More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Phep_3516 on replicon NC_013061
Organism: Pedobacter heparinus DSM 2366



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010831  Cphamn1_2031  peptidase M16 domain protein  41.12 
 
 
985 aa  788    Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal  0.79996 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1829  peptidase M16 domain protein  41.63 
 
 
984 aa  792    Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal  0.661414 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0410  peptidase M16 domain protein  40.82 
 
 
979 aa  761    Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0390  M16 family peptidase  39.61 
 
 
976 aa  768    Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal  0.45037 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0303  M16 family peptidase  40.39 
 
 
983 aa  782    Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2025  peptidase M16 domain-containing protein  41.65 
 
 
981 aa  774    Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.0310906  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2368  peptidase M16 domain protein  41.65 
 
 
981 aa  788    Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_08201  peptidase, M16 family protein  40.81 
 
 
990 aa  728    Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.287012  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3516  peptidase M16 domain protein  100 
 
 
977 aa  2019    Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0913  peptidase M16 domain protein  56.5 
 
 
982 aa  1134    Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1230  zinc protease  42.36 
 
 
979 aa  788    Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.837321 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0141  peptidase M16 domain protein  51.38 
 
 
975 aa  1002    Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2263  peptidase M16 domain protein  37.49 
 
 
980 aa  650    Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.000614686  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6480  peptidase M16 domain protein  29.25 
 
 
1014 aa  473  1e-132  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0622  peptidase M16-like  29.01 
 
 
503 aa  200  1.0000000000000001e-49  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2773  peptidase M16-like  27.69 
 
 
550 aa  189  2e-46  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.346187 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2346  peptidase M16 domain protein  29.39 
 
 
518 aa  187  6e-46  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2753  peptidase M16 domain protein  28.6 
 
 
532 aa  186  2.0000000000000003e-45  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.346086  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0927  M16 family peptidase  27.59 
 
 
468 aa  174  7.999999999999999e-42  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.680782  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3357  processing peptidase  26.39 
 
 
526 aa  171  4e-41  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2530  peptidase M16-like  26.48 
 
 
496 aa  171  6e-41  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00393243 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2745  peptidase M16 domain protein  26.16 
 
 
520 aa  167  6.9999999999999995e-40  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0687  peptidase M16 domain protein  27.21 
 
 
494 aa  166  2.0000000000000002e-39  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  decreased coverage  0.00118117  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3629  peptidase M16 domain-containing protein  27.72 
 
 
497 aa  164  7e-39  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.854314  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0699  peptidase M16 domain protein  26.78 
 
 
494 aa  162  2e-38  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000162318 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0496  peptidase M16 domain protein  25.53 
 
 
501 aa  163  2e-38  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3215  peptidase M16 domain-containing protein  25.53 
 
 
510 aa  161  6e-38  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0739  processing peptidase  24.9 
 
 
539 aa  161  7e-38  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1598  peptidase M16 domain-containing protein  29.43 
 
 
493 aa  158  4e-37  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal  0.314521 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0376  putative zinc protease protein  24.68 
 
 
508 aa  157  1e-36  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal  0.535365 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4370  peptidase M16-like  25.15 
 
 
528 aa  154  7e-36  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.345763 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1981  M16 family peptidase  24.52 
 
 
526 aa  140  1e-31  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1782  peptidase M16 domain-containing protein  23.68 
 
 
530 aa  133  1.0000000000000001e-29  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.636723  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01173  Peptidase, M16 family protein  21.24 
 
 
930 aa  132  4.0000000000000003e-29  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.0120262  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0642  exported pepdidase, putative zinc protease  23.55 
 
 
950 aa  130  9.000000000000001e-29  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1482  peptidase M16-like  25.54 
 
 
493 aa  130  1.0000000000000001e-28  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.830241  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0094  peptidase M16-like  23.8 
 
 
477 aa  124  7e-27  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0932  insulinase-like peptidase  24.82 
 
 
489 aa  124  9.999999999999999e-27  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1993  peptidase M16 domain protein  23.51 
 
 
457 aa  123  1.9999999999999998e-26  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0430  peptidase M16-like  25.66 
 
 
453 aa  122  3.9999999999999996e-26  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1972  peptidase M16 domain-containing protein  24.57 
 
 
428 aa  122  4.9999999999999996e-26  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1207  peptidase M16 domain-containing protein  23.72 
 
 
945 aa  121  7e-26  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1867  peptidase M16-like  23.12 
 
 
457 aa  120  1.9999999999999998e-25  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2387  peptidase M16-like protein  22.4 
 
 
959 aa  119  3.9999999999999997e-25  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal  0.183046 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0089  peptidase M16 domain protein  20.57 
 
 
921 aa  118  6e-25  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2078  peptidase M16 domain protein  23.3 
 
 
441 aa  117  8.999999999999998e-25  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1348  peptidase M16 domain protein  22.3 
 
 
439 aa  117  1.0000000000000001e-24  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.387051  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0892  peptidase M16 domain-containing protein  23.46 
 
 
499 aa  117  1.0000000000000001e-24  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.12862  normal 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1927  peptidase M16 domain-containing protein  24.31 
 
 
455 aa  116  2.0000000000000002e-24  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.464341  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1544  peptidase M16 domain-containing protein  27.91 
 
 
440 aa  115  4.0000000000000004e-24  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4079  M16 family metallopeptidase  20.85 
 
