More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cpin_1928 on replicon NC_013132
Organism: Chitinophaga pinensis DSM 2588



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013132  Cpin_1928  carbohydrate kinase FGGY  100 
 
 		 493 aa  1024    Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.00371914  normal  0.681853 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0437  carbohydrate kinase FGGY  57.52 
 
 		 498 aa  563  1.0000000000000001e-159  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  hitchhiker  0.0000361421  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4109  carbohydrate kinase FGGY  57.64 
 
 		 494 aa  560  1e-158  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4247  Carbohydrate kinase, FGGY-like protein  57.06 
 
 		 492 aa  526  1e-148  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1605  carbohydrate kinase FGGY  50.41 
 
 		 490 aa  494  9.999999999999999e-139  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2000  carbohydrate kinase, FGGY  51.53 
 
 		 493 aa  484  1e-135  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2505  CDP-diacylglycerol--serine O-phosphatidyltransferase  50.92 
 
 		 494 aa  480  1e-134  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.00721444  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2025  xylulokinase  36.24 
 
 		 509 aa  262  1e-68  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0567  xylulokinase  33.33 
 
 		 502 aa  244  3e-63  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.433437  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0154  xylulokinase  32.46 
 
 		 500 aa  236  5.0000000000000005e-61  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3431  xylulokinase  31.89 
 
 		 509 aa  233  7.000000000000001e-60  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_19510  xylulokinase  31.36 
 
 		 501 aa  232  1e-59  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2179  xylulokinase  33.98 
 
 		 512 aa  230  5e-59  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0904  xylulokinase  34.35 
 
 		 505 aa  228  2e-58  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.130402 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0831  xylulokinase  33.58 
 
 		 492 aa  223  7e-57  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0808  xylulokinase  33.58 
 
 		 492 aa  223  7e-57  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0920  xylulokinase  29.96 
 
 		 518 aa  221  3e-56  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2886  xylulokinase  32.65 
 
 		 504 aa  220  5e-56  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.13014  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_3052  xylulokinase  31.49 
 
 		 511 aa  218  2e-55  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2446  xylulokinase  30.6 
 
 		 515 aa  214  2.9999999999999995e-54  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2620  xylulokinase  31.7 
 
 		 506 aa  214  3.9999999999999995e-54  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0722  xylulokinase  32.69 
 
 		 511 aa  209  6e-53  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0411  xylulokinase  29.61 
 
 		 496 aa  204  3e-51  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1911  xylulokinase  28.6 
 
 		 509 aa  199  1.0000000000000001e-49  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.048525  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3874  xylulokinase  32.41 
 
 		 484 aa  198  2.0000000000000003e-49  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3983  xylulokinase  32.21 
 
 		 484 aa  196  6e-49  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.308981  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0402  xylulokinase  31.12 
 
 		 498 aa  196  6e-49  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  hitchhiker  0.00337825  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4043  xylulokinase  32.01 
 
 		 484 aa  196  8.000000000000001e-49  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.145832  normal  0.120116 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2770  xylulokinase  32.66 
 
 		 511 aa  194  3e-48  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3938  xylulokinase  32.01 
 
 		 484 aa  194  3e-48  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.856967 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4060  xylulokinase  32.22 
 
 		 484 aa  194  4e-48  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0077  xylulokinase  33.68 
 
 		 486 aa  193  7e-48  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0157  xylulokinase  32.96 
 
 		 484 aa  192  1e-47  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03416  xylulokinase  32.22 
 
 		 484 aa  191  2e-47  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2691  carbohydrate kinase  32.22 
 
 		 517 aa  191  2e-47  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1517  carbohydrate kinase  32.22 
 
 		 517 aa  192  2e-47  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.128905 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3767  xylulokinase  32.22 
 
 		 484 aa  191  2e-47  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03367  hypothetical protein  32.22 
 
 		 484 aa  191  2e-47  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3038  xylulokinase  29.59 
 
 		 489 aa  191  2.9999999999999997e-47  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.571184  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2464  xylulokinase  32.79 
 
 		 484 aa  191  4e-47  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.542449 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3419  xylulokinase  29.71 
 
 		 488 aa  190  4e-47  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  decreased coverage  0.00000613693  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0146  xylulokinase  32.02 
 
 		 484 aa  190  5.999999999999999e-47  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4940  xylulokinase  32.22 
 
 		 484 aa  189  7e-47  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.0856501 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0150  xylulokinase  32.02 
 
 		 484 aa  189  9e-47  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2819  xylulokinase  30.48 
 
 		 484 aa  187  3e-46  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.416999  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1763  xylulokinase  31.86 
 
 		 499 aa  186  6e-46  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3887  xylulokinase  31.6 
 
 		 484 aa  186  1.0000000000000001e-45  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1732  xylulose kinase  28.48 
 
 		 494 aa  183  5.0000000000000004e-45  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3412  xylulokinase  31.63 
 
 		 485 aa  183  6e-45  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2702  xylulokinase  29.26 
 
 		 493 aa  181  2.9999999999999997e-44  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  hitchhiker  0.0029542  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2435  xylulokinase  29.49 
 
