More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gmet_2530 on replicon NC_007517
Organism: Geobacter metallireducens GS-15



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_002939  GSU0927  M16 family peptidase  85.34 
 
 
468 aa  824    Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.680782  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2530  peptidase M16-like  100 
 
 
496 aa  1016    Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00393243 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3629  peptidase M16 domain-containing protein  79.7 
 
 
497 aa  802    Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.854314  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0687  peptidase M16 domain protein  77.33 
 
 
494 aa  809    Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  decreased coverage  0.00118117  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0699  peptidase M16 domain protein  77.33 
 
 
494 aa  808    Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000162318 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0496  peptidase M16 domain protein  68.48 
 
 
501 aa  720    Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3215  peptidase M16 domain-containing protein  69.57 
 
 
510 aa  699    Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1981  M16 family peptidase  54.16 
 
 
526 aa  564  1.0000000000000001e-159  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2346  peptidase M16 domain protein  40.69 
 
 
518 aa  382  1e-104  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0622  peptidase M16-like  42.09 
 
 
503 aa  372  1e-102  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2753  peptidase M16 domain protein  38.88 
 
 
532 aa  370  1e-101  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.346086  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1598  peptidase M16 domain-containing protein  40 
 
 
493 aa  371  1e-101  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal  0.314521 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3357  processing peptidase  39.83 
 
 
526 aa  363  4e-99  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2745  peptidase M16 domain protein  39.62 
 
 
520 aa  360  3e-98  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0739  processing peptidase  38.97 
 
 
539 aa  360  4e-98  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4370  peptidase M16-like  40 
 
 
528 aa  353  2.9999999999999997e-96  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.345763 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2773  peptidase M16-like  38.33 
 
 
550 aa  350  4e-95  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.346187 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0376  putative zinc protease protein  35.84 
 
 
508 aa  308  1.0000000000000001e-82  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal  0.535365 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3228  peptidase M16 domain-containing protein  33.82 
 
 
493 aa  247  4e-64  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.966774 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0734  peptidase M16-like protein  34.19 
 
 
470 aa  239  1e-61  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2987  M16 family peptidase  33.69 
 
 
466 aa  232  1e-59  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.669528  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1933  peptidase M16-like  31.33 
 
 
459 aa  228  2e-58  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.0501339  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1927  peptidase M16 domain-containing protein  30.66 
 
 
455 aa  223  6e-57  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.464341  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2737  peptidase M16-like  30.62 
 
 
465 aa  219  6e-56  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1941  peptidase M16-like  30.2 
 
 
453 aa  219  8.999999999999998e-56  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2725  hypothetical protein  30.57 
 
 
441 aa  216  7e-55  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2598  hypothetical protein  30.36 
 
 
441 aa  215  9.999999999999999e-55  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0303  M16 family peptidase  29.66 
 
 
983 aa  214  2.9999999999999995e-54  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0171  peptidase M16 domain protein  33.19 
 
 
462 aa  214  2.9999999999999995e-54  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.0696206  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1867  peptidase M16-like  32.03 
 
 
457 aa  213  7.999999999999999e-54  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2315  processing peptidase  30.37 
 
 
443 aa  211  3e-53  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.276856  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5791  peptidase M16 domain protein  29.98 
 
 
447 aa  211  3e-53  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.0298791 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0303  peptidase M16 domain-containing protein  29.18 
 
 
442 aa  210  4e-53  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3581  peptidase M16 domain-containing protein  29.8 
 
 
461 aa  209  8e-53  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4537.2  Zn-dependent peptidase  28.66 
 
 
443 aa  209  1e-52  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1348  peptidase M16 domain protein  31.95 
 
 
439 aa  208  2e-52  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.387051  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2078  peptidase M16 domain protein  31.6 
 
 
441 aa  208  2e-52  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2806  peptidase M16 domain-containing protein  31.12 
 
 
876 aa  207  3e-52  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.326138  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3948  peptidase M16 domain-containing protein  29.79 
 
 
443 aa  206  6e-52  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.843768  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1993  peptidase M16 domain protein  31.39 
 
 
457 aa  206  7e-52  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4256  peptidase M16 domain-containing protein  28.51 
 
 
443 aa  206  8e-52  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.802915  normal  0.163527 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4130  peptidase M16 domain-containing protein  28.51 
 
 
443 aa  206  9e-52  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3491  peptidase M16 domain-containing protein  28.46 
 
 
443 aa  205  1e-51  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0207  peptidase M16 domain-containing protein  28.51 
 
 
443 aa  205  1e-51  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.0549198  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0261  peptidase M16 domain-containing protein  29.76 
 
 
443 aa  205  2e-51  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  unclonable  0.000000513625  normal  0.227904 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4630  peptidase M16 domain-containing protein  33.55 
 
 
464 aa  203  6e-51  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3815  peptidase M16 domain-containing protein  28.66 
 
 
443 aa  202  9.999999999999999e-51  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3742  peptidase M16 domain-containing protein  28.66 
 
 
443 aa  202  1.9999999999999998e-50  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0260  peptidase M16 domain-containing protein  29.48 
 
 
443 aa  201  3e-50  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal  0.0286002 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3940  peptidase M16 domain-containing protein  28.66 
 
 
443 aa  201  3e-50  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3545  peptidase M16 domain-containing protein  30.32 
 
