156 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Coch_1519 on replicon NC_013162
Organism: Capnocytophaga ochracea DSM 7271



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013162  Coch_1519  hypothetical protein  100 
 
 		 287 aa  598  1e-170  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.109074  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1917  hypothetical protein  42.32 
 
 		 300 aa  238  5.999999999999999e-62  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.944351 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0634  hypothetical protein  43.69 
 
 		 300 aa  233  2.0000000000000002e-60  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.909002 
 
 
-
 
NC_002950  PG0160  hypothetical protein  39.53 
 
 		 300 aa  225  7e-58  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6322  hypothetical protein  42.24 
 
 		 303 aa  224  9e-58  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0569  hypothetical protein  40.54 
 
 		 303 aa  220  1.9999999999999999e-56  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00106206  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0368  hypothetical protein  40.67 
 
 		 309 aa  218  1e-55  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.000000592569  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1149  hypothetical protein  39.86 
 
 		 297 aa  216  4e-55  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.30507  normal  0.426274 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3149  hypothetical protein  41.5 
 
 		 299 aa  213  2.9999999999999995e-54  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0247  hypothetical protein  39.53 
 
 		 306 aa  207  1e-52  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.893142  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1411  hypothetical protein  39.12 
 
 		 303 aa  204  2e-51  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0848057  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1673  hypothetical protein  39.33 
 
 		 305 aa  200  1.9999999999999998e-50  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1222  hypothetical protein  38.36 
 
 		 305 aa  197  1.0000000000000001e-49  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.342426  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0031  hypothetical protein  38.01 
 
 		 291 aa  194  1e-48  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  0.426299 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0603  hypothetical protein  36.21 
 
 		 305 aa  189  4e-47  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0363  hypothetical protein  34.62 
 
 		 293 aa  174  1.9999999999999998e-42  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0338  hypothetical protein  34.73 
 
 		 322 aa  171  1e-41  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0355  hypothetical protein  34.48 
 
 		 290 aa  171  2e-41  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3628  hypothetical protein  35.76 
 
 		 290 aa  170  3e-41  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.458062  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0357  hypothetical protein  34.48 
 
 		 290 aa  169  4e-41  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0362  hypothetical protein  34.48 
 
 		 290 aa  169  5e-41  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3875  hypothetical protein  35.12 
 
 		 301 aa  168  9e-41  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.584028  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0365  hypothetical protein  34.48 
 
 		 290 aa  167  2e-40  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000186978 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3495  hypothetical protein  33.22 
 
 		 314 aa  166  5.9999999999999996e-40  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4579  hypothetical protein  34.65 
 
 		 319 aa  166  5.9999999999999996e-40  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  unclonable  0.0000000316379 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0268  hypothetical protein  36.27 
 
 		 288 aa  160  2e-38  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3611  hypothetical protein  33.22 
 
 		 293 aa  158  1e-37  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3808  hypothetical protein  34.03 
 
 		 290 aa  156  4e-37  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0332  hypothetical protein  32.88 
 
 		 293 aa  155  6e-37  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.30778 
 
 
-
 
NC_002936  DET0530  glucose-1-phosphate thymidylyltransferase  23.86 
 
 		 393 aa  51.6  0.00001  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.911327  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1630  Nucleotidyl transferase  30.17 
 
 		 397 aa  50.8  0.00002  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2897  UDP-glucose pyrophosphorylase  30.47 
 
 		 295 aa  51.2  0.00002  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2383  UTP-glucose-1-phosphate uridylyltransferase  30.47 
 
 		 295 aa  51.2  0.00002  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.082332  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0506  nucleotidyl transferase  25.08 
 
 		 393 aa  51.6  0.00002  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3048  Nucleotidyl transferase  26.92 
 
 		 393 aa  50.8  0.00003  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.916197  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0991  Nucleotidyl transferase  31.9 
 
 		 397 aa  50.8  0.00003  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1563  glucose-1-phosphate thymidylyltransferase  24.45 
 
 		 289 aa  49.7  0.00005  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1627  UTP-glucose-1-phosphate uridylyltransferase  27.27 
 
