More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rmar_0437 on replicon NC_013501
Organism: Rhodothermus marinus DSM 4252



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013501  Rmar_0437  carbohydrate kinase FGGY  100 
 
 		 498 aa  1013    Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  hitchhiker  0.0000361421  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4109  carbohydrate kinase FGGY  55.47 
 
 		 494 aa  551  1e-156  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1928  carbohydrate kinase FGGY  57.52 
 
 		 493 aa  551  1e-155  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.00371914  normal  0.681853 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4247  Carbohydrate kinase, FGGY-like protein  58.66 
 
 		 492 aa  545  1e-154  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1605  carbohydrate kinase FGGY  51.42 
 
 		 490 aa  515  1.0000000000000001e-145  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2000  carbohydrate kinase, FGGY  50.82 
 
 		 493 aa  506  9.999999999999999e-143  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2505  CDP-diacylglycerol--serine O-phosphatidyltransferase  50.3 
 
 		 494 aa  495  1e-139  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.00721444  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_19510  xylulokinase  32.08 
 
 		 501 aa  253  4.0000000000000004e-66  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2025  xylulokinase  37.65 
 
 		 509 aa  251  3e-65  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3431  xylulokinase  32.81 
 
 		 509 aa  246  6.999999999999999e-64  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0920  xylulokinase  34.25 
 
 		 518 aa  242  1e-62  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0154  xylulokinase  32.53 
 
 		 500 aa  237  3e-61  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0567  xylulokinase  32.87 
 
 		 502 aa  234  4.0000000000000004e-60  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.433437  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2446  xylulokinase  32.66 
 
 		 515 aa  225  2e-57  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0722  xylulokinase  32.49 
 
 		 511 aa  223  8e-57  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0904  xylulokinase  35.89 
 
 		 505 aa  221  1.9999999999999999e-56  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.130402 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2620  xylulokinase  34.69 
 
 		 506 aa  218  2e-55  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2179  xylulokinase  34.69 
 
 		 512 aa  215  9.999999999999999e-55  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2886  xylulokinase  34.28 
 
 		 504 aa  214  2.9999999999999995e-54  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.13014  normal  1 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0808  xylulokinase  31.78 
 
 		 492 aa  212  1e-53  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0831  xylulokinase  31.78 
 
 		 492 aa  212  1e-53  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0411  xylulokinase  31.06 
 
 		 496 aa  205  2e-51  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_3052  xylulokinase  32.94 
 
 		 511 aa  204  3e-51  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1006  carbohydrate kinase FGGY  30.19 
 
 		 503 aa  200  5e-50  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  decreased coverage  0.00908398  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2819  xylulokinase  32.39 
 
 		 484 aa  197  2.0000000000000003e-49  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.416999  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0077  xylulokinase  32.94 
 
 		 486 aa  197  3e-49  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0402  xylulokinase  34.21 
 
 		 498 aa  195  1e-48  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  hitchhiker  0.00337825  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2702  xylulokinase  33.25 
 
 		 493 aa  194  2e-48  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  hitchhiker  0.0029542  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1911  xylulokinase  29.82 
 
 		 509 aa  194  3e-48  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.048525  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6659  xylulokinase  35.87 
 
 		 486 aa  193  6e-48  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0550  xylulokinase  31.85 
 
 		 483 aa  192  1e-47  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0548  xylulokinase  31.65 
 
 		 483 aa  190  4e-47  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.560227  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2435  xylulokinase  33.17 
 
 		 493 aa  190  5.999999999999999e-47  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00457949 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3833  xylulokinase  32.6 
 
 		 489 aa  189  1e-46  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.967873  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3419  xylulokinase  30.78 
 
 		 488 aa  189  1e-46  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  decreased coverage  0.00000613693  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1763  xylulokinase  33.74 
 
 		 499 aa  189  1e-46  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4438  xylulokinase  33.41 
 
 		 485 aa  187  3e-46  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3412  xylulokinase  31.65 
 
 		 485 aa  187  3e-46  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2471  carbohydrate kinase FGGY  31.09 
 
 		 509 aa  187  3e-46  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0101197  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2898  xylulokinase  34.06 
 
 		 481 aa  187  5e-46  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0204645  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4156  xylulokinase  31.97 
 
 		 485 aa  186  7e-46  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2211  xylulokinase  29.61 
 
 		 500 aa  186  8e-46  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2464  xylulokinase  32.66 
 
 		 484 aa  186  8e-46  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.542449 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0894  glycerol kinase  30.98 
 
 		 538 aa  186  8e-46  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0055  xylulokinase  30.25 
 
 		 484 aa  185  2.0000000000000003e-45  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2635  xylulokinase  31.81 
 
 		 498 aa  184  3e-45  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0697  xylulokinase  32.79 
 
 		 499 aa  183  6e-45  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0014259 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1656  xylulokinase  33.42 
 
 		 486 aa  183  8.000000000000001e-45  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.889036  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0146  xylulokinase  32.06 
 
 		 484 aa  182  9.000000000000001e-45  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0224  xylulokinase  30.43 
 
