78 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cphy_0247 on replicon NC_010001
Organism: Clostridium phytofermentans ISDg



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010001  Cphy_0247  hypothetical protein  100 
 
 		 306 aa  624  1e-178  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.893142  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0368  hypothetical protein  55.26 
 
 		 309 aa  329  3e-89  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.000000592569  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0569  hypothetical protein  52.44 
 
 		 303 aa  322  7e-87  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00106206  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0160  hypothetical protein  49.5 
 
 		 300 aa  299  3e-80  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1411  hypothetical protein  48.52 
 
 		 303 aa  293  3e-78  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0848057  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1673  hypothetical protein  50.65 
 
 		 305 aa  293  3e-78  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1222  hypothetical protein  47.21 
 
 		 305 aa  286  4e-76  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.342426  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1917  hypothetical protein  45.54 
 
 		 300 aa  285  7e-76  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.944351 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0031  hypothetical protein  49.49 
 
 		 291 aa  276  4e-73  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  0.426299 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1149  hypothetical protein  43.28 
 
 		 297 aa  271  1e-71  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.30507  normal  0.426274 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0634  hypothetical protein  44.74 
 
 		 300 aa  253  3e-66  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.909002 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6322  hypothetical protein  44.66 
 
 		 303 aa  253  3e-66  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0603  hypothetical protein  40.63 
 
 		 305 aa  233  4.0000000000000004e-60  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3149  hypothetical protein  41.75 
 
 		 299 aa  228  1e-58  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1519  hypothetical protein  39.53 
 
 		 287 aa  207  1e-52  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.109074  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0363  hypothetical protein  39.53 
 
 		 293 aa  186  3e-46  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3875  hypothetical protein  36.88 
 
 		 301 aa  182  5.0000000000000004e-45  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.584028  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0268  hypothetical protein  37.21 
 
 		 288 aa  182  7e-45  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0355  hypothetical protein  36.7 
 
 		 290 aa  181  1e-44  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0362  hypothetical protein  36.7 
 
 		 290 aa  180  2.9999999999999997e-44  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3495  hypothetical protein  38.36 
 
 		 314 aa  180  2.9999999999999997e-44  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0357  hypothetical protein  36.7 
 
 		 290 aa  179  4.999999999999999e-44  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3628  hypothetical protein  37.63 
 
 		 290 aa  178  8e-44  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.458062  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0365  hypothetical protein  36.7 
 
 		 290 aa  178  1e-43  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000186978 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0338  hypothetical protein  36.86 
 
 		 322 aa  175  8e-43  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3611  hypothetical protein  36.73 
 
 		 293 aa  169  5e-41  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0332  hypothetical protein  36.39 
 
 		 293 aa  169  8e-41  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.30778 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4579  hypothetical protein  35.18 
 
 		 319 aa  168  1e-40  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  unclonable  0.0000000316379 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3808  hypothetical protein  36.73 
 
 		 290 aa  162  8.000000000000001e-39  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1077  UTP-glucose-1-phosphate uridylyltransferase  29.75 
 
 		 300 aa  47.8  0.0002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.645448  normal  0.304823 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1591  UTP-glucose-1-phosphate uridylyltransferase  31.01 
 
 		 296 aa  47.4  0.0003  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1534  UTP-glucose-1-phosphate uridylyltransferase  31.01 
 
 		 296 aa  47.4  0.0003  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1973  UTP-glucose-1-phosphate uridylyltransferase  29.68 
 
 		 305 aa  46.6  0.0005  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.09229  normal  0.531021 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3611  UTP-glucose-1-phosphate uridylyltransferase  29.46 
 
 		 295 aa  46.2  0.0007  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3313  UTP-glucose-1-phosphate uridylyltransferase  29.46 
 
 		 295 aa  45.8  0.0008  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.426102  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RSp0006  UTP--glucose-1-phosphate uridylyltransferase UDP-glucose pyrophosphorylase protein  28.66 
 
 		 321 aa  45.4  0.001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0524481  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_3786  UTP-glucose-1-phosphate uridylyltransferase  29.93 
 
 		 317 aa  45.4  0.001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0945557  normal  0.170806 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1717  UTP-glucose-1-phosphate uridylyltransferase GalU  29.41 
 
 		 296 aa  45.4  0.001  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.88424  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2225  UDP-glucose pyrophosphorylase  29.03 
 
 		 305 aa  45.4  0.001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.0411622 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3899  UTP-glucose-1-phosphate uridylyltransferase  29.93 
 
 		 317 aa  45.4  0.001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.79289  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3870  UTP-glucose-1-phosphate uridylyltransferase  29.25 
 
 		 295 aa  44.3  0.002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_28250  dTDP-glucose pyrophosphorylase  23.97 
 
