More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene GM21_0699 on replicon NC_012918
Organism: Geobacter sp. M21



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_002939  GSU0927  M16 family peptidase  78.02 
 
 
468 aa  767    Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.680782  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0699  peptidase M16 domain protein  100 
 
 
494 aa  1017    Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000162318 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0496  peptidase M16 domain protein  69.72 
 
 
501 aa  725    Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0687  peptidase M16 domain protein  97.57 
 
 
494 aa  998    Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  decreased coverage  0.00118117  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3629  peptidase M16 domain-containing protein  80.68 
 
 
497 aa  798    Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.854314  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2530  peptidase M16-like  77.33 
 
 
496 aa  786    Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00393243 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3215  peptidase M16 domain-containing protein  67.99 
 
 
510 aa  696    Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1981  M16 family peptidase  56.85 
 
 
526 aa  581  1.0000000000000001e-165  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2753  peptidase M16 domain protein  40.77 
 
 
532 aa  387  1e-106  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.346086  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1598  peptidase M16 domain-containing protein  41.81 
 
 
493 aa  375  1e-103  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal  0.314521 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2346  peptidase M16 domain protein  40.81 
 
 
518 aa  377  1e-103  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0622  peptidase M16-like  40.94 
 
 
503 aa  363  3e-99  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3357  processing peptidase  40.04 
 
 
526 aa  363  4e-99  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2745  peptidase M16 domain protein  39.83 
 
 
520 aa  361  2e-98  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0739  processing peptidase  39.02 
 
 
539 aa  356  5e-97  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2773  peptidase M16-like  38.12 
 
 
550 aa  346  4e-94  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.346187 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4370  peptidase M16-like  39.35 
 
 
528 aa  345  8.999999999999999e-94  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.345763 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0376  putative zinc protease protein  34.48 
 
 
508 aa  309  9e-83  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal  0.535365 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3228  peptidase M16 domain-containing protein  34.09 
 
 
493 aa  249  5e-65  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.966774 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0734  peptidase M16-like protein  32.52 
 
 
470 aa  232  1e-59  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1933  peptidase M16-like  33.12 
 
 
459 aa  231  2e-59  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.0501339  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2987  M16 family peptidase  32.64 
 
 
466 aa  225  1e-57  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.669528  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2737  peptidase M16-like  30.25 
 
 
465 aa  221  1.9999999999999999e-56  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1867  peptidase M16-like  32.56 
 
 
457 aa  220  5e-56  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5791  peptidase M16 domain protein  30.55 
 
 
447 aa  219  7e-56  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.0298791 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2315  processing peptidase  31.67 
 
 
443 aa  218  2e-55  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.276856  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2078  peptidase M16 domain protein  31.85 
 
 
441 aa  216  5e-55  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1941  peptidase M16-like  29.86 
 
 
453 aa  215  1.9999999999999998e-54  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1993  peptidase M16 domain protein  31.63 
 
 
457 aa  214  3.9999999999999995e-54  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1348  peptidase M16 domain protein  31.67 
 
 
439 aa  209  1e-52  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.387051  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3719  peptidase M16, C-terminal:peptidase M16, N-terminal  31.11 
 
 
452 aa  207  2e-52  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.0647985 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3581  peptidase M16 domain-containing protein  29.88 
 
 
461 aa  207  3e-52  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0171  peptidase M16 domain protein  31.63 
 
 
462 aa  207  4e-52  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.0696206  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3545  peptidase M16 domain-containing protein  31.01 
 
 
422 aa  207  4e-52  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.408173  normal  0.11594 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1927  peptidase M16 domain-containing protein  31.43 
 
 
455 aa  207  5e-52  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.464341  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0303  peptidase M16 domain-containing protein  28.86 
 
 
442 aa  207  5e-52  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1782  peptidase M16 domain-containing protein  30.36 
 
 
530 aa  206  9e-52  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.636723  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0387  putative zinc protease protein  30.32 
 
 
501 aa  205  2e-51  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3486  peptidase M16-like protein  29.49 
 
 
441 aa  203  6e-51  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.0315623  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1972  peptidase M16 domain-containing protein  30.66 
 
 
428 aa  201  1.9999999999999998e-50  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0377  insulinase family protein  34.83 
 
 
453 aa  201  3e-50  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.454609  decreased coverage  0.00376869 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6480  peptidase M16 domain protein  32.16 
 
 
1014 aa  201  3e-50  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3948  peptidase M16 domain-containing protein  29.91 
 
 
443 aa  200  3.9999999999999996e-50  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.843768  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0207  peptidase M16 domain-containing protein  28.4 
 
 
443 aa  200  3.9999999999999996e-50  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.0549198  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0932  insulinase-like peptidase  30.53 
 
 
489 aa  198  2.0000000000000003e-49  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4630  peptidase M16 domain-containing protein  32.34 
 
 
464 aa  197  2.0000000000000003e-49  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1482  peptidase M16-like  30.44 
 
 
493 aa  198  2.0000000000000003e-49  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.830241  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3491  peptidase M16 domain-containing protein  27.99 
 
 
443 aa  197  3e-49  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1544  peptidase M16 domain-containing protein  29.23 
 
 
440 aa  196  6e-49  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0335  peptidase M16, C-terminal:peptidase M16, N-terminal  29.25 
 
 
506 aa  196  7e-49  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.844691  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0303  M16 family peptidase  27.86 
 
