More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Coch_0141 on replicon NC_013162
Organism: Capnocytophaga ochracea DSM 7271



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_014230  CA2559_08201  peptidase, M16 family protein  40.33 
 
 
990 aa  724    Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.287012  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1829  peptidase M16 domain protein  41 
 
 
984 aa  797    Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal  0.661414 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2368  peptidase M16 domain protein  43.75 
 
 
981 aa  830    Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2025  peptidase M16 domain-containing protein  44.07 
 
 
981 aa  822    Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.0310906  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0390  M16 family peptidase  42.08 
 
 
976 aa  824    Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal  0.45037 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0303  M16 family peptidase  43.93 
 
 
983 aa  845    Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0410  peptidase M16 domain protein  43.01 
 
 
979 aa  830    Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0913  peptidase M16 domain protein  55.31 
 
 
982 aa  1108    Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0141  peptidase M16 domain protein  100 
 
 
975 aa  1990    Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1230  zinc protease  44.69 
 
 
979 aa  833    Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.837321 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3516  peptidase M16 domain protein  52.2 
 
 
977 aa  1000    Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2031  peptidase M16 domain protein  42.69 
 
 
985 aa  825    Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal  0.79996 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2263  peptidase M16 domain protein  36.13 
 
 
980 aa  606  9.999999999999999e-173  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.000614686  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6480  peptidase M16 domain protein  32.77 
 
 
1014 aa  543  1e-153  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0622  peptidase M16-like  30.04 
 
 
503 aa  204  5e-51  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3629  peptidase M16 domain-containing protein  30 
 
 
497 aa  199  2.0000000000000003e-49  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.854314  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0687  peptidase M16 domain protein  29.11 
 
 
494 aa  197  8.000000000000001e-49  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  decreased coverage  0.00118117  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0927  M16 family peptidase  29.13 
 
 
468 aa  191  5e-47  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.680782  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0699  peptidase M16 domain protein  29.11 
 
 
494 aa  187  8e-46  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000162318 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3215  peptidase M16 domain-containing protein  26.95 
 
 
510 aa  185  4.0000000000000006e-45  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2753  peptidase M16 domain protein  28.25 
 
 
532 aa  185  5.0000000000000004e-45  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.346086  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0496  peptidase M16 domain protein  28.89 
 
 
501 aa  182  2e-44  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2530  peptidase M16-like  27.72 
 
 
496 aa  182  2.9999999999999997e-44  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00393243 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01173  Peptidase, M16 family protein  22.69 
 
 
930 aa  171  7e-41  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.0120262  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1981  M16 family peptidase  26.64 
 
 
526 aa  164  6e-39  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2773  peptidase M16-like  26.48 
 
 
550 aa  164  1e-38  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.346187 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1598  peptidase M16 domain-containing protein  28.64 
 
 
493 aa  160  1e-37  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal  0.314521 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0376  putative zinc protease protein  26.35 
 
 
508 aa  160  2e-37  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal  0.535365 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2346  peptidase M16 domain protein  25.84 
 
 
518 aa  159  2e-37  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0739  processing peptidase  27.09 
 
 
539 aa  154  8.999999999999999e-36  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3357  processing peptidase  25.44 
 
 
526 aa  152  4e-35  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2745  peptidase M16 domain protein  25.22 
 
 
520 aa  148  6e-34  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0932  insulinase-like peptidase  25 
 
 
489 aa  140  1e-31  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1482  peptidase M16-like  24.2 
 
 
493 aa  138  7.000000000000001e-31  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.830241  normal 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1782  peptidase M16 domain-containing protein  24.22 
 
 
530 aa  136  1.9999999999999998e-30  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.636723  normal 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0108  peptidase M16 domain protein  27.63 
 
 
422 aa  134  1.0000000000000001e-29  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2012  peptidase M16 domain-containing protein  25.05 
 
 
929 aa  131  7.000000000000001e-29  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1927  peptidase M16 domain-containing protein  23.91 
 
 
455 aa  127  1e-27  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.464341  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0335  peptidase M16, C-terminal:peptidase M16, N-terminal  23.06 
 
 
506 aa  127  1e-27  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.844691  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0089  peptidase M16 domain protein  19.9 
 
 
921 aa  126  3e-27  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3719  peptidase M16, C-terminal:peptidase M16, N-terminal  24.56 
 
 
452 aa  125  3e-27  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.0647985 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0165  peptidase M16 domain protein  22.13 
 
 
949 aa  125  3e-27  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2387  peptidase M16-like protein  21.06 
 
 
959 aa  125  4e-27  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal  0.183046 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2253  peptidase M16 domain-containing protein  23.36 
 
 
912 aa  124  6e-27  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.890772  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1933  peptidase M16-like  23.31 
 
 
459 aa  124  8e-27  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.0501339  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1834  peptidase M16 domain protein  23.17 
 
 
934 aa  123  9.999999999999999e-27  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.106959  normal  0.617697 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3617  peptidase M16 domain protein  22.3 
 
 
470 aa  123  1.9999999999999998e-26  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.903787  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3519  peptidase M16 domain-containing protein  23.29 
 
 
484 aa  122  4.9999999999999996e-26  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2842  peptidase M16 domain protein  23.73 
 
 
484 aa  121  7e-26  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.853184  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3872  peptidase M16 domain-containing protein  23.61 
 
 
484 aa  121  7e-26  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.817075  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4370  peptidase M16-like  24.12 
 
