More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sde_2505 on replicon NC_007912
Organism: Saccharophagus degradans 2-40



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007912  Sde_2505  CDP-diacylglycerol--serine O-phosphatidyltransferase  100 
 
 		 494 aa  1019    Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.00721444  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4109  carbohydrate kinase FGGY  52.44 
 
 		 494 aa  506  9.999999999999999e-143  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0437  carbohydrate kinase FGGY  50.3 
 
 		 498 aa  503  1e-141  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  hitchhiker  0.0000361421  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1605  carbohydrate kinase FGGY  49.19 
 
 		 490 aa  484  1e-135  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1928  carbohydrate kinase FGGY  51.13 
 
 		 493 aa  480  1e-134  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.00371914  normal  0.681853 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4247  Carbohydrate kinase, FGGY-like protein  50.2 
 
 		 492 aa  476  1e-133  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2000  carbohydrate kinase, FGGY  45.95 
 
 		 493 aa  427  1e-118  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0154  xylulokinase  31.43 
 
 		 500 aa  240  4e-62  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2886  xylulokinase  29.9 
 
 		 504 aa  211  3e-53  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.13014  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2179  xylulokinase  30.26 
 
 		 512 aa  209  1e-52  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2025  xylulokinase  31.04 
 
 		 509 aa  207  3e-52  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3431  xylulokinase  30.34 
 
 		 509 aa  201  1.9999999999999998e-50  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0920  xylulokinase  29.8 
 
 		 518 aa  201  3.9999999999999996e-50  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0567  xylulokinase  29.6 
 
 		 502 aa  200  3.9999999999999996e-50  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.433437  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2620  xylulokinase  28.37 
 
 		 506 aa  197  5.000000000000001e-49  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0722  xylulokinase  30.4 
 
 		 511 aa  196  9e-49  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0411  xylulokinase  28.26 
 
 		 496 aa  192  8e-48  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0831  xylulokinase  30 
 
 		 492 aa  190  5e-47  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0808  xylulokinase  30 
 
 		 492 aa  190  5e-47  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0904  xylulokinase  30.78 
 
 		 505 aa  189  7e-47  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.130402 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_19510  xylulokinase  27.98 
 
 		 501 aa  187  4e-46  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_3052  xylulokinase  29.25 
 
 		 511 aa  184  3e-45  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2435  xylulokinase  31.43 
 
 		 493 aa  179  1e-43  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00457949 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1763  xylulokinase  30.34 
 
 		 499 aa  177  3e-43  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2446  xylulokinase  27.78 
 
 		 515 aa  177  5e-43  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2702  xylulokinase  31.67 
 
 		 493 aa  177  5e-43  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  hitchhiker  0.0029542  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3038  xylulokinase  27.57 
 
 		 489 aa  174  1.9999999999999998e-42  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.571184  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0402  xylulokinase  27.09 
 
 		 498 aa  172  1e-41  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  hitchhiker  0.00337825  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0131  xylulokinase  28.26 
 
 		 503 aa  172  1e-41  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.435122  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0224  xylulokinase  28.19 
 
 		 490 aa  169  8e-41  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.0998899  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0132  xylulokinase  29.87 
 
 		 496 aa  168  2e-40  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.162788 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3419  xylulokinase  25.91 
 
 		 488 aa  166  8e-40  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  decreased coverage  0.00000613693  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2211  xylulokinase  25.32 
 
 		 500 aa  166  9e-40  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0703  xylulokinase  29.75 
 
 		 487 aa  166  1.0000000000000001e-39  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.872008  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2471  carbohydrate kinase FGGY  27.9 
 
 		 509 aa  164  3e-39  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0101197  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6659  xylulokinase  28.22 
 
 		 486 aa  164  3e-39  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4473  xylulokinase  27.76 
 
 		 499 aa  164  4.0000000000000004e-39  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.495653  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3887  xylulokinase  27.52 
 
 		 484 aa  161  2e-38  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2691  xylulokinase  30.5 
 
 		 501 aa  161  2e-38  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2819  xylulokinase  27.07 
 
 		 484 aa  162  2e-38  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.416999  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1732  xylulose kinase  27.68 
 
 		 494 aa  160  4e-38  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2687  xylulokinase  25.15 
 
 		 499 aa  160  4e-38  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1911  xylulokinase  26.15 
 
 		 509 aa  160  5e-38  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.048525  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1198  xylulokinase  29.71 
 
 		 488 aa  160  5e-38  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.64875  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3710  xylulokinase  28.34 
 
 		 484 aa  160  7e-38  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.917033  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0146  xylulokinase  27.72 
 
 		 484 aa  159  1e-37  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3833  xylulokinase  28.83 
 
 		 489 aa  159  1e-37  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.967873  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03416  xylulokinase  27.72 
 
 		 484 aa  158  2e-37  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0097  xylulokinase  28.92 
 
