More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gbem_0687 on replicon NC_011146
Organism: Geobacter bemidjiensis Bem



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002939  GSU0927  M16 family peptidase  78.02 
 
 		 468 aa  769    Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.680782  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0496  peptidase M16 domain protein  69.51 
 
 		 501 aa  723    Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0699  peptidase M16 domain protein  97.57 
 
 		 494 aa  998    Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000162318 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2530  peptidase M16-like  77.33 
 
 		 496 aa  788    Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00393243 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3215  peptidase M16 domain-containing protein  68.34 
 
 		 510 aa  696    Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3629  peptidase M16 domain-containing protein  81.1 
 
 		 497 aa  804    Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.854314  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0687  peptidase M16 domain protein  100 
 
 		 494 aa  1018    Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  decreased coverage  0.00118117  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1981  M16 family peptidase  57.26 
 
 		 526 aa  587  1e-166  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2753  peptidase M16 domain protein  41.2 
 
 		 532 aa  389  1e-107  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.346086  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2346  peptidase M16 domain protein  40.9 
 
 		 518 aa  378  1e-103  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1598  peptidase M16 domain-containing protein  41.6 
 
 		 493 aa  375  1e-102  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.314521 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3357  processing peptidase  40.04 
 
 		 526 aa  365  1e-100  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0622  peptidase M16-like  40.94 
 
 		 503 aa  366  1e-100  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2745  peptidase M16 domain protein  40.51 
 
 		 520 aa  363  3e-99  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0739  processing peptidase  39.87 
 
 		 539 aa  361  1e-98  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2773  peptidase M16-like  38.33 
 
 		 550 aa  347  2e-94  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.346187 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4370  peptidase M16-like  39.14 
 
 		 528 aa  343  5.999999999999999e-93  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.345763 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0376  putative zinc protease protein  34.89 
 
 		 508 aa  310  5e-83  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.535365 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3228  peptidase M16 domain-containing protein  34.09 
 
 		 493 aa  250  3e-65  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.966774 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1933  peptidase M16-like  33.33 
 
 		 459 aa  235  2.0000000000000002e-60  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.0501339  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0734  peptidase M16-like protein  32.72 
 
 		 470 aa  234  2.0000000000000002e-60  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0377  insulinase family protein  31.36 
 
 		 453 aa  229  1e-58  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.454609  decreased coverage  0.00376869 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2987  M16 family peptidase  33.05 
 
 		 466 aa  228  2e-58  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.669528  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1867  peptidase M16-like  33.19 
 
 		 457 aa  223  7e-57  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1941  peptidase M16-like  30.67 
 
 		 453 aa  223  9e-57  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2737  peptidase M16-like  30.66 
 
 		 465 aa  220  3.9999999999999997e-56  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2078  peptidase M16 domain protein  32.27 
 
 		 441 aa  218  1e-55  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5791  peptidase M16 domain protein  30.55 
 
 		 447 aa  218  2e-55  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.0298791 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1348  peptidase M16 domain protein  32.75 
 
 		 439 aa  217  2.9999999999999998e-55  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.387051  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1993  peptidase M16 domain protein  32.06 
 
 		 457 aa  216  7e-55  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2315  processing peptidase  31.24 
 
 		 443 aa  214  3.9999999999999995e-54  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.276856  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3581  peptidase M16 domain-containing protein  30.49 
 
 		 461 aa  212  9e-54  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3545  peptidase M16 domain-containing protein  31.56 
 
 		 422 aa  211  3e-53  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.408173  normal  0.11594 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3486  peptidase M16-like protein  30.1 
 
 		 441 aa  208  1e-52  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.0315623  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0303  peptidase M16 domain-containing protein  29.27 
 
 		 442 aa  208  1e-52  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6480  peptidase M16 domain protein  32.82 
 
 		 1014 aa  208  2e-52  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0335  peptidase M16, C-terminal:peptidase M16, N-terminal  29.46 
 
 		 506 aa  208  2e-52  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.844691  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0171  peptidase M16 domain protein  31.85 
 
 		 462 aa  207  4e-52  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.0696206  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1972  peptidase M16 domain-containing protein  31.29 
 
 		 428 aa  206  8e-52  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1927  peptidase M16 domain-containing protein  31.22 
 
 		 455 aa  205  1e-51  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.464341  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3719  peptidase M16, C-terminal:peptidase M16, N-terminal  30.83 
 
 		 452 aa  204  2e-51  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.0647985 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1782  peptidase M16 domain-containing protein  30.57 
 
 		 530 aa  205  2e-51  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.636723  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5162  peptidase M16 domain-containing protein  30.61 
 
 		 451 aa  204  4e-51  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5112  peptidase M16 domain protein  30.61 
 
 		 451 aa  203  6e-51  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.233553  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0387  putative zinc protease protein  29.89 
 
 		 501 aa  203  6e-51  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0932  insulinase-like peptidase  30.74 
 
 		 489 aa  202  7e-51  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3948  peptidase M16 domain-containing protein  30.34 
 
 		 443 aa  202  8e-51  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.843768  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0303  M16 family peptidase  28.29 
 
 		 983 aa  202  9.999999999999999e-51  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1482  peptidase M16-like  30.66 
 
 		 493 aa  202  9.999999999999999e-51  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.830241  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4985  peptidase M16 domain-containing protein  30.4 
 
 		 451 aa  201  1.9999999999999998e-50  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4630  peptidase M16 domain-containing protein  32.98 
 