 
528 aa  120  7.999999999999999e-26  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.345763 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0242  peptidase M16 domain protein  23.94 
 
 
477 aa  119  1.9999999999999998e-25  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A2107  M16 family peptidase  23.11 
 
 
442 aa  119  3e-25  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0269  peptidase M16 domain protein  24.13 
 
 
494 aa  119  3e-25  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.271306  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0734  peptidase M16-like protein  23.6 
 
 
470 aa  119  3e-25  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_02705  putative protease  23.79 
 
 
440 aa  119  3.9999999999999997e-25  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.441156  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0217  peptidase, M16 family  23.11 
 
 
459 aa  118  3.9999999999999997e-25  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.233228  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0282  peptidase M16-like protein  22.17 
 
 
504 aa  118  5e-25  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.35404  normal 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1225  peptidase M16-like  26.01 
 
 
431 aa  117  8.999999999999998e-25  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.522553  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0094  peptidase M16-like  24.84 
 
 
477 aa  117  8.999999999999998e-25  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4079  M16 family metallopeptidase  23.29 
 
 
959 aa  117  1.0000000000000001e-24  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.621113  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3486  peptidase M16-like protein  25.11 
 
 
441 aa  117  1.0000000000000001e-24  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.0315623  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3228  peptidase M16 domain-containing protein  23.01 
 
 
493 aa  117  1.0000000000000001e-24  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.966774 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1835  peptidase M16 domain protein  22.58 
 
 
949 aa  116  2.0000000000000002e-24  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.300051  normal  0.619696 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1632  peptidase M16 domain protein  22.91 
 
 
454 aa  116  2.0000000000000002e-24  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.48477  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2737  peptidase M16-like  22.8 
 
 
465 aa  115  3e-24  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1348  peptidase M16 domain protein  22.02 
 
 
439 aa  115  3e-24  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.387051  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3596  pseudouridine synthase, Rsu  22.5 
 
 
912 aa  115  4.0000000000000004e-24  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3948  peptidase M16 domain-containing protein  23.88 
 
 
443 aa  115  5e-24  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.843768  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0387  putative zinc protease protein  23.63 
 
 
501 aa  114  8.000000000000001e-24  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0642  exported pepdidase, putative zinc protease  21.02 
 
 
950 aa  114  9e-24  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1544  peptidase M16 domain-containing protein  26.89 
 
 
440 aa  114  1.0000000000000001e-23  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3327  peptidase M16 domain-containing protein  22.44 
 
 
944 aa  114  1.0000000000000001e-23  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00235124 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1392  peptidase M16-like  22.8 
 
 
489 aa  114  1.0000000000000001e-23  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.260457  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4179  peptidase M16-like  22.62 
 
 
476 aa  113  2.0000000000000002e-23  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.567421  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3581  peptidase M16 domain-containing protein  24.04 
 
 
461 aa  113  2.0000000000000002e-23  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2725  hypothetical protein  23.89 
 
 
441 aa  112  3e-23  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2598  hypothetical protein  23.89 
 
 
441 aa  112  3e-23  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0430  peptidase M16-like  24.3 
 
 
453 aa  112  3e-23  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0377  insulinase family protein  22.52 
 
 
453 aa  112  4.0000000000000004e-23  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.454609  decreased coverage  0.00376869 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1867  peptidase M16-like  21.74 
 
 
457 aa  112  4.0000000000000004e-23  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1097  putative zinc protease  24.34 
 
 
448 aa  112  5e-23  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.414004  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2760  peptidase M16 domain-containing protein  24.34 
 
 
448 aa  112  5e-23  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1993  peptidase M16 domain protein  21.74 
 
 
457 aa  111  6e-23  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3528  peptidase M16 domain protein  21.66 
 
 
949 aa  111  7.000000000000001e-23  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.146206  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4170  peptidase M16 domain protein  22.7 
 
 
969 aa  111  7.000000000000001e-23  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.353568  normal  0.732695 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1207  peptidase M16 domain-containing protein  21.64 
 
 
945 aa  111  8.000000000000001e-23  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2931  peptidase M16 domain-containing protein  23.58 
 
 
448 aa  110  9.000000000000001e-23  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  decreased coverage  0.00146664  normal  0.111067 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3464  peptidase M16 domain protein  21.55 
 
 
929 aa  110  1e-22  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.694105  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1941  peptidase M16-like  21.52 
 
 
453 aa  110  1e-22  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3381  peptidase M16-like  21.38 
 
 
947 aa  110  1e-22  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.529886  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2826  peptidase M16-like  20.37 
 
 
952 aa  110  1e-22  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.110257  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2987  M16 family peptidase  21.11 
 
 
466 aa  110  1e-22  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.669528  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0627  peptidase, M16 family  25.98 
 
 
417 aa  110  2e-22  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0260  peptidase M16 domain-containing protein  24.62 
 
 
443 aa  110  2e-22  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal  0.0286002 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2545  peptidase M16  22.87 
 
 
464 aa  110  2e-22  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002529  protease insulinase family/protease insulinase family  20.91 
 
 
947 aa  110  2e-22  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3491  peptidase M16 domain-containing protein  25.16 
 
 
443 aa  109  2e-22  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4762  peptidase M16 domain-containing protein  23.89 
 
 
479 aa  108  3e-22  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.250673  normal  0.651283 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0187  protease  23.7 
 
 
514 aa  109  3e-22  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>