 		 493 aa  179  7e-44  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00457949 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_3065  xylulokinase  31.12 
 
 		 472 aa  177  4e-43  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.760339 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0132  xylulokinase  31.62 
 
 		 496 aa  175  1.9999999999999998e-42  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.162788 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1989  xylulokinase  28.9 
 
 		 496 aa  175  1.9999999999999998e-42  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0097  xylulokinase  30.98 
 
 		 483 aa  174  2.9999999999999996e-42  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2635  xylulokinase  28.97 
 
 		 498 aa  174  3.9999999999999995e-42  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_27320  xylulokinase  30.21 
 
 		 495 aa  172  9e-42  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.342678  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0059  xylulokinase  32.1 
 
 		 486 aa  171  3e-41  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3710  xylulokinase  30.41 
 
 		 484 aa  170  5e-41  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.917033  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_4103  xylulokinase  30.84 
 
 		 484 aa  170  6e-41  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2211  xylulokinase  28.02 
 
 		 500 aa  169  1e-40  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4473  xylulokinase  28.97 
 
 		 499 aa  169  1e-40  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.495653  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3833  xylulokinase  30.58 
 
 		 489 aa  169  1e-40  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.967873  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2687  xylulokinase  27.5 
 
 		 499 aa  169  1e-40  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2920  xylulose kinase  29.44 
 
 		 496 aa  169  1e-40  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.223361  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3559  xylulokinase  30.07 
 
 		 510 aa  168  2e-40  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1006  carbohydrate kinase FGGY  26.61 
 
 		 503 aa  168  2e-40  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  decreased coverage  0.00908398  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2791  xylulokinase  30.41 
 
 		 484 aa  168  2e-40  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.504033  normal  0.565277 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3412  xylulokinase  29.8 
 
 		 484 aa  167  4e-40  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.636398  normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR0548  xylulokinase  31.19 
 
 		 483 aa  167  5e-40  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.560227  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0550  xylulokinase  31.19 
 
 		 483 aa  167  5e-40  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2471  carbohydrate kinase FGGY  29.07 
 
 		 509 aa  167  5.9999999999999996e-40  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0101197  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4156  xylulokinase  31.4 
 
 		 485 aa  166  6.9999999999999995e-40  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_34350  xylulose kinase  29.21 
 
 		 502 aa  166  1.0000000000000001e-39  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0575074  normal  0.550997 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A4162  xylulose kinase  30.4 
 
 		 484 aa  165  2.0000000000000002e-39  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.618416  normal  0.0143871 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2898  xylulokinase  27.93 
 
 		 481 aa  165  2.0000000000000002e-39  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0204645  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0055  xylulokinase  30.4 
 
 		 484 aa  164  3e-39  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0224  xylulokinase  26.51 
 
 		 490 aa  164  3e-39  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.0998899  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0028  xylulokinase  31.66 
 
 		 483 aa  164  5.0000000000000005e-39  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.237536  normal  0.287388 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4438  xylulokinase  31.07 
 
 		 485 aa  163  5.0000000000000005e-39  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2515  xylulokinase  29.78 
 
 		 472 aa  163  6e-39  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.898924  normal  0.571015 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1609  xylulokinase  26.35 
 
 		 506 aa  162  9e-39  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6659  xylulokinase  28.99 
 
 		 486 aa  162  1e-38  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0697  xylulokinase  27.29 
 
 		 499 aa  161  3e-38  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0014259 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0711  xylulokinase  29.19 
 
 		 493 aa  161  3e-38  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.133304  normal  0.321935 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0131  xylulokinase  28.28 
 
 		 503 aa  160  6e-38  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.435122  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0497  xylulokinase  28.7 
 
 		 494 aa  160  6e-38  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.71509  normal  0.01013 
 
 
-
 
NC_010580  Bind_3807  xylulokinase  28.07 
 
 		 481 aa  159  7e-38  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.702656  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0224  xylulokinase  29.82 
 
 		 483 aa  160  7e-38  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2713  xylulose kinase  27.88 
 
 		 485 aa  159  9e-38  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0237  xylulokinase  29.03 
 
 		 486 aa  159  1e-37  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0702  xylulokinase  30.65 
 
 		 493 aa  158  2e-37  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0628  carbohydrate kinase, FGGY  27.52 
 
 		 506 aa  158  2e-37  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1656  xylulokinase  29.03 
 
 		 486 aa  158  2e-37  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.889036  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4544  xylulokinase  30.85 
 
 		 508 aa  158  2e-37  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4059  L-xylulose/3-keto-L-gulonate kinase  29.54 
 
 		 498 aa  157  3e-37  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.822702  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3952  L-xylulose/3-keto-L-gulonate kinase  29.54 
 
 		 498 aa  157  3e-37  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2036  xylulokinase  29.7 
 
 		 496 aa  157  4e-37  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1663  gluconate kinase  29.15 
 
 		 512 aa  157  4e-37  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0964235  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4208  xylulokinase  28.94 
 
 		 492 aa  157  4e-37  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0365818  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>