57 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cpin_1917 on replicon NC_013132
Organism: Chitinophaga pinensis DSM 2588



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013132  Cpin_1917  hypothetical protein  100 
 
 		 300 aa  619  1e-176  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.944351 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0634  hypothetical protein  60.54 
 
 		 300 aa  376  1e-103  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.909002 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3149  hypothetical protein  52.17 
 
 		 299 aa  343  2.9999999999999997e-93  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6322  hypothetical protein  52.63 
 
 		 303 aa  336  3.9999999999999995e-91  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002950  PG0160  hypothetical protein  52.67 
 
 		 300 aa  332  4e-90  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0368  hypothetical protein  48.33 
 
 		 309 aa  301  8.000000000000001e-81  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.000000592569  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1149  hypothetical protein  46.73 
 
 		 297 aa  295  6e-79  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.30507  normal  0.426274 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1411  hypothetical protein  48.48 
 
 		 303 aa  291  7e-78  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0848057  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0569  hypothetical protein  47.02 
 
 		 303 aa  290  2e-77  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00106206  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1222  hypothetical protein  47.47 
 
 		 305 aa  286  4e-76  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.342426  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0247  hypothetical protein  45.54 
 
 		 306 aa  285  7e-76  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.893142  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0031  hypothetical protein  46.74 
 
 		 291 aa  274  1.0000000000000001e-72  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  0.426299 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0603  hypothetical protein  45.1 
 
 		 305 aa  256  3e-67  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1519  hypothetical protein  42.32 
 
 		 287 aa  238  5.999999999999999e-62  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.109074  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1673  hypothetical protein  38.83 
 
 		 305 aa  234  1.0000000000000001e-60  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0338  hypothetical protein  35.29 
 
 		 322 aa  200  1.9999999999999998e-50  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0363  hypothetical protein  38.41 
 
 		 293 aa  196  3e-49  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0355  hypothetical protein  36.9 
 
 		 290 aa  194  1e-48  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4579  hypothetical protein  36.72 
 
 		 319 aa  194  1e-48  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  unclonable  0.0000000316379 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3875  hypothetical protein  36.9 
 
 		 301 aa  191  1e-47  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.584028  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3628  hypothetical protein  37.93 
 
 		 290 aa  190  2e-47  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.458062  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0365  hypothetical protein  36.55 
 
 		 290 aa  190  2e-47  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000186978 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0362  hypothetical protein  36.21 
 
 		 290 aa  191  2e-47  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0357  hypothetical protein  35.86 
 
 		 290 aa  187  3e-46  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0268  hypothetical protein  37.46 
 
 		 288 aa  185  9e-46  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0332  hypothetical protein  37.88 
 
 		 293 aa  180  2e-44  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.30778 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3611  hypothetical protein  37.88 
 
 		 293 aa  180  2.9999999999999997e-44  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3808  hypothetical protein  38.44 
 
 		 290 aa  178  1e-43  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3495  hypothetical protein  34.55 
 
 		 314 aa  173  2.9999999999999996e-42  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1518  UDP-glucose pyrophosphorylase  26.47 
 
 		 290 aa  47.8  0.0002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.722973  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0648  UTP-glucose-1-phosphate uridylyltransferase  30 
 
 		 294 aa  47.8  0.0002  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.324766  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0507  UTP-glucose-1-phosphate uridylyltransferase  34 
 
 		 291 aa  47  0.0004  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.0029114  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_28250  dTDP-glucose pyrophosphorylase  24.06 
 
 		 263 aa  46.2  0.0007  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.682184  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2479  UTP-glucose-1-phosphate uridylyltransferase  28 
 
 		 310 aa  45.4  0.001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.347896  normal  0.922436 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0659  UDP-glucose pyrophosphorylase  28.46 
 
 		 298 aa  45.4  0.001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1627  UTP-glucose-1-phosphate uridylyltransferase  27.34 
 
 		 287 aa  45.4  0.001  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0060  UTP-glucose-1-phosphate uridylyltransferase  29 
 
 		 291 aa  45.1  0.001  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.858271 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3407  UTP-glucose-1-phosphate uridylyltransferase  30.23 
 
 		 290 aa  45.4  0.001  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1717  UTP-glucose-1-phosphate uridylyltransferase GalU  28.71 
 
 		 296 aa  44.7  0.002  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.88424  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4112  UTP-glucose-1-phosphate uridylyltransferase  27.91 
 
 		 289 aa  45.1  0.002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0241424  hitchhiker  0.000234521 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2537  UDP-glucose pyrophosphorylase  23.17 
 
 		 292 aa  43.9  0.003  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.619652 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0991  Nucleotidyl transferase  28.46 
 
 		 397 aa  43.5  0.004  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1219  UTP-glucose-1-phosphate uridylyltransferase  26.52 
 
 		 296 aa  43.9  0.004  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.184128 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2931  UTP--glucose-1-phosphate uridylyltransferase  30.3 
 
 		 306 aa  43.5  0.004  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.000109311  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1434  UTP-glucose-1-phosphate uridylyltransferase GalU  30.61 
 
 		 306 aa  43.1  0.005  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0858211  normal  0.652641 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1202  Nucleotidyl transferase  28.69 
 
 		 393 aa  43.5  0.005  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3621  UTP-glucose-1-phosphate uridylyltransferase  27.48 
 
 		 289 aa  43.1  0.006  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.603812  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3553  UTP-glucose-1-phosphate uridylyltransferase  27.48 
 
 		 289 aa  42.7  0.006  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1782  UTP-glucose-1-phosphate uridylyltransferase GalU  27.72 
 
 		 290 aa  43.1  0.006  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.210122 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1534  UTP-glucose-1-phosphate uridylyltransferase  28 
 
 		 296 aa  42.7  0.007  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1591  UTP-glucose-1-phosphate uridylyltransferase  28 
 
 		 296 aa  42.7  0.007  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_03545  glucose-1-phosphate thymidylyltransferase, putative  27.85 
 
 		 336 aa  42.4  0.009  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2383  UTP-glucose-1-phosphate uridylyltransferase  32.04 
 
 		 295 aa  42.4  0.009  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.082332  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1135  UDP-glucose pyrophosphorylase  25.6 
 
 		 288 aa  42.4  0.009  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00581514 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2897  UDP-glucose pyrophosphorylase  32.04 
 
 		 295 aa  42.4  0.009  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2596  UTP-glucose-1-phosphate uridylyltransferase  30.3 
 
 		 301 aa  42.4  0.009  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.225479  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1714  UTP-glucose-1-phosphate uridylyltransferase  29.29 
 
 		 305 aa  42.4  0.01  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.00169518  normal  0.555364 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>