174 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CPF_1411 on replicon NC_008261
Organism: Clostridium perfringens ATCC 13124



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008261  CPF_1411  hypothetical protein  100 
 
 		 303 aa  604  9.999999999999999e-173  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0848057  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1222  hypothetical protein  96.37 
 
 		 305 aa  583  1.0000000000000001e-165  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.342426  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0368  hypothetical protein  55.37 
 
 		 309 aa  329  3e-89  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.000000592569  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0247  hypothetical protein  48.52 
 
 		 306 aa  293  3e-78  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.893142  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1917  hypothetical protein  48.48 
 
 		 300 aa  291  7e-78  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.944351 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0569  hypothetical protein  49.83 
 
 		 303 aa  291  8e-78  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00106206  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0634  hypothetical protein  50.84 
 
 		 300 aa  290  2e-77  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.909002 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6322  hypothetical protein  45.18 
 
 		 303 aa  281  1e-74  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1149  hypothetical protein  39.94 
 
 		 297 aa  265  5.999999999999999e-70  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.30507  normal  0.426274 
 
 
-
 
NC_002950  PG0160  hypothetical protein  44.33 
 
 		 300 aa  258  7e-68  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3149  hypothetical protein  41.81 
 
 		 299 aa  252  6e-66  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0603  hypothetical protein  42.95 
 
 		 305 aa  224  2e-57  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1673  hypothetical protein  40.73 
 
 		 305 aa  223  3e-57  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0031  hypothetical protein  40.27 
 
 		 291 aa  222  6e-57  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  0.426299 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3875  hypothetical protein  37.58 
 
 		 301 aa  205  7e-52  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.584028  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1519  hypothetical protein  39.12 
 
 		 287 aa  204  2e-51  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.109074  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0363  hypothetical protein  34.38 
 
 		 293 aa  186  4e-46  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0338  hypothetical protein  33.44 
 
 		 322 aa  184  1.0000000000000001e-45  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0268  hypothetical protein  34.01 
 
 		 288 aa  182  6e-45  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3628  hypothetical protein  34.26 
 
 		 290 aa  181  2e-44  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.458062  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0355  hypothetical protein  33.56 
 
 		 290 aa  181  2e-44  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0365  hypothetical protein  33.56 
 
 		 290 aa  180  2.9999999999999997e-44  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000186978 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0362  hypothetical protein  33.22 
 
 		 290 aa  179  5.999999999999999e-44  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0357  hypothetical protein  33.22 
 
 		 290 aa  178  1e-43  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3495  hypothetical protein  32.67 
 
 		 314 aa  175  8e-43  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3611  hypothetical protein  34.38 
 
 		 293 aa  175  9.999999999999999e-43  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0332  hypothetical protein  34.38 
 
 		 293 aa  175  9.999999999999999e-43  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.30778 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3808  hypothetical protein  34.03 
 
 		 290 aa  167  2e-40  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4579  hypothetical protein  32.13 
 
 		 319 aa  164  2.0000000000000002e-39  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  unclonable  0.0000000316379 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1630  Nucleotidyl transferase  24.04 
 
 		 397 aa  50.8  0.00003  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2479  UTP-glucose-1-phosphate uridylyltransferase  29.01 
 
 		 310 aa  50.8  0.00003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.347896  normal  0.922436 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1717  UTP-glucose-1-phosphate uridylyltransferase GalU  29.1 
 
 		 296 aa  50.8  0.00003  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.88424  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RSp0006  UTP--glucose-1-phosphate uridylyltransferase UDP-glucose pyrophosphorylase protein  30.5 
 
 		 321 aa  50.4  0.00004  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0524481  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0648  UTP-glucose-1-phosphate uridylyltransferase  30.77 
 
 		 294 aa  50.4  0.00004  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.324766  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1702  UTP-glucose-1-phosphate uridylyltransferase  30.71 
 
 		 295 aa  49.7  0.00007  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.613955  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0749  UTP-glucose-1-phosphate uridylyltransferase  30.71 
 
 		 327 aa  49.3  0.00007  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1669  UTP-glucose-1-phosphate uridylyltransferase  30.71 
 
 		 325 aa  49.7  0.00007  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1877  UTP-glucose-1-phosphate uridylyltransferase  30.71 
 
