40 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cphy_0569 on replicon NC_010001
Organism: Clostridium phytofermentans ISDg



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010001  Cphy_0569  hypothetical protein  100 
 
 
303 aa  620  1e-176  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00106206  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0368  hypothetical protein  54.97 
 
 
309 aa  330  2e-89  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.000000592569  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0247  hypothetical protein  52.44 
 
 
306 aa  322  7e-87  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.893142  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1411  hypothetical protein  49.83 
 
 
303 aa  291  8e-78  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0848057  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6322  hypothetical protein  46.56 
 
 
303 aa  291  9e-78  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1917  hypothetical protein  47.02 
 
 
300 aa  290  2e-77  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.944351 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1222  hypothetical protein  49.66 
 
 
305 aa  285  5.999999999999999e-76  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.342426  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0160  hypothetical protein  45.36 
 
 
300 aa  276  3e-73  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1149  hypothetical protein  43.61 
 
 
297 aa  275  1.0000000000000001e-72  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.30507  normal  0.426274 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3149  hypothetical protein  45.36 
 
 
299 aa  273  3e-72  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0634  hypothetical protein  45.87 
 
 
300 aa  264  1e-69  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.909002 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0031  hypothetical protein  43.73 
 
 
291 aa  250  2e-65  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal  0.426299 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1673  hypothetical protein  41.12 
 
 
305 aa  245  4.9999999999999997e-64  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0603  hypothetical protein  42.81 
 
 
305 aa  233  3e-60  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1519  hypothetical protein  40.54 
 
 
287 aa  220  1.9999999999999999e-56  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.109074  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0363  hypothetical protein  36.68 
 
 
293 aa  198  1.0000000000000001e-49  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0268  hypothetical protein  35.35 
 
 
288 aa  189  4e-47  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0338  hypothetical protein  35.24 
 
 
322 aa  189  5.999999999999999e-47  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3628  hypothetical protein  37.07 
 
 
290 aa  184  2.0000000000000003e-45  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.458062  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0355  hypothetical protein  35.52 
 
 
290 aa  182  5.0000000000000004e-45  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0357  hypothetical protein  35.93 
 
 
290 aa  180  2e-44  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3808  hypothetical protein  38.06 
 
 
290 aa  180  2.9999999999999997e-44  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3875  hypothetical protein  36.33 
 
 
301 aa  179  4e-44  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.584028  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0362  hypothetical protein  35.59 
 
 
290 aa  179  4.999999999999999e-44  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0365  hypothetical protein  35.59 
 
 
290 aa  179  7e-44  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000186978 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0332  hypothetical protein  37.02 
 
 
293 aa  178  8e-44  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal  0.30778 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3611  hypothetical protein  37.37 
 
 
293 aa  177  2e-43  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4579  hypothetical protein  35.18 
 
 
319 aa  176  4e-43  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  unclonable  0.0000000316379 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3495  hypothetical protein  34 
 
 
314 aa  169  5e-41  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3621  UTP-glucose-1-phosphate uridylyltransferase  30.53 
 
 
289 aa  50.4  0.00003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.603812  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3553  UTP-glucose-1-phosphate uridylyltransferase  30.53 
 
 
289 aa  50.1  0.00005  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3469  UDP-glucose pyrophosphorylase  31.3 
 
 
289 aa  48.5  0.0001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.300387  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3579  UTP-glucose-1-phosphate uridylyltransferase  28.24 
 
 
293 aa  45.8  0.0009  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.0429781 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0688  UTP--glucose-1-phosphate uridylyltransferase  31.06 
 
 
334 aa  45.4  0.001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.289129 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1202  Nucleotidyl transferase  25.16 
 
 
393 aa  45.8  0.001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2065  Nucleotidyl transferase  23.72 
 
 
393 aa  45.1  0.002  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3211  UDP-glucose pyrophosphorylase  26.12 
 
 
323 aa  42.7  0.007  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.464773  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2479  UTP-glucose-1-phosphate uridylyltransferase  29.77 
 
 
310 aa  42.4  0.009  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.347896  normal  0.922436 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0481  UTP-glucose-1-phosphate uridylyltransferase GalU  32.06 
 
 
287 aa  42.4  0.009  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0151475  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6661  UDP-N-acetylglucosamine pyrophosphorylase  27.43 
 
 
483 aa  42.4  0.009  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>