48 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene SO_0363 on replicon NC_004347
Organism: Shewanella oneidensis MR-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_004347  SO_0363  hypothetical protein  100 
 
 		 293 aa  602  1.0000000000000001e-171  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0332  hypothetical protein  89.76 
 
 		 293 aa  526  1e-148  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.30778 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3611  hypothetical protein  89.08 
 
 		 293 aa  526  1e-148  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3808  hypothetical protein  88.62 
 
 		 290 aa  516  1.0000000000000001e-145  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0355  hypothetical protein  83.1 
 
 		 290 aa  501  1e-141  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0362  hypothetical protein  82.76 
 
 		 290 aa  499  1e-140  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0357  hypothetical protein  82.76 
 
 		 290 aa  498  1e-140  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0365  hypothetical protein  83.1 
 
 		 290 aa  497  1e-140  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000186978 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3628  hypothetical protein  80.34 
 
 		 290 aa  484  1e-136  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.458062  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3875  hypothetical protein  59.59 
 
 		 301 aa  344  1e-93  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.584028  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0338  hypothetical protein  54.69 
 
 		 322 aa  342  5.999999999999999e-93  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4579  hypothetical protein  57.47 
 
 		 319 aa  337  9.999999999999999e-92  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  unclonable  0.0000000316379 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3495  hypothetical protein  58.55 
 
 		 314 aa  337  1.9999999999999998e-91  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0268  hypothetical protein  55.9 
 
 		 288 aa  300  2e-80  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0031  hypothetical protein  40.99 
 
 		 291 aa  209  3e-53  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  0.426299 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1149  hypothetical protein  40.2 
 
 		 297 aa  207  2e-52  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.30507  normal  0.426274 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0368  hypothetical protein  37.92 
 
 		 309 aa  202  7e-51  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.000000592569  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6322  hypothetical protein  40.07 
 
 		 303 aa  200  1.9999999999999998e-50  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0603  hypothetical protein  36.24 
 
 		 305 aa  201  1.9999999999999998e-50  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0569  hypothetical protein  36.68 
 
 		 303 aa  198  1.0000000000000001e-49  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00106206  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1917  hypothetical protein  38.41 
 
 		 300 aa  196  3e-49  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.944351 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3149  hypothetical protein  38.19 
 
 		 299 aa  190  2e-47  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002950  PG0160  hypothetical protein  39.79 
 
 		 300 aa  190  2.9999999999999997e-47  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0247  hypothetical protein  39.53 
 
 		 306 aa  186  3e-46  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.893142  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1411  hypothetical protein  34.38 
 
 		 303 aa  186  3e-46  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0848057  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0634  hypothetical protein  33.9 
 
 		 300 aa  183  2.0000000000000003e-45  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.909002 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1222  hypothetical protein  33.33 
 
 		 305 aa  180  2.9999999999999997e-44  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.342426  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1519  hypothetical protein  34.62 
 
 		 287 aa  174  1.9999999999999998e-42  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.109074  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1673  hypothetical protein  32.29 
 
 		 305 aa  154  2e-36  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_28250  dTDP-glucose pyrophosphorylase  27.85 
 
 		 263 aa  56.2  0.0000006  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.682184  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0506  nucleotidyl transferase  23.27 
 
 		 393 aa  50.4  0.00004  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_471  nucleoside-diphosphate-sugar pyrophosphorylase  23.1 
 
 		 393 aa  47.4  0.0003  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4650  UTP-glucose-1-phosphate uridylyltransferase  26.47 
 
 		 295 aa  44.7  0.002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.0000000733677  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5057  UTP-glucose-1-phosphate uridylyltransferase  26.47 
 
 		 295 aa  44.7  0.002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.839194  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1415  4-diphosphocytidyl-2C-methyl-D-erythritol synthase  38.46 
 
 		 204 aa  45.1  0.002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4789  UTP-glucose-1-phosphate uridylyltransferase  26.47 
 
 		 295 aa  44.7  0.002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4630  UTP-glucose-1-phosphate uridylyltransferase  26.47 
 
 		 295 aa  44.7  0.002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00254018  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5029  UTP-glucose-1-phosphate uridylyltransferase  26.47 
 
 		 296 aa  44.7  0.002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0184  UTP-glucose-1-phosphate uridylyltransferase  26.47 
 
 		 296 aa  44.7  0.002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5050  UTP-glucose-1-phosphate uridylyltransferase  26.47 
 
 		 296 aa  44.7  0.002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.80239  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5152  UTP-glucose-1-phosphate uridylyltransferase  26.47 
 
 		 295 aa  44.7  0.002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5063  UTP-glucose-1-phosphate uridylyltransferase  26.47 
 
 		 296 aa  44.7  0.002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3529  UTP-glucose-1-phosphate uridylyltransferase  27.21 
 
 		 295 aa  43.9  0.003  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3361  UTP-glucose-1-phosphate uridylyltransferase  29.93 
 
 		 295 aa  43.9  0.003  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4740  UTP-glucose-1-phosphate uridylyltransferase  27.13 
 
 		 295 aa  43.9  0.003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0459455  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4310  molybdenum hydroxylase accessory protein, YgfJ family  42.31 
 
 		 228 aa  43.1  0.005  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.707183  normal  0.580614 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0665  glucosamine-1-phosphate N-acetyltransferase / UDP-N-acetylglucosamine pyrophosphorylase  21.31 
 
 		 374 aa  43.1  0.006  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5449  UTP-glucose-1-phosphate uridylyltransferase  26.39 
 
 		 293 aa  42.4  0.01  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.784502  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>