More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cpin_0913 on replicon NC_013132
Organism: Chitinophaga pinensis DSM 2588



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007512  Plut_0390  M16 family peptidase  41.47 
 
 
976 aa  805    Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal  0.45037 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0303  M16 family peptidase  42.33 
 
 
983 aa  808    Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2368  peptidase M16 domain protein  43.08 
 
 
981 aa  820    Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0913  peptidase M16 domain protein  100 
 
 
982 aa  2032    Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_08201  peptidase, M16 family protein  41.24 
 
 
990 aa  769    Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.287012  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0141  peptidase M16 domain protein  55.31 
 
 
975 aa  1132    Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1230  zinc protease  44.26 
 
 
979 aa  830    Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.837321 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2031  peptidase M16 domain protein  41.82 
 
 
985 aa  816    Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal  0.79996 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0410  peptidase M16 domain protein  41.6 
 
 
979 aa  802    Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1829  peptidase M16 domain protein  41.39 
 
 
984 aa  825    Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal  0.661414 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2025  peptidase M16 domain-containing protein  41.91 
 
 
981 aa  792    Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.0310906  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3516  peptidase M16 domain protein  57.08 
 
 
977 aa  1148    Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2263  peptidase M16 domain protein  34.92 
 
 
980 aa  625  1e-177  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.000614686  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6480  peptidase M16 domain protein  31.96 
 
 
1014 aa  537  1e-151  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0927  M16 family peptidase  29.96 
 
 
468 aa  201  7.999999999999999e-50  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.680782  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2753  peptidase M16 domain protein  28.44 
 
 
532 aa  191  5e-47  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.346086  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3629  peptidase M16 domain-containing protein  29.48 
 
 
497 aa  191  5.999999999999999e-47  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.854314  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2530  peptidase M16-like  29.24 
 
 
496 aa  190  1e-46  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00393243 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0687  peptidase M16 domain protein  28.26 
 
 
494 aa  184  6e-45  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  decreased coverage  0.00118117  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0699  peptidase M16 domain protein  28.04 
 
 
494 aa  179  3e-43  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000162318 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3215  peptidase M16 domain-containing protein  28.79 
 
 
510 aa  176  9.999999999999999e-43  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0622  peptidase M16-like  27.47 
 
 
503 aa  176  1.9999999999999998e-42  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2346  peptidase M16 domain protein  27.59 
 
 
518 aa  171  5e-41  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0496  peptidase M16 domain protein  27.07 
 
 
501 aa  170  1e-40  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0376  putative zinc protease protein  25.86 
 
 
508 aa  170  1e-40  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal  0.535365 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0739  processing peptidase  27.15 
 
 
539 aa  167  1.0000000000000001e-39  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1981  M16 family peptidase  27.54 
 
 
526 aa  165  3e-39  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2773  peptidase M16-like  26.41 
 
 
550 aa  165  4.0000000000000004e-39  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.346187 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1598  peptidase M16 domain-containing protein  26.21 
 
 
493 aa  157  1e-36  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal  0.314521 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3357  processing peptidase  27.27 
 
 
526 aa  149  2.0000000000000003e-34  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2745  peptidase M16 domain protein  26.4 
 
 
520 aa  146  2e-33  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4370  peptidase M16-like  26.05 
 
 
528 aa  137  9.999999999999999e-31  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.345763 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01173  Peptidase, M16 family protein  20.56 
 
 
930 aa  136  1.9999999999999998e-30  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.0120262  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1782  peptidase M16 domain-containing protein  24.64 
 
 
530 aa  131  6e-29  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.636723  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0165  peptidase M16 domain protein  21.05 
 
 
949 aa  121  4.9999999999999996e-26  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1927  peptidase M16 domain-containing protein  23.84 
 
 
455 aa  121  4.9999999999999996e-26  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.464341  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1482  peptidase M16-like  25 
 
 
493 aa  119  1.9999999999999998e-25  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.830241  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0282  peptidase M16-like protein  23.36 
 
 
504 aa  119  1.9999999999999998e-25  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.35404  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2387  peptidase M16-like protein  21.2 
 
 
959 aa  119  1.9999999999999998e-25  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal  0.183046 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1955  peptidase M16 domain-containing protein  21.1 
 
 
960 aa  118  6e-25  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.384397  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0642  exported pepdidase, putative zinc protease  24.06 
 
 
950 aa  118  6e-25  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0932  insulinase-like peptidase  25 
 
 
489 aa  116  2.0000000000000002e-24  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0242  peptidase M16 domain protein  24.25 
 
 
477 aa  116  2.0000000000000002e-24  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1544  peptidase M16 domain-containing protein  26.65 
 
 
440 aa  115  3e-24  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3617  peptidase M16 domain protein  21.49 
 
 
470 aa  115  4.0000000000000004e-24  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.903787  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0387  putative zinc protease protein  22.95 
 
 
501 aa  115  5e-24  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0892  peptidase M16 domain-containing protein  23.37 
 
 
499 aa  115  5e-24  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.12862  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0335  peptidase M16, C-terminal:peptidase M16, N-terminal  22.27 
 
 
506 aa  115  5e-24  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.844691  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1348  peptidase M16 domain protein  23.35 
 
 
439 aa  115  6e-24  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.387051  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0269  peptidase M16 domain protein  23.46 
 
