61 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Slin_6322 on replicon NC_013730
Organism: Spirosoma linguale DSM 74



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013730  Slin_6322  hypothetical protein  100 
 
 
303 aa  633    Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3149  hypothetical protein  67.33 
 
 
299 aa  433  1e-120  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1917  hypothetical protein  52.63 
 
 
300 aa  336  3.9999999999999995e-91  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.944351 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0634  hypothetical protein  52.48 
 
 
300 aa  329  4e-89  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.909002 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0569  hypothetical protein  46.56 
 
 
303 aa  291  9e-78  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00106206  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0368  hypothetical protein  47.37 
 
 
309 aa  283  3.0000000000000004e-75  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.000000592569  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0160  hypothetical protein  48.03 
 
 
300 aa  282  4.0000000000000003e-75  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1411  hypothetical protein  45.18 
 
 
303 aa  281  1e-74  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0848057  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1222  hypothetical protein  44.19 
 
 
305 aa  276  4e-73  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.342426  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1149  hypothetical protein  46.1 
 
 
297 aa  268  1e-70  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.30507  normal  0.426274 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0031  hypothetical protein  48.3 
 
 
291 aa  268  1e-70  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal  0.426299 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0603  hypothetical protein  43.79 
 
 
305 aa  263  3e-69  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0247  hypothetical protein  44.66 
 
 
306 aa  253  3e-66  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.893142  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1673  hypothetical protein  41.29 
 
 
305 aa  232  5e-60  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3875  hypothetical protein  42.67 
 
 
301 aa  227  2e-58  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.584028  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1519  hypothetical protein  42.24 
 
 
287 aa  224  1e-57  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.109074  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0268  hypothetical protein  41.61 
 
 
288 aa  203  3e-51  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0363  hypothetical protein  40.07 
 
 
293 aa  200  1.9999999999999998e-50  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3628  hypothetical protein  39.25 
 
 
290 aa  200  3e-50  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.458062  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4579  hypothetical protein  37.01 
 
 
319 aa  192  4e-48  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  unclonable  0.0000000316379 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0332  hypothetical protein  40.48 
 
 
293 aa  188  1e-46  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal  0.30778 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0357  hypothetical protein  38.14 
 
 
290 aa  188  1e-46  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0362  hypothetical protein  37.8 
 
 
290 aa  186  3e-46  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0355  hypothetical protein  37.8 
 
 
290 aa  186  4e-46  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3611  hypothetical protein  39.93 
 
 
293 aa  185  1.0000000000000001e-45  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0365  hypothetical protein  37.8 
 
 
290 aa  184  1.0000000000000001e-45  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000186978 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0338  hypothetical protein  36.57 
 
 
322 aa  184  1.0000000000000001e-45  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3808  hypothetical protein  39.59 
 
 
290 aa  180  2.9999999999999997e-44  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3495  hypothetical protein  36.18 
 
 
314 aa  173  1.9999999999999998e-42  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_28250  dTDP-glucose pyrophosphorylase  26.74 
 
 
263 aa  63.9  0.000000003  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.682184  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1518  UDP-glucose pyrophosphorylase  32.46 
 
 
290 aa  50.1  0.00005  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.722973  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4605  UTP-glucose-1-phosphate uridylyltransferase  26.9 
 
 
295 aa  46.6  0.0006  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3211  UDP-glucose pyrophosphorylase  29.23 
 
 
323 aa  46.2  0.0006  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.464773  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0238  D,D-heptose 1,7-bisphosphate phosphatase  28.03 
 
 
408 aa  46.2  0.0007  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.546722 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1202  Nucleotidyl transferase  28 
 
 
393 aa  45.8  0.0008  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1782  UTP-glucose-1-phosphate uridylyltransferase GalU  30.69 
 
 
290 aa  44.3  0.002  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal  0.210122 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3977  UTP-glucose-1-phosphate uridylyltransferase  26.32 
 
 
295 aa  44.7  0.002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.482021  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3552  UTP-glucose-1-phosphate uridylyltransferase  26.32 
 
 
295 aa  44.7  0.002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.489332  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3870  UTP-glucose-1-phosphate uridylyltransferase  26.32 
 
 
295 aa  44.3  0.002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3367  UTP-glucose-1-phosphate uridylyltransferase  26.32 
 
 
295 aa  44.3  0.002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4390  UTP-glucose-1-phosphate uridylyltransferase  26.32 
 
 
295 aa  44.7  0.002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0829901  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2109  UDP-glucose pyrophosphorylase  26.32 
 
 
295 aa  44.7  0.002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.814022  normal  0.448139 
 
 
-
 
NC_003296  RSp0006  UTP--glucose-1-phosphate uridylyltransferase UDP-glucose pyrophosphorylase protein  28.57 
 
 
321 aa  43.9  0.003  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0524481  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1077  UTP-glucose-1-phosphate uridylyltransferase  28.09 
 
 
300 aa  43.9  0.003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.645448  normal  0.304823 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1973  UTP-glucose-1-phosphate uridylyltransferase  28.08 
 
 
305 aa  43.9  0.003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.09229  normal  0.531021 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0060  UTP-glucose-1-phosphate uridylyltransferase  29.7 
 
 
291 aa  43.9  0.003  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.858271 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0648  UTP-glucose-1-phosphate uridylyltransferase  26.98 
 
 
294 aa  43.9  0.004  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.324766  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2225  UDP-glucose pyrophosphorylase  26.32 
 
 
305 aa  43.9  0.004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.0411622 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1385  UTP-glucose-1-phosphate uridylyltransferase GalU  29.37 
 
 
302 aa  43.5  0.005  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4040  UDP-glucose pyrophosphorylase  30 
 
 
348 aa  43.5  0.005  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0507  UTP-glucose-1-phosphate uridylyltransferase  29.7 
 
 
291 aa  43.5  0.005  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.0029114  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2479  UTP-glucose-1-phosphate uridylyltransferase  35.64 
 
 
310 aa  43.5  0.005  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.347896  normal  0.922436 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0699  UTP-glucose-1-phosphate uridylyltransferase  26.32 
 
 
294 aa  43.1  0.006  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1627  UTP-glucose-1-phosphate uridylyltransferase  29.03 
 
 
287 aa  43.1  0.006  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0373  UDP-glucose pyrophosphorylase  31.07 
 
 
309 aa  43.1  0.006  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3579  UTP-glucose-1-phosphate uridylyltransferase  29.77 
 
 
293 aa  43.1  0.006  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.0429781 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1219  UTP-glucose-1-phosphate uridylyltransferase  28.78 
 
 
296 aa  42.7  0.007  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal  0.184128 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1737  UDP-glucose pyrophosphorylase  29.69 
 
 
293 aa  42.4  0.009  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.793832  normal 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1095  UDP-glucose pyrophosphorylase  27.81 
 
 
293 aa  42.4  0.01  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0749  UTP-glucose-1-phosphate uridylyltransferase  25.73 
 
 
327 aa  42.4  0.01  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1630  Nucleotidyl transferase  21.75 
 
 
397 aa  42.4  0.01  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>