More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gura_3629 on replicon NC_009483
Organism: Geobacter uraniireducens Rf4



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_002939  GSU0927  M16 family peptidase  77.99 
 
 
468 aa  780    Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.680782  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2530  peptidase M16-like  77.28 
 
 
496 aa  787    Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00393243 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3629  peptidase M16 domain-containing protein  100 
 
 
497 aa  1024    Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.854314  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0687  peptidase M16 domain protein  78.82 
 
 
494 aa  810    Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  decreased coverage  0.00118117  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0496  peptidase M16 domain protein  68.12 
 
 
501 aa  697    Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0699  peptidase M16 domain protein  78.41 
 
 
494 aa  804    Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000162318 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3215  peptidase M16 domain-containing protein  69.02 
 
 
510 aa  701    Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1981  M16 family peptidase  56.38 
 
 
526 aa  582  1.0000000000000001e-165  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2753  peptidase M16 domain protein  40.47 
 
 
532 aa  379  1e-104  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.346086  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2346  peptidase M16 domain protein  41.49 
 
 
518 aa  381  1e-104  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0622  peptidase M16-like  41.79 
 
 
503 aa  378  1e-103  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0739  processing peptidase  40.37 
 
 
539 aa  369  1e-100  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1598  peptidase M16 domain-containing protein  39.62 
 
 
493 aa  367  1e-100  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal  0.314521 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3357  processing peptidase  38.88 
 
 
526 aa  358  9.999999999999999e-98  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2745  peptidase M16 domain protein  39.17 
 
 
520 aa  355  1e-96  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2773  peptidase M16-like  38.54 
 
 
550 aa  350  4e-95  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.346187 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4370  peptidase M16-like  38.66 
 
 
528 aa  342  5.999999999999999e-93  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.345763 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0376  putative zinc protease protein  34.95 
 
 
508 aa  310  2.9999999999999997e-83  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal  0.535365 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1933  peptidase M16-like  34.23 
 
 
459 aa  246  8e-64  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.0501339  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2987  M16 family peptidase  34.12 
 
 
466 aa  237  3e-61  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.669528  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3228  peptidase M16 domain-containing protein  31.87 
 
 
493 aa  234  2.0000000000000002e-60  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.966774 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1867  peptidase M16-like  33.12 
 
 
457 aa  221  3e-56  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0734  peptidase M16-like protein  37.98 
 
 
470 aa  219  6e-56  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2737  peptidase M16-like  31.8 
 
 
465 aa  219  1e-55  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2806  peptidase M16 domain-containing protein  32.99 
 
 
876 aa  217  4e-55  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.326138  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2306  peptidase M16 domain-containing protein  31.81 
 
 
443 aa  215  1.9999999999999998e-54  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3491  peptidase M16 domain-containing protein  28.98 
 
 
443 aa  213  4.9999999999999996e-54  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0377  insulinase family protein  31.29 
 
 
453 aa  213  7e-54  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.454609  decreased coverage  0.00376869 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1941  peptidase M16-like  36.06 
 
 
453 aa  212  1e-53  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4256  peptidase M16 domain-containing protein  28.57 
 
 
443 aa  212  1e-53  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.802915  normal  0.163527 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3486  peptidase M16-like protein  29.88 
 
 
441 aa  212  1e-53  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.0315623  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4130  peptidase M16 domain-containing protein  28.57 
 
 
443 aa  211  2e-53  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0207  peptidase M16 domain-containing protein  28.57 
 
 
443 aa  211  3e-53  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.0549198  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2078  peptidase M16 domain protein  32.19 
 
 
441 aa  209  7e-53  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3815  peptidase M16 domain-containing protein  28.78 
 
 
443 aa  209  8e-53  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0303  M16 family peptidase  29.27 
 
 
983 aa  209  1e-52  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3742  peptidase M16 domain-containing protein  28.78 
 
 
443 aa  209  1e-52  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1993  peptidase M16 domain protein  31.97 
 
 
457 aa  208  2e-52  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3940  peptidase M16 domain-containing protein  28.78 
 
 
443 aa  208  2e-52  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1348  peptidase M16 domain protein  32.03 
 
 
439 aa  206  5e-52  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.387051  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0171  peptidase M16 domain protein  33.4 
 
 
462 aa  206  6e-52  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.0696206  normal 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0932  insulinase-like peptidase  30.47 
 
 
489 aa  206  8e-52  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2315  processing peptidase  30.32 
 
 
443 aa  206  8e-52  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.276856  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3948  peptidase M16 domain-containing protein  30.08 
 
 
443 aa  206  9e-52  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.843768  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0217  peptidase, M16 family  27.29 
 
 
459 aa  206  1e-51  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.233228  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0209  peptidase M16 domain protein  28.16 
 
 
443 aa  206  1e-51  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.61941  normal  0.477171 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6480  peptidase M16 domain protein  30.8 
 
 
1014 aa  204  2e-51  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0387  putative zinc protease protein  29.77 
 
 
501 aa  203  6e-51  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A2107  M16 family peptidase  27.75 
 
 
442 aa  203  6e-51  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2545  peptidase M16  31.78 
 
 
464 aa  201  1.9999999999999998e-50  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0260  peptidase M16 domain-containing protein  29.7 
 
 
443 aa  201  1.9999999999999998e-50  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal  0.0286002 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1972  peptidase M16 domain-containing protein  30.75 
 
