31 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sama_0268 on replicon NC_008700
Organism: Shewanella amazonensis SB2B



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008700  Sama_0268  hypothetical protein  100 
 
 
288 aa  583  1e-166  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3628  hypothetical protein  58.08 
 
 
290 aa  301  1e-80  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.458062  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0362  hypothetical protein  56.51 
 
 
290 aa  301  1e-80  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0363  hypothetical protein  55.9 
 
 
293 aa  300  2e-80  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0355  hypothetical protein  56.21 
 
 
290 aa  299  3e-80  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0357  hypothetical protein  56.16 
 
 
290 aa  298  7e-80  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0365  hypothetical protein  56.51 
 
 
290 aa  297  1e-79  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000186978 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0332  hypothetical protein  56.94 
 
 
293 aa  291  9e-78  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal  0.30778 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3611  hypothetical protein  56.94 
 
 
293 aa  291  1e-77  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3808  hypothetical protein  56.9 
 
 
290 aa  290  2e-77  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0338  hypothetical protein  51.49 
 
 
322 aa  286  2e-76  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3495  hypothetical protein  52.19 
 
 
314 aa  281  9e-75  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3875  hypothetical protein  52.72 
 
 
301 aa  279  3e-74  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.584028  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4579  hypothetical protein  50 
 
 
319 aa  270  2e-71  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  unclonable  0.0000000316379 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6322  hypothetical protein  41.61 
 
 
303 aa  203  3e-51  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002950  PG0160  hypothetical protein  40.69 
 
 
300 aa  196  5.000000000000001e-49  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0031  hypothetical protein  38.95 
 
 
291 aa  193  2e-48  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal  0.426299 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0569  hypothetical protein  35.35 
 
 
303 aa  189  2.9999999999999997e-47  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00106206  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3149  hypothetical protein  39.31 
 
 
299 aa  186  5e-46  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1917  hypothetical protein  37.46 
 
 
300 aa  185  9e-46  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.944351 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1411  hypothetical protein  34.01 
 
 
303 aa  182  5.0000000000000004e-45  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0848057  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0247  hypothetical protein  37.21 
 
 
306 aa  182  6e-45  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.893142  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1149  hypothetical protein  40.07 
 
 
297 aa  179  7e-44  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.30507  normal  0.426274 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1222  hypothetical protein  32.88 
 
 
305 aa  178  8e-44  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.342426  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0603  hypothetical protein  34.6 
 
 
305 aa  177  2e-43  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0634  hypothetical protein  34.24 
 
 
300 aa  172  3.9999999999999995e-42  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.909002 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0368  hypothetical protein  33.78 
 
 
309 aa  172  5e-42  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.000000592569  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1519  hypothetical protein  36.27 
 
 
287 aa  160  2e-38  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.109074  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1673  hypothetical protein  30.23 
 
 
305 aa  136  5e-31  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_28250  dTDP-glucose pyrophosphorylase  25.42 
 
 
263 aa  53.1  0.000005  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.682184  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4310  molybdenum hydroxylase accessory protein, YgfJ family  45.28 
 
 
228 aa  43.9  0.003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.707183  normal  0.580614 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>