34 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sputcn32_3628 on replicon NC_009438
Organism: Shewanella putrefaciens CN-32



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009438  Sputcn32_3628  hypothetical protein  100 
 
 
290 aa  595  1e-169  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.458062  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0362  hypothetical protein  84.48 
 
 
290 aa  505  9.999999999999999e-143  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0357  hypothetical protein  84.83 
 
 
290 aa  505  9.999999999999999e-143  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0355  hypothetical protein  84.83 
 
 
290 aa  506  9.999999999999999e-143  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0365  hypothetical protein  84.83 
 
 
290 aa  503  1e-141  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000186978 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0363  hypothetical protein  80.34 
 
 
293 aa  484  1e-136  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3611  hypothetical protein  81.72 
 
 
293 aa  475  1e-133  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3808  hypothetical protein  81.72 
 
 
290 aa  476  1e-133  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0332  hypothetical protein  81.03 
 
 
293 aa  471  1e-132  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal  0.30778 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3875  hypothetical protein  58.56 
 
 
301 aa  338  5.9999999999999996e-92  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.584028  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0338  hypothetical protein  56.49 
 
 
322 aa  335  3.9999999999999995e-91  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4579  hypothetical protein  57.19 
 
 
319 aa  332  3e-90  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  unclonable  0.0000000316379 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3495  hypothetical protein  56.95 
 
 
314 aa  321  9.999999999999999e-87  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0268  hypothetical protein  58.08 
 
 
288 aa  301  1e-80  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0031  hypothetical protein  41.9 
 
 
291 aa  210  2e-53  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal  0.426299 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1149  hypothetical protein  39.93 
 
 
297 aa  204  1e-51  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.30507  normal  0.426274 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6322  hypothetical protein  39.25 
 
 
303 aa  200  3e-50  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002950  PG0160  hypothetical protein  42.07 
 
 
300 aa  197  1.0000000000000001e-49  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3149  hypothetical protein  39.37 
 
 
299 aa  192  7e-48  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1917  hypothetical protein  37.93 
 
 
300 aa  190  2e-47  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.944351 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0603  hypothetical protein  36.59 
 
 
305 aa  188  1e-46  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0368  hypothetical protein  36.45 
 
 
309 aa  186  4e-46  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.000000592569  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0569  hypothetical protein  37.07 
 
 
303 aa  184  2.0000000000000003e-45  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00106206  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1411  hypothetical protein  34.26 
 
 
303 aa  181  1e-44  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0848057  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0247  hypothetical protein  37.63 
 
 
306 aa  178  7e-44  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.893142  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1222  hypothetical protein  33.22 
 
 
305 aa  175  9.999999999999999e-43  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.342426  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0634  hypothetical protein  34.02 
 
 
300 aa  172  3.9999999999999995e-42  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.909002 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1519  hypothetical protein  35.76 
 
 
287 aa  170  3e-41  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.109074  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1673  hypothetical protein  33.56 
 
 
305 aa  147  1.0000000000000001e-34  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_28250  dTDP-glucose pyrophosphorylase  28.27 
 
 
263 aa  57.8  0.0000002  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.682184  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0506  nucleotidyl transferase  23.81 
 
 
393 aa  48.1  0.0002  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4310  molybdenum hydroxylase accessory protein, YgfJ family  46.15 
 
 
228 aa  47  0.0004  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.707183  normal  0.580614 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_471  nucleoside-diphosphate-sugar pyrophosphorylase  23.53 
 
 
393 aa  46.2  0.0007  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1415  4-diphosphocytidyl-2C-methyl-D-erythritol synthase  37.31 
 
 
204 aa  44.3  0.003  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>