
 
 		 379 aa  78.2  0.00000000000003  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4311  conserved hypothetical protein TIGR00486  34.02 
 
 		 373 aa  78.2  0.00000000000003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.3364399999999999e-45 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4039  NIF3-like protein  34.02 
 
 		 373 aa  78.6  0.00000000000003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0149626  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2410  protein of unknown function DUF34  34.29 
 
 		 373 aa  77.4  0.00000000000006  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0245658  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5147  protein of unknown function DUF34  35.79 
 
 		 366 aa  77.4  0.00000000000006  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.660499  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4141  hypothetical protein  35.05 
 
 		 373 aa  77  0.00000000000009  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  unclonable  0.000000770541  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2143  protein of unknown function DUF34  36.36 
 
 		 395 aa  75.5  0.0000000000002  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.454619  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3085  hypothetical protein  34.74 
 
 		 375 aa  75.5  0.0000000000002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2674  protein of unknown function DUF34  34.34 
 
 		 369 aa  74.7  0.0000000000004  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0399  hypothetical protein  33.68 
 
 		 372 aa  73.2  0.000000000001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.399804  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1217  protein of unknown function DUF34  31.31 
 
 		 373 aa  73.2  0.000000000001  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.00000145347  hitchhiker  0.00320087 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0683  protein of unknown function DUF34  35.79 
 
 		 388 aa  72.4  0.000000000002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0879  protein of unknown function DUF34  37.11 
 
 		 380 aa  71.6  0.000000000003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2013  hypothetical protein  37.76 
 
 		 377 aa  71.2  0.000000000004  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.124677  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3988  hypothetical protein  36.84 
 
 		 372 aa  70.9  0.000000000006  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1974  protein of unknown function DUF34  31.96 
 
 		 369 aa  69.3  0.00000000002  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.13936  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6896  protein of unknown function DUF34  33.33 
 
 		 364 aa  68.9  0.00000000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0175851  normal  1 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1617  hypothetical protein  31 
 
 		 366 aa  68.6  0.00000000003  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.00640299  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1651  hypothetical protein  31 
 
 		 366 aa  68.6  0.00000000003  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.0212562  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1828  protein of unknown function DUF34  41.24 
 
 		 384 aa  68.2  0.00000000004  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  hitchhiker  0.00918722  normal  0.0357547 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_12390  conserved hypothetical protein TIGR00486  31.91 
 
 		 372 aa  67  0.00000000007  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.0226405  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_02240  hypothetical protein  42.11 
 
 		 110 aa  66.6  0.0000000001  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2150  hypothetical protein  31.63 
 
 		 373 aa  66.2  0.0000000001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2712  protein of unknown function DUF34  44.09 
 
 		 373 aa  65.9  0.0000000002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.163591  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2713  divalent cations, tolerance CutA family protein  30.85 
 
 		 112 aa  65.9  0.0000000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0209571  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3016  hypothetical protein  33.73 
 
 		 373 aa  65.9  0.0000000002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.097716  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2698  CutA1 divalent ion tolerance protein  30.85 
 
 		 115 aa  64.3  0.0000000006  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2612  CutA1 divalent ion tolerance protein  30.85 
 
 		 115 aa  64.3  0.0000000006  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.849435  hitchhiker  0.00000461322 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2423  hypothetical protein  30.53 
 
 		 112 aa  63.5  0.0000000009  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.36164  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0233  hypothetical protein  31.31 
 
 		 364 aa  62.8  0.000000001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.737243  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1542  protein of unknown function DUF34  35.92 
 
 		 365 aa  63.2  0.000000001  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.0986735  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3302  hypothetical protein  29.9 
 
 		 377 aa  62.4  0.000000002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.53977  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2741  CutA1 divalent ion tolerance protein  29.79 
 
 		 112 aa  62.8  0.000000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000239405  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2452  cutA1 divalent ion tolerance protein  29.79 
 
 		 112 aa  62.4  0.000000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00490395  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2690  CutA1 divalent ion tolerance protein  29.79 
 
 		 112 aa  62.4  0.000000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000001361 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4214  protein of unknown function DUF34  28.97 
 
 		 388 aa  62.8  0.000000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000000117062  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0025  protein of unknown function DUF34  29.52 
 
 		 365 aa  61.2  0.000000004  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.459063  normal  0.55748 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1125  hypothetical protein  23.23 
 
 		 366 aa  61.2  0.000000005  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  hitchhiker  0.00107465  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0900  hypothetical protein  36.73 
 
 		 393 aa  59.7  0.00000001  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  decreased coverage  0.00277153  normal  1 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0545  nitrogen regulatory protein PII  29.03 
 
 		 115 aa  58.2  0.00000004  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  unclonable  8.30947e-25  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3123  protein of unknown function DUF34  30.53 
 
 		 366 aa  57.8  0.00000006  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0556  hypothetical protein  40.43 
 
 		 117 aa  57.4  0.00000007  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.71454  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1619  protein of unknown function DUF34  25.29 
 
 		 366 aa  57  0.00000008  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.15807  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2593  hypothetical protein  32.97 
 
 		 361 aa  50.8  0.000006  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.328565  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0495  protein of unknown function DUF34  36.76 
 
 		 372 aa  49.7  0.00001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.0420348 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0478  protein of unknown function DUF34  36.76 
 
 		 372 aa  48.9  0.00002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.763164  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5270  protein of unknown function DUF34  27.84 
 
 		 386 aa  42  0.003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>