138 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cpha266_0928 on replicon NC_008639
Organism: Chlorobium phaeobacteroides DSM 266



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007512  Plut_0714  phosphodiesterase  85.9 
 
 
524 aa  923    Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  hitchhiker  0.0000321405  normal 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1541  phosphodiesterase  85.52 
 
 
524 aa  875    Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  hitchhiker  0.00592062  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0928  phosphodiesterase  100 
 
 
525 aa  1056    Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.111648  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1632  phosphodiesterase  88.19 
 
 
524 aa  926    Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  hitchhiker  0.000000000458404  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1630  phosphodiesterase  81.15 
 
 
524 aa  875    Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  hitchhiker  0.00282322  normal 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0818  phosphodiesterase  81.3 
 
 
524 aa  867    Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.000000112638  normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2088  phosphodiesterase  88.57 
 
 
524 aa  933    Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  hitchhiker  0.000367312  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1127  phosphodiesterase  44.23 
 
 
522 aa  429  1e-119  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.23482  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0007  phosphodiesterase  43.57 
 
 
523 aa  426  1e-118  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0813303  normal  0.187405 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0828  phosphodiesterase  43.3 
 
 
517 aa  422  1e-117  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.894152  normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0988  RNA binding metal dependent phosphohydrolase  43.7 
 
 
521 aa  415  9.999999999999999e-116  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.549745  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0284  metal dependent phosphohydrolase  44.11 
 
 
536 aa  415  1e-114  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.876396  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7243  phosphodiesterase  42.4 
 
 
521 aa  414  1e-114  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0122  phosphodiesterase  43.76 
 
 
519 aa  409  1e-113  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0615  RNA binding metal dependent phosphohydrolase  50.57 
 
 
558 aa  407  1.0000000000000001e-112  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.22485  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_06705  hypothetical protein  40.23 
 
 
522 aa  403  1e-111  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.0206529  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3101  phosphodiesterase  43.21 
 
 
511 aa  403  1e-111  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0679097  normal  0.374081 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0788  phosphodiesterase  42.12 
 
 
522 aa  404  1e-111  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0401  phosphodiesterase  42.27 
 
 
513 aa  401  9.999999999999999e-111  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1091  metal dependent phosphohydrolase  45.47 
 
 
524 aa  401  9.999999999999999e-111  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.0000612767  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1475  metal dependent phosphohydrolase  43.38 
 
 
515 aa  400  9.999999999999999e-111  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  hitchhiker  0.0039808  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1081  metal dependent phosphohydrolase  45.54 
 
 
504 aa  393  1e-108  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.075195  normal 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1926  phosphodiesterase  42.35 
 
 
511 aa  394  1e-108  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1644  phosphodiesterase  42.35 
 
 
511 aa  394  1e-108  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2578  metal dependent phosphohydrolase  42.57 
 
 
520 aa  394  1e-108  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.102064  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1625  phosphodiesterase  42.64 
 
 
508 aa  394  1e-108  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00284901  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1061  phosphodiesterase  43.65 
 
 
513 aa  395  1e-108  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  unclonable  0.000000060823  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0605  RNA binding metal dependent phosphohydrolase  43.38 
 
 
522 aa  395  1e-108  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1919  phosphodiesterase  42.34 
 
 
512 aa  391  1e-107  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0169953  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1475  metal dependent phosphohydrolase  43.32 
 
 
487 aa  390  1e-107  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.0000182866  normal  0.981892 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2350  phosphodiesterase  42.08 
 
 
520 aa  386  1e-106  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000201473  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1184  phosphodiesterase  41.85 
 
 
519 aa  388  1e-106  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.105071 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1617  RNA binding metal dependent phosphohydrolase  40.27 
 
 
510 aa  382  1e-105  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  hitchhiker  0.0000205751  hitchhiker  0.00000000000531756 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1120  RNA binding metal dependent phosphohydrolase  43.89 
 
 
537 aa  385  1e-105  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.520277  normal  0.168608 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0978  phosphodiesterase  40.38 
 
 
527 aa  381  1e-104  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0108049  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1254  HDIG/KH domain-containing protein  41.79 
 
 
515 aa  382  1e-104  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.0168178  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3293  phosphodiesterase  41.17 
 
 
533 aa  380  1e-104  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1262  RNA binding metal dependent phosphohydrolase  42.26 
 
 
509 aa  377  1e-103  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.00130643  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1180  phosphodiesterase  42.83 
 
 
520 aa  376  1e-103  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00430196  normal 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_10740  metal dependent phosphohydrolase  38.07 
 
 
513 aa  377  1e-103  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.462426  unclonable  0.00000000186001 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0585  phosphodiesterase  40.71 
 
 
519 aa  377  1e-103  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0567  metal dependent phosphohydrolase  39.77 
 
 
509 aa  376  1e-103  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0968  phosphodiesterase  40.79 
 
 
533 aa  377  1e-103  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00053282  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1137  phosphodiesterase  41.49 
 
 
520 aa  374  1e-102  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3312  phosphodiesterase  40.68 
 
 
521 aa  374  1e-102  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.924608  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_07460  metal dependent phosphohydrolase  41.1 
 
 
525 aa  373  1e-102  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  hitchhiker  0.00487641  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0608  RNA binding metal dependent phosphohydrolase  41.25 
 
 
520 aa  374  1e-102  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.00000412066  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2598  RNA binding metal dependent phosphohydrolase  42.23 
 
 
516 aa  372  1e-102  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  decreased coverage  0.0000056493  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3500  phosphodiesterase  43.11 
 
 
521 aa  375  1e-102  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.0000584399  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1693  phosphodiesterase  42.97 
 