 
983 aa  196  7e-49  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2274  peptidase M16 domain-containing protein  30.91 
 
 
424 aa  196  7e-49  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0845723  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4256  peptidase M16 domain-containing protein  28.19 
 
 
443 aa  196  8.000000000000001e-49  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.802915  normal  0.163527 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3617  peptidase M16 domain protein  30.3 
 
 
470 aa  195  1e-48  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.903787  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4130  peptidase M16 domain-containing protein  28.19 
 
 
443 aa  196  1e-48  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4537.2  Zn-dependent peptidase  27.99 
 
 
443 aa  195  2e-48  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2806  peptidase M16 domain-containing protein  34.85 
 
 
876 aa  195  2e-48  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.326138  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0109  peptidase M16 domain protein  29.57 
 
 
458 aa  192  1e-47  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.470915  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2031  peptidase M16 domain protein  27.85 
 
 
985 aa  192  2e-47  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal  0.79996 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A2107  M16 family peptidase  26.76 
 
 
442 aa  192  2e-47  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1632  peptidase M16 domain protein  30.17 
 
 
454 aa  191  2e-47  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.48477  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0120  peptidase M16 domain protein  29.57 
 
 
458 aa  191  2.9999999999999997e-47  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0217  peptidase, M16 family  25.96 
 
 
459 aa  191  2.9999999999999997e-47  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.233228  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0102  peptidase M16-like  29.11 
 
 
458 aa  191  4e-47  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.49801  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0209  peptidase M16 domain protein  27.79 
 
 
443 aa  191  4e-47  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.61941  normal  0.477171 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3815  peptidase M16 domain-containing protein  28.19 
 
 
443 aa  190  5e-47  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3742  peptidase M16 domain-containing protein  28.19 
 
 
443 aa  189  7e-47  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0242  peptidase M16 domain protein  28.54 
 
 
477 aa  189  1e-46  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3940  peptidase M16 domain-containing protein  28.19 
 
 
443 aa  189  1e-46  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2725  hypothetical protein  33.43 
 
 
441 aa  188  2e-46  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0141  peptidase M16 domain protein  29.11 
 
 
975 aa  187  3e-46  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2598  hypothetical protein  33.15 
 
 
441 aa  187  5e-46  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0269  peptidase M16 domain protein  28.66 
 
 
494 aa  186  7e-46  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.271306  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2703  peptidase M16 domain protein  28.46 
 
 
440 aa  186  7e-46  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2025  peptidase M16 domain-containing protein  29.14 
 
 
981 aa  186  7e-46  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.0310906  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4406  peptidase M16-like  30.17 
 
 
943 aa  185  1.0000000000000001e-45  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1829  peptidase M16 domain protein  28.63 
 
 
984 aa  185  2.0000000000000003e-45  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal  0.661414 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_08201  peptidase, M16 family protein  27.89 
 
 
990 aa  185  2.0000000000000003e-45  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.287012  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0261  peptidase M16 domain-containing protein  28.69 
 
 
443 aa  185  2.0000000000000003e-45  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  unclonable  0.000000513625  normal  0.227904 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0260  peptidase M16 domain-containing protein  28.85 
 
 
443 aa  183  6e-45  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal  0.0286002 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0390  M16 family peptidase  28.76 
 
 
976 aa  180  4e-44  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal  0.45037 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3444  hypothetical protein  28.28 
 
 
443 aa  180  4e-44  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1580  peptidase M16 domain protein  28.33 
 
 
896 aa  179  7e-44  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00116015 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2368  peptidase M16 domain protein  27.47 
 
 
981 aa  179  1e-43  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0913  peptidase M16 domain protein  28.04 
 
 
982 aa  179  1e-43  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4176  peptidase M16 domain-containing protein  28.72 
 
 
455 aa  178  2e-43  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0478283  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1230  zinc protease  28.19 
 
 
979 aa  178  2e-43  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.837321 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2204  peptidase M16 domain-containing protein  27.78 
 
 
469 aa  178  2e-43  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0863446  normal  0.285951 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0410  peptidase M16 domain protein  28.41 
 
 
979 aa  178  2e-43  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2306  peptidase M16 domain-containing protein  29.11 
 
 
443 aa  177  3e-43  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_02705  putative protease  33.8 
 
 
440 aa  177  5e-43  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.441156  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_5112  peptidase M16 domain protein  33.24 
 
 
451 aa  176  6e-43  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.233553  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5162  peptidase M16 domain-containing protein  33.15 
 
 
451 aa  177  6e-43  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2658  peptidase M16 domain-containing protein  28.66 
 
 
460 aa  176  7e-43  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.287658  hitchhiker  0.000609596 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4752  insulinase-like:peptidase M16, C-terminal  28.33 
 
 
450 aa  175  1.9999999999999998e-42  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.0494338 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4985  peptidase M16 domain-containing protein  32.96 
 
 
451 aa  175  1.9999999999999998e-42  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0353  peptidase M16 domain-containing protein  32.77 
 
 
451 aa  174  3.9999999999999995e-42  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0426  peptidase, M16 family  28.12 
 
 
450 aa  172  1e-41  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2545  peptidase M16  28.27 
 
 
464 aa  171  2e-41  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0282  peptidase M16-like protein  31.46 
 
 
504 aa  171  4e-41  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.35404  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>