More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pcar_1981 on replicon NC_007498
Organism: Pelobacter carbinolicus DSM 2380



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007498  Pcar_1981  M16 family peptidase  100 
 
 
526 aa  1085    Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0687  peptidase M16 domain protein  57.26 
 
 
494 aa  587  1e-166  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  decreased coverage  0.00118117  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3629  peptidase M16 domain-containing protein  57.11 
 
 
497 aa  578  1e-164  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.854314  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0699  peptidase M16 domain protein  56.85 
 
 
494 aa  581  1e-164  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000162318 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0927  M16 family peptidase  56.47 
 
 
468 aa  553  1e-156  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.680782  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2530  peptidase M16-like  54.16 
 
 
496 aa  544  1e-153  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00393243 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0496  peptidase M16 domain protein  54.51 
 
 
501 aa  541  9.999999999999999e-153  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3215  peptidase M16 domain-containing protein  53.67 
 
 
510 aa  521  1e-146  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2346  peptidase M16 domain protein  40.04 
 
 
518 aa  369  1e-101  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3357  processing peptidase  42.27 
 
 
526 aa  364  2e-99  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2753  peptidase M16 domain protein  40.25 
 
 
532 aa  362  6e-99  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.346086  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2745  peptidase M16 domain protein  42.05 
 
 
520 aa  361  1e-98  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0739  processing peptidase  41.18 
 
 
539 aa  354  2e-96  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1598  peptidase M16 domain-containing protein  40.3 
 
 
493 aa  350  3e-95  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal  0.314521 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0622  peptidase M16-like  41.14 
 
 
503 aa  348  2e-94  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2773  peptidase M16-like  40.43 
 
 
550 aa  345  8e-94  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.346187 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4370  peptidase M16-like  40.67 
 
 
528 aa  345  2e-93  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.345763 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0376  putative zinc protease protein  39.1 
 
 
508 aa  302  8.000000000000001e-81  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal  0.535365 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2737  peptidase M16-like  32.67 
 
 
465 aa  229  9e-59  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2315  processing peptidase  33.33 
 
 
443 aa  228  3e-58  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.276856  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0734  peptidase M16-like protein  32 
 
 
470 aa  225  1e-57  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3228  peptidase M16 domain-containing protein  33.19 
 
 
493 aa  221  1.9999999999999999e-56  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.966774 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3581  peptidase M16 domain-containing protein  31.36 
 
 
461 aa  221  3e-56  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3486  peptidase M16-like protein  31.34 
 
 
441 aa  218  2e-55  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.0315623  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1933  peptidase M16-like  31.79 
 
 
459 aa  216  9e-55  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.0501339  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0261  peptidase M16 domain-containing protein  31.3 
 
 
443 aa  214  1.9999999999999998e-54  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  unclonable  0.000000513625  normal  0.227904 
 
 
-
 
NC_006369  lpl2598  hypothetical protein  30.93 
 
 
441 aa  214  2.9999999999999995e-54  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2987  M16 family peptidase  32.56 
 
 
466 aa  214  3.9999999999999995e-54  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.669528  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2725  hypothetical protein  30.72 
 
 
441 aa  213  7.999999999999999e-54  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0171  peptidase M16 domain protein  34.32 
 
 
462 aa  212  1e-53  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.0696206  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0303  peptidase M16 domain-containing protein  30.55 
 
 
442 aa  210  7e-53  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4130  peptidase M16 domain-containing protein  30.96 
 
 
443 aa  209  8e-53  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4256  peptidase M16 domain-containing protein  30.96 
 
 
443 aa  209  8e-53  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.802915  normal  0.163527 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1927  peptidase M16 domain-containing protein  29.61 
 
 
455 aa  209  1e-52  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.464341  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0207  peptidase M16 domain-containing protein  30.96 
 
 
443 aa  209  1e-52  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.0549198  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0209  peptidase M16 domain protein  30.75 
 
 
443 aa  208  2e-52  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.61941  normal  0.477171 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4537.2  Zn-dependent peptidase  30.35 
 
 
443 aa  207  5e-52  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0217  peptidase, M16 family  28.57 
 
 
459 aa  207  5e-52  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.233228  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0387  putative zinc protease protein  31.24 
 
 
501 aa  207  6e-52  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A2107  M16 family peptidase  29.26 
 
 
442 aa  206  7e-52  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1632  peptidase M16 domain protein  29.84 
 
 
454 aa  204  3e-51  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.48477  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3742  peptidase M16 domain-containing protein  30.55 
 
 
443 aa  204  3e-51  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3815  peptidase M16 domain-containing protein  30.55 
 
 
443 aa  204  3e-51  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0260  peptidase M16 domain-containing protein  30.71 
 
 
443 aa  204  3e-51  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal  0.0286002 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3491  peptidase M16 domain-containing protein  30.35 
 
 
443 aa  204  3e-51  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0269  peptidase M16 domain protein  30.02 
 
 
494 aa  202  9.999999999999999e-51  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.271306  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3940  peptidase M16 domain-containing protein  30.55 
 
 
443 aa  202  9.999999999999999e-51  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3948  peptidase M16 domain-containing protein  30.77 
 
 
443 aa  202  1.9999999999999998e-50  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.843768  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2806  peptidase M16 domain-containing protein  35.97 
 
 
876 aa  200  5e-50  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.326138  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0282  peptidase M16-like protein  31.21 
 
 
504 aa  200  5e-50  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.35404  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3444  hypothetical protein  30.08 
 
