56 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Phep_0634 on replicon NC_013061
Organism: Pedobacter heparinus DSM 2366



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013061  Phep_0634  hypothetical protein  100 
 
 
300 aa  610  9.999999999999999e-175  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.909002 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1917  hypothetical protein  60.54 
 
 
300 aa  376  1e-103  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.944351 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6322  hypothetical protein  52.48 
 
 
303 aa  329  4e-89  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3149  hypothetical protein  50.5 
 
 
299 aa  317  1e-85  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1411  hypothetical protein  50.84 
 
 
303 aa  290  2e-77  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0848057  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1222  hypothetical protein  50.17 
 
 
305 aa  285  4e-76  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.342426  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1149  hypothetical protein  44.74 
 
 
297 aa  280  3e-74  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.30507  normal  0.426274 
 
 
-
 
NC_002950  PG0160  hypothetical protein  45.85 
 
 
300 aa  279  4e-74  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0031  hypothetical protein  47.08 
 
 
291 aa  272  5.000000000000001e-72  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal  0.426299 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0368  hypothetical protein  46.36 
 
 
309 aa  270  2e-71  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.000000592569  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0569  hypothetical protein  45.87 
 
 
303 aa  264  1e-69  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00106206  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0603  hypothetical protein  45.42 
 
 
305 aa  254  2.0000000000000002e-66  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0247  hypothetical protein  44.74 
 
 
306 aa  253  3e-66  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.893142  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1519  hypothetical protein  43.69 
 
 
287 aa  233  2.0000000000000002e-60  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.109074  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1673  hypothetical protein  41.5 
 
 
305 aa  224  1e-57  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0338  hypothetical protein  34.74 
 
 
322 aa  194  2e-48  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3875  hypothetical protein  36.49 
 
 
301 aa  192  4e-48  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.584028  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0363  hypothetical protein  33.9 
 
 
293 aa  183  2.0000000000000003e-45  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4579  hypothetical protein  35.2 
 
 
319 aa  183  3e-45  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  unclonable  0.0000000316379 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0355  hypothetical protein  32.87 
 
 
290 aa  173  2.9999999999999996e-42  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3628  hypothetical protein  34.02 
 
 
290 aa  172  5e-42  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.458062  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0268  hypothetical protein  34.24 
 
 
288 aa  172  5e-42  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3495  hypothetical protein  34.45 
 
 
314 aa  172  5e-42  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0357  hypothetical protein  32.87 
 
 
290 aa  171  9e-42  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0365  hypothetical protein  32.53 
 
 
290 aa  170  3e-41  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000186978 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0362  hypothetical protein  32.18 
 
 
290 aa  169  6e-41  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0332  hypothetical protein  32.53 
 
 
293 aa  168  1e-40  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal  0.30778 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3611  hypothetical protein  32.53 
 
 
293 aa  166  5e-40  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3808  hypothetical protein  32.87 
 
 
290 aa  164  1.0000000000000001e-39  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2479  UTP-glucose-1-phosphate uridylyltransferase  29.77 
 
 
310 aa  48.1  0.0002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.347896  normal  0.922436 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3579  UTP-glucose-1-phosphate uridylyltransferase  36.73 
 
 
293 aa  48.1  0.0002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.0429781 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1627  UTP-glucose-1-phosphate uridylyltransferase  27.54 
 
 
287 aa  47.8  0.0002  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2537  UDP-glucose pyrophosphorylase  27.55 
 
 
292 aa  47.4  0.0003  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal  0.619652 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0920  Nucleotidyl transferase  26.12 
 
 
391 aa  46.6  0.0006  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RSp0006  UTP--glucose-1-phosphate uridylyltransferase UDP-glucose pyrophosphorylase protein  28.37 
 
 
321 aa  46.2  0.0007  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0524481  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1652  UTP-glucose-1-phosphate uridylyltransferase  27.98 
 
 
292 aa  45.1  0.001  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.601586  normal  0.125455 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3553  UTP-glucose-1-phosphate uridylyltransferase  31.25 
 
 
289 aa  44.3  0.002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3621  UTP-glucose-1-phosphate uridylyltransferase  31.25 
 
 
289 aa  44.7  0.002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.603812  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1702  UTP-glucose-1-phosphate uridylyltransferase  31.09 
 
 
295 aa  43.9  0.003  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.613955  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2283  UTP-glucose-1-phosphate uridylyltransferase  31.09 
 
 
295 aa  43.9  0.003  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0749  UTP-glucose-1-phosphate uridylyltransferase  31.09 
 
 
327 aa  43.9  0.003  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_3786  UTP-glucose-1-phosphate uridylyltransferase  27.88 
 
 
317 aa  44.3  0.003  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0945557  normal  0.170806 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2442  UTP-glucose-1-phosphate uridylyltransferase  25 
 
 
290 aa  44.3  0.003  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2422  UTP-glucose-1-phosphate uridylyltransferase  31.09 
 
 
295 aa  43.9  0.003  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0699  UTP-glucose-1-phosphate uridylyltransferase  31.09 
 
 
294 aa  43.9  0.003  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3899  UTP-glucose-1-phosphate uridylyltransferase  27.88 
 
 
317 aa  44.3  0.003  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.79289  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4550  UDP-glucose pyrophosphorylase  24.87 
 
 
299 aa  43.5  0.004  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.222966  normal  0.111674 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2280  UTP--glucose-1-phosphate uridylyltransferase  26.7 
 
 
297 aa  43.5  0.004  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0549  UTP-glucose-1-phosphate uridylyltransferase  31.09 
 
 
325 aa  43.9  0.004  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1877  UTP-glucose-1-phosphate uridylyltransferase  31.09 
 
 
325 aa  43.9  0.004  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1669  UTP-glucose-1-phosphate uridylyltransferase  31.09 
 
 
325 aa  43.9  0.004  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1717  UTP-glucose-1-phosphate uridylyltransferase GalU  30.61 
 
 
296 aa  42.7  0.006  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.88424  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1722  Nucleotidyl transferase  28.91 
 
 
288 aa  43.1  0.006  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.480557  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2049  UTP-glucose-1-phosphate uridylyltransferase  25 
 
 
290 aa  42.7  0.007  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.244059  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2237  UTP--glucose-1-phosphate uridylyltransferase protein  25.24 
 
 
289 aa  42.7  0.008  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1782  UTP-glucose-1-phosphate uridylyltransferase GalU  29.29 
 
 
290 aa  42.4  0.009  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal  0.210122 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>