More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Clim_0410 on replicon NC_010803
Organism: Chlorobium limicola DSM 245



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008639  Cpha266_2025  peptidase M16 domain-containing protein  77.09 
 
 		 981 aa  1568    Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.0310906  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1829  peptidase M16 domain protein  69.03 
 
 		 984 aa  1417    Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.661414 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0390  M16 family peptidase  75.13 
 
 		 976 aa  1524    Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.45037 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0303  M16 family peptidase  73.22 
 
 		 983 aa  1490    Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_08201  peptidase, M16 family protein  41.75 
 
 		 990 aa  809    Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.287012  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2368  peptidase M16 domain protein  75.54 
 
 		 981 aa  1568    Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2031  peptidase M16 domain protein  66.73 
 
 		 985 aa  1376    Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.79996 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0913  peptidase M16 domain protein  41.6 
 
 		 982 aa  788    Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3516  peptidase M16 domain protein  40.82 
 
 		 977 aa  761    Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2263  peptidase M16 domain protein  36.04 
 
 		 980 aa  640    Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.000614686  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0141  peptidase M16 domain protein  43.01 
 
 		 975 aa  830    Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1230  zinc protease  46.03 
 
 		 979 aa  854    Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.837321 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0410  peptidase M16 domain protein  100 
 
 		 979 aa  2019    Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6480  peptidase M16 domain protein  35.14 
 
 		 1014 aa  565  1.0000000000000001e-159  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3629  peptidase M16 domain-containing protein  28.42 
 
 		 497 aa  194  5e-48  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.854314  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0496  peptidase M16 domain protein  29.04 
 
 		 501 aa  191  5e-47  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2753  peptidase M16 domain protein  26.99 
 
 		 532 aa  181  4e-44  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.346086  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0687  peptidase M16 domain protein  28.41 
 
 		 494 aa  180  1e-43  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  decreased coverage  0.00118117  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2530  peptidase M16-like  27.23 
 
 		 496 aa  179  2e-43  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00393243 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0699  peptidase M16 domain protein  28.41 
 
 		 494 aa  178  4e-43  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000162318 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0927  M16 family peptidase  27.05 
 
 		 468 aa  176  9.999999999999999e-43  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.680782  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2773  peptidase M16-like  26.52 
 
 		 550 aa  175  2.9999999999999996e-42  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.346187 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0622  peptidase M16-like  29.15 
 
 		 503 aa  173  2e-41  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2346  peptidase M16 domain protein  26.62 
 
 		 518 aa  171  4e-41  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3215  peptidase M16 domain-containing protein  25.51 
 
 		 510 aa  171  5e-41  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3357  processing peptidase  26.62 
 
 		 526 aa  163  1e-38  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0739  processing peptidase  25.39 
 
 		 539 aa  159  2e-37  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2745  peptidase M16 domain protein  26.4 
 
 		 520 aa  159  2e-37  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0376  putative zinc protease protein  26.19 
 
 		 508 aa  154  5.9999999999999996e-36  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.535365 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1598  peptidase M16 domain-containing protein  26.59 
 
 		 493 aa  154  7e-36  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.314521 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1981  M16 family peptidase  26.44 
 
 		 526 aa  149  2.0000000000000003e-34  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4370  peptidase M16-like  24.89 
 
 		 528 aa  137  9.999999999999999e-31  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.345763 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1927  peptidase M16 domain-containing protein  22.49 
 
 		 455 aa  119  1.9999999999999998e-25  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.464341  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2826  peptidase M16-like  21.83 
 
 		 952 aa  120  1.9999999999999998e-25  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.110257  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0430  peptidase M16-like  24.18 
 
 		 453 aa  118  5e-25  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3872  peptidase M16 domain-containing protein  24.26 
 
 		 484 aa  118  6e-25  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.817075  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2387  peptidase M16-like protein  20.46 
 
 		 959 aa  118  6e-25  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.183046 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3617  peptidase M16 domain protein  23.85 
 
 		 470 aa  117  7.999999999999999e-25  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.903787  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3719  peptidase M16, C-terminal:peptidase M16, N-terminal  24.35 
 
 		 452 aa  117  8.999999999999998e-25  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.0647985 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0269  peptidase M16 domain protein  25.22 
 
 		 494 aa  117  1.0000000000000001e-24  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.271306  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0242  peptidase M16 domain protein  24.78 
 
 		 477 aa  116  2.0000000000000002e-24  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2987  M16 family peptidase  23.33 
 
 		 466 aa  115  5e-24  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.669528  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1632  peptidase M16 domain protein  23.41 
 
 		 454 aa  115  6e-24  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.48477  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0734  peptidase M16-like protein  21.27 
 
 		 470 aa  113  2.0000000000000002e-23  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0108  peptidase M16 domain protein  23.41 
 
 		 422 aa  113  2.0000000000000002e-23  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1782  peptidase M16 domain-containing protein  22.71 
 
 		 530 aa  110  1e-22  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.636723  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2737  peptidase M16-like  23.3 
 
 		 465 aa  110  1e-22  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4630  peptidase M16 domain-containing protein  25.2 
 
 		 464 aa  109  2e-22  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5316  peptidase M16, C-terminal:peptidase M16, N-terminal  22.01 
 
 		 942 aa  110  2e-22  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0240  peptidase M16 domain protein  24.45 
 
 		 948 aa  108  4e-22  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.239759  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1544  peptidase M16 domain-containing protein  23.61 
 