 		 287 aa  48.5  0.0001  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2537  UDP-glucose pyrophosphorylase  30.16 
 
 		 292 aa  48.5  0.0001  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.619652 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2237  UTP-glucose-1-phosphate uridylyltransferase GalU  29.55 
 
 		 302 aa  48.9  0.0001  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1592  UTP-glucose-1-phosphate uridylyltransferase  26.21 
 
 		 293 aa  47.8  0.0002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.414437  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4550  UDP-glucose pyrophosphorylase  29.66 
 
 		 299 aa  47.8  0.0002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.222966  normal  0.111674 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1717  UTP-glucose-1-phosphate uridylyltransferase GalU  26.28 
 
 		 296 aa  48.1  0.0002  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.88424  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1202  Nucleotidyl transferase  29.06 
 
 		 393 aa  47.4  0.0003  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RSp0006  UTP--glucose-1-phosphate uridylyltransferase UDP-glucose pyrophosphorylase protein  27.14 
 
 		 321 aa  47  0.0004  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0524481  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0958  UTP-glucose-1-phosphate uridylyltransferase  25.71 
 
 		 294 aa  46.6  0.0004  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1462  UDP-glucose pyrophosphorylase  27.87 
 
 		 313 aa  47  0.0004  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.430614  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1440  UTP-glucose-1-phosphate uridylyltransferase  25.71 
 
 		 294 aa  46.6  0.0004  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0931386  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2215  UTP-glucose-1-phosphate uridylyltransferase  28.12 
 
 		 295 aa  47  0.0004  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.136255 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5071  UTP-glucose-1-phosphate uridylyltransferase  26.72 
 
 		 293 aa  47  0.0004  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1418  UTP-glucose-1-phosphate uridylyltransferase  25.71 
 
 		 294 aa  46.6  0.0004  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3899  UTP-glucose-1-phosphate uridylyltransferase  27.46 
 
 		 317 aa  46.6  0.0005  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.79289  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2634  UTP-glucose-1-phosphate uridylyltransferase  25.71 
 
 		 294 aa  46.6  0.0005  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_3786  UTP-glucose-1-phosphate uridylyltransferase  27.46 
 
 		 317 aa  46.6  0.0005  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0945557  normal  0.170806 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1875  UTP-glucose-1-phosphate uridylyltransferase  25.71 
 
 		 294 aa  46.6  0.0005  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.35135  normal  0.0372426 
 
 
-
 
NC_006348  BMA0926  UTP-glucose-1-phosphate uridylyltransferase  25.71 
 
 		 293 aa  46.2  0.0006  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5556  UTP-glucose-1-phosphate uridylyltransferase  27.48 
 
 		 292 aa  46.2  0.0006  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000425579  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1845  UTP-glucose-1-phosphate uridylyltransferase  25.71 
 
 		 293 aa  46.2  0.0006  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.276349  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4584  UDP-glucose pyrophosphorylase  25.71 
 
 		 294 aa  46.2  0.0006  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1459  UTP-glucose-1-phosphate uridylyltransferase  25.71 
 
 		 293 aa  46.2  0.0006  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0423  UTP-glucose-1-phosphate uridylyltransferase  25.71 
 
 		 293 aa  46.2  0.0006  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1668  UTP-glucose-1-phosphate uridylyltransferase  25.71 
 
 		 293 aa  46.2  0.0006  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1690  UTP-glucose-1-phosphate uridylyltransferase  25.71 
 
 		 293 aa  46.2  0.0006  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.914927  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0740  UTP-glucose-1-phosphate uridylyltransferase  25.71 
 
 		 293 aa  46.2  0.0006  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1140  Nucleotidyl transferase  25.86 
 
 		 247 aa  46.2  0.0007  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.497469  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4956  UTP--glucose-1-phosphate uridylyltransferase  27.48 
 
 		 297 aa  46.2  0.0007  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00000197493  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1334  UDP-glucose pyrophosphorylase  25 
 
 		 293 aa  46.2  0.0007  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0507  UTP-glucose-1-phosphate uridylyltransferase  27.91 
 
 		 291 aa  46.2  0.0007  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.0029114  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5449  UTP-glucose-1-phosphate uridylyltransferase  26.52 
 
