138 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cag_1541 on replicon NC_007514
Organism: Chlorobium chlorochromatii CaD3



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007512  Plut_0714  phosphodiesterase  82.63 
 
 
524 aa  901    Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  hitchhiker  0.0000321405  normal 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1541  phosphodiesterase  100 
 
 
524 aa  1058    Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  hitchhiker  0.00592062  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0928  phosphodiesterase  84.38 
 
 
525 aa  916    Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.111648  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1632  phosphodiesterase  84.16 
 
 
524 aa  902    Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  hitchhiker  0.000000000458404  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1630  phosphodiesterase  78.24 
 
 
524 aa  853    Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  hitchhiker  0.00282322  normal 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0818  phosphodiesterase  77.67 
 
 
524 aa  853    Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.000000112638  normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2088  phosphodiesterase  86.07 
 
 
524 aa  918    Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  hitchhiker  0.000367312  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0007  phosphodiesterase  43.93 
 
 
523 aa  442  1e-123  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0813303  normal  0.187405 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1127  phosphodiesterase  45.38 
 
 
522 aa  439  9.999999999999999e-123  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.23482  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0284  metal dependent phosphohydrolase  46.71 
 
 
536 aa  434  1e-120  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.876396  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0828  phosphodiesterase  43.64 
 
 
517 aa  433  1e-120  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.894152  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0615  RNA binding metal dependent phosphohydrolase  43.52 
 
 
558 aa  420  1e-116  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.22485  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7243  phosphodiesterase  43.63 
 
 
521 aa  420  1e-116  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0122  phosphodiesterase  44.65 
 
 
519 aa  418  9.999999999999999e-116  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0988  RNA binding metal dependent phosphohydrolase  43.21 
 
 
521 aa  418  9.999999999999999e-116  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.549745  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_06705  hypothetical protein  41.76 
 
 
522 aa  415  1e-114  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.0206529  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3101  phosphodiesterase  44.04 
 
 
511 aa  411  1e-113  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0679097  normal  0.374081 
 
 
-
 
NC_002950  PG0401  phosphodiesterase  41.14 
 
 
513 aa  407  1.0000000000000001e-112  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0788  phosphodiesterase  41.6 
 
 
522 aa  407  1.0000000000000001e-112  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1919  phosphodiesterase  42.97 
 
 
512 aa  402  1e-111  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0169953  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2578  metal dependent phosphohydrolase  43.55 
 
 
520 aa  400  9.999999999999999e-111  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.102064  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1625  phosphodiesterase  42.44 
 
 
508 aa  399  9.999999999999999e-111  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00284901  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1061  phosphodiesterase  44.87 
 
 
513 aa  401  9.999999999999999e-111  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  unclonable  0.000000060823  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2350  phosphodiesterase  41.92 
 
 
520 aa  398  1e-109  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000201473  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1091  metal dependent phosphohydrolase  43.91 
 
 
524 aa  396  1e-109  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.0000612767  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1475  metal dependent phosphohydrolase  43.32 
 
 
487 aa  397  1e-109  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.0000182866  normal  0.981892 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0968  phosphodiesterase  42.48 
 
 
533 aa  396  1e-109  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00053282  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1184  phosphodiesterase  42.11 
 
 
519 aa  397  1e-109  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.105071 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0605  RNA binding metal dependent phosphohydrolase  42.5 
 
 
522 aa  395  1e-109  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3293  phosphodiesterase  42.48 
 
 
533 aa  396  1e-109  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1180  phosphodiesterase  44.02 
 
 
520 aa  394  1e-108  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00430196  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1475  metal dependent phosphohydrolase  41.29 
 
 
515 aa  392  1e-108  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  hitchhiker  0.0039808  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1137  phosphodiesterase  43.07 
 
 
520 aa  390  1e-107  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0978  phosphodiesterase  41.33 
 
 
527 aa  389  1e-107  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0108049  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1617  RNA binding metal dependent phosphohydrolase  40.66 
 
 
510 aa  390  1e-107  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  hitchhiker  0.0000205751  hitchhiker  0.00000000000531756 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1081  metal dependent phosphohydrolase  43.99 
 
 
504 aa  391  1e-107  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.075195  normal 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1926  phosphodiesterase  41.95 
 
 
511 aa  392  1e-107  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1644  phosphodiesterase  41.95 
 
 
511 aa  392  1e-107  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3312  phosphodiesterase  42.03 
 
 
521 aa  389  1e-107  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.924608  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0585  phosphodiesterase  42.48 
 
 
519 aa  391  1e-107  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3371  phosphodiesterase  42.75 
 
 
519 aa  390  1e-107  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3500  phosphodiesterase  45.11 
 
 
521 aa  392  1e-107  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.0000584399  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1254  HDIG/KH domain-containing protein  42.12 
 
 
515 aa  386  1e-106  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.0168178  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_10740  metal dependent phosphohydrolase  38.77 
 
 
513 aa  385  1e-106  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.462426  unclonable  0.00000000186001 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0608  RNA binding metal dependent phosphohydrolase  42.33 
 
 
520 aa  387  1e-106  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.00000412066  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1120  RNA binding metal dependent phosphohydrolase  42.86 
 
 
537 aa  383  1e-105  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.520277  normal  0.168608 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1100  phosphodiesterase  42.83 
 
 
521 aa  384  1e-105  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.0000000238727  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0237  hypothetical protein  40.69 
 
 
509 aa  379  1e-104  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2207  phosphodiesterase  40.11 
 
 
518 aa  379  1e-104  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1693  phosphodiesterase  42.94 
 