 		 440 aa  107  1e-21  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0165  peptidase M16 domain protein  21.9 
 
 		 949 aa  107  1e-21  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3519  peptidase M16 domain-containing protein  25.41 
 
 		 484 aa  107  1e-21  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2368  peptidase M16 domain-containing protein  26.33 
 
 		 853 aa  107  1e-21  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.136771 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0377  insulinase family protein  27.56 
 
 		 453 aa  105  4e-21  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.454609  decreased coverage  0.00376869 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2842  peptidase M16 domain protein  25 
 
 		 484 aa  105  4e-21  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.853184  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0387  putative zinc protease protein  21.56 
 
 		 501 aa  105  5e-21  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1482  peptidase M16-like  25.52 
 
 		 493 aa  104  8e-21  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.830241  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2760  peptidase M16 domain-containing protein  24.18 
 
 		 448 aa  103  1e-20  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1800  peptidase M16 domain-containing protein  23.33 
 
 		 492 aa  103  1e-20  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.296573  normal  0.835018 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1097  putative zinc protease  24.18 
 
 		 448 aa  103  1e-20  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.414004  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0892  peptidase M16 domain-containing protein  22.08 
 
 		 499 aa  103  1e-20  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.12862  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2078  peptidase M16 domain protein  26.71 
 
 		 441 aa  103  2e-20  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0089  peptidase M16 domain protein  20.25 
 
 		 921 aa  103  2e-20  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1867  peptidase M16-like  26.71 
 
 		 457 aa  103  2e-20  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0187  protease  23.54 
 
 		 514 aa  103  2e-20  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0282  peptidase M16-like protein  21.9 
 
 		 504 aa  103  2e-20  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.35404  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0094  peptidase M16-like  23.59 
 
 		 477 aa  103  2e-20  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3596  pseudouridine synthase, Rsu  20.72 
 
 		 912 aa  102  3e-20  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1993  peptidase M16 domain protein  26.71 
 
 		 457 aa  102  4e-20  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0335  peptidase M16, C-terminal:peptidase M16, N-terminal  21.95 
 
 		 506 aa  102  4e-20  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.844691  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A2107  M16 family peptidase  21.01 
 
 		 442 aa  102  5e-20  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_03530  peptidase M16-like protein  23.72 
 
 		 448 aa  101  6e-20  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  hitchhiker  0.00356454  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4035  peptidase M16-like  23.18 
 
 		 461 aa  101  6e-20  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.291122 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3038  peptidase M16 domain-containing protein  23.84 
 
 		 513 aa  101  6e-20  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.101443  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0217  peptidase, M16 family  21.43 
 
 		 459 aa  101  7e-20  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.233228  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002529  protease insulinase family/protease insulinase family  21.59 
 
 		 947 aa  101  9e-20  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0331  peptidase M16 domain-containing protein  24.76 
 
 		 937 aa  100  1e-19  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0932  insulinase-like peptidase  23.86 
 
 		 489 aa  99.8  2e-19  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0467  putative zinc protease  22.56 
 
 		 465 aa  99.8  2e-19  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.723216  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_04890  putative zinc protease  22.56 
 
 		 465 aa  99.8  2e-19  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1834  peptidase M16 domain protein  23.14 
 
 		 934 aa  100  2e-19  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.106959  normal  0.617697 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4179  peptidase M16-like  22.93 
 
 		 476 aa  99.4  3e-19  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.567421  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2204  peptidase M16 domain-containing protein  24.12 
 
 		 469 aa  99.4  3e-19  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0863446  normal  0.285951 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5338  peptidase M16-like  22.87 
 
 		 451 aa  99  4e-19  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.796458 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5911  peptidase M16-like protein, possible Zn-dependent  20.69 
 
 		 957 aa  98.6  5e-19  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2144  peptidase M16 domain-containing protein  23.91 
 
 		 453 aa  98.6  5e-19  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.00773461  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2863  peptidase M16 domain protein  23.09 
 
 		 457 aa  98.2  6e-19  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0631519 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1348  peptidase M16 domain protein  22.84 
 
 		 439 aa  97.1  1e-18  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.387051  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_02705  putative protease  22.76 
 
 		 440 aa  96.7  2e-18  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.441156  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2931  peptidase M16 domain-containing protein  26.25 
 
 		 448 aa  96.7  2e-18  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  decreased coverage  0.00146664  normal  0.111067 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2328  peptidase M16 domain-containing protein  23.89 
 
 		 460 aa  97.1  2e-18  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.977171  normal  0.638567 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2605  peptidase M16 domain protein  23.89 
 
 		 460 aa  97.1  2e-18  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.204595 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1972  peptidase M16 domain-containing protein  26.1 
 
 		 428 aa  96.7  2e-18  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04156  zinc protease  21.13 
 
 		 956 aa  97.1  2e-18  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2283  peptidase M16 domain protein  26.41 
 
 		 460 aa  97.1  2e-18  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.366903  normal  0.739928 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0089  insulinase family protease/insulinase family protease  20.37 
 
 		 952 aa  95.9  3e-18  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1713  putative Zn-dependent protease  22.8 
 
 		 461 aa  95.9  3e-18  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.137894 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2315  processing peptidase  22.42 
 
 		 443 aa  95.5  4e-18  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.276856  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0260  peptidase M16 domain-containing protein  21.5 
 
 		 443 aa  95.5  4e-18  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.0286002 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>