84 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ccel_0368 on replicon NC_011898
Organism: Clostridium cellulolyticum H10



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011898  Ccel_0368  hypothetical protein  100 
 
 		 309 aa  634    Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.000000592569  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1411  hypothetical protein  55.37 
 
 		 303 aa  329  3e-89  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0848057  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0247  hypothetical protein  55.26 
 
 		 306 aa  329  3e-89  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.893142  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0569  hypothetical protein  54.97 
 
 		 303 aa  330  3e-89  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00106206  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1222  hypothetical protein  54.79 
 
 		 305 aa  322  4e-87  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.342426  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1917  hypothetical protein  48.33 
 
 		 300 aa  301  9e-81  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.944351 
 
 
-
 
NC_002950  PG0160  hypothetical protein  46.67 
 
 		 300 aa  290  3e-77  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0031  hypothetical protein  47.99 
 
 		 291 aa  288  8e-77  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  0.426299 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1149  hypothetical protein  45.39 
 
 		 297 aa  285  9e-76  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.30507  normal  0.426274 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6322  hypothetical protein  47.37 
 
 		 303 aa  283  3.0000000000000004e-75  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0634  hypothetical protein  46.36 
 
 		 300 aa  270  2e-71  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.909002 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3149  hypothetical protein  45.85 
 
 		 299 aa  267  2e-70  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1673  hypothetical protein  46.75 
 
 		 305 aa  265  5e-70  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0603  hypothetical protein  41.12 
 
 		 305 aa  228  7e-59  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1519  hypothetical protein  40.67 
 
 		 287 aa  218  1e-55  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.109074  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3875  hypothetical protein  41.04 
 
 		 301 aa  209  4e-53  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.584028  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0363  hypothetical protein  37.92 
 
 		 293 aa  202  7e-51  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0355  hypothetical protein  37.12 
 
 		 290 aa  198  1.0000000000000001e-49  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0357  hypothetical protein  36.79 
 
 		 290 aa  195  8.000000000000001e-49  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0365  hypothetical protein  36.45 
 
 		 290 aa  192  5e-48  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000186978 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0362  hypothetical protein  36.12 
 
 		 290 aa  192  7e-48  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3628  hypothetical protein  36.45 
 
 		 290 aa  186  4e-46  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.458062  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3611  hypothetical protein  37.46 
 
 		 293 aa  185  7e-46  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0332  hypothetical protein  37.46 
 
 		 293 aa  184  1.0000000000000001e-45  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.30778 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0338  hypothetical protein  35.28 
 
 		 322 aa  180  2e-44  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3808  hypothetical protein  36.79 
 
 		 290 aa  176  3e-43  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0268  hypothetical protein  33.78 
 
 		 288 aa  172  5e-42  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4579  hypothetical protein  35.08 
 
 		 319 aa  169  7e-41  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  unclonable  0.0000000316379 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3495  hypothetical protein  34.52 
 
 		 314 aa  159  8e-38  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1630  Nucleotidyl transferase  31.39 
 
 		 397 aa  48.1  0.0002  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1202  Nucleotidyl transferase  30.65 
 
 		 393 aa  47.8  0.0002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1627  UTP-glucose-1-phosphate uridylyltransferase  30.6 
 
 		 287 aa  47  0.0004  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1077  UTP-glucose-1-phosphate uridylyltransferase  29.17 
 
 		 300 aa  46.6  0.0005  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.645448  normal  0.304823 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0914  UTP--glucose-1-phosphate uridylyltransferase  30.99 
 
 		 295 aa  47  0.0005  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.194054  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2631  UDP-glucose pyrophosphorylase  30.28 
 
 		 299 aa  46.6  0.0005  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.0067419  normal  1 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1101  UTP-glucose-1-phosphate uridylyltransferase  30.99 
 
 		 295 aa  47  0.0005  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0445  UTP-glucose-1-phosphate uridylyltransferase  32.85 
 
 		 298 aa  46.6  0.0006  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0606  UTP-glucose-1-phosphate uridylyltransferase  32.85 
 
 		 298 aa  46.6  0.0006  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.490803  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0373  UDP-glucose pyrophosphorylase  31.39 
 
 		 309 aa  46.2  0.0007  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0648  UTP-glucose-1-phosphate uridylyltransferase  31.54 
 
 		 294 aa  45.8  0.0009  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.324766  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3899  UTP-glucose-1-phosphate uridylyltransferase  30.34 
 
 		 317 aa  45.1  0.001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.79289  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_3786  UTP-glucose-1-phosphate uridylyltransferase  30.34 
 
 		 317 aa  45.1  0.001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0945557  normal  0.170806 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1973  UTP-glucose-1-phosphate uridylyltransferase  27.22 
 
 		 305 aa  45.4  0.001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.09229  normal  0.531021 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2831  molybdenum hydroxylase accessory protein, YgfJ family  28.24 
 
 		 216 aa  45.4  0.001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4550  UDP-glucose pyrophosphorylase  28.93 
 
 		 299 aa  45.1  0.002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.222966  normal  0.111674 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0862  UDP-glucose pyrophosphorylase  29.58 
 