 
443 aa  197  6e-49  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5791  peptidase M16 domain protein  29.01 
 
 
447 aa  196  6e-49  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.0298791 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3719  peptidase M16, C-terminal:peptidase M16, N-terminal  28.54 
 
 
452 aa  195  1e-48  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.0647985 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0335  peptidase M16, C-terminal:peptidase M16, N-terminal  29.98 
 
 
506 aa  195  2e-48  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.844691  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1348  peptidase M16 domain protein  34.13 
 
 
439 aa  194  2e-48  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.387051  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3617  peptidase M16 domain protein  30.65 
 
 
470 aa  195  2e-48  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.903787  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1941  peptidase M16-like  30.46 
 
 
453 aa  194  3e-48  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2703  peptidase M16 domain protein  29.63 
 
 
440 aa  192  9e-48  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0187  protease  29.05 
 
 
514 aa  187  4e-46  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0377  insulinase family protein  30.68 
 
 
453 aa  184  3e-45  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.454609  decreased coverage  0.00376869 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2274  peptidase M16 domain-containing protein  32.09 
 
 
424 aa  184  5.0000000000000004e-45  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0845723  normal 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3038  peptidase M16 domain-containing protein  29.33 
 
 
513 aa  183  6e-45  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.101443  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2306  peptidase M16 domain-containing protein  31.01 
 
 
443 aa  183  7e-45  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2204  peptidase M16 domain-containing protein  30.39 
 
 
469 aa  181  2.9999999999999997e-44  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0863446  normal  0.285951 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1580  peptidase M16 domain protein  29.87 
 
 
896 aa  181  2.9999999999999997e-44  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00116015 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3545  peptidase M16 domain-containing protein  31.45 
 
 
422 aa  181  4e-44  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.408173  normal  0.11594 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5162  peptidase M16 domain-containing protein  30.08 
 
 
451 aa  179  1e-43  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_03530  peptidase M16-like protein  31.11 
 
 
448 aa  179  2e-43  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  hitchhiker  0.00356454  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1800  peptidase M16 domain-containing protein  29.88 
 
 
492 aa  178  2e-43  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.296573  normal  0.835018 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2144  peptidase M16 domain-containing protein  27.67 
 
 
453 aa  178  2e-43  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.00773461  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2545  peptidase M16  30.11 
 
 
464 aa  178  3e-43  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0063  M16 family peptidase  31.42 
 
 
459 aa  177  4e-43  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.0261125  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0467  putative zinc protease  29.07 
 
 
465 aa  177  4e-43  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.723216  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_04890  putative zinc protease  29.07 
 
 
465 aa  177  4e-43  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0892  peptidase M16 domain-containing protein  28.79 
 
 
499 aa  176  8e-43  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.12862  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5112  peptidase M16 domain protein  29.45 
 
 
451 aa  175  1.9999999999999998e-42  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.233553  normal 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1782  peptidase M16 domain-containing protein  28.72 
 
 
530 aa  175  1.9999999999999998e-42  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.636723  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2078  peptidase M16 domain protein  30.15 
 
 
441 aa  175  1.9999999999999998e-42  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1225  peptidase M16-like  26.34 
 
 
431 aa  174  1.9999999999999998e-42  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.522553  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1972  peptidase M16 domain-containing protein  30.66 
 
 
428 aa  175  1.9999999999999998e-42  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1867  peptidase M16-like  30.17 
 
 
457 aa  174  2.9999999999999996e-42  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4630  peptidase M16 domain-containing protein  29.5 
 
 
464 aa  174  3.9999999999999995e-42  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_08201  peptidase, M16 family protein  27.16 
 
 
990 aa  173  6.999999999999999e-42  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.287012  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6480  peptidase M16 domain protein  29.83 
 
 
1014 aa  172  1e-41  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4985  peptidase M16 domain-containing protein  29.24 
 
 
451 aa  172  1e-41  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_02705  putative protease  27.81 
 
 
440 aa  172  2e-41  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.441156  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3165  peptidase M16-like  29.54 
 
 
464 aa  171  3e-41  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3872  peptidase M16 domain-containing protein  30.58 
 
 
484 aa  170  5e-41  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.817075  normal 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1482  peptidase M16-like  28.11 
 
 
493 aa  169  8e-41  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.830241  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4373  peptidase M16 domain protein  30.47 
 
 
473 aa  169  9e-41  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1272  peptidase M16 domain protein  30.06 
 
 
470 aa  168  2e-40  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.720642  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0242  peptidase M16 domain protein  31.79 
 
 
477 aa  168  2e-40  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1993  peptidase M16 domain protein  29.72 
 
 
457 aa  167  2.9999999999999998e-40  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7810  putative zinc protease  28.97 
 
 
467 aa  167  2.9999999999999998e-40  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.129356  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4176  peptidase M16 domain-containing protein  29.5 
 
 
455 aa  167  4e-40  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0478283  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4035  peptidase M16-like  29.25 
 
 
461 aa  167  4e-40  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.291122 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0913  peptidase M16 domain protein  27.54 
 
 
982 aa  166  1.0000000000000001e-39  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2012  peptidase M16 domain-containing protein  26.61 
 
 
929 aa  165  2.0000000000000002e-39  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0141  peptidase M16 domain protein  26.64 
 
 
975 aa  164  3e-39  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4179  peptidase M16-like  28.69 
 
 
476 aa  163  5.0000000000000005e-39  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.567421  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>