More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cagg_2361 on replicon NC_011831
Organism: Chloroflexus aggregans DSM 9485



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011831  Cagg_2361  ABC-type dipeptide transport system periplasmic component-like protein  100 
 
 
445 aa  920    Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal  0.0243915 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0413  ABC-type dipeptide transport system periplasmic component-like protein  70.64 
 
 
653 aa  590  1e-167  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.457116  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1058  ABC-type dipeptide transport system periplasmic component-like protein  70.07 
 
 
653 aa  570  1e-161  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0354  ABC-type dipeptide transport system periplasmic component-like protein  42.03 
 
 
381 aa  239  6.999999999999999e-62  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.180837 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0093  extracellular solute-binding protein  35.07 
 
 
604 aa  172  9e-42  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.503977 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0197  extracellular solute-binding protein  32.28 
 
 
605 aa  152  1e-35  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.386701  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3501  extracellular solute-binding protein  33.71 
 
 
639 aa  146  8.000000000000001e-34  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.0000268642  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2944  extracellular solute-binding protein family 5  33.85 
 
 
587 aa  145  2e-33  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal  0.0305195 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2657  extracellular solute-binding protein  31.18 
 
 
617 aa  132  2.0000000000000002e-29  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.0000297428  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3496  extracellular solute-binding protein  29.31 
 
 
590 aa  128  2.0000000000000002e-28  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0872  extracellular solute-binding protein  32.82 
 
 
541 aa  99.4  1e-19  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  decreased coverage  0.00426332  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0337  extracellular solute-binding protein family 5  26.69 
 
 
581 aa  97.8  3e-19  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1563  extracellular solute-binding protein  24.76 
 
 
588 aa  93.2  8e-18  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.176735  normal  0.279007 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2258  solute-binding family 5 protein  27.41 
 
 
579 aa  92  2e-17  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2555  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, oligopeptide/dipeptide-binding protein  27.41 
 
 
580 aa  91.3  3e-17  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2270  extracellular solute-binding protein family 5  24.14 
 
 
580 aa  91.3  4e-17  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2321  extracellular solute-binding protein family 5  24.14 
 
 
580 aa  91.3  4e-17  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.815964 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3874  ABC transporter substrate binding protein (oligopeptide)  28.62 
 
 
585 aa  85.9  0.000000000000001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0477  extracellular solute-binding protein family 5  24.15 
 
 
573 aa  83.6  0.000000000000006  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2731  extracellular solute-binding protein family 5  26.27 
 
 
622 aa  82  0.00000000000002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0608  extracellular solute-binding protein  28.68 
 
 
566 aa  80.5  0.00000000000006  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2203  extracellular solute-binding protein family 5  25.75 
 
 
531 aa  79.3  0.0000000000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.0247328 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1410  extracellular solute-binding protein family 5  28.47 
 
 
615 aa  75.9  0.000000000001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0324  extracellular solute-binding protein  24.69 
 
 
586 aa  75.9  0.000000000001  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  unclonable  0.000000261589  hitchhiker  0.0038707 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1988  ABC peptide transporter, periplasmic ligand binding protein  25.4 
 
 
505 aa  75.5  0.000000000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.693495  normal  0.584075 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1596  extracellular solute-binding protein family 5  23.64 
 
 
572 aa  75.5  0.000000000002  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.0368881  unclonable  7.93881e-23 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2906  extracellular solute-binding protein family 5  21.54 
 
 
574 aa  74.3  0.000000000004  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0232  extracellular solute-binding protein  27.57 
 
 
517 aa  72  0.00000000002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1483  extracellular solute-binding protein  25.2 
 
 
551 aa  72  0.00000000002  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.228319  normal  0.152124 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4579  extracellular solute-binding protein  29.8 
 
 
596 aa  72  0.00000000002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2277  extracellular solute-binding protein family 5  24.36 
 
 
615 aa  71.2  0.00000000003  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  hitchhiker  0.00527261  decreased coverage  0.000000000210766 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2798  extracellular solute-binding protein family 5  27.46 
 
 
557 aa  70.9  0.00000000004  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1273  extracellular solute-binding protein family 5  24 
 