 		 490 aa  182  9.000000000000001e-45  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.0998899  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03416  xylulokinase  31.85 
 
 		 484 aa  182  1e-44  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1745  xylulokinase  33.42 
 
 		 486 aa  182  1e-44  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4473  xylulokinase  32.93 
 
 		 499 aa  182  1e-44  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.495653  normal  1 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0237  xylulokinase  33.42 
 
 		 486 aa  182  1e-44  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_4103  xylulokinase  30.45 
 
 		 484 aa  182  1e-44  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3767  xylulokinase  31.85 
 
 		 484 aa  182  1e-44  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03367  hypothetical protein  31.85 
 
 		 484 aa  182  1e-44  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4940  xylulokinase  32.27 
 
 		 484 aa  181  2e-44  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.0856501 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4043  xylulokinase  31.35 
 
 		 484 aa  181  2.9999999999999997e-44  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.145832  normal  0.120116 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4060  xylulokinase  31.63 
 
 		 484 aa  181  4e-44  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1483  gluconate kinase  32.93 
 
 		 514 aa  180  4e-44  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0132  xylulokinase  33.67 
 
 		 496 aa  180  4e-44  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.162788 
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1238  xylulokinase  32.51 
 
 		 475 aa  180  5.999999999999999e-44  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0408596  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1079  xylulokinase  32.51 
 
 		 475 aa  180  5.999999999999999e-44  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3710  xylulokinase  31.93 
 
 		 484 aa  180  5.999999999999999e-44  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.917033  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0028  xylulokinase  32.45 
 
 		 483 aa  180  5.999999999999999e-44  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.237536  normal  0.287388 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0150  xylulokinase  32.06 
 
 		 484 aa  180  5.999999999999999e-44  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0071  xylulokinase  32.51 
 
 		 475 aa  180  5.999999999999999e-44  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0348  xylulokinase  32.51 
 
 		 475 aa  180  5.999999999999999e-44  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0059  xylulokinase  31.69 
 
 		 486 aa  179  7e-44  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3887  xylulokinase  32.06 
 
 		 484 aa  179  9e-44  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A4162  xylulose kinase  30.25 
 
 		 484 aa  179  1e-43  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.618416  normal  0.0143871 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0497  xylulokinase  31.6 
 
 		 494 aa  179  1e-43  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.71509  normal  0.01013 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1173  xylulokinase  32.68 
 
 		 486 aa  178  2e-43  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  decreased coverage  0.000934305  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3983  xylulokinase  31.15 
 
 		 484 aa  179  2e-43  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.308981  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3938  xylulokinase  30.94 
 
 		 484 aa  178  2e-43  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.856967 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0157  xylulokinase  31.73 
 
 		 484 aa  177  3e-43  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3412  xylulokinase  31.85 
 
 		 484 aa  177  3e-43  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.636398  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1976  xylulokinase  33 
 
 		 493 aa  177  5e-43  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.775645  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2586  xylulokinase  33 
 
 		 493 aa  177  5e-43  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.220049  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3874  xylulokinase  30.94 
 
 		 484 aa  176  9.999999999999999e-43  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2515  xylulokinase  33.6 
 
 		 472 aa  176  9.999999999999999e-43  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.898924  normal  0.571015 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1198  xylulokinase  31.36 
 
 		 488 aa  174  1.9999999999999998e-42  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.64875  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_3065  xylulokinase  33.33 
 
 		 472 aa  174  3.9999999999999995e-42  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.760339 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0711  xylulokinase  31.37 
 
 		 493 aa  173  7.999999999999999e-42  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.133304  normal  0.321935 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2770  xylulokinase  33.03 
 
 		 511 aa  173  7.999999999999999e-42  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2610  xylulokinase  32.76 
 
 		 493 aa  172  1e-41  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.246925  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2634  xylulokinase  32.76 
 
 		 493 aa  172  1e-41  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_34350  xylulose kinase  34.53 
 
 		 502 aa  172  1e-41  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0575074  normal  0.550997 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2505  xylulokinase  32.76 
 
 		 493 aa  172  1e-41  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0356237  normal  0.488907 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1117  xylulokinase  33.04 
 
 		 491 aa  171  2e-41  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3239  xylulokinase  31.87 
 
 		 493 aa  172  2e-41  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0224  xylulokinase  30.56 
 
 		 483 aa  171  2e-41  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2920  xylulose kinase  34.29 
 
 		 496 aa  171  2e-41  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.223361  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5917  xylulokinase  32.76 
 
 		 493 aa  171  3e-41  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2691  carbohydrate kinase  32.59 
 
 		 517 aa  171  3e-41  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1517  carbohydrate kinase  32.59 
 
 		 517 aa  171  3e-41  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.128905 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2781  gluconate kinase  30.81 
 
 		 530 aa  171  3e-41  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3038  xylulokinase  26.52 
 
 		 489 aa  170  5e-41  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.571184  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6033  xylulokinase  31.76 
 
 		 492 aa  170  6e-41  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.629819  normal  0.638126 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>