33 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Spea_3875 on replicon NC_009901
Organism: Shewanella pealeana ATCC 700345



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009901  Spea_3875  hypothetical protein  100 
 
 
301 aa  624  1e-178  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.584028  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0362  hypothetical protein  58.7 
 
 
290 aa  345  4e-94  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0363  hypothetical protein  59.59 
 
 
293 aa  344  1e-93  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0355  hypothetical protein  58.36 
 
 
290 aa  344  1e-93  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0357  hypothetical protein  58.7 
 
 
290 aa  343  2.9999999999999997e-93  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0365  hypothetical protein  58.7 
 
 
290 aa  341  7e-93  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000186978 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3808  hypothetical protein  60.07 
 
 
290 aa  338  4e-92  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3611  hypothetical protein  60.41 
 
 
293 aa  338  5e-92  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0332  hypothetical protein  60.41 
 
 
293 aa  338  5e-92  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal  0.30778 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3628  hypothetical protein  58.56 
 
 
290 aa  338  5.9999999999999996e-92  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.458062  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0338  hypothetical protein  53.38 
 
 
322 aa  333  2e-90  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4579  hypothetical protein  55.81 
 
 
319 aa  323  2e-87  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  unclonable  0.0000000316379 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3495  hypothetical protein  52.48 
 
 
314 aa  314  9.999999999999999e-85  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0268  hypothetical protein  52.72 
 
 
288 aa  279  3e-74  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6322  hypothetical protein  42.67 
 
 
303 aa  227  2e-58  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0031  hypothetical protein  40.75 
 
 
291 aa  223  3e-57  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal  0.426299 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0368  hypothetical protein  41.04 
 
 
309 aa  209  4e-53  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.000000592569  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1411  hypothetical protein  37.58 
 
 
303 aa  205  7e-52  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0848057  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1222  hypothetical protein  36.79 
 
 
305 aa  202  6e-51  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.342426  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0160  hypothetical protein  41.16 
 
 
300 aa  202  8e-51  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1149  hypothetical protein  40.7 
 
 
297 aa  200  1.9999999999999998e-50  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.30507  normal  0.426274 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0603  hypothetical protein  36.12 
 
 
305 aa  199  3.9999999999999996e-50  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3149  hypothetical protein  39.66 
 
 
299 aa  195  7e-49  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0634  hypothetical protein  36.49 
 
 
300 aa  192  4e-48  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.909002 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1917  hypothetical protein  36.9 
 
 
300 aa  191  1e-47  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.944351 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0247  hypothetical protein  36.88 
 
 
306 aa  182  4.0000000000000006e-45  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.893142  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0569  hypothetical protein  36.33 
 
 
303 aa  179  4e-44  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00106206  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1519  hypothetical protein  35.12 
 
 
287 aa  168  1e-40  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.109074  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1673  hypothetical protein  33.11 
 
 
305 aa  155  9e-37  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_28250  dTDP-glucose pyrophosphorylase  28.63 
 
 
263 aa  50.1  0.00004  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.682184  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2392  hypothetical protein  48 
 
 
207 aa  45.1  0.002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.831976 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1202  Nucleotidyl transferase  27.08 
 
 
393 aa  43.9  0.004  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4310  molybdenum hydroxylase accessory protein, YgfJ family  44.68 
 
 
228 aa  42.4  0.01  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.707183  normal  0.580614 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>