 		 263 aa  44.3  0.002  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.682184  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2109  UDP-glucose pyrophosphorylase  29.25 
 
 		 295 aa  44.3  0.002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.814022  normal  0.448139 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0648  UTP-glucose-1-phosphate uridylyltransferase  30.23 
 
 		 294 aa  44.7  0.002  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.324766  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0699  UTP-glucose-1-phosphate uridylyltransferase  29.56 
 
 		 294 aa  45.1  0.002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0659  UDP-glucose pyrophosphorylase  28.57 
 
 		 298 aa  45.1  0.002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3367  UTP-glucose-1-phosphate uridylyltransferase  29.25 
 
 		 295 aa  44.3  0.002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6189  UTP-glucose-1-phosphate uridylyltransferase  29.93 
 
 		 294 aa  45.1  0.002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.642524  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1652  UTP-glucose-1-phosphate uridylyltransferase  29.55 
 
 		 292 aa  44.7  0.002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.601586  normal  0.125455 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2707  UTP-glucose-1-phosphate uridylyltransferase  27.13 
 
 		 295 aa  43.9  0.003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.206675  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1627  UTP-glucose-1-phosphate uridylyltransferase  32.03 
 
 		 287 aa  44.3  0.003  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5920  UTP-glucose-1-phosphate uridylyltransferase  29.71 
 
 		 294 aa  43.9  0.003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.366675  normal  0.485189 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3552  UTP-glucose-1-phosphate uridylyltransferase  29.25 
 
 		 295 aa  44.3  0.003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.489332  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3723  UDP-glucose pyrophosphorylase  31.43 
 
 		 299 aa  43.9  0.003  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.61357  normal  0.645527 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4390  UTP-glucose-1-phosphate uridylyltransferase  29.25 
 
 		 295 aa  44.3  0.003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0829901  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3977  UTP-glucose-1-phosphate uridylyltransferase  29.25 
 
 		 295 aa  44.3  0.003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.482021  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3626  UTP-glucose-1-phosphate uridylyltransferase  28.67 
 
 		 288 aa  43.9  0.003  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00403447 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2479  UTP-glucose-1-phosphate uridylyltransferase  30.07 
 
 		 310 aa  43.5  0.004  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.347896  normal  0.922436 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2283  UTP-glucose-1-phosphate uridylyltransferase  28.93 
 
 		 295 aa  43.5  0.004  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2422  UTP-glucose-1-phosphate uridylyltransferase  28.93 
 
 		 295 aa  43.5  0.004  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1877  UTP-glucose-1-phosphate uridylyltransferase  28.93 
 
 		 325 aa  43.5  0.004  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1702  UTP-glucose-1-phosphate uridylyltransferase  28.93 
 
 		 295 aa  43.5  0.004  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.613955  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2020  glucose-1-phosphate thymidylyltransferase  31.4 
 
 		 397 aa  43.5  0.004  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.611525 
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1669  UTP-glucose-1-phosphate uridylyltransferase  28.93 
 
 		 325 aa  43.5  0.004  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0749  UTP-glucose-1-phosphate uridylyltransferase  28.93 
 
 		 327 aa  43.5  0.004  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0549  UTP-glucose-1-phosphate uridylyltransferase  28.93 
 
 		 325 aa  43.5  0.004  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2931  UTP--glucose-1-phosphate uridylyltransferase  26.98 
 
 		 306 aa  43.5  0.005  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.000109311  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1518  UDP-glucose pyrophosphorylase  28.17 
 
 		 290 aa  43.1  0.006  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.722973  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0625  UDP-glucose pyrophosphorylase  29.46 
 
 		 289 aa  43.1  0.006  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.0556323  normal  0.764647 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1735  UDP-glucose pyrophosphorylase  29.14 
 
 		 289 aa  43.1  0.006  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1135  UDP-glucose pyrophosphorylase  31.2 
 
 		 288 aa  42.7  0.007  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00581514 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0445  UTP-glucose-1-phosphate uridylyltransferase  30.71 
 
 		 298 aa  42.7  0.008  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0606  UTP-glucose-1-phosphate uridylyltransferase  30.71 
 
 		 298 aa  42.7  0.008  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.490803  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1363  UTP-glucose-1-phosphate uridylyltransferase  29.71 
 
 		 293 aa  42.4  0.009  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2003  MobA-like protein-like  28.87 
 
 		 455 aa  42.4  0.009  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  decreased coverage  0.00000020239  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1592  UTP-glucose-1-phosphate uridylyltransferase  27.04 
 
 		 293 aa  42.4  0.01  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.414437  normal  1 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0334  UTP-glucose-1-phosphate uridylyltransferase  25.58 
 
 		 294 aa  42.4  0.01  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0238  D,D-heptose 1,7-bisphosphate phosphatase  25 
 
 		 408 aa  42.4  0.01  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.546722 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>