 
959 aa  114  1.0000000000000001e-23  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.621113  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0108  peptidase M16 domain protein  27.93 
 
 
422 aa  114  1.0000000000000001e-23  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0187  protease  24.27 
 
 
514 aa  114  1.0000000000000001e-23  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2737  peptidase M16-like  22.44 
 
 
465 aa  112  2.0000000000000002e-23  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3327  peptidase M16 domain-containing protein  22.87 
 
 
944 aa  113  2.0000000000000002e-23  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00235124 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2981  peptidase M16 domain-containing protein  21.27 
 
 
949 aa  112  2.0000000000000002e-23  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3560  M16 family peptidase  21.81 
 
 
949 aa  112  3e-23  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1941  peptidase M16-like  21.52 
 
 
453 aa  112  3e-23  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1835  peptidase M16 domain protein  22.73 
 
 
949 aa  112  3e-23  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.300051  normal  0.619696 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02764  putative metallopeptidase, M16 family protein  21.02 
 
 
945 aa  112  3e-23  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0165  peptidase M16 domain protein  20.71 
 
 
949 aa  112  3e-23  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3161  peptidase M16 domain-containing protein  21.27 
 
 
949 aa  112  3e-23  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_03530  peptidase M16-like protein  23.14 
 
 
448 aa  112  5e-23  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  hitchhiker  0.00356454  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2012  peptidase M16 domain-containing protein  21.48 
 
 
929 aa  111  7.000000000000001e-23  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0335  peptidase M16, C-terminal:peptidase M16, N-terminal  23.11 
 
 
506 aa  110  9.000000000000001e-23  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.844691  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4537.2  Zn-dependent peptidase  26.22 
 
 
443 aa  110  1e-22  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1035  peptidase M16 domain-containing protein  21.34 
 
 
944 aa  110  1e-22  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4130  peptidase M16 domain-containing protein  26 
 
 
443 aa  110  1e-22  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3948  peptidase M16 domain-containing protein  24.73 
 
 
443 aa  110  1e-22  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.843768  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3063  peptidase M16 domain-containing protein  21.35 
 
 
949 aa  110  1e-22  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal  0.354036 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0120  peptidase M16 domain protein  26.75 
 
 
458 aa  110  2e-22  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0207  peptidase M16 domain-containing protein  26 
 
 
443 aa  110  2e-22  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.0549198  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4630  peptidase M16 domain-containing protein  25.11 
 
 
464 aa  109  2e-22  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4256  peptidase M16 domain-containing protein  26 
 
 
443 aa  109  2e-22  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.802915  normal  0.163527 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0377  insulinase family protein  25.51 
 
 
453 aa  109  3e-22  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.454609  decreased coverage  0.00376869 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2987  M16 family peptidase  22.76 
 
 
466 aa  109  3e-22  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.669528  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3491  peptidase M16 domain-containing protein  25.74 
 
 
443 aa  109  3e-22  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1632  peptidase M16 domain protein  23.19 
 
 
454 aa  108  4e-22  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.48477  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0102  peptidase M16-like  27.91 
 
 
458 aa  108  4e-22  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.49801  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3486  peptidase M16-like protein  23.67 
 
 
441 aa  108  4e-22  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.0315623  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0209  peptidase M16 domain protein  25.79 
 
 
443 aa  108  7e-22  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.61941  normal  0.477171 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0734  peptidase M16-like protein  22.37 
 
 
470 aa  107  8e-22  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0260  peptidase M16 domain-containing protein  25.94 
 
 
443 aa  107  1e-21  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal  0.0286002 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0109  peptidase M16 domain protein  27.65 
 
 
458 aa  106  2e-21  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.470915  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_02705  putative protease  25.83 
 
 
440 aa  107  2e-21  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.441156  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0303  peptidase M16 domain-containing protein  23.6 
 
 
442 aa  106  2e-21  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5791  peptidase M16 domain protein  23.53 
 
 
447 aa  106  2e-21  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.0298791 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3581  peptidase M16 domain-containing protein  24.31 
 
 
461 aa  105  3e-21  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2725  hypothetical protein  21.88 
 
 
441 aa  105  3e-21  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2598  hypothetical protein  21.88 
 
 
441 aa  105  3e-21  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1030  peptidase M16 domain-containing protein  20.81 
 
 
950 aa  105  4e-21  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0282  peptidase M16-like protein  21.76 
 
 
504 aa  105  4e-21  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.35404  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1131  peptidase M16 domain-containing protein  20.81 
 
 
950 aa  105  4e-21  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3742  peptidase M16 domain-containing protein  25.69 
 
 
443 aa  105  4e-21  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1933  peptidase M16-like  21.62 
 
 
459 aa  105  5e-21  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.0501339  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0467  putative zinc protease  23.64 
 
 
465 aa  105  5e-21  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.723216  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_04890  putative zinc protease  23.64 
 
 
465 aa  105  5e-21  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3596  pseudouridine synthase, Rsu  21.3 
 
 
912 aa  105  6e-21  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04156  zinc protease  20.99 
 
 
956 aa  105  6e-21  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0261  peptidase M16 domain-containing protein  24.37 
 
 
443 aa  105  6e-21  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  unclonable  0.000000513625  normal  0.227904 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>