195 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CPR_1222 on replicon NC_008262
Organism: Clostridium perfringens SM101



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008262  CPR_1222  hypothetical protein  100 
 
 
305 aa  608  1e-173  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.342426  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1411  hypothetical protein  96.37 
 
 
303 aa  583  1.0000000000000001e-165  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0848057  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0368  hypothetical protein  54.79 
 
 
309 aa  322  4e-87  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.000000592569  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1917  hypothetical protein  47.47 
 
 
300 aa  286  4e-76  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.944351 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0247  hypothetical protein  47.21 
 
 
306 aa  286  4e-76  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.893142  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0634  hypothetical protein  50.17 
 
 
300 aa  285  5e-76  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.909002 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0569  hypothetical protein  49.66 
 
 
303 aa  285  5.999999999999999e-76  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00106206  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6322  hypothetical protein  44.19 
 
 
303 aa  276  4e-73  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1149  hypothetical protein  40.4 
 
 
297 aa  264  2e-69  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.30507  normal  0.426274 
 
 
-
 
NC_002950  PG0160  hypothetical protein  44 
 
 
300 aa  258  9e-68  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3149  hypothetical protein  41.14 
 
 
299 aa  249  3e-65  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0031  hypothetical protein  40.34 
 
 
291 aa  223  4e-57  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal  0.426299 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1673  hypothetical protein  39.87 
 
 
305 aa  221  9.999999999999999e-57  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0603  hypothetical protein  42.3 
 
 
305 aa  218  1e-55  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3875  hypothetical protein  36.79 
 
 
301 aa  202  6e-51  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.584028  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1519  hypothetical protein  38.36 
 
 
287 aa  197  1.0000000000000001e-49  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.109074  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0338  hypothetical protein  32.69 
 
 
322 aa  184  2.0000000000000003e-45  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0363  hypothetical protein  33.33 
 
 
293 aa  180  2.9999999999999997e-44  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0268  hypothetical protein  32.88 
 
 
288 aa  178  9e-44  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3628  hypothetical protein  33.22 
 
 
290 aa  175  9.999999999999999e-43  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.458062  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0355  hypothetical protein  32.53 
 
 
290 aa  174  9.999999999999999e-43  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0365  hypothetical protein  32.53 
 
 
290 aa  173  2.9999999999999996e-42  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000186978 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0362  hypothetical protein  32.18 
 
 
290 aa  173  3.9999999999999995e-42  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3495  hypothetical protein  31.44 
 
 
314 aa  172  5e-42  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0357  hypothetical protein  32.18 
 
 
290 aa  172  6.999999999999999e-42  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0332  hypothetical protein  33.33 
 
 
293 aa  169  6e-41  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal  0.30778 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3611  hypothetical protein  33.33 
 
 
293 aa  168  8e-41  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4579  hypothetical protein  32.01 
 
 
319 aa  161  1e-38  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  unclonable  0.0000000316379 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3808  hypothetical protein  32.99 
 
 
290 aa  160  2e-38  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2479  UTP-glucose-1-phosphate uridylyltransferase  30.53 
 
 
310 aa  55.8  0.0000008  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.347896  normal  0.922436 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0648  UTP-glucose-1-phosphate uridylyltransferase  30.88 
 
 
294 aa  53.5  0.000005  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.324766  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RSp0006  UTP--glucose-1-phosphate uridylyltransferase UDP-glucose pyrophosphorylase protein  30.15 
 
 
321 aa  53.1  0.000006  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0524481  normal 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1630  Nucleotidyl transferase  24.2 
 
 
397 aa  52.8  0.000007  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1717  UTP-glucose-1-phosphate uridylyltransferase GalU  29.93 
 
 
296 aa  52.8  0.000008  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.88424  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1973  UTP-glucose-1-phosphate uridylyltransferase  29.85 
 
 
305 aa  51.2  0.00002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.09229  normal  0.531021 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4927  UDP-glucose pyrophosphorylase  22.07 
 
 
293 aa  51.6  0.00002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.241232 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2537  UDP-glucose pyrophosphorylase  34.33 
 
