36 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Shew185_0355 on replicon NC_009665
Organism: Shewanella baltica OS185



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009665  Shew185_0355  hypothetical protein  100 
 
 
290 aa  595  1e-169  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0362  hypothetical protein  97.93 
 
 
290 aa  585  1e-166  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0365  hypothetical protein  97.93 
 
 
290 aa  582  1.0000000000000001e-165  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000186978 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0357  hypothetical protein  97.24 
 
 
290 aa  580  1.0000000000000001e-165  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3628  hypothetical protein  84.83 
 
 
290 aa  506  9.999999999999999e-143  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.458062  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0363  hypothetical protein  83.1 
 
 
293 aa  501  1e-141  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3611  hypothetical protein  84.14 
 
 
293 aa  489  1e-137  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3808  hypothetical protein  83.45 
 
 
290 aa  486  1e-136  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0332  hypothetical protein  83.45 
 
 
293 aa  482  1e-135  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal  0.30778 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3875  hypothetical protein  58.36 
 
 
301 aa  344  1e-93  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.584028  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3495  hypothetical protein  59.27 
 
 
314 aa  342  4e-93  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4579  hypothetical protein  58.03 
 
 
319 aa  339  4e-92  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  unclonable  0.0000000316379 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0338  hypothetical protein  56.49 
 
 
322 aa  337  1.9999999999999998e-91  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0268  hypothetical protein  56.21 
 
 
288 aa  299  3e-80  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0031  hypothetical protein  40.77 
 
 
291 aa  211  7.999999999999999e-54  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal  0.426299 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0603  hypothetical protein  38.33 
 
 
305 aa  205  8e-52  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0368  hypothetical protein  37.12 
 
 
309 aa  198  1.0000000000000001e-49  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.000000592569  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1149  hypothetical protein  40 
 
 
297 aa  196  5.000000000000001e-49  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.30507  normal  0.426274 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1917  hypothetical protein  36.9 
 
 
300 aa  194  1e-48  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.944351 
 
 
-
 
NC_002950  PG0160  hypothetical protein  40.83 
 
 
300 aa  194  1e-48  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3149  hypothetical protein  37.28 
 
 
299 aa  186  3e-46  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6322  hypothetical protein  37.8 
 
 
303 aa  186  4e-46  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0569  hypothetical protein  35.52 
 
 
303 aa  182  5.0000000000000004e-45  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00106206  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0247  hypothetical protein  36.7 
 
 
306 aa  181  1e-44  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.893142  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1411  hypothetical protein  33.56 
 
 
303 aa  181  2e-44  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0848057  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1222  hypothetical protein  32.53 
 
 
305 aa  174  9.999999999999999e-43  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.342426  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0634  hypothetical protein  32.87 
 
 
300 aa  173  2.9999999999999996e-42  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.909002 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1519  hypothetical protein  34.48 
 
 
287 aa  171  2e-41  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.109074  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1673  hypothetical protein  32.75 
 
 
305 aa  149  5e-35  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_28250  dTDP-glucose pyrophosphorylase  28.1 
 
 
263 aa  58.2  0.0000002  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.682184  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0530  glucose-1-phosphate thymidylyltransferase  23.59 
 
 
393 aa  53.9  0.000003  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.911327  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0506  nucleotidyl transferase  23.78 
 
 
393 aa  53.5  0.000004  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_471  nucleoside-diphosphate-sugar pyrophosphorylase  24.63 
 
 
393 aa  52  0.00001  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1415  4-diphosphocytidyl-2C-methyl-D-erythritol synthase  38.81 
 
 
204 aa  46.2  0.0006  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4310  molybdenum hydroxylase accessory protein, YgfJ family  44.23 
 
 
228 aa  44.7  0.002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.707183  normal  0.580614 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1202  Nucleotidyl transferase  28.99 
 
 
393 aa  44.7  0.002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>