 
494 aa  114  1.0000000000000001e-23  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.271306  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2012  peptidase M16 domain-containing protein  21.39 
 
 
929 aa  113  2.0000000000000002e-23  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0108  peptidase M16 domain protein  25.05 
 
 
422 aa  112  2.0000000000000002e-23  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_2034  zinc protease  21.05 
 
 
962 aa  113  2.0000000000000002e-23  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.554182  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2826  peptidase M16-like  21.66 
 
 
952 aa  112  4.0000000000000004e-23  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.110257  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2598  hypothetical protein  22.69 
 
 
441 aa  111  6e-23  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2725  hypothetical protein  22.69 
 
 
441 aa  111  7.000000000000001e-23  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1632  peptidase M16 domain protein  23.04 
 
 
454 aa  109  3e-22  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.48477  normal 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0217  peptidase, M16 family  22.27 
 
 
459 aa  108  5e-22  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.233228  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0102  peptidase M16-like  23.78 
 
 
458 aa  108  6e-22  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.49801  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A2107  M16 family peptidase  22.54 
 
 
442 aa  108  7e-22  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1941  peptidase M16-like  21.73 
 
 
453 aa  107  1e-21  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_03530  peptidase M16-like protein  23.67 
 
 
448 aa  107  1e-21  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  hitchhiker  0.00356454  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3872  peptidase M16 domain-containing protein  22.78 
 
 
484 aa  107  1e-21  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.817075  normal 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_02705  putative protease  23.91 
 
 
440 aa  107  2e-21  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.441156  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0109  peptidase M16 domain protein  23.54 
 
 
458 aa  105  3e-21  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.470915  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04156  zinc protease  21.33 
 
 
956 aa  105  3e-21  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1207  peptidase M16 domain-containing protein  22.32 
 
 
945 aa  105  3e-21  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3519  peptidase M16 domain-containing protein  22.53 
 
 
484 aa  105  4e-21  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03487  peptidase  23.41 
 
 
947 aa  105  5e-21  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0120  peptidase M16 domain protein  23.31 
 
 
458 aa  104  7e-21  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0734  peptidase M16-like protein  21.69 
 
 
470 aa  104  7e-21  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0094  peptidase M16-like  27.47 
 
 
477 aa  104  1e-20  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2842  peptidase M16 domain protein  22.32 
 
 
484 aa  104  1e-20  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.853184  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5162  peptidase M16 domain-containing protein  23.14 
 
 
451 aa  103  2e-20  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5338  peptidase M16-like  22.41 
 
 
451 aa  103  2e-20  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.796458 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3327  peptidase M16 domain-containing protein  20.62 
 
 
944 aa  103  2e-20  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00235124 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0426  peptidase, M16 family  23.63 
 
 
450 aa  102  3e-20  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3719  peptidase M16, C-terminal:peptidase M16, N-terminal  22.25 
 
 
452 aa  101  8e-20  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.0647985 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02764  putative metallopeptidase, M16 family protein  22.18 
 
 
945 aa  101  8e-20  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2253  peptidase M16 domain-containing protein  22.75 
 
 
912 aa  100  1e-19  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.890772  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3614  peptidase M16 domain protein  23.66 
 
 
424 aa  100  1e-19  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.600859 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5112  peptidase M16 domain protein  22.49 
 
 
451 aa  99.8  2e-19  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.233553  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4752  insulinase-like:peptidase M16, C-terminal  23.63 
 
 
450 aa  100  2e-19  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.0494338 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1392  peptidase M16-like  25.32 
 
 
489 aa  99.8  2e-19  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.260457  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0353  peptidase M16 domain-containing protein  22.34 
 
 
451 aa  100  2e-19  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1933  peptidase M16-like  21.83 
 
 
459 aa  99  4e-19  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.0501339  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1689  pseudouridine synthase, Rsu  25.74 
 
 
919 aa  98.6  5e-19  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.000215702  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01108  peptidase, M16 family protein  27.92 
 
 
954 aa  98.2  6e-19  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.690969  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3129  peptidase M16 domain-containing protein  23.93 
 
 
967 aa  98.2  7e-19  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.586411 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2987  M16 family peptidase  21.59 
 
 
466 aa  97.8  8e-19  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.669528  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0260  peptidase M16 domain-containing protein  23.98 
 
 
443 aa  97.8  9e-19  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal  0.0286002 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0089  peptidase M16 domain protein  19.98 
 
 
921 aa  97.4  1e-18  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1671  peptidase M16-like  23.61 
 
 
509 aa  97.4  1e-18  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2615  peptidase M16 domain-containing protein  19.9 
 
 
910 aa  97.1  1e-18  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.0381043  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1867  peptidase M16-like  22.99 
 
 
457 aa  96.7  2e-18  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2658  peptidase M16 domain-containing protein  22.08 
 
 
460 aa  96.7  2e-18  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.287658  hitchhiker  0.000609596 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0467  putative zinc protease  23.49 
 
 
465 aa  96.7  2e-18  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.723216  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_04890  putative zinc protease  23.49 
 
 
465 aa  96.7  2e-18  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4179  peptidase M16-like  24.46 
 
 
476 aa  95.5  4e-18  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.567421  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4035  peptidase M16-like  24.46 
 
 
461 aa  95.5  4e-18  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.291122 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>