 
519 aa  379  1e-104  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  hitchhiker  0.00893236  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_07460  metal dependent phosphohydrolase  42.33 
 
 
525 aa  375  1e-103  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  hitchhiker  0.00487641  normal 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1262  RNA binding metal dependent phosphohydrolase  42.95 
 
 
509 aa  376  1e-103  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.00130643  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1475  metal dependent phosphohydrolase  44.87 
 
 
512 aa  377  1e-103  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.331031  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1337  phosphodiesterase  43.28 
 
 
540 aa  373  1e-102  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.00000000127735  normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2598  RNA binding metal dependent phosphohydrolase  40.95 
 
 
516 aa  372  1e-102  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  decreased coverage  0.0000056493  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_11870  metal dependent phosphohydrolase  41.23 
 
 
514 aa  373  1e-102  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000537836  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0114  metal dependent phosphohydrolase  42.64 
 
 
520 aa  369  1e-101  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0777  RNA binding metal dependent phosphohydrolase  40.34 
 
 
517 aa  369  1e-101  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  unclonable  0.0000000796077  normal  0.068248 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2218  2',3'-cyclic-nucleotide 2'-phosphodiesterase  41.8 
 
 
502 aa  370  1e-101  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.173507 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3104  phosphodiesterase  41.54 
 
 
516 aa  370  1e-101  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000128005  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0567  metal dependent phosphohydrolase  38.24 
 
 
509 aa  367  1e-100  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1160  phosphodiesterase  41.04 
 
 
510 aa  369  1e-100  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1191  phosphodiesterase  39.73 
 
 
518 aa  368  1e-100  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000197151  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2086  phosphodiesterase  40.31 
 
 
518 aa  365  1e-99  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3291  RNA binding metal dependent phosphohydrolase  41.07 
 
 
523 aa  364  2e-99  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0260994  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3711  phosphodiesterase  46.35 
 
 
510 aa  364  3e-99  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  unclonable  0.00000469244  unclonable  0.0000000332559 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0953  RNA binding metal dependent phosphohydrolase  38.24 
 
 
518 aa  362  1e-98  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0330  phosphodiesterase  42.1 
 
 
535 aa  360  3e-98  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  decreased coverage  0.000340911  decreased coverage  0.00581399 
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0515  phosphodiesterase  38.81 
 
 
510 aa  360  3e-98  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0524  metal dependent phosphohydrolase  42.12 
 
 
513 aa  360  4e-98  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.00240284  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1583  RNA binding metal dependent phosphohydrolase  41.24 
 
 
560 aa  360  5e-98  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0715  metal dependent phosphohydrolase  41.94 
 
 
516 aa  359  8e-98  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.352371  normal  0.854509 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0856  phosphodiesterase  42.29 
 
 
535 aa  358  9e-98  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  unclonable  0.0000301712  normal  0.0173757 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0083  phosphodiesterase  39.36 
 
 
517 aa  354  2e-96  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.479038  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1490  metal dependent phosphohydrolase  43.65 
 
 
491 aa  353  2.9999999999999997e-96  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.355219  normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3627  phosphodiesterase  38.72 
 
 
520 aa  353  4e-96  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3519  phosphodiesterase  38.72 
 
 
520 aa  353  4e-96  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3537  phosphodiesterase  38.72 
 
 
520 aa  353  4e-96  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.311927  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3914  phosphodiesterase  38.72 
 
 
520 aa  353  4e-96  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00777631  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0805  metal-dependent phosphohydrolase, HD region  43.53 
 
 
501 aa  353  5e-96  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3790  phosphodiesterase  38.72 
 
 
520 aa  353  5.9999999999999994e-96  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000195923 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3549  phosphodiesterase  37.93 
 
 
521 aa  352  7e-96  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.000213332  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3813  phosphodiesterase  37.9 
 
 
520 aa  352  1e-95  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0688282  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3825  phosphodiesterase  38 
 
 
521 aa  351  2e-95  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00141281  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3877  phosphodiesterase  37.71 
 
 
520 aa  350  3e-95  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0179865  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2430  phosphodiesterase  37.71 
 
 
520 aa  350  4e-95  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1422  phosphodiesterase  38.15 
 
 
521 aa  350  4e-95  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.008621  normal  0.971465 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0962  phosphodiesterase  41.68 
 
 
507 aa  349  7e-95  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.0148724  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1724  phosphodiesterase  40.08 
 
 
518 aa  348  1e-94  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2017  YmdA/YtgF protein  38.32 
 
 
546 aa  348  2e-94  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.855551  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0940  phosphodiesterase  40.85 
 
 
507 aa  348  2e-94  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  unclonable  0.00000000513456  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1681  phosphodiesterase  41.26 
 
 
564 aa  343  4e-93  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1372  phosphodiesterase  39.76 
 
 
519 aa  342  7e-93  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.800868  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1558  RNA binding metal dependent phosphohydrolase  41.35 
 
 
509 aa  342  1e-92  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0442  hypothetical protein  36.89 
 
 
532 aa  341  2e-92  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1293  phosphodiesterase  41.11 
 
 
517 aa  341  2e-92  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  decreased coverage  0.000703284  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4793  phosphodiesterase  42.49 
 
 
509 aa  341  2e-92  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0108516  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3248  metal dependent phosphohydrolase  42.05 
 
 
480 aa  340  5e-92  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.350775 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3523  metal dependent phosphohydrolase  40.45 
 
 
646 aa  339  5.9999999999999996e-92  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.555023  normal  0.082287 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0798  RNA binding metal dependent phosphohydrolase  41.15 
 
 
487 aa  339  5.9999999999999996e-92  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.164487  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>