 
593 aa  71.2  0.00000000004  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6955  oligopeptide ABC transporter (substrate-binding protein)  25 
 
 
597 aa  70.1  0.00000000008  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0551  extracellular solute-binding protein  23.6 
 
 
591 aa  70.1  0.00000000008  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2770  extracellular solute-binding protein  28.83 
 
 
603 aa  69.7  0.00000000009  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.14158  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0450  extracellular solute-binding protein family 5  24.74 
 
 
519 aa  69.7  0.0000000001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal  0.15126 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4599  extracellular solute-binding protein  27.64 
 
 
621 aa  68.9  0.0000000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.593059  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2311  extracellular solute-binding protein family 5  23.24 
 
 
562 aa  68.9  0.0000000002  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.34367  normal  0.0804809 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0570  extracellular solute-binding protein  23.2 
 
 
591 aa  68.6  0.0000000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0910  extracellular solute-binding protein  24.58 
 
 
555 aa  68.2  0.0000000003  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.463169  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0383  extracellular solute-binding protein  27.46 
 
 
618 aa  67.8  0.0000000003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.531894  normal  0.778896 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1632  extracellular solute-binding protein family 5  26.34 
 
 
517 aa  67.8  0.0000000004  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2655  extracellular solute-binding protein  24.31 
 
 
539 aa  67.4  0.0000000004  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.0000125789  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0816  extracellular solute-binding protein  27.06 
 
 
533 aa  67.4  0.0000000005  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3677  oligopeptide ABC transporter, oligopeptide-binding protein  24.08 
 
 
520 aa  67  0.0000000006  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.969921  normal  0.0940549 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0892  extracellular solute-binding protein  28.14 
 
 
596 aa  67  0.0000000006  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.353929  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1234  extracellular solute-binding protein  25.43 
 
 
538 aa  67  0.0000000007  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.871598  normal  0.318753 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4611  extracellular solute-binding protein family 5  25 
 
 
553 aa  66.6  0.0000000009  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.596915 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4293  extracellular solute-binding protein  29.64 
 
 
541 aa  66.6  0.0000000009  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.5263  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1605  extracellular solute-binding protein  26.51 
 
 
595 aa  66.2  0.000000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013164  Apre_1771  extracellular solute-binding protein family 5  32.26 
 
 
547 aa  66.2  0.000000001  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0724  oligopeptide ABC transporter, oligopeptide-binding protein  22.45 
 
 
593 aa  65.1  0.000000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0566  oligopeptide ABC transporter, oligopeptide-binding protein  22.45 
 
 
593 aa  65.5  0.000000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3678  oligopeptide ABC transporter, oligopeptide-binding protein  25.1 
 
 
525 aa  65.5  0.000000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.0885273 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1116  extracellular solute-binding protein  25.97 
 
 
581 aa  65.1  0.000000002  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.749385  normal  0.0404913 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0990  extracellular solute-binding protein  21.54 
 
 
571 aa  64.7  0.000000003  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0391  extracellular solute-binding protein  25.29 
 
 
522 aa  65.1  0.000000003  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1009  extracellular solute-binding protein  21.54 
 
 
571 aa  64.7  0.000000003  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_3074  extracellular solute-binding protein family 5  25.65 
 
 
621 aa  64.7  0.000000003  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  unclonable  0.00000149398  normal  0.300897 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1433  peptide ABC transporter, periplasmic peptide-binding protein  24.3 
 
 
538 aa  64.3  0.000000004  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.948157  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0722  radical SAM domain-containing protein  24.12 
 
 
522 aa  64.7  0.000000004  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal  0.597639 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0404  peptide ABC transporter, periplasmic peptide-binding protein, putative  28.11 
 
 
562 aa  63.9  0.000000005  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.195292  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0231  oligopeptide ABC transporter oligopeptide-binding protein  22.89 
 
 
555 aa  63.9  0.000000005  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2857  extracellular solute-binding protein  25.82 
 
 
593 aa  63.9  0.000000005  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.358002 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2097  4-phytase  23.51 
 
 
546 aa  63.9  0.000000005  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  0.00000775897  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0689  extracellular solute-binding protein family 5  31.61 
 
