30 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Shew_3495 on replicon NC_009092
Organism: Shewanella loihica PV-4



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009092  Shew_3495  hypothetical protein  100 
 
 		 314 aa  645    Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0355  hypothetical protein  59.27 
 
 		 290 aa  342  5e-93  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0362  hypothetical protein  59.27 
 
 		 290 aa  341  1e-92  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0365  hypothetical protein  59.27 
 
 		 290 aa  339  4e-92  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000186978 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0357  hypothetical protein  58.94 
 
 		 290 aa  337  1.9999999999999998e-91  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0363  hypothetical protein  58.55 
 
 		 293 aa  337  1.9999999999999998e-91  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0332  hypothetical protein  57.67 
 
 		 293 aa  327  1.0000000000000001e-88  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.30778 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3611  hypothetical protein  57.33 
 
 		 293 aa  324  1e-87  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3628  hypothetical protein  56.95 
 
 		 290 aa  321  9.999999999999999e-87  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.458062  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3808  hypothetical protein  58 
 
 		 290 aa  316  3e-85  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3875  hypothetical protein  52.48 
 
 		 301 aa  314  1.9999999999999998e-84  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.584028  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0338  hypothetical protein  49.22 
 
 		 322 aa  296  4e-79  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4579  hypothetical protein  51.59 
 
 		 319 aa  295  5e-79  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  unclonable  0.0000000316379 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0268  hypothetical protein  52.19 
 
 		 288 aa  281  1e-74  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1149  hypothetical protein  39.41 
 
 		 297 aa  190  2.9999999999999997e-47  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.30507  normal  0.426274 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0031  hypothetical protein  36.33 
 
 		 291 aa  184  2.0000000000000003e-45  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  0.426299 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0247  hypothetical protein  38.36 
 
 		 306 aa  180  2.9999999999999997e-44  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.893142  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0603  hypothetical protein  34.8 
 
 		 305 aa  179  4.999999999999999e-44  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1411  hypothetical protein  32.67 
 
 		 303 aa  175  9e-43  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0848057  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1917  hypothetical protein  34.55 
 
 		 300 aa  173  2.9999999999999996e-42  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.944351 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6322  hypothetical protein  36.18 
 
 		 303 aa  173  2.9999999999999996e-42  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1222  hypothetical protein  31.44 
 
 		 305 aa  172  5e-42  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.342426  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0634  hypothetical protein  34.45 
 
 		 300 aa  172  5e-42  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.909002 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3149  hypothetical protein  36.36 
 
 		 299 aa  171  1e-41  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002950  PG0160  hypothetical protein  36.58 
 
 		 300 aa  170  4e-41  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0569  hypothetical protein  34 
 
 		 303 aa  169  6e-41  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00106206  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1519  hypothetical protein  33.22 
 
 		 287 aa  166  6.9999999999999995e-40  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.109074  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0368  hypothetical protein  34.52 
 
 		 309 aa  159  8e-38  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.000000592569  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1673  hypothetical protein  32.53 
 
 		 305 aa  155  8e-37  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0506  nucleotidyl transferase  24.72 
 
 		 393 aa  42.4  0.009  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>