 		 325 aa  49.7  0.00007  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2422  UTP-glucose-1-phosphate uridylyltransferase  30.71 
 
 		 295 aa  49.7  0.00007  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2283  UTP-glucose-1-phosphate uridylyltransferase  30.71 
 
 		 295 aa  49.7  0.00007  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0549  UTP-glucose-1-phosphate uridylyltransferase  30.71 
 
 		 325 aa  49.7  0.00007  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3579  UTP-glucose-1-phosphate uridylyltransferase  30.08 
 
 		 293 aa  49.3  0.00008  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.0429781 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2237  UTP-glucose-1-phosphate uridylyltransferase GalU  28 
 
 		 302 aa  49.3  0.00009  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3899  UTP-glucose-1-phosphate uridylyltransferase  29.79 
 
 		 317 aa  48.9  0.0001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.79289  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4927  UDP-glucose pyrophosphorylase  22.42 
 
 		 293 aa  48.5  0.0001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.241232 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0991  Nucleotidyl transferase  22.59 
 
 		 397 aa  48.5  0.0001  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2109  UDP-glucose pyrophosphorylase  30.71 
 
 		 295 aa  48.5  0.0001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.814022  normal  0.448139 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1518  UDP-glucose pyrophosphorylase  29.63 
 
 		 290 aa  48.5  0.0001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.722973  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2537  UDP-glucose pyrophosphorylase  32.09 
 
 		 292 aa  48.5  0.0001  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.619652 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0699  UTP-glucose-1-phosphate uridylyltransferase  30.08 
 
 		 294 aa  48.9  0.0001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4390  UTP-glucose-1-phosphate uridylyltransferase  30.71 
 
 		 295 aa  48.5  0.0001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0829901  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_3786  UTP-glucose-1-phosphate uridylyltransferase  29.79 
 
 		 317 aa  48.9  0.0001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0945557  normal  0.170806 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3367  UTP-glucose-1-phosphate uridylyltransferase  30.71 
 
 		 295 aa  48.5  0.0001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1462  UDP-glucose pyrophosphorylase  30.43 
 
 		 313 aa  48.5  0.0001  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.430614  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3977  UTP-glucose-1-phosphate uridylyltransferase  30.71 
 
 		 295 aa  48.5  0.0001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.482021  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3552  UTP-glucose-1-phosphate uridylyltransferase  30.71 
 
 		 295 aa  48.5  0.0001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.489332  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3870  UTP-glucose-1-phosphate uridylyltransferase  30.71 
 
 		 295 aa  48.5  0.0001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5396  UTP-glucose-1-phosphate uridylyltransferase  27.94 
 
 		 293 aa  47.8  0.0002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0625  UDP-glucose pyrophosphorylase  23.6 
 
 		 289 aa  47.8  0.0002  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.0556323  normal  0.764647 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5449  UTP-glucose-1-phosphate uridylyltransferase  27.74 
 
 		 293 aa  48.1  0.0002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.784502  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1219  UTP-glucose-1-phosphate uridylyltransferase  26.28 
 
 		 296 aa  47.8  0.0002  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.184128 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2073  UTP-glucose-1-phosphate uridylyltransferase  26.61 
 
 		 296 aa  48.1  0.0002  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4605  UTP-glucose-1-phosphate uridylyltransferase  30.08 
 
 		 295 aa  48.1  0.0002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2945  Nucleotidyl transferase  21.67 
 
 		 248 aa  47.4  0.0003  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1735  UDP-glucose pyrophosphorylase  28.57 
 
 		 289 aa  47.4  0.0003  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2634  UTP-glucose-1-phosphate uridylyltransferase  30 
 
 		 294 aa  47.4  0.0003  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1973  UTP-glucose-1-phosphate uridylyltransferase  29.29 
 
 		 305 aa  47.4  0.0003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.09229  normal  0.531021 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1782  UTP-glucose-1-phosphate uridylyltransferase GalU  30.77 
 
 		 290 aa  47.4  0.0003  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.210122 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3529  UTP-glucose-1-phosphate uridylyltransferase  25.83 
 