 
519 aa  374  1e-102  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  hitchhiker  0.00893236  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0237  hypothetical protein  39.73 
 
 
509 aa  370  1e-101  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0777  RNA binding metal dependent phosphohydrolase  40.04 
 
 
517 aa  370  1e-101  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  unclonable  0.0000000796077  normal  0.068248 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2218  2',3'-cyclic-nucleotide 2'-phosphodiesterase  42.01 
 
 
502 aa  371  1e-101  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.173507 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3371  phosphodiesterase  40.46 
 
 
519 aa  371  1e-101  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1191  phosphodiesterase  40.87 
 
 
518 aa  369  1e-101  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000197151  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1475  metal dependent phosphohydrolase  42.94 
 
 
512 aa  365  1e-100  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.331031  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2207  phosphodiesterase  39.92 
 
 
518 aa  369  1e-100  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1337  phosphodiesterase  43.78 
 
 
540 aa  367  1e-100  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.00000000127735  normal 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0524  metal dependent phosphohydrolase  40.47 
 
 
513 aa  365  1e-100  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.00240284  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1160  phosphodiesterase  41.51 
 
 
510 aa  367  1e-100  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3104  phosphodiesterase  41.76 
 
 
516 aa  367  1e-100  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000128005  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0083  phosphodiesterase  41.7 
 
 
517 aa  365  1e-99  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.479038  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1100  phosphodiesterase  40.34 
 
 
521 aa  364  2e-99  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.0000000238727  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0953  RNA binding metal dependent phosphohydrolase  37.62 
 
 
518 aa  364  2e-99  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_11870  metal dependent phosphohydrolase  42.18 
 
 
514 aa  364  3e-99  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000537836  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2086  phosphodiesterase  40.3 
 
 
518 aa  362  6e-99  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3291  RNA binding metal dependent phosphohydrolase  39.47 
 
 
523 aa  362  1e-98  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0260994  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1583  RNA binding metal dependent phosphohydrolase  41.68 
 
 
560 aa  359  8e-98  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3549  phosphodiesterase  38.46 
 
 
521 aa  356  3.9999999999999996e-97  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.000213332  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1422  phosphodiesterase  39.31 
 
 
521 aa  356  3.9999999999999996e-97  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.008621  normal  0.971465 
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0515  phosphodiesterase  38.74 
 
 
510 aa  355  6.999999999999999e-97  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3825  phosphodiesterase  38.46 
 
 
521 aa  355  1e-96  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00141281  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3813  phosphodiesterase  38.39 
 
 
520 aa  354  2e-96  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0688282  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3711  phosphodiesterase  43.99 
 
 
510 aa  354  2e-96  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  unclonable  0.00000469244  unclonable  0.0000000332559 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3627  phosphodiesterase  38.39 
 
 
520 aa  353  2.9999999999999997e-96  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3519  phosphodiesterase  38.39 
 
 
520 aa  353  2.9999999999999997e-96  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3537  phosphodiesterase  38.39 
 
 
520 aa  353  2.9999999999999997e-96  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.311927  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3914  phosphodiesterase  38.39 
 
 
520 aa  353  2.9999999999999997e-96  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00777631  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0114  metal dependent phosphohydrolase  42.62 
 
 
520 aa  353  4e-96  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3790  phosphodiesterase  38.39 
 
 
520 aa  353  5e-96  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000195923 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1724  phosphodiesterase  40.34 
 
 
518 aa  353  5.9999999999999994e-96  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2430  phosphodiesterase  38.39 
 
 
520 aa  352  7e-96  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3877  phosphodiesterase  38 
 
 
520 aa  352  8.999999999999999e-96  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0179865  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1490  metal dependent phosphohydrolase  43.28 
 
 
491 aa  352  1e-95  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.355219  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0805  metal-dependent phosphohydrolase, HD region  43.95 
 
 
501 aa  348  1e-94  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0715  metal dependent phosphohydrolase  40.4 
 
 
516 aa  348  1e-94  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.352371  normal  0.854509 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2017  YmdA/YtgF protein  38.92 
 
 
546 aa  348  1e-94  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.855551  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3248  metal dependent phosphohydrolase  39.73 
 
 
480 aa  347  2e-94  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.350775 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0856  phosphodiesterase  44.76 
 
 
535 aa  347  2e-94  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  unclonable  0.0000301712  normal  0.0173757 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0940  phosphodiesterase  41.17 
 
 
507 aa  347  3e-94  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  unclonable  0.00000000513456  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0330  phosphodiesterase  44.52 
 
 
535 aa  347  3e-94  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  decreased coverage  0.000340911  decreased coverage  0.00581399 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1372  phosphodiesterase  40.94 
 
 
519 aa  347  4e-94  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.800868  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0936  RNA binding metal dependent phosphohydrolase  38.56 
 
 
530 aa  344  2.9999999999999997e-93  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0962  phosphodiesterase  41.36 
 
 
507 aa  343  2.9999999999999997e-93  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.0148724  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1346  phosphodiesterase  40.73 
 
 
519 aa  343  4e-93  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.66517  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2694  RNA binding metal dependent phosphohydrolase  39.66 
 
 
527 aa  343  4e-93  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0875  phosphodiesterase  47.32 
 
 
575 aa  340  5e-92  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1427  metal dependent phophohydrolase  43.65 
 
 
588 aa  338  9.999999999999999e-92  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.0408518 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3523  metal dependent phosphohydrolase  41.36 
 
 
646 aa  338  1.9999999999999998e-91  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.555023  normal  0.082287 
 
 
-
 
NC_008532  STER_0442  hypothetical protein  36.52 
 
 
532 aa  338  1.9999999999999998e-91  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>