 		 464 aa  201  1.9999999999999998e-50  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0353  peptidase M16 domain-containing protein  30.21 
 
 		 451 aa  201  3e-50  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2274  peptidase M16 domain-containing protein  31.47 
 
 		 424 aa  201  3.9999999999999996e-50  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0845723  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0141  peptidase M16 domain protein  29.11 
 
 		 975 aa  197  3e-49  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3491  peptidase M16 domain-containing protein  28.19 
 
 		 443 aa  197  3e-49  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1544  peptidase M16 domain-containing protein  29.44 
 
 		 440 aa  197  3e-49  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4256  peptidase M16 domain-containing protein  28.4 
 
 		 443 aa  196  8.000000000000001e-49  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.802915  normal  0.163527 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4130  peptidase M16 domain-containing protein  28.4 
 
 		 443 aa  196  8.000000000000001e-49  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2031  peptidase M16 domain protein  28.25 
 
 		 985 aa  196  1e-48  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.79996 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0207  peptidase M16 domain-containing protein  28.4 
 
 		 443 aa  196  1e-48  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.0549198  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0217  peptidase, M16 family  26.57 
 
 		 459 aa  196  1e-48  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.233228  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A2107  M16 family peptidase  27.39 
 
 		 442 aa  196  1e-48  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4537.2  Zn-dependent peptidase  27.99 
 
 		 443 aa  195  2e-48  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3617  peptidase M16 domain protein  30.1 
 
 		 470 aa  193  5e-48  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.903787  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2806  peptidase M16 domain-containing protein  34.58 
 
 		 876 aa  193  6e-48  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.326138  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0209  peptidase M16 domain protein  27.99 
 
 		 443 aa  191  4e-47  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.61941  normal  0.477171 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3815  peptidase M16 domain-containing protein  28.4 
 
 		 443 aa  190  5.999999999999999e-47  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3742  peptidase M16 domain-containing protein  28.4 
 
 		 443 aa  189  7e-47  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2025  peptidase M16 domain-containing protein  28.93 
 
 		 981 aa  189  1e-46  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.0310906  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3940  peptidase M16 domain-containing protein  28.4 
 
 		 443 aa  189  1e-46  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1632  peptidase M16 domain protein  29.96 
 
 		 454 aa  188  2e-46  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.48477  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_08201  peptidase, M16 family protein  27.89 
 
 		 990 aa  188  2e-46  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.287012  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2703  peptidase M16 domain protein  28.46 
 
 		 440 aa  187  3e-46  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2725  hypothetical protein  32.87 
 
 		 441 aa  187  3e-46  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1829  peptidase M16 domain protein  28.85 
 
 		 984 aa  187  3e-46  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.661414 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0261  peptidase M16 domain-containing protein  29.12 
 
 		 443 aa  187  4e-46  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  unclonable  0.000000513625  normal  0.227904 
 
 
-
 
NC_006369  lpl2598  hypothetical protein  32.58 
 
 		 441 aa  186  7e-46  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0913  peptidase M16 domain protein  28.26 
 
 		 982 aa  184  2.0000000000000003e-45  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0390  M16 family peptidase  28.98 
 
 		 976 aa  184  2.0000000000000003e-45  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.45037 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0260  peptidase M16 domain-containing protein  29.27 
 
 		 443 aa  185  2.0000000000000003e-45  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.0286002 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4406  peptidase M16-like  30.17 
 
 		 943 aa  184  3e-45  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2368  peptidase M16 domain protein  27.47 
 
 		 981 aa  184  4.0000000000000006e-45  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0242  peptidase M16 domain protein  28.34 
 
 		 477 aa  183  5.0000000000000004e-45  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4176  peptidase M16 domain-containing protein  28.93 
 
 		 455 aa  183  6e-45  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0478283  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4752  insulinase-like:peptidase M16, C-terminal  29.05 
 
 		 450 aa  182  9.000000000000001e-45  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.0494338 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1580  peptidase M16 domain protein  28.6 
 
 		 896 aa  182  2e-44  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00116015 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0269  peptidase M16 domain protein  28.45 
 
 		 494 aa  181  2e-44  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.271306  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1230  zinc protease  28.41 
 
 		 979 aa  182  2e-44  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.837321 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3444  hypothetical protein  28.48 
 
 		 443 aa  181  2.9999999999999997e-44  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0410  peptidase M16 domain protein  28.41 
 
 		 979 aa  180  4.999999999999999e-44  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0426  peptidase, M16 family  28.84 
 
 		 450 aa  179  7e-44  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2658  peptidase M16 domain-containing protein  29.06 
 
 		 460 aa  179  9e-44  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.287658  hitchhiker  0.000609596 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0282  peptidase M16-like protein  28.18 
 
 		 504 aa  174  1.9999999999999998e-42  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.35404  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2204  peptidase M16 domain-containing protein  27.78 
 
 		 469 aa  174  2.9999999999999996e-42  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0863446  normal  0.285951 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2545  peptidase M16  28.48 
 
 		 464 aa  173  5.999999999999999e-42  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2306  peptidase M16 domain-containing protein  32.87 
 
 		 443 aa  173  6.999999999999999e-42  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_02705  putative protease  32.96 
 
 		 440 aa  172  7.999999999999999e-42  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.441156  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0089  peptidase M16 domain protein  28.73 
 
 		 921 aa  172  1e-41  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0094  peptidase M16-like  31.19 
 
 		 477 aa  171  3e-41  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0467  putative zinc protease  25.9 
 
 		 465 aa  171  3e-41  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.723216  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>