56 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dfer_3149 on replicon NC_013037
Organism: Dyadobacter fermentans DSM 18053



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013037  Dfer_3149  hypothetical protein  100 
 
 		 299 aa  624  1e-178  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6322  hypothetical protein  67.33 
 
 		 303 aa  433  1e-120  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1917  hypothetical protein  52.17 
 
 		 300 aa  343  2.9999999999999997e-93  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.944351 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0634  hypothetical protein  50.5 
 
 		 300 aa  317  1e-85  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.909002 
 
 
-
 
NC_002950  PG0160  hypothetical protein  48.84 
 
 		 300 aa  275  9e-73  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0569  hypothetical protein  45.36 
 
 		 303 aa  273  3e-72  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00106206  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0368  hypothetical protein  45.85 
 
 		 309 aa  267  2e-70  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.000000592569  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0031  hypothetical protein  47.78 
 
 		 291 aa  253  2.0000000000000002e-66  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  0.426299 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1411  hypothetical protein  41.81 
 
 		 303 aa  252  6e-66  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0848057  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1222  hypothetical protein  41.14 
 
 		 305 aa  249  3e-65  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.342426  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0603  hypothetical protein  40.66 
 
 		 305 aa  241  1e-62  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1149  hypothetical protein  42.24 
 
 		 297 aa  241  2e-62  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.30507  normal  0.426274 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1673  hypothetical protein  41.16 
 
 		 305 aa  230  2e-59  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0247  hypothetical protein  41.75 
 
 		 306 aa  228  1e-58  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.893142  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1519  hypothetical protein  41.5 
 
 		 287 aa  213  3.9999999999999995e-54  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.109074  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0338  hypothetical protein  40.33 
 
 		 322 aa  206  3e-52  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3875  hypothetical protein  39.66 
 
 		 301 aa  195  7e-49  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.584028  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3628  hypothetical protein  39.37 
 
 		 290 aa  192  7e-48  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.458062  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0363  hypothetical protein  38.19 
 
 		 293 aa  190  2e-47  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0355  hypothetical protein  37.28 
 
 		 290 aa  186  3e-46  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0268  hypothetical protein  39.31 
 
 		 288 aa  186  5e-46  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4579  hypothetical protein  37.75 
 
 		 319 aa  184  2.0000000000000003e-45  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  unclonable  0.0000000316379 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0357  hypothetical protein  36.93 
 
 		 290 aa  183  3e-45  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0362  hypothetical protein  37.37 
 
 		 290 aa  183  3e-45  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0365  hypothetical protein  37.02 
 
 		 290 aa  182  5.0000000000000004e-45  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000186978 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0332  hypothetical protein  38.62 
 
 		 293 aa  178  7e-44  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.30778 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3611  hypothetical protein  38.89 
 
 		 293 aa  177  1e-43  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3808  hypothetical protein  38.41 
 
 		 290 aa  177  2e-43  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3495  hypothetical protein  36.36 
 
 		 314 aa  171  1e-41  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_28250  dTDP-glucose pyrophosphorylase  25.83 
 
 		 263 aa  55.8  0.0000008  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.682184  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3211  UDP-glucose pyrophosphorylase  31.01 
 
 		 323 aa  48.1  0.0002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.464773  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1717  UTP-glucose-1-phosphate uridylyltransferase GalU  24.38 
 
 		 296 aa  47.4  0.0003  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.88424  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2479  UTP-glucose-1-phosphate uridylyltransferase  31.68 
 
 		 310 aa  45.1  0.001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.347896  normal  0.922436 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_17370  UTP-glucose-1-phosphate uridylyltransferase  23.71 
 
 		 304 aa  44.3  0.002  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2225  UDP-glucose pyrophosphorylase  27.38 
 
 		 305 aa  44.3  0.002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.0411622 
 
 
-
 
NC_003296  RSp0006  UTP--glucose-1-phosphate uridylyltransferase UDP-glucose pyrophosphorylase protein  27.88 
 
 		 321 aa  43.9  0.003  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0524481  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0699  UTP-glucose-1-phosphate uridylyltransferase  29.53 
 
 		 294 aa  44.3  0.003  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2280  UTP--glucose-1-phosphate uridylyltransferase  24.85 
 
 		 297 aa  43.5  0.005  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2283  UTP-glucose-1-phosphate uridylyltransferase  28.86 
 
 		 295 aa  43.1  0.005  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2422  UTP-glucose-1-phosphate uridylyltransferase  28.86 
 
 		 295 aa  43.1  0.005  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1702  UTP-glucose-1-phosphate uridylyltransferase  28.86 
 
 		 295 aa  43.1  0.005  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.613955  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0549  UTP-glucose-1-phosphate uridylyltransferase  28.86 
 
 		 325 aa  43.1  0.006  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0749  UTP-glucose-1-phosphate uridylyltransferase  28.86 
 
 		 327 aa  43.1  0.006  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1669  UTP-glucose-1-phosphate uridylyltransferase  28.86 
 
 		 325 aa  43.1  0.006  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1877  UTP-glucose-1-phosphate uridylyltransferase  28.86 
 
 		 325 aa  43.1  0.006  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1973  UTP-glucose-1-phosphate uridylyltransferase  26.79 
 
 		 305 aa  42.7  0.007  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.09229  normal  0.531021 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2634  UTP-glucose-1-phosphate uridylyltransferase  25.55 
 
 		 294 aa  42.4  0.008  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1845  UTP-glucose-1-phosphate uridylyltransferase  27.5 
 
 		 293 aa  42.4  0.01  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.276349  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0423  UTP-glucose-1-phosphate uridylyltransferase  27.5 
 
 		 293 aa  42.4  0.01  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0445  UTP-glucose-1-phosphate uridylyltransferase  30.39 
 
 		 298 aa  42.4  0.01  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0926  UTP-glucose-1-phosphate uridylyltransferase  27.5 
 
 		 293 aa  42.4  0.01  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1668  UTP-glucose-1-phosphate uridylyltransferase  27.5 
 
 		 293 aa  42.4  0.01  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1459  UTP-glucose-1-phosphate uridylyltransferase  27.5 
 
 		 293 aa  42.4  0.01  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0606  UTP-glucose-1-phosphate uridylyltransferase  30.39 
 
 		 298 aa  42.4  0.01  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.490803  normal  1 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1690  UTP-glucose-1-phosphate uridylyltransferase  27.5 
 
 		 293 aa  42.4  0.01  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.914927  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0740  UTP-glucose-1-phosphate uridylyltransferase  27.5 
 
 		 293 aa  42.4  0.01  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>