 
544 aa  63.9  0.000000005  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0248  oligopeptide ABC transporter, oligopeptide-binding protein, putative  22.89 
 
 
575 aa  63.9  0.000000006  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0241  putative oligopeptide ABC transporter, oligopeptide-binding protein  22.89 
 
 
575 aa  63.5  0.000000006  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0209  oligopeptide ABC transporter, oligopeptide-binding protein  22.89 
 
 
575 aa  63.5  0.000000006  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.019765  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1979  oligopeptide ABC transporter, solute-binding protein  25.56 
 
 
516 aa  63.5  0.000000007  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4796  extracellular solute-binding protein family 5  34.96 
 
 
532 aa  63.5  0.000000008  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.478428  normal 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0713  oligopeptide ABC transporter, oligopeptide-binding protein  22.45 
 
 
593 aa  63.2  0.000000009  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00303874 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0218  oligopeptide ABC transporter oligopeptide-binding protein  23.32 
 
 
559 aa  63.2  0.000000009  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0623  oligopeptide ABC transporter oligopeptide-binding protein  22.45 
 
 
593 aa  63.2  0.000000009  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1356  extracellular solute-binding protein family 5  26.27 
 
 
596 aa  63.2  0.000000009  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0656  oligopeptide ABC transporter oligopeptide-binding protein  22.45 
 
 
593 aa  63.2  0.000000009  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0785  oligopeptide ABC transporter, oligopeptide-binding protein  22.45 
 
 
593 aa  63.2  0.00000001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0265  oligopeptide-binding protein OppA  24.09 
 
 
566 aa  62.8  0.00000001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0038  extracellular solute-binding protein family 5  27.6 
 
 
568 aa  62.8  0.00000001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0788  extracellular solute-binding protein family 5  22.64 
 
 
576 aa  62.4  0.00000002  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.301156 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0247  oligopeptide ABC transporter, substrate-binding protein, putative  23.64 
 
 
567 aa  62  0.00000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.460021  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0205  oligopeptide ABC transporter, oligopeptide-binding protein  23.87 
 
 
575 aa  62  0.00000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0114  extracellular solute-binding protein  25.44 
 
 
530 aa  61.6  0.00000002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0715  extracellular solute-binding protein  24.81 
 
 
565 aa  62.4  0.00000002  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.109389  normal 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0387  extracellular solute-binding protein family 5  25.31 
 
 
503 aa  62  0.00000002  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.000000219856  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3875  ABC transporter substrate binding protein (oligopeptide)  24.28 
 
 
568 aa  61.2  0.00000003  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4235  extracellular solute-binding protein  26.79 
 
 
542 aa  61.2  0.00000003  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0928  extracellular solute-binding protein  24.91 
 
 
541 aa  61.2  0.00000003  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0219  extracellular solute-binding protein  22.86 
 
 
575 aa  61.2  0.00000003  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4559  dipeptide ABC transporter, periplasmic dipeptide-binding protein  27.27 
 
 
530 aa  60.8  0.00000004  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4236  extracellular solute-binding protein  26.18 
 
 
530 aa  61.2  0.00000004  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.978762  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3906  dipeptide ABC transporter periplasmic dipeptide-binding protein  26.82 
 
 
526 aa  60.8  0.00000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal  0.938997 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3842  dipeptide ABC transporter, periplasmic dipeptide-binding protein  26.82 
 
 
526 aa  60.8  0.00000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3950  dipeptide ABC transporter periplasmic dipeptide-binding protein  26.82 
 
 
526 aa  60.8  0.00000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0885  dipeptide ABC transporter, periplasmic peptide-binding protein  24.91 
 
 
541 aa  60.5  0.00000006  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.575043  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0924  extracellular solute-binding protein  24.91 
 
 
541 aa  60.5  0.00000006  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0818  peptide/nickel transport system substrate-binding protein  26.45 
 
 
568 aa  60.1  0.00000007  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0723  hypothetical protein  23.67 
 
 
527 aa  60.1  0.00000007  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.703564  normal  0.46015 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4037  dipeptide ABC transporter, periplasmic dipeptide-binding protein  26.36 
 
 
535 aa  60.1  0.00000008  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>