45 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Shewana3_3808 on replicon NC_008577
Organism: Shewanella sp. ANA-3



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008577  Shewana3_3808  hypothetical protein  100 
 
 
290 aa  597  1e-169  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3611  hypothetical protein  95.17 
 
 
293 aa  545  1e-154  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0332  hypothetical protein  93.79 
 
 
293 aa  536  1e-151  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal  0.30778 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0363  hypothetical protein  88.62 
 
 
293 aa  532  1e-150  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0355  hypothetical protein  83.45 
 
 
290 aa  502  1e-141  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0362  hypothetical protein  83.1 
 
 
290 aa  499  1e-140  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0357  hypothetical protein  83.45 
 
 
290 aa  500  1e-140  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0365  hypothetical protein  83.45 
 
 
290 aa  498  1e-140  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000186978 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3628  hypothetical protein  81.72 
 
 
290 aa  488  1e-137  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.458062  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3875  hypothetical protein  60.07 
 
 
301 aa  347  1e-94  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.584028  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0338  hypothetical protein  54.58 
 
 
322 aa  335  5e-91  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4579  hypothetical protein  57.05 
 
 
319 aa  324  1e-87  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  unclonable  0.0000000316379 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3495  hypothetical protein  58 
 
 
314 aa  322  3e-87  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0268  hypothetical protein  56.9 
 
 
288 aa  300  1e-80  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0031  hypothetical protein  40.28 
 
 
291 aa  197  2.0000000000000003e-49  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal  0.426299 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1149  hypothetical protein  39.73 
 
 
297 aa  194  1e-48  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.30507  normal  0.426274 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0603  hypothetical protein  36.24 
 
 
305 aa  192  4e-48  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0569  hypothetical protein  38.06 
 
 
303 aa  191  1e-47  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00106206  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1917  hypothetical protein  38.44 
 
 
300 aa  190  2e-47  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.944351 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6322  hypothetical protein  39.59 
 
 
303 aa  190  2.9999999999999997e-47  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0368  hypothetical protein  36.79 
 
 
309 aa  187  2e-46  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.000000592569  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3149  hypothetical protein  38.41 
 
 
299 aa  182  7e-45  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002950  PG0160  hypothetical protein  39.58 
 
 
300 aa  182  8.000000000000001e-45  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0247  hypothetical protein  36.73 
 
 
306 aa  173  2.9999999999999996e-42  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.893142  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1411  hypothetical protein  34.03 
 
 
303 aa  172  5.999999999999999e-42  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0848057  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0634  hypothetical protein  32.87 
 
 
300 aa  169  4e-41  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.909002 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1222  hypothetical protein  32.99 
 
 
305 aa  166  5e-40  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.342426  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1519  hypothetical protein  34.38 
 
 
287 aa  161  2e-38  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.109074  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1673  hypothetical protein  32.64 
 
 
305 aa  147  1.0000000000000001e-34  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0506  nucleotidyl transferase  24.37 
 
 
393 aa  53.1  0.000005  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0530  glucose-1-phosphate thymidylyltransferase  24 
 
 
393 aa  52.8  0.000006  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.911327  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_471  nucleoside-diphosphate-sugar pyrophosphorylase  23.66 
 
 
393 aa  49.7  0.00006  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_28250  dTDP-glucose pyrophosphorylase  26.45 
 
 
263 aa  47.4  0.0003  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.682184  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4310  molybdenum hydroxylase accessory protein, YgfJ family  42.31 
 
 
228 aa  44.7  0.002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.707183  normal  0.580614 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1202  Nucleotidyl transferase  25.36 
 
 
393 aa  43.5  0.004  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5057  UTP-glucose-1-phosphate uridylyltransferase  26.77 
 
 
295 aa  42.4  0.008  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.839194  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5029  UTP-glucose-1-phosphate uridylyltransferase  26.77 
 
 
296 aa  42.4  0.008  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0184  UTP-glucose-1-phosphate uridylyltransferase  26.77 
 
 
296 aa  42.4  0.008  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5050  UTP-glucose-1-phosphate uridylyltransferase  26.77 
 
 
296 aa  42.7  0.008  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.80239  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5063  UTP-glucose-1-phosphate uridylyltransferase  26.77 
 
 
296 aa  42.4  0.008  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4789  UTP-glucose-1-phosphate uridylyltransferase  26.77 
 
 
295 aa  42.4  0.009  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4630  UTP-glucose-1-phosphate uridylyltransferase  26.77 
 
 
295 aa  42.4  0.009  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00254018  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4650  UTP-glucose-1-phosphate uridylyltransferase  26.77 
 
 
295 aa  42.4  0.009  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.0000000733677  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5152  UTP-glucose-1-phosphate uridylyltransferase  26.77 
 
 
295 aa  42.4  0.009  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4740  UTP-glucose-1-phosphate uridylyltransferase  26.36 
 
 
295 aa  42.4  0.01  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0459455  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>