 
292 aa  51.2  0.00002  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal  0.619652 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_3786  UTP-glucose-1-phosphate uridylyltransferase  29.63 
 
 
317 aa  50.8  0.00003  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0945557  normal  0.170806 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3899  UTP-glucose-1-phosphate uridylyltransferase  29.63 
 
 
317 aa  50.8  0.00003  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.79289  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5449  UTP-glucose-1-phosphate uridylyltransferase  28.47 
 
 
293 aa  50.8  0.00003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.784502  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5396  UTP-glucose-1-phosphate uridylyltransferase  28.68 
 
 
293 aa  50.4  0.00004  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1702  UTP-glucose-1-phosphate uridylyltransferase  30.08 
 
 
295 aa  50.1  0.00004  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.613955  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1735  UDP-glucose pyrophosphorylase  24.26 
 
 
289 aa  50.4  0.00004  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1669  UTP-glucose-1-phosphate uridylyltransferase  30.08 
 
 
325 aa  50.1  0.00004  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1877  UTP-glucose-1-phosphate uridylyltransferase  30.08 
 
 
325 aa  50.1  0.00004  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2422  UTP-glucose-1-phosphate uridylyltransferase  30.08 
 
 
295 aa  50.1  0.00004  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2283  UTP-glucose-1-phosphate uridylyltransferase  30.08 
 
 
295 aa  50.1  0.00004  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0549  UTP-glucose-1-phosphate uridylyltransferase  30.08 
 
 
325 aa  50.1  0.00004  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0625  UDP-glucose pyrophosphorylase  28.24 
 
 
289 aa  50.1  0.00005  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.0556323  normal  0.764647 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0749  UTP-glucose-1-phosphate uridylyltransferase  30.08 
 
 
327 aa  50.1  0.00005  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0699  UTP-glucose-1-phosphate uridylyltransferase  30.08 
 
 
294 aa  50.1  0.00005  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1077  UTP-glucose-1-phosphate uridylyltransferase  29.2 
 
 
300 aa  50.1  0.00005  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.645448  normal  0.304823 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4605  UTP-glucose-1-phosphate uridylyltransferase  30.88 
 
 
295 aa  50.1  0.00005  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1435  UTP-glucose-1-phosphate uridylyltransferase  28.24 
 
 
294 aa  50.1  0.00005  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.36592  normal  0.483741 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2225  UDP-glucose pyrophosphorylase  29.1 
 
 
305 aa  49.7  0.00006  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.0411622 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3552  UTP-glucose-1-phosphate uridylyltransferase  30.53 
 
 
295 aa  49.3  0.00007  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.489332  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4390  UTP-glucose-1-phosphate uridylyltransferase  30.53 
 
 
295 aa  49.3  0.00007  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0829901  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3211  UDP-glucose pyrophosphorylase  29.66 
 
 
323 aa  49.3  0.00007  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.464773  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3977  UTP-glucose-1-phosphate uridylyltransferase  30.53 
 
 
295 aa  49.3  0.00007  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.482021  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2109  UDP-glucose pyrophosphorylase  30.53 
 
 
295 aa  49.3  0.00008  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.814022  normal  0.448139 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3367  UTP-glucose-1-phosphate uridylyltransferase  30.53 
 
 
295 aa  49.3  0.00008  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2237  UTP-glucose-1-phosphate uridylyltransferase GalU  28 
 
 
302 aa  49.3  0.00008  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3579  UTP-glucose-1-phosphate uridylyltransferase  30.53 
 
 
293 aa  49.3  0.00008  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.0429781 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3870  UTP-glucose-1-phosphate uridylyltransferase  30.53 
 
 
295 aa  49.3  0.00008  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2073  UTP-glucose-1-phosphate uridylyltransferase  27.85 
 
 
296 aa  49.3  0.00009  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3529  UTP-glucose-1-phosphate uridylyltransferase  30.15 
 
 
295 aa  49.3  0.00009  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4956  UTP--glucose-1-phosphate uridylyltransferase  29.41 
 
 
297 aa  48.9  0.0001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00000197493  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0862  UDP-glucose pyrophosphorylase  27.61 
 
 
298 aa  48.5  0.0001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0734  UTP--glucose-1-phosphate uridylyltransferase  30.53 
 