 
422 aa  201  3.9999999999999996e-50  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.408173  normal  0.11594 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0209  peptidase M16 domain protein  28.11 
 
 
443 aa  199  7e-50  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.61941  normal  0.477171 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2031  peptidase M16 domain protein  29.34 
 
 
985 aa  198  2.0000000000000003e-49  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal  0.79996 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1972  peptidase M16 domain-containing protein  30.75 
 
 
428 aa  198  2.0000000000000003e-49  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3719  peptidase M16, C-terminal:peptidase M16, N-terminal  29.83 
 
 
452 aa  197  3e-49  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.0647985 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0335  peptidase M16, C-terminal:peptidase M16, N-terminal  30.41 
 
 
506 aa  197  3e-49  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.844691  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3486  peptidase M16-like protein  29.79 
 
 
441 aa  197  3e-49  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.0315623  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0102  peptidase M16-like  30.34 
 
 
458 aa  197  4.0000000000000005e-49  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.49801  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0467  putative zinc protease  29.16 
 
 
465 aa  197  4.0000000000000005e-49  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.723216  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_04890  putative zinc protease  29.16 
 
 
465 aa  197  4.0000000000000005e-49  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0217  peptidase, M16 family  26.79 
 
 
459 aa  196  6e-49  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.233228  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0120  peptidase M16 domain protein  30.34 
 
 
458 aa  196  6e-49  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0913  peptidase M16 domain protein  29.24 
 
 
982 aa  196  7e-49  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0109  peptidase M16 domain protein  30.82 
 
 
458 aa  196  9e-49  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.470915  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6480  peptidase M16 domain protein  30.17 
 
 
1014 aa  195  2e-48  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A2107  M16 family peptidase  27.39 
 
 
442 aa  193  6e-48  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_03530  peptidase M16-like protein  30.71 
 
 
448 aa  192  1e-47  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  hitchhiker  0.00356454  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0932  insulinase-like peptidase  30.25 
 
 
489 aa  191  2e-47  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0377  insulinase family protein  34.2 
 
 
453 aa  191  2.9999999999999997e-47  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.454609  decreased coverage  0.00376869 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2025  peptidase M16 domain-containing protein  30.24 
 
 
981 aa  191  2.9999999999999997e-47  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.0310906  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_08201  peptidase, M16 family protein  28.14 
 
 
990 aa  190  4e-47  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.287012  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3444  hypothetical protein  29.72 
 
 
443 aa  189  9e-47  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0390  M16 family peptidase  28.94 
 
 
976 aa  189  9e-47  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal  0.45037 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0353  peptidase M16 domain-containing protein  30.46 
 
 
451 aa  189  1e-46  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_02705  putative protease  27.96 
 
 
440 aa  189  1e-46  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.441156  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5162  peptidase M16 domain-containing protein  29.55 
 
 
451 aa  188  2e-46  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1829  peptidase M16 domain protein  28.17 
 
 
984 aa  187  3e-46  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal  0.661414 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4176  peptidase M16 domain-containing protein  29.29 
 
 
455 aa  187  4e-46  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0478283  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2545  peptidase M16  29.3 
 
 
464 aa  187  4e-46  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2703  peptidase M16 domain protein  28.95 
 
 
440 aa  187  4e-46  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2368  peptidase M16 domain protein  27.7 
 
 
981 aa  187  5e-46  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0410  peptidase M16 domain protein  28.02 
 
 
979 aa  187  6e-46  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0141  peptidase M16 domain protein  28.91 
 
 
975 aa  186  8e-46  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0387  putative zinc protease protein  28.81 
 
 
501 aa  186  9e-46  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1225  peptidase M16-like  28.42 
 
 
431 aa  186  1.0000000000000001e-45  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.522553  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0430  peptidase M16-like  27.72 
 
 
453 aa  186  1.0000000000000001e-45  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0242  peptidase M16 domain protein  29.03 
 
 
477 aa  185  2.0000000000000003e-45  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2274  peptidase M16 domain-containing protein  29.92 
 
 
424 aa  185  2.0000000000000003e-45  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0845723  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3617  peptidase M16 domain protein  30.5 
 
 
470 aa  184  3e-45  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.903787  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2204  peptidase M16 domain-containing protein  28.45 
 
 
469 aa  182  2e-44  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0863446  normal  0.285951 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5112  peptidase M16 domain protein  28.93 
 
 
451 aa  180  4.999999999999999e-44  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.233553  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5316  peptidase M16, C-terminal:peptidase M16, N-terminal  29.36 
 
 
942 aa  179  1e-43  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0063  M16 family peptidase  30.32 
 
 
459 aa  178  2e-43  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.0261125  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4985  peptidase M16 domain-containing protein  28.72 
 
 
451 aa  177  4e-43  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1713  putative Zn-dependent protease  28.57 
 
 
461 aa  176  7e-43  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.137894 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4752  insulinase-like:peptidase M16, C-terminal  29.24 
 
 
450 aa  176  7e-43  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.0494338 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1782  peptidase M16 domain-containing protein  28.12 
 
 
530 aa  176  7e-43  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.636723  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0426  peptidase, M16 family  29.24 
 
 
450 aa  176  9.999999999999999e-43  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2306  peptidase M16 domain-containing protein  28.18 
 
 
443 aa  175  9.999999999999999e-43  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3165  peptidase M16-like  28.24 
 
 
464 aa  175  1.9999999999999998e-42  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>