38 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sbal223_0365 on replicon NC_011663
Organism: Shewanella baltica OS223



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011663  Sbal223_0365  hypothetical protein  100 
 
 
290 aa  596  1e-169  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000186978 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0362  hypothetical protein  97.93 
 
 
290 aa  584  1e-166  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0357  hypothetical protein  97.93 
 
 
290 aa  584  1e-166  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0355  hypothetical protein  97.93 
 
 
290 aa  582  1.0000000000000001e-165  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3628  hypothetical protein  84.83 
 
 
290 aa  503  1e-141  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.458062  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0363  hypothetical protein  83.1 
 
 
293 aa  497  1e-140  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3611  hypothetical protein  84.14 
 
 
293 aa  486  1e-136  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3808  hypothetical protein  83.45 
 
 
290 aa  482  1e-135  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0332  hypothetical protein  83.45 
 
 
293 aa  479  1e-134  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal  0.30778 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4579  hypothetical protein  58.69 
 
 
319 aa  345  6e-94  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  unclonable  0.0000000316379 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3875  hypothetical protein  58.7 
 
 
301 aa  341  5.999999999999999e-93  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.584028  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3495  hypothetical protein  59.27 
 
 
314 aa  339  2.9999999999999998e-92  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0338  hypothetical protein  55.84 
 
 
322 aa  338  7e-92  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0268  hypothetical protein  56.51 
 
 
288 aa  297  1e-79  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0031  hypothetical protein  41.46 
 
 
291 aa  214  9.999999999999999e-55  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal  0.426299 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0603  hypothetical protein  37.28 
 
 
305 aa  199  5e-50  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1149  hypothetical protein  40.78 
 
 
297 aa  197  1.0000000000000001e-49  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.30507  normal  0.426274 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0368  hypothetical protein  36.45 
 
 
309 aa  192  4e-48  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.000000592569  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1917  hypothetical protein  36.55 
 
 
300 aa  190  2e-47  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.944351 
 
 
-
 
NC_002950  PG0160  hypothetical protein  40.14 
 
 
300 aa  188  1e-46  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6322  hypothetical protein  37.8 
 
 
303 aa  184  1.0000000000000001e-45  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3149  hypothetical protein  37.02 
 
 
299 aa  182  4.0000000000000006e-45  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1411  hypothetical protein  33.56 
 
 
303 aa  180  2.9999999999999997e-44  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0848057  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0569  hypothetical protein  35.59 
 
 
303 aa  179  7e-44  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00106206  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0247  hypothetical protein  36.7 
 
 
306 aa  178  1e-43  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.893142  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1222  hypothetical protein  32.53 
 
 
305 aa  173  1.9999999999999998e-42  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.342426  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0634  hypothetical protein  32.53 
 
 
300 aa  170  2e-41  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.909002 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1519  hypothetical protein  34.48 
 
 
287 aa  167  2e-40  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.109074  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1673  hypothetical protein  32.4 
 
 
305 aa  149  8e-35  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_28250  dTDP-glucose pyrophosphorylase  28.93 
 
 
263 aa  57.4  0.0000003  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.682184  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0506  nucleotidyl transferase  23.78 
 
 
393 aa  55.1  0.000001  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0530  glucose-1-phosphate thymidylyltransferase  23.59 
 
 
393 aa  53.9  0.000003  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.911327  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_471  nucleoside-diphosphate-sugar pyrophosphorylase  25 
 
 
393 aa  52.4  0.000008  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1415  4-diphosphocytidyl-2C-methyl-D-erythritol synthase  38.81 
 
 
204 aa  46.6  0.0005  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4310  molybdenum hydroxylase accessory protein, YgfJ family  44.23 
 
 
228 aa  44.7  0.002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.707183  normal  0.580614 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1805  UTP-glucose-1-phosphate uridylyltransferase  29.03 
 
 
289 aa  43.9  0.003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.403699  normal  0.224939 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0665  glucosamine-1-phosphate N-acetyltransferase / UDP-N-acetylglucosamine pyrophosphorylase  21.65 
 
 
374 aa  43.5  0.004  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1202  Nucleotidyl transferase  26.81 
 
 
393 aa  43.1  0.005  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>