39 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PG0160 on replicon NC_002950
Organism: Porphyromonas gingivalis W83



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_002950  PG0160  hypothetical protein  100 
 
 
300 aa  615  1e-175  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1917  hypothetical protein  52.67 
 
 
300 aa  332  4e-90  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.944351 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1149  hypothetical protein  50.5 
 
 
297 aa  303  2.0000000000000002e-81  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.30507  normal  0.426274 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0247  hypothetical protein  49.5 
 
 
306 aa  299  3e-80  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.893142  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0031  hypothetical protein  50.86 
 
 
291 aa  293  3e-78  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal  0.426299 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0368  hypothetical protein  46.67 
 
 
309 aa  290  3e-77  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.000000592569  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6322  hypothetical protein  48.03 
 
 
303 aa  282  4.0000000000000003e-75  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0634  hypothetical protein  45.85 
 
 
300 aa  279  4e-74  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.909002 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0569  hypothetical protein  45.36 
 
 
303 aa  276  3e-73  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00106206  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3149  hypothetical protein  48.84 
 
 
299 aa  275  9e-73  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1411  hypothetical protein  44.33 
 
 
303 aa  258  7e-68  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0848057  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1222  hypothetical protein  44 
 
 
305 aa  258  8e-68  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.342426  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0603  hypothetical protein  42.3 
 
 
305 aa  249  3e-65  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1673  hypothetical protein  39.54 
 
 
305 aa  228  1e-58  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1519  hypothetical protein  39.53 
 
 
287 aa  225  7e-58  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.109074  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3875  hypothetical protein  41.16 
 
 
301 aa  202  8e-51  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.584028  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3628  hypothetical protein  42.07 
 
 
290 aa  197  1.0000000000000001e-49  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.458062  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0268  hypothetical protein  40.69 
 
 
288 aa  196  5.000000000000001e-49  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0355  hypothetical protein  40.83 
 
 
290 aa  194  2e-48  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0362  hypothetical protein  40.41 
 
 
290 aa  192  8e-48  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0363  hypothetical protein  39.79 
 
 
293 aa  190  2.9999999999999997e-47  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4579  hypothetical protein  39.8 
 
 
319 aa  189  4e-47  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  unclonable  0.0000000316379 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0357  hypothetical protein  40.14 
 
 
290 aa  189  5.999999999999999e-47  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0365  hypothetical protein  40.14 
 
 
290 aa  188  1e-46  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000186978 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0338  hypothetical protein  36.93 
 
 
322 aa  188  1e-46  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0332  hypothetical protein  40.28 
 
 
293 aa  183  3e-45  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal  0.30778 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3611  hypothetical protein  39.93 
 
 
293 aa  182  9.000000000000001e-45  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3808  hypothetical protein  39.58 
 
 
290 aa  173  3.9999999999999995e-42  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3495  hypothetical protein  36.58 
 
 
314 aa  170  3e-41  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_28250  dTDP-glucose pyrophosphorylase  26.97 
 
 
263 aa  50.1  0.00005  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.682184  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1219  UTP-glucose-1-phosphate uridylyltransferase  32.54 
 
 
296 aa  48.1  0.0002  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal  0.184128 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0648  UTP-glucose-1-phosphate uridylyltransferase  25.43 
 
 
294 aa  47.4  0.0003  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.324766  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0445  UTP-glucose-1-phosphate uridylyltransferase  32.81 
 
 
298 aa  45.1  0.001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0606  UTP-glucose-1-phosphate uridylyltransferase  32.81 
 
 
298 aa  45.1  0.001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.490803  normal 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1717  UTP-glucose-1-phosphate uridylyltransferase GalU  28.12 
 
 
296 aa  45.4  0.001  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.88424  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1435  UTP-glucose-1-phosphate uridylyltransferase  24.04 
 
 
294 aa  42.7  0.007  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.36592  normal  0.483741 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2473  UDP-glucose pyrophosphorylase  27.81 
 
 
292 aa  42.7  0.008  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.836492  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1735  UDP-glucose pyrophosphorylase  30.95 
 
 
289 aa  42.4  0.009  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2479  UTP-glucose-1-phosphate uridylyltransferase  28.91 
 
 
310 aa  42.4  0.01  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.347896  normal  0.922436 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>