 
428 aa  201  1.9999999999999998e-50  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5791  peptidase M16 domain protein  29.39 
 
 
447 aa  200  5e-50  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.0298791 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2031  peptidase M16 domain protein  29.24 
 
 
985 aa  200  6e-50  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal  0.79996 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3165  peptidase M16-like  31.24 
 
 
464 aa  199  7.999999999999999e-50  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1482  peptidase M16-like  29.61 
 
 
493 aa  199  9e-50  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.830241  normal 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0390  M16 family peptidase  28.94 
 
 
976 aa  199  1.0000000000000001e-49  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal  0.45037 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0141  peptidase M16 domain protein  30 
 
 
975 aa  199  1.0000000000000001e-49  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2368  peptidase M16 domain protein  28.95 
 
 
981 aa  198  2.0000000000000003e-49  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3444  hypothetical protein  29.18 
 
 
443 aa  198  2.0000000000000003e-49  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0109  peptidase M16 domain protein  30.17 
 
 
458 aa  198  2.0000000000000003e-49  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.470915  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0120  peptidase M16 domain protein  30 
 
 
458 aa  197  3e-49  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0102  peptidase M16-like  29.85 
 
 
458 aa  197  4.0000000000000005e-49  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.49801  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2725  hypothetical protein  33.14 
 
 
441 aa  197  5.000000000000001e-49  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0063  M16 family peptidase  30.8 
 
 
459 aa  195  1e-48  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.0261125  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2598  hypothetical protein  32.86 
 
 
441 aa  196  1e-48  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_03530  peptidase M16-like protein  30.88 
 
 
448 aa  196  1e-48  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  hitchhiker  0.00356454  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3719  peptidase M16, C-terminal:peptidase M16, N-terminal  29.36 
 
 
452 aa  195  2e-48  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.0647985 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4630  peptidase M16 domain-containing protein  32.26 
 
 
464 aa  194  2e-48  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0410  peptidase M16 domain protein  28.42 
 
 
979 aa  194  2e-48  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1927  peptidase M16 domain-containing protein  34.73 
 
 
455 aa  194  3e-48  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.464341  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2025  peptidase M16 domain-containing protein  29.71 
 
 
981 aa  194  4e-48  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.0310906  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0282  peptidase M16-like protein  29.45 
 
 
504 aa  193  5e-48  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.35404  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4035  peptidase M16-like  29.18 
 
 
461 aa  192  9e-48  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.291122 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3617  peptidase M16 domain protein  31.14 
 
 
470 aa  192  1e-47  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.903787  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0913  peptidase M16 domain protein  29.48 
 
 
982 aa  191  2e-47  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0303  peptidase M16 domain-containing protein  33.43 
 
 
442 aa  191  2e-47  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4179  peptidase M16-like  28.57 
 
 
476 aa  191  2.9999999999999997e-47  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.567421  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0335  peptidase M16, C-terminal:peptidase M16, N-terminal  28.66 
 
 
506 aa  190  5.999999999999999e-47  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.844691  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0261  peptidase M16 domain-containing protein  28.98 
 
 
443 aa  189  7e-47  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  unclonable  0.000000513625  normal  0.227904 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4176  peptidase M16 domain-containing protein  29.13 
 
 
455 aa  189  8e-47  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0478283  normal 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1829  peptidase M16 domain protein  28.23 
 
 
984 aa  189  1e-46  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal  0.661414 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0242  peptidase M16 domain protein  29.18 
 
 
477 aa  188  2e-46  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5162  peptidase M16 domain-containing protein  29.39 
 
 
451 aa  188  2e-46  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1632  peptidase M16 domain protein  34.45 
 
 
454 aa  187  3e-46  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.48477  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0269  peptidase M16 domain protein  28.54 
 
 
494 aa  187  4e-46  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.271306  normal 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_08201  peptidase, M16 family protein  28.25 
 
 
990 aa  187  5e-46  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.287012  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3581  peptidase M16 domain-containing protein  34.3 
 
 
461 aa  186  6e-46  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5112  peptidase M16 domain protein  29.39 
 
 
451 aa  186  9e-46  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.233553  normal 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1782  peptidase M16 domain-containing protein  28.78 
 
 
530 aa  184  4.0000000000000006e-45  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.636723  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4985  peptidase M16 domain-containing protein  29.18 
 
 
451 aa  184  5.0000000000000004e-45  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0353  peptidase M16 domain-containing protein  28.83 
 
 
451 aa  183  8.000000000000001e-45  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1225  peptidase M16-like  27.05 
 
 
431 aa  179  8e-44  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.522553  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1392  peptidase M16-like  27.65 
 
 
489 aa  179  8e-44  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.260457  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1544  peptidase M16 domain-containing protein  27.1 
 
 
440 aa  178  2e-43  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0094  peptidase M16-like  30.07 
 
 
477 aa  178  2e-43  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4537.2  Zn-dependent peptidase  31.49 
 
 
443 aa  177  6e-43  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4406  peptidase M16-like  29.6 
 
 
943 aa  175  1.9999999999999998e-42  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1800  peptidase M16 domain-containing protein  29.68 
 
 
492 aa  174  2.9999999999999996e-42  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.296573  normal  0.835018 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2012  peptidase M16 domain-containing protein  29.68 
 
 
929 aa  174  5e-42  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>