More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dfer_4109 on replicon NC_013037
Organism: Dyadobacter fermentans DSM 18053



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013730  Slin_4247  Carbohydrate kinase, FGGY-like protein  71.43 
 
 		 492 aa  693    Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4109  carbohydrate kinase FGGY  100 
 
 		 494 aa  1018    Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0437  carbohydrate kinase FGGY  55.47 
 
 		 498 aa  551  1e-155  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  hitchhiker  0.0000361421  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1928  carbohydrate kinase FGGY  57.64 
 
 		 493 aa  545  1e-154  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.00371914  normal  0.681853 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1605  carbohydrate kinase FGGY  52.02 
 
 		 490 aa  512  1e-144  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2505  CDP-diacylglycerol--serine O-phosphatidyltransferase  52.44 
 
 		 494 aa  498  1e-140  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.00721444  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2000  carbohydrate kinase, FGGY  50.71 
 
 		 493 aa  489  1e-137  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0567  xylulokinase  32.66 
 
 		 502 aa  245  1.9999999999999999e-63  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.433437  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_19510  xylulokinase  31.86 
 
 		 501 aa  243  6e-63  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0154  xylulokinase  32.27 
 
 		 500 aa  238  2e-61  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2025  xylulokinase  33.33 
 
 		 509 aa  231  3e-59  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0722  xylulokinase  34.75 
 
 		 511 aa  231  3e-59  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0920  xylulokinase  31.86 
 
 		 518 aa  230  4e-59  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2886  xylulokinase  32.61 
 
 		 504 aa  229  6e-59  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.13014  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2620  xylulokinase  32 
 
 		 506 aa  229  6e-59  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3431  xylulokinase  32.46 
 
 		 509 aa  229  8e-59  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2179  xylulokinase  32.69 
 
 		 512 aa  225  1e-57  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1911  xylulokinase  29.67 
 
 		 509 aa  213  5.999999999999999e-54  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.048525  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0904  xylulokinase  33.86 
 
 		 505 aa  210  4e-53  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.130402 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2446  xylulokinase  31.16 
 
 		 515 aa  206  7e-52  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3038  xylulokinase  31.57 
 
 		 489 aa  206  1e-51  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.571184  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1763  xylulokinase  33.86 
 
 		 499 aa  202  1.9999999999999998e-50  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0411  xylulokinase  29.78 
 
 		 496 aa  199  7e-50  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0402  xylulokinase  30.3 
 
 		 498 aa  199  1.0000000000000001e-49  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  hitchhiker  0.00337825  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_3052  xylulokinase  30.54 
 
 		 511 aa  194  4e-48  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0808  xylulokinase  30.84 
 
 		 492 aa  192  9e-48  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0831  xylulokinase  30.84 
 
 		 492 aa  192  9e-48  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3419  xylulokinase  30.71 
 
 		 488 aa  189  7e-47  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  decreased coverage  0.00000613693  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6505  xylulokinase  30.65 
 
 		 492 aa  188  2e-46  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6739  xylulokinase  30.65 
 
 		 492 aa  188  2e-46  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0801458  normal  0.563999 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6328  xylulokinase  30.24 
 
 		 492 aa  186  6e-46  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2687  xylulokinase  29.38 
 
 		 499 aa  186  8e-46  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6033  xylulokinase  30.97 
 
 		 492 aa  184  2.0000000000000003e-45  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.629819  normal  0.638126 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4473  xylulokinase  31.58 
 
 		 499 aa  184  3e-45  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.495653  normal  1 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6333  xylulokinase  30.74 
 
 		 492 aa  184  3e-45  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2211  xylulokinase  29.94 
 
 		 500 aa  183  5.0000000000000004e-45  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0077  xylulokinase  30.02 
 
 		 486 aa  182  1e-44  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2898  xylulokinase  31.25 
 
 		 481 aa  181  2e-44  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0204645  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3887  xylulokinase  29.4 
 
 		 484 aa  181  2.9999999999999997e-44  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0131  xylulokinase  29.82 
 
 		 503 aa  181  2.9999999999999997e-44  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.435122  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2770  xylulokinase  31.25 
 
 		 511 aa  180  4.999999999999999e-44  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0146  xylulokinase  28.9 
 
 		 484 aa  180  5.999999999999999e-44  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03416  xylulokinase  29.11 
 
 		 484 aa  179  8e-44  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03367  hypothetical protein  29.11 
 
 		 484 aa  179  8e-44  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3767  xylulokinase  29.11 
 
 		 484 aa  179  8e-44  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2691  carbohydrate kinase  30.18 
 
 		 517 aa  179  9e-44  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1517  carbohydrate kinase  30.18 
 
 		 517 aa  179  1e-43  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.128905 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2471  carbohydrate kinase FGGY  30.98 
 
 		 509 aa  177  3e-43  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0101197  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0150  xylulokinase  28.9 
 
 		 484 aa  177  3e-43  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4060  xylulokinase  28.9 
 
 		 484 aa  177  3e-43  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4940  xylulokinase  29.11 
 