 		 483 aa  158  2e-37  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3767  xylulokinase  27.72 
 
 		 484 aa  158  2e-37  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03367  hypothetical protein  27.72 
 
 		 484 aa  158  2e-37  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4940  xylulokinase  27.93 
 
 		 484 aa  158  3e-37  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.0856501 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4060  xylulokinase  27.69 
 
 		 484 aa  157  3e-37  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0644  xylulokinase  27.24 
 
 		 498 aa  157  3e-37  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2898  xylulokinase  27.77 
 
 		 481 aa  156  7e-37  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0204645  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP2099  D-xylulose kinase  25.05 
 
 		 496 aa  156  8e-37  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1088  xylulokinase  27.22 
 
 		 495 aa  156  9e-37  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000712825 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3983  xylulokinase  27.59 
 
 		 484 aa  155  2e-36  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.308981  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0059  xylulokinase  28.98 
 
 		 486 aa  155  2e-36  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0150  xylulokinase  27.52 
 
 		 484 aa  155  2e-36  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3412  xylulokinase  27.29 
 
 		 484 aa  155  2e-36  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.636398  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3412  xylulokinase  27.77 
 
 		 485 aa  154  2.9999999999999998e-36  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_3065  xylulokinase  28.41 
 
 		 472 aa  154  2.9999999999999998e-36  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.760339 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0157  xylulokinase  28.92 
 
 		 484 aa  154  2.9999999999999998e-36  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1989  xylulokinase  26.56 
 
 		 496 aa  154  4e-36  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1656  xylulokinase  29.02 
 
 		 486 aa  154  4e-36  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.889036  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3938  xylulokinase  27.37 
 
 		 484 aa  153  5e-36  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.856967 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4043  xylulokinase  27.37 
 
 		 484 aa  153  5e-36  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.145832  normal  0.120116 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0055  xylulokinase  27.57 
 
 		 484 aa  153  5.9999999999999996e-36  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0237  xylulokinase  29.02 
 
 		 486 aa  153  7e-36  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1976  xylulokinase  31.25 
 
 		 493 aa  153  7e-36  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.775645  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2586  xylulokinase  31.25 
 
 		 493 aa  153  7e-36  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.220049  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3874  xylulokinase  28.26 
 
 		 484 aa  152  8.999999999999999e-36  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2515  xylulokinase  28.92 
 
 		 472 aa  153  8.999999999999999e-36  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.898924  normal  0.571015 
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1238  xylulokinase  28.34 
 
 		 475 aa  152  1e-35  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0408596  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1079  xylulokinase  28.34 
 
 		 475 aa  152  1e-35  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0697  xylulokinase  26.89 
 
 		 499 aa  152  1e-35  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0014259 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_27320  xylulokinase  29.64 
 
 		 495 aa  152  1e-35  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.342678  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0071  xylulokinase  28.34 
 
 		 475 aa  152  1e-35  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0348  xylulokinase  28.34 
 
 		 475 aa  152  1e-35  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3559  xylulokinase  28.86 
 
 		 510 aa  151  2e-35  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2128  putative D-arabinitol kinase protein  31.25 
 
 		 491 aa  150  3e-35  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.449223  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2285  xylulokinase  29.47 
 
 		 505 aa  151  3e-35  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4156  xylulokinase  28.76 
 
 		 485 aa  151  3e-35  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_4103  xylulokinase  28.82 
 
 		 484 aa  151  3e-35  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2391  carbohydrate kinase FGGY  27.59 
 
 		 497 aa  150  3e-35  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4385  xylulokinase  29.02 
 
 		 488 aa  150  4e-35  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5066  xylulokinase  29.02 
 
 		 488 aa  150  4e-35  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.442874  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5794  xylulokinase  29.02 
 
 		 488 aa  150  4e-35  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0711  xylulokinase  27.23 
 
 		 493 aa  150  4e-35  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.133304  normal  0.321935 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A4162  xylulose kinase  28.6 
 
 		 484 aa  150  4e-35  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.618416  normal  0.0143871 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2505  xylulokinase  30.9 
 
 		 493 aa  150  6e-35  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0356237  normal  0.488907 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2634  xylulokinase  30.9 
 
 		 493 aa  150  7e-35  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2610  xylulokinase  30.9 
 
 		 493 aa  149  9e-35  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.246925  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5917  xylulokinase  30.56 
 
 		 493 aa  149  1.0000000000000001e-34  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1745  xylulokinase  28.8 
 
 		 486 aa  149  1.0000000000000001e-34  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2920  xylulose kinase  27.17 
 
 		 496 aa  149  1.0000000000000001e-34  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.223361  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2770  xylulokinase  28.67 
 
 		 511 aa  148  2.0000000000000003e-34  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3239  xylulokinase  32.99 
 
 		 493 aa  148  2.0000000000000003e-34  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2635  xylulokinase  26.88 
 
 		 498 aa  147  3e-34  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>