62 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Oter_1149 on replicon NC_010571
Organism: Opitutus terrae PB90-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010571  Oter_1149  hypothetical protein  100 
 
 
297 aa  602  1.0000000000000001e-171  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.30507  normal  0.426274 
 
 
-
 
NC_002950  PG0160  hypothetical protein  50.5 
 
 
300 aa  303  2.0000000000000002e-81  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1917  hypothetical protein  46.73 
 
 
300 aa  295  6e-79  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.944351 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0031  hypothetical protein  47.95 
 
 
291 aa  286  2.9999999999999996e-76  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal  0.426299 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0368  hypothetical protein  45.39 
 
 
309 aa  285  8e-76  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.000000592569  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0634  hypothetical protein  44.74 
 
 
300 aa  280  3e-74  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.909002 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0569  hypothetical protein  43.61 
 
 
303 aa  275  9e-73  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00106206  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0247  hypothetical protein  43.28 
 
 
306 aa  271  1e-71  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.893142  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6322  hypothetical protein  46.1 
 
 
303 aa  268  1e-70  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1411  hypothetical protein  39.94 
 
 
303 aa  265  5.999999999999999e-70  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0848057  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1222  hypothetical protein  40.4 
 
 
305 aa  264  1e-69  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.342426  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0603  hypothetical protein  44.48 
 
 
305 aa  254  1.0000000000000001e-66  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3149  hypothetical protein  42.24 
 
 
299 aa  241  2e-62  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1519  hypothetical protein  39.86 
 
 
287 aa  216  4e-55  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.109074  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1673  hypothetical protein  35.29 
 
 
305 aa  213  1.9999999999999998e-54  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0363  hypothetical protein  40.2 
 
 
293 aa  207  2e-52  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3628  hypothetical protein  39.93 
 
 
290 aa  204  1e-51  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.458062  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0338  hypothetical protein  37.54 
 
 
322 aa  203  3e-51  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3875  hypothetical protein  40.7 
 
 
301 aa  200  1.9999999999999998e-50  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.584028  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0365  hypothetical protein  40.78 
 
 
290 aa  197  1.0000000000000001e-49  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000186978 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0357  hypothetical protein  40.78 
 
 
290 aa  197  2.0000000000000003e-49  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4579  hypothetical protein  38.78 
 
 
319 aa  197  2.0000000000000003e-49  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  unclonable  0.0000000316379 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0362  hypothetical protein  39.46 
 
 
290 aa  197  2.0000000000000003e-49  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3611  hypothetical protein  39 
 
 
293 aa  196  5.000000000000001e-49  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0355  hypothetical protein  40 
 
 
290 aa  196  5.000000000000001e-49  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0332  hypothetical protein  39.33 
 
 
293 aa  196  6e-49  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal  0.30778 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3495  hypothetical protein  39.41 
 
 
314 aa  190  2.9999999999999997e-47  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3808  hypothetical protein  39.06 
 
 
290 aa  189  4e-47  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0268  hypothetical protein  40.07 
 
 
288 aa  179  7e-44  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_28250  dTDP-glucose pyrophosphorylase  26.94 
 
 
263 aa  53.1  0.000005  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.682184  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0238  D,D-heptose 1,7-bisphosphate phosphatase  29.11 
 
 
408 aa  48.5  0.0001  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.546722 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0991  Nucleotidyl transferase  37.1 
 
 
397 aa  48.9  0.0001  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5396  UTP-glucose-1-phosphate uridylyltransferase  28.19 
 
 
293 aa  48.1  0.0002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1630  Nucleotidyl transferase  31.22 
 
 
397 aa  48.1  0.0002  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002936  DET0530  glucose-1-phosphate thymidylyltransferase  22.03 
 
 
393 aa  47.4  0.0003  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.911327  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2143  glucose-1-phosphate thymidyltransferase  27.57 
 
 
357 aa  47.4  0.0003  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.591307  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0060  UTP-glucose-1-phosphate uridylyltransferase  25.59 
 
 
291 aa  47.4  0.0003  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.858271 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0335  UDP-glucose pyrophosphorylase  28.57 
 
 
293 aa  46.6  0.0005  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0621281  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2117  UDP-glucose pyrophosphorylase  30.95 
 
 
292 aa  46.2  0.0006  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012028  Hlac_2874  Nucleotidyl transferase  28.9 
 
 
402 aa  46.2  0.0007  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2230  nucleotidyl transferase  23.84 
 
 
383 aa  46.2  0.0007  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0901  nucleotidyl transferase  32.85 
 
 
403 aa  46.2  0.0007  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3361  UTP-glucose-1-phosphate uridylyltransferase  26.32 
 
 
295 aa  45.4  0.001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2280  UTP--glucose-1-phosphate uridylyltransferase  29.79 
 
 
297 aa  45.4  0.001  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4112  UTP-glucose-1-phosphate uridylyltransferase  24.5 
 
 
289 aa  45.1  0.001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0241424  hitchhiker  0.000234521 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1151  UTP-glucose-1-phosphate uridylyltransferase  27.27 
 
 
302 aa  44.7  0.002  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.0000000109052  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1219  UTP-glucose-1-phosphate uridylyltransferase  30 
 
 
296 aa  44.7  0.002  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal  0.184128 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5449  UTP-glucose-1-phosphate uridylyltransferase  27.33 
 
 
293 aa  45.1  0.002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.784502  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1712  Nucleotidyl transferase  30.7 
 
 
290 aa  43.9  0.003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0920  Nucleotidyl transferase  27.5 
 
 
391 aa  44.3  0.003  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0506  nucleotidyl transferase  21.33 
 
 
393 aa  43.9  0.003  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0513  nucleotidyl transferase  22.95 
 
 
411 aa  43.5  0.004  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0648  UTP-glucose-1-phosphate uridylyltransferase  28.57 
 
 
294 aa  43.9  0.004  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.324766  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1782  UTP-glucose-1-phosphate uridylyltransferase GalU  30.56 
 
 
290 aa  43.5  0.004  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal  0.210122 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0334  UTP-glucose-1-phosphate uridylyltransferase  25.93 
 
 
294 aa  43.5  0.004  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4956  UTP--glucose-1-phosphate uridylyltransferase  26.85 
 
 
297 aa  43.5  0.004  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00000197493  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5556  UTP-glucose-1-phosphate uridylyltransferase  26.85 
 
 
292 aa  43.5  0.004  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000425579  normal 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_2012  organic solvent tolerance protein  34.88 
 
 
792 aa  43.1  0.005  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3268  UTP-glucose-1-phosphate uridylyltransferase  28.1 
 
 
296 aa  42.7  0.006  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2537  UDP-glucose pyrophosphorylase  21.46 
 
 
292 aa  42.7  0.007  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal  0.619652 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3380  UTP-glucose-1-phosphate uridylyltransferase  28.38 
 
 
266 aa  42.4  0.009  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0659  UDP-glucose pyrophosphorylase  30.83 
 
 
298 aa  42.4  0.01  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>