 		 298 aa  44.7  0.002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2237  UTP--glucose-1-phosphate uridylyltransferase protein  29.58 
 
 		 289 aa  44.7  0.002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1219  UTP-glucose-1-phosphate uridylyltransferase  28.08 
 
 		 296 aa  45.1  0.002  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.184128 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0920  Nucleotidyl transferase  28 
 
 		 391 aa  44.7  0.002  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0238  D,D-heptose 1,7-bisphosphate phosphatase  27.42 
 
 		 408 aa  44.7  0.002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.546722 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2864  UDP-glucose pyrophosphorylase  29.79 
 
 		 301 aa  45.1  0.002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2225  UDP-glucose pyrophosphorylase  27.22 
 
 		 305 aa  44.7  0.002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.0411622 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2283  UTP-glucose-1-phosphate uridylyltransferase  27.07 
 
 		 295 aa  43.9  0.003  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0991  Nucleotidyl transferase  32.03 
 
 		 397 aa  43.9  0.003  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1702  UTP-glucose-1-phosphate uridylyltransferase  27.07 
 
 		 295 aa  43.9  0.003  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.613955  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1669  UTP-glucose-1-phosphate uridylyltransferase  27.07 
 
 		 325 aa  43.9  0.003  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1877  UTP-glucose-1-phosphate uridylyltransferase  27.07 
 
 		 325 aa  43.9  0.003  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0749  UTP-glucose-1-phosphate uridylyltransferase  27.07 
 
 		 327 aa  44.3  0.003  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2422  UTP-glucose-1-phosphate uridylyltransferase  27.07 
 
 		 295 aa  43.9  0.003  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0549  UTP-glucose-1-phosphate uridylyltransferase  27.07 
 
 		 325 aa  43.9  0.003  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4112  UTP-glucose-1-phosphate uridylyltransferase  28.47 
 
 		 289 aa  43.9  0.003  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0241424  hitchhiker  0.000234521 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1717  UTP-glucose-1-phosphate uridylyltransferase GalU  30.88 
 
 		 296 aa  43.9  0.003  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.88424  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3211  UDP-glucose pyrophosphorylase  30.53 
 
 		 323 aa  44.3  0.003  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.464773  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2479  UTP-glucose-1-phosphate uridylyltransferase  31.34 
 
 		 310 aa  43.9  0.003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.347896  normal  0.922436 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3248  UTP-glucose-1-phosphate uridylyltransferase  28.95 
 
 		 294 aa  43.9  0.004  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3209  UTP-glucose-1-phosphate uridylyltransferase  28.95 
 
 		 294 aa  43.9  0.004  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3261  UTP-glucose-1-phosphate uridylyltransferase  28.95 
 
 		 294 aa  43.9  0.004  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.307824  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6189  UTP-glucose-1-phosphate uridylyltransferase  28.66 
 
 		 294 aa  43.5  0.004  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.642524  normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0901  nucleotidyl transferase  29.46 
 
 		 403 aa  43.9  0.004  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0699  UTP-glucose-1-phosphate uridylyltransferase  27.12 
 
 		 294 aa  43.5  0.004  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1499  apolipoprotein N-acyltransferase  28.71 
 
 		 554 aa  43.1  0.005  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4390  UTP-glucose-1-phosphate uridylyltransferase  28.85 
 
 		 295 aa  43.1  0.006  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0829901  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3977  UTP-glucose-1-phosphate uridylyltransferase  28.85 
 
 		 295 aa  43.1  0.006  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.482021  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3367  UTP-glucose-1-phosphate uridylyltransferase  28.85 
 
 		 295 aa  43.1  0.006  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2571  UTP-glucose-1-phosphate uridylyltransferase  32.88 
 
 		 301 aa  43.1  0.006  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000185896 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2109  UDP-glucose pyrophosphorylase  28.85 
 
 		 295 aa  43.1  0.006  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.814022  normal  0.448139 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3870  UTP-glucose-1-phosphate uridylyltransferase  28.85 
 
 		 295 aa  43.1  0.006  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3552  UTP-glucose-1-phosphate uridylyltransferase  28.85 
 
 		 295 aa  43.1  0.006  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.489332  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RSp0006  UTP--glucose-1-phosphate uridylyltransferase UDP-glucose pyrophosphorylase protein  29.79 
 
 		 321 aa  42.7  0.008  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0524481  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3188  UTP-glucose-1-phosphate uridylyltransferase  32.35 
 
 		 301 aa  42.7  0.008  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.492305  normal  1 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0487  UTP-glucose-1-phosphate uridylyltransferase  28.57 
 
 		 296 aa  42.4  0.009  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0507  UTP-glucose-1-phosphate uridylyltransferase  28.06 
 
 		 291 aa  42.4  0.01  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.0029114  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2634  UTP-glucose-1-phosphate uridylyltransferase  28.95 
 
 		 294 aa  42.4  0.01  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1435  UTP-glucose-1-phosphate uridylyltransferase  25.77 
 
 		 294 aa  42.4  0.01  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.36592  normal  0.483741 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>