 		 295 aa  47.4  0.0003  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0734  UTP--glucose-1-phosphate uridylyltransferase  29.77 
 
 		 297 aa  47.4  0.0003  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1077  UTP-glucose-1-phosphate uridylyltransferase  29.17 
 
 		 300 aa  47.4  0.0003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.645448  normal  0.304823 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7385  UDP-glucose pyrophosphorylase  29.29 
 
 		 294 aa  47  0.0004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.921964 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3621  UTP-glucose-1-phosphate uridylyltransferase  29.77 
 
 		 289 aa  47  0.0004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.603812  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5920  UTP-glucose-1-phosphate uridylyltransferase  29.29 
 
 		 294 aa  47  0.0004  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.366675  normal  0.485189 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1435  UTP-glucose-1-phosphate uridylyltransferase  27.48 
 
 		 294 aa  47  0.0004  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.36592  normal  0.483741 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3211  UDP-glucose pyrophosphorylase  28.89 
 
 		 323 aa  47  0.0004  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.464773  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4956  UTP--glucose-1-phosphate uridylyltransferase  28.68 
 
 		 297 aa  46.6  0.0005  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00000197493  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4584  UDP-glucose pyrophosphorylase  29.29 
 
 		 294 aa  46.6  0.0005  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0958  UTP-glucose-1-phosphate uridylyltransferase  29.29 
 
 		 294 aa  46.6  0.0005  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1440  UTP-glucose-1-phosphate uridylyltransferase  29.29 
 
 		 294 aa  46.6  0.0005  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0931386  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1418  UTP-glucose-1-phosphate uridylyltransferase  29.29 
 
 		 294 aa  46.6  0.0005  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4112  UTP-glucose-1-phosphate uridylyltransferase  28.03 
 
 		 289 aa  46.6  0.0005  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0241424  hitchhiker  0.000234521 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1875  UTP-glucose-1-phosphate uridylyltransferase  29.29 
 
 		 294 aa  46.6  0.0005  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.35135  normal  0.0372426 
 
 
-
 
NC_006348  BMA0926  UTP-glucose-1-phosphate uridylyltransferase  30 
 
 		 293 aa  46.2  0.0006  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1845  UTP-glucose-1-phosphate uridylyltransferase  30 
 
 		 293 aa  46.2  0.0006  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.276349  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3553  UTP-glucose-1-phosphate uridylyltransferase  29.77 
 
 		 289 aa  46.6  0.0006  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6189  UTP-glucose-1-phosphate uridylyltransferase  29.29 
 
 		 294 aa  46.2  0.0006  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.642524  normal  1 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1459  UTP-glucose-1-phosphate uridylyltransferase  30 
 
 		 293 aa  46.2  0.0006  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0423  UTP-glucose-1-phosphate uridylyltransferase  30 
 
 		 293 aa  46.2  0.0006  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1668  UTP-glucose-1-phosphate uridylyltransferase  30 
 
 		 293 aa  46.2  0.0006  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1140  Nucleotidyl transferase  19.52 
 
 		 247 aa  46.2  0.0006  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.497469  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1690  UTP-glucose-1-phosphate uridylyltransferase  30 
 
 		 293 aa  46.2  0.0006  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.914927  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0740  UTP-glucose-1-phosphate uridylyltransferase  30 
 
 		 293 aa  46.2  0.0006  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1363  UTP-glucose-1-phosphate uridylyltransferase  28.57 
 
 		 293 aa  46.2  0.0007  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2237  UTP--glucose-1-phosphate uridylyltransferase protein  27.54 
 
 		 289 aa  45.8  0.0008  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0184  UTP-glucose-1-phosphate uridylyltransferase  25.1 
 
 		 296 aa  45.8  0.0008  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2225  UDP-glucose pyrophosphorylase  28.57 
 
 		 305 aa  45.8  0.0008  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.0411622 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5063  UTP-glucose-1-phosphate uridylyltransferase  25.1 
 
 		 296 aa  45.8  0.0008  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_17370  UTP-glucose-1-phosphate uridylyltransferase  29.17 
 
 		 304 aa  45.8  0.0008  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5050  UTP-glucose-1-phosphate uridylyltransferase  25.1 
 
 		 296 aa  45.8  0.0008  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.80239  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>