 		 293 aa  46.2  0.0007  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.784502  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5396  UTP-glucose-1-phosphate uridylyltransferase  26.72 
 
 		 293 aa  45.8  0.0008  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_471  nucleoside-diphosphate-sugar pyrophosphorylase  23.16 
 
 		 393 aa  45.8  0.0008  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2183  UDP-glucose pyrophosphorylase  30.08 
 
 		 289 aa  45.8  0.0008  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4112  UTP-glucose-1-phosphate uridylyltransferase  30.71 
 
 		 289 aa  45.8  0.0008  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0241424  hitchhiker  0.000234521 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1095  UDP-glucose pyrophosphorylase  25 
 
 		 293 aa  45.8  0.0009  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0373  UDP-glucose pyrophosphorylase  28.17 
 
 		 309 aa  45.4  0.001  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4040  UDP-glucose pyrophosphorylase  28.36 
 
 		 348 aa  45.1  0.001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1219  UTP-glucose-1-phosphate uridylyltransferase  26.58 
 
 		 296 aa  45.1  0.001  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.184128 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2073  UTP-glucose-1-phosphate uridylyltransferase  28.03 
 
 		 296 aa  45.1  0.001  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2800  UTP-glucose-1-phosphate uridylyltransferase  24.29 
 
 		 293 aa  45.4  0.001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.324628 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3621  UTP-glucose-1-phosphate uridylyltransferase  28.35 
 
 		 289 aa  45.4  0.001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.603812  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3553  UTP-glucose-1-phosphate uridylyltransferase  28.35 
 
 		 289 aa  45.4  0.001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_28250  dTDP-glucose pyrophosphorylase  23.73 
 
 		 263 aa  45.4  0.001  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.682184  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4087  UTP-glucose-1-phosphate uridylyltransferase  25.9 
 
 		 312 aa  45.1  0.001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.77847 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0625  UDP-glucose pyrophosphorylase  28.46 
 
 		 289 aa  44.3  0.002  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.0556323  normal  0.764647 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2280  UTP--glucose-1-phosphate uridylyltransferase  30.99 
 
 		 297 aa  44.3  0.002  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1159  UDP-glucose pyrophosphorylase  25.71 
 
 		 291 aa  44.7  0.002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000567806  decreased coverage  0.00280278 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0911  UTP-glucose-1-phosphate uridylyltransferase  25.9 
 
 		 301 aa  44.3  0.002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3469  UDP-glucose pyrophosphorylase  28.35 
 
 		 289 aa  44.3  0.002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.300387  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2854  nucleotidyl transferase  25.95 
 
 		 388 aa  44.7  0.002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.233123 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1737  UDP-glucose pyrophosphorylase  24.29 
 
 		 293 aa  44.7  0.002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.793832  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_23880  UDP-glucose pyrophosphorylase  28.03 
 
 		 325 aa  44.7  0.002  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1151  UTP-glucose-1-phosphate uridylyltransferase  28.35 
 
 		 302 aa  44.7  0.002  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.0000000109052  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6189  UTP-glucose-1-phosphate uridylyltransferase  26.43 
 
 		 294 aa  45.1  0.002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.642524  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6276  UTP-glucose-1-phosphate uridylyltransferase  23.57 
 
 		 293 aa  44.7  0.002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0511  glucose-1-phosphate thymidylyltransferase  23.47 
 
 		 290 aa  44.7  0.002  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3188  UTP-glucose-1-phosphate uridylyltransferase  27.34 
 
 		 301 aa  44.7  0.002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.492305  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3179  UTP-glucose-1-phosphate uridylyltransferase  23.96 
 
 		 293 aa  44.3  0.002  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.282171 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0734  UTP--glucose-1-phosphate uridylyltransferase  27.41 
 
 		 297 aa  44.7  0.002  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5920  UTP-glucose-1-phosphate uridylyltransferase  26.43 
 
 		 294 aa  45.1  0.002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.366675  normal  0.485189 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1064  UTP-glucose-1-phosphate uridylyltransferase GalU  29.84 
 
 		 275 aa  43.9  0.003  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.936196  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>