 		 484 aa  177  5e-43  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.0856501 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1989  xylulokinase  31.19 
 
 		 496 aa  176  8e-43  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2702  xylulokinase  30.95 
 
 		 493 aa  175  9.999999999999999e-43  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  hitchhiker  0.0029542  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1006  carbohydrate kinase FGGY  27.76 
 
 		 503 aa  176  9.999999999999999e-43  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  decreased coverage  0.00908398  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2515  xylulokinase  31.72 
 
 		 472 aa  175  1.9999999999999998e-42  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.898924  normal  0.571015 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2635  xylulokinase  30.41 
 
 		 498 aa  174  2.9999999999999996e-42  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4043  xylulokinase  28.75 
 
 		 484 aa  173  5e-42  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.145832  normal  0.120116 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3938  xylulokinase  28.81 
 
 		 484 aa  173  5.999999999999999e-42  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.856967 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3983  xylulokinase  28.75 
 
 		 484 aa  173  5.999999999999999e-42  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.308981  normal  1 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0224  xylulokinase  27.85 
 
 		 490 aa  173  7.999999999999999e-42  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.0998899  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1732  xylulose kinase  30.17 
 
 		 494 aa  172  1e-41  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0132  xylulokinase  31.5 
 
 		 496 aa  171  2e-41  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.162788 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4156  xylulokinase  30.28 
 
 		 485 aa  171  3e-41  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0059  xylulokinase  30.17 
 
 		 486 aa  170  6e-41  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3874  xylulokinase  28.54 
 
 		 484 aa  169  7e-41  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP2099  D-xylulose kinase  30.7 
 
 		 496 aa  169  1e-40  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2819  xylulokinase  31.57 
 
 		 484 aa  169  1e-40  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.416999  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_3065  xylulokinase  30.77 
 
 		 472 aa  169  1e-40  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.760339 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0097  xylulokinase  31.33 
 
 		 483 aa  168  2e-40  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2435  xylulokinase  30.02 
 
 		 493 aa  168  2e-40  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00457949 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0224  xylulokinase  30.43 
 
 		 483 aa  168  2e-40  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4438  xylulokinase  30.47 
 
 		 485 aa  167  4e-40  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1877  carbohydrate kinase, FGGY  29.65 
 
 		 506 aa  166  1.0000000000000001e-39  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.10987 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4208  xylulokinase  29.22 
 
 		 492 aa  165  2.0000000000000002e-39  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0365818  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0157  xylulokinase  29.81 
 
 		 484 aa  165  2.0000000000000002e-39  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_4103  xylulokinase  29.48 
 
 		 484 aa  165  2.0000000000000002e-39  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6659  xylulokinase  30.47 
 
 		 486 aa  165  2.0000000000000002e-39  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3412  xylulokinase  30.42 
 
 		 485 aa  164  2.0000000000000002e-39  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0055  xylulokinase  28.96 
 
 		 484 aa  165  2.0000000000000002e-39  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3559  xylulokinase  30.89 
 
 		 510 aa  164  3e-39  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1198  xylulokinase  29.06 
 
 		 488 aa  164  4.0000000000000004e-39  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.64875  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A4162  xylulose kinase  29.48 
 
 		 484 aa  163  7e-39  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.618416  normal  0.0143871 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2464  xylulokinase  31.53 
 
 		 484 aa  162  9e-39  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.542449 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0628  carbohydrate kinase, FGGY  27.91 
 
 		 506 aa  162  2e-38  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2610  xylulokinase  29.63 
 
 		 493 aa  161  2e-38  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.246925  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_34350  xylulose kinase  29.72 
 
 		 502 aa  162  2e-38  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0575074  normal  0.550997 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3833  xylulokinase  32.53 
 
 		 489 aa  161  2e-38  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.967873  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0588  xylulokinase (xylulose kinase)  29.39 
 
 		 486 aa  161  3e-38  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2920  xylulose kinase  29.26 
 
 		 496 aa  161  3e-38  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.223361  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4544  xylulokinase  31.87 
 
 		 508 aa  160  3e-38  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0497  xylulokinase  31.01 
 
 		 494 aa  160  4e-38  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.71509  normal  0.01013 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0711  xylulokinase  29.89 
 
 		 493 aa  158  2e-37  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.133304  normal  0.321935 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5917  xylulokinase  29.3 
 
 		 493 aa  157  3e-37  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1976  xylulokinase  29.52 
 
 		 493 aa  157  4e-37  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.775645  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2586  xylulokinase  29.52 
 
 		 493 aa  157  4e-37  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.220049  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1609  xylulokinase  26.28 
 
 		 506 aa  157  4e-37  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3725  xylulokinase  29.26 
 
 		 492 aa  156  9e-37  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1267  carbohydrate kinase, FGGY  29 
 
 		 501 aa  155  2e-36  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3239  xylulokinase  30.43 
 
 		 493 aa  155  2e-36  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0028  xylulokinase  31.77 
 
 		 483 aa  155  2e-36  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.237536  normal  0.287388 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>