 
297 aa  48.9  0.0001  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_3295  glucose-1-phosphate thymidylyltransferase  21.11 
 
 
294 aa  48.5  0.0001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  unclonable  0.00238421  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2945  Nucleotidyl transferase  21.93 
 
 
248 aa  48.9  0.0001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5920  UTP-glucose-1-phosphate uridylyltransferase  28.36 
 
 
294 aa  48.5  0.0001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.366675  normal  0.485189 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1219  UTP-glucose-1-phosphate uridylyltransferase  25.97 
 
 
296 aa  48.5  0.0001  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal  0.184128 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2893  glucose-1-phosphate thymidylyltransferase  21.11 
 
 
294 aa  48.5  0.0001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal  0.413887 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0859  UTP-glucose-1-phosphate uridylyltransferase  29.41 
 
 
289 aa  48.1  0.0002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  decreased coverage  0.00129209  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5057  UTP-glucose-1-phosphate uridylyltransferase  29.53 
 
 
295 aa  48.1  0.0002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.839194  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4789  UTP-glucose-1-phosphate uridylyltransferase  29.53 
 
 
295 aa  48.5  0.0002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4630  UTP-glucose-1-phosphate uridylyltransferase  29.53 
 
 
295 aa  48.5  0.0002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00254018  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4650  UTP-glucose-1-phosphate uridylyltransferase  29.53 
 
 
295 aa  48.5  0.0002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.0000000733677  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0926  UTP-glucose-1-phosphate uridylyltransferase  28.36 
 
 
293 aa  48.1  0.0002  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1845  UTP-glucose-1-phosphate uridylyltransferase  28.36 
 
 
293 aa  48.1  0.0002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.276349  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7385  UDP-glucose pyrophosphorylase  28.36 
 
 
294 aa  48.1  0.0002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.921964 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1159  UDP-glucose pyrophosphorylase  28.68 
 
 
291 aa  48.1  0.0002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000567806  decreased coverage  0.00280278 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1518  UDP-glucose pyrophosphorylase  28.68 
 
 
290 aa  48.1  0.0002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.722973  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5152  UTP-glucose-1-phosphate uridylyltransferase  29.53 
 
 
295 aa  48.5  0.0002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1363  UTP-glucose-1-phosphate uridylyltransferase  29.01 
 
 
293 aa  47.8  0.0002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1498  UTP-glucose-1-phosphate uridylyltransferase  30.53 
 
 
288 aa  48.1  0.0002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.000563267  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1592  UTP-glucose-1-phosphate uridylyltransferase  29.63 
 
 
293 aa  47.8  0.0002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.414437  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1334  UDP-glucose pyrophosphorylase  29.45 
 
 
293 aa  47.8  0.0002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1737  UDP-glucose pyrophosphorylase  29.41 
 
 
293 aa  47.8  0.0002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.793832  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1320  UTP-glucose-1-phosphate uridylyltransferase  29.41 
 
 
294 aa  48.1  0.0002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1462  UDP-glucose pyrophosphorylase  28.99 
 
 
313 aa  48.1  0.0002  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.430614  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3621  UTP-glucose-1-phosphate uridylyltransferase  29.77 
 
 
289 aa  47.8  0.0002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.603812  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1459  UTP-glucose-1-phosphate uridylyltransferase  28.36 
 
 
293 aa  48.1  0.0002  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0423  UTP-glucose-1-phosphate uridylyltransferase  28.36 
 
 
293 aa  48.1  0.0002  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1359  UTP-glucose-1-phosphate uridylyltransferase  29.41 
 
 
294 aa  48.1  0.0002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.371452  normal 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1668  UTP-glucose-1-phosphate uridylyltransferase  28.36 
 
 
293 aa  48.1  0.0002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1690  UTP-glucose-1-phosphate uridylyltransferase  28.36 
 
 
293 aa  48.1  0.0002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.914927  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0740  UTP-glucose-1-phosphate uridylyltransferase  28.36 
 
 
293 aa  48.1  0.0002  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0991  Nucleotidyl transferase  22.73 
 
 
